BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054P18
Chromosome3 (Build37)
Map Location 60,700,336 - 60,854,341
singlet/doubletdoublet
Overlap geneP2ry1
Upstream geneC130079G13Rik, LOC676914, Aadacl2, Aadac, Sucnr1, LOC669823, LOC100040485, Mbnl1, LOC676933, LOC100040501, EG666853
Downstream geneRap2b, LOC666891, LOC669910
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054P18.bB6Ng01-054P18.g
ACCDH877578DH877579
length1,168790
definitionDH877578|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054P18, 5' end.DH877579|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054P18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,853,149 - 60,854,341)(60,700,336 - 60,701,124)
sequence
gaattcacagcgcattccactcagtaaacttaactcagacacaaataaca
gcatctctcattctttgtgcactggcttctgcttatagtgcctccactgt
agttgtctccttctgttctacagcataattattaactgttacccagttag
tagccgatatattatcttcagttgatgggtctttctctctggactgcgta
ggaattagagactttcacacagtacagcactgtgcttggatccatgccca
aatattctggtttaattagtttacaacatggatgactattgagactatat
aaaaatctcttagtgcatgcatatgagaagctagctcagaactgagaaca
cagcttggagttctctctgatgagtcaaactcctggcaaatgtttagaac
tcctattgtgttcagcatctgaaggtacttctcatatgtatgaatatacc
atgggcagtcaggtataaaattgccttacattggttggacatattaaaaa
tctgattgtttattattacttccaaaataatgctaaacttgaacttgaca
catcatgaaggaaggagaaattcaatactgcttattcttactcttttaac
tttatatttgaatagtgatacaggaaactagaacctagagcccttgctcc
ttcattcttgtctttaggatctgagatgctcagtgtttctatctaagtct
gatatgatattgtgtgtgaagaaatgataattttcctatgtgtacctttt
atgtgaactccacagtcagagcttttaatgcatggcctcagtgaacacag
tgcattccataacatttgagactgtaacattgaggatacaaacgtagata
agtatattttctatctgcctatcaagtcctactttagggtctggtggaaa
actgtcaaagatgaacaaatataattgcttgccttattgtactcttaaat
atggagagagaacagtctattttcagtctttcatattggaaacaaagtag
aataattttgtaatatatacttatgacactacaaaacagtttattttagt
aaatgtcgagtttgggggatgtatatgttgagaaaactatagaacatggt
gatatctatgttgtaatcagccaatactgtctccttgtcaacttacaatt
ggcacactctaaagagtc
gaattcactcttgtgtaattcactttgtaaatggttcataggcaacacta
attcactatggaaaaatccaagtttactgaaatgcaatggcttattctat
taggccactgaaatgactaactttaatactcagcttgctataatgcagaa
tcaccaaggtgaaaatctcaatgaaggattgtatccattgggttgaccta
tggacatgtctcaggacaatggtgtattatcttcattaagttagttgatg
ttgaaagatgaagttcatagtgaatggcaccacagacatgcatttccaaa
taggatcagagtagagaatgatgtcaagcagaaacaagcaagcaatgaag
catgtttgcaatatttctgtctgtcctgggtatggatggatgtgatcagc
ttttagtctcctgactctgtgactttaccatagggacgtatattagggta
ttttatcatatcataaatgaacctagaacaggcattatgccctcatgttt
ctaccaccacttaagagacctcgcctcctactttcatctctttaggggtt
tggttgatgactcaatgaaacagcatgcagattcattctataaaattaag
ttgagaataacattaaagagaaagattacgttaggctacatgacgaaaaa
gaacttccattaattaatcaataataattaaaacaacacattttaaacat
ctttgtgcacatttttattgtgtttagttcttcatgtaaatgtcataaat
gtcacactttggaagtgcctagctcttggggggggggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_60853149_60854341
seq2: B6Ng01-054P18.b_50_1217 (reverse)

seq1  GACTCTTTAGAGTGTGCACATTGTAAAAGGTATGGACAAGAGACGACAGT  50
      |||||||||||||||||  |||||||      | |||||| || ||||| 
seq2  GACTCTTTAGAGTGTGCCAATTGTAA-----GTTGACAAG-GA-GACAG-  42

seq1  TATTTGCTTGATGTACAACATTAGATATACACATGTTCCTTATAGTTTTC  100
      |||| || |||| ||||||| |||||||   |||||||  ||||||||||
seq2  TATTGGC-TGAT-TACAACA-TAGATATCACCATGTTC--TATAGTTTTC  87

seq1  TCAACATTAATTACATCCCCCAAACTTCGACATTTTACTAAAAATTAAAC  150
      |||||||    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||
seq2  TCAACAT---ATACATCCCCCAAAC-TCGACA-TTTACTAAAA--TAAAC  130

seq1  TGTTTTGTAGTGTCATAGGTATTATATTACAATATTAATTTCTACTTTGT  200
      ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||
seq2  TGTTTTGTAGTGTCATAAGTA-TATATTACAAAATTA--TTCTACTTTGT  177

seq1  TTCCAAATATTGAAAGACTGAAAATAGACTGTTCTCTCTCCATATTTTAA  250
      |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTCC-AATA-TGAAAGACTGAAAATAGACTGTTCTCTCTCCATA-TTTAA  224

seq1  GAGTACAATAAGGCAAGCAATTATATTTGTTCATCTTTGACAGTTTTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTACAATAAGGCAAGCAATTATATTTGTTCATCTTTGACAGTTTTCCA  274

seq1  CCAGACCCTAAAGTAGGACTTGATAGGCAGATAGAAAATATACTTATCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACCCTAAAGTAGGACTTGATAGGCAGATAGAAAATATACTTATCTA  324

seq1  CGTTTGTATCCTCAATGTTACAGTCTCAAATGTTATGGAATGCACTGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTGTATCCTCAATGTTACAGTCTCAAATGTTATGGAATGCACTGTGT  374

seq1  TCACTGAGGCCATGCATTAAAAGCTCTGACTGTGGAGTTCACAT-AAAGG  449
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCACTGAGGCCATGCATTAAAAGCTCTGACTGTGGAGTTCACATAAAAGG  424

seq1  TACACATAGGAAAATTATCATTTCTTCACACACAATATCATATCAGACTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATAGGAAAATTATCATTTCTTCACACACAATATCATATCAGACTT  474

seq1  AGATAGAAACACTGAGCATCTCAGATCCTAAAGACAAGAATGAAGGAGCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGAAACACTGAGCATCTCAGATCCTAAAGACAAGAATGAAGGAGCA  524

seq1  AGGGCTCTAGGTTCTAGTTTCCTGTATCACTATTCAAATATAAAGTTAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTCTAGGTTCTAGTTTCCTGTATCACTATTCAAATATAAAGTTAAA  574

seq1  AGAGTAAGAATAAGCAGTATTGAATTTCTCCTTCCTTCATGATGTGTCAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAAGAATAAGCAGTATTGAATTTCTCCTTCCTTCATGATGTGTCAA  624

seq1  GTTCAAGTTTAGCATTATTTTGGAAGTAATAATAAACAATCAGATTTTTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGTTTAGCATTATTTTGGAAGTAATAATAAACAATCAGATTTTTA  674

seq1  ATATGTCCAACCAATGTAAGGCAATTTTATACCTGACTGCCCATGGTATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTCCAACCAATGTAAGGCAATTTTATACCTGACTGCCCATGGTATA  724

seq1  TTCATACATATGAGAAGTACCTTCAGATGCTGAACACAATAGGAGTTCTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATACATATGