BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-050A11
Chromosome3 (Build37)
Map Location 74,741,025 - 74,882,561
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC050789
Upstream geneLOC667425, LOC619764, LOC667434, LOC100041551, EG667459
Downstream geneSerpini2, Wdr49, Pdcd10, Serpini1, Golph4, Fstl5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-050A11.bB6Ng01-050A11.g
ACCDH874099DH874100
length951960
definitionDH874099|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050A11, 5' end.DH874100|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050A11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,881,603 - 74,882,561)(74,741,025 - 74,741,969)
sequence
gaattcaaaaaaataggagaaaccacctcttttgagaaaaatgaaacaga
gaaaaatatagacccccaaaataacaaagactctgttgattcctgcatgt
cacttgggagcaagggttccttgccaaccatagattcatctacatctttc
atagaggagaattcatctcaagacaccaacacatcattgaaatgcagcaa
tcaaaatgagaggtcaaacttgggaaattcaaaaactgcaaaggaaccac
tggtaaatacctattatatttactgcattaatagtttataaggatattct
tgagaaaatgatgttatagcataatacatactaaaaggttattttctact
tagattaaagtactgccgcttaaggtgatagctaaagaatgactcatatc
gaaacaggcatttcttataagataaatgtcattttaacatgcatttttct
gtgacaaatgatactagagaaacacctcattgatatatcaagaataatgg
tgcttttgcaaataaatttacaattgcagaatagagtgtcattctgatat
atatatatatattatatataaaatgtttgtgtgtgtggtgtgtgtgtgtg
cgtgcgtgtgttatgtacaaaacacatatgcatgcataaacacacatata
tgtacatcaatacattttattattgaaagtgatatattttttaggtgcag
agaaaatgacccacttctttcaatgtaggtaaagcaagtcatgattttag
gaatatgcctaaggaggaaatagtgcaacaaacaaagaagctcattcttg
tactcatgccaaattttaaatgtttgaaccatcatcctacatatagacgt
cttatgtagtatgatgattaatataaaattgttggtattgataaaccacc
catttccagtacttgaattaatttaaaggtcattttagcagcctaaactg
a
gaattcaaggagaaggagacatttatgcatagctagtgcgaatctaacta
gttcagccttgtggaaatcagcatgaaggttcacccaaacaataaacgtg
aaatcaatcaaacaaacaaacccccaaacaaacaaacaaatagcaaatta
acaattaaccatatgtaccactcatgagtatttatctaaagaatattaat
tcaacatattgcagatacttgcacagtgacactaattgcagcaatgttca
taatagctaaattacaaggccaatataagtatatgtcaacagaagattga
ataaaggaaataaattatagatcaatgatatcattatagtaaacaaatca
gatcacattcatatggacataattgtatattttctcttgtctataaacct
ttgattatatatagatacatgaattagtatgtccacctttatggaaaagt
acacaaattgatgctatggaaaccttgctccccaatataactggccaata
gaagtctagatgagctgggcatcgtggcgcccacctttaatttcagcact
cgggaggcagaggcaggcagttttctgaattcgaggccagcctggtctac
aaagtgagttccgggacatccagggcaatacagagaaaccctgtcttgaa
aaaaaaaaaaaatgaagtttagagcctgtgattgggcattagaaatagaa
aggtggaacttgaggattgagtgaagggcctcagagagaccaaagaggag
aagcagaaaggatagagtgagaccaccatgagaggagatagaccaggaat
gagcacatgggccaggaatcacagcaagcaacataggacatatggatgaa
aatgtgtagaatagctccaaccttgcacgatctgggctgataacttgtat
ctcgctgagctagtatctcacagcagattcactcagacacggatcttcta
tggcaagctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_74881603_74882561
seq2: B6Ng01-050A11.b_45_995 (reverse)

seq1  TCAGTTTAGGCTGCATAAAATGACTTTAAAATTAAATTTCAAGTACTGGA  50
      |||||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||| 
seq2  TCAGTTTAGGCTGC-TAAAATGACCTTTAAATTAA--TTCAAGTACTGG-  46

seq1  AAATGGGTGGTTTATTCAATTACCAAGAATTTTATTATTAATAATCATAA  100
      |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| |
seq2  AAATGGGTGGTTTA-TCAA-TACCAACAATTTTA-TATTAATCATCAT-A  92

seq1  CTACATAAGACGTCTATTATGTAGGATGATGGTTCAAAAACATTTTAAAA  150
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||
seq2  CTACATAAGACGTCTA-TATGTAGGATGATGGTTCAAACA---TTTAAAA  138

seq1  TTTGGCATGAGTACAAGAATGAGCTTCTTTGTTTGTTGCACTATTTCCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCATGAGTACAAGAATGAGCTTCTTTGTTTGTTGCACTATTTCCTC  188

seq1  CTTAGGCATATTCCTAAAATCATGACTTGCTTTACCTACATTGCAAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTTAGGCATATTCCTAAAATCATGACTTGCTTTACCTACATTGAAAGAAG  238

seq1  T-GGTCATTTTCTCTGCACCT-AAAAATATATCACTTTCAATAAT-AAAT  297
      | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGGGTCATTTTCTCTGCACCTAAAAAATATATCACTTTCAATAATAAAAT  288

seq1  GTATTGATGTACATATATGTGTGTTTATGCATGCATATGTG-TTTGTACA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTATTGATGTACATATATGTGTGTTTATGCATGCATATGTGTTTTGTACA  338

seq1  TAACACACGCACGCACACACACACACCACACACACAAACATTTTATATAT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACACGCACGCACACACACACACCACACACACAAACATTTTATATAT  388

seq1  AATATATATATATATATCAGAATGACACTCTATTCTGCAATTGTAAATTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATATATATATATATCAGAATGACACTCTATTCTGCAATTGTAAATTT  438

seq1  ATTTGCAAAAGCACCATTATTCTTGATATATCAATGAGGTGTTTCTCTAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCAAAAGCACCATTATTCTTGATATATCAATGAGGTGTTTCTCTAG  488

seq1  TATCATTTGTCACAGAAAAATGCATGTTAAAATGACATTTATCTTATAAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATTTGTCACAGAAAAATGCATGTTAAAATGACATTTATCTTATAAG  538

seq1  AAATGCCTGTTTCGATATGAGTCATTCTTTAGCTATCACCTTAAGCGGCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCCTGTTTCGATATGAGTCATTCTTTAGCTATCACCTTAAGCGGCA  588

seq1  GTACTTTAATCTAAGTAGAAAATAACCTTTTAGTATGTATTATGCTATAA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTTAATCTAAGTAGAAAATAACCTTTTAGTATGTATTATGCTATAA  638

seq1  CATCATTTTCTCAAGAATATCCTTATAAACTATTAATGCAGTAAATATAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTTTCTCAAGAATATCCTTATAAACTATTAATGCAGTAAATATAA  688

seq1  TAGGTATTTACCAGTGGTTCCTTTGCAGTTTTTGAATTTCCCAAGTTTGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTATTTACCAGTGGTTCCTTTGCAGTTTTTGAATTTCCCAAGTTTGA  738

seq1  CCTCTCATTTTGATTGCTGCATTTCAATGATGTGTTGGTGTCTTGAGATG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCATTTTGATTGCTGCATTTCAATGATGTGTTGGTGTCTTGAGATG  788

seq1  AATTCTCCTCTATGAAAGATGTAGATGAATCTATGGTTGGCAAGGAACCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTCCTCTATGAAAGATGTAGATGAATCTATGGTTGGCAAGGAACCC  838

seq1  TTGCTCCCAAGTGACATGCAGGAATCAACAGAGTCTTTGTTATTTTGGGG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCCAAGTGACATGCAGGAATCAACAGAGTCTTTGTTATTTTGGGG  888

seq1  GTCTATATTTTTCTCTGTTTCATTTTTCTCAAAAGAGGTGGTTTCTCCTA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATATTTTTCTCTGTTTCATTTTTCTCAAAAGAGGTGGTTTCTCCTA  938

seq1  TTTTTTTGAATTC  959
      |||||||||||||
seq2  TTTTTTTGAATTC  951

seq1: chr3_74741025_74741969
seq2: B6Ng01-050A11.g_69_1007

seq1  GAATTCAAGGAGAAGGAGACATTTATGCATAGCTAGTGCGAATCTAACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAGAAGGAGACATTTATGCATAGCTAGTGCGAATCTAACTA  50

seq1  GTTCAGCCTTGTGGAAATCAGCATGAAGGTTCACCCAAACAATAAACGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGCCTTGTGGAAATCAGCATGAAGGTTCACCCAAACAATAAACGTG  100

seq1  AAATCAATCAAACAAACAAACCCCCAAACAAACAAACAAATAGCAAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAATCAAACAAACAAACCCCCAAACAAACAAACAAATAGCAAATTA  150

seq1  ACAATTAACCATATGTACCACTCATGAGTATTTATCTAAAGAATATTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTAACCATATGTACCACTCATGAGTATTTATCTAAAGAATATTAAT  200

seq1  TCAACATATTGCAGATACTTGCACAGTGACACTAATTGCAGCAATGTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACATATTGCAGATACTTGCACAGTGACACTAATTGCAGCAATGTTCA  250

seq1  TAATAGCTAAATTACAAGGCCAATATAAGTATATGTCAACAGAAGATTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGCTAAATTACAAGGCCAATATAAGTATATGTCAACAGAAGATTGA  300

seq1  ATAAAGGAAATAAATTATAGATCAATGATATCATTATAGTAAACAAATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGGAAATAAATTATAGATCAATGATATCATTATAGTAAACAAATCA  350

seq1  GATCACATTCATATGGACATAATTGTATATTTTCTCTTGTCTATAAACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACATTCATATGGACATAATTGTATATTTTCTCTTGTCTATAAACCT  400

seq1  TTGATTATATATAGATACATGAATTAGTATGTCCACCTTTATGGAAAAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTATATATAGATACATGAATTAGTATGTCCACCTTTATGGAAAAGT  450

seq1  ACACAAATTGATGCTATGGAAACCTTGCTCCCCAATATAACTGGCCAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAATTGATGCTATGGAAACCTTGCTCCCCAATATAACTGGCCAATA  500

seq1  GAAGTCTAGATGAGCTGGGCATCGTGGCGCCCACCTTTAATTTCAGCACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTAGATGAGCTGGGCATCGTGGCGCCCACCTTTAATTTCAGCACT  550

seq1  CGGGAGGCAGAGGCAGGCAGTTTTCTGAATTCGAGGCCAGCCTGGTCTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGAGGCAGAGGCAGGCAGTTTTCTGAATTCGAGGCCAGCCTGGTCTAC  600

seq1  AAAGTGAGTTCCGGGACATCCAGGGCAATACAGAGAAACCCTGTCTTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAGTTCCGGGACATCCAGGGCAATACAGAGAAACCCTGTCTTGAA  650

seq1  AAAAAAAAAAAATGAAGTTTAGAGCCTGTGATTGGGCATTAGAAATAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAATGAAGTTTAGAGCCTGTGATTGGGCATTAGAAATAGAA  700

seq1  AGGTGGAACTTGAGGATTGAGTGAAGGGCCTCAGGAGAGACCAAAGAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGGTGGAACTTGAGGATTGAGTGAAGGGCCTCA-GAGAGACCAAAGAGGA  749

seq1  GAAGCAGAAAGGATAGAGTGAGACCACCATGAGAGGAGATAGACCAGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAGAAAGGATAGAGTGAGACCACCATGAGAGGAGATAGACCAGGAA  799

seq1  TGAGCACAT-GGCCAGGAATCACAGCAAGCAACATAGGACATATGGATGA  849
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGAGCACATGGGCCAGGAATCACAGCAAGCAACATAGGACATATGGATG-  848

seq1  AAAATGTGTTAGAATAGCTCCAACCTTGCACGATCTGGGCTGATAACTTG  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTG-TAGAATAGCTCCAACCTTGCACGATCTGGGCTGATAACTTG  897

seq1  TATCTCGCCTGAGCTAGTATCTCACCAGCAAGAATTCACTCAGACA  945
      ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||
seq2  TATCTCG-CTGAGCTAGTATCTCA-CAGCA--GATTCACTCAGACA  939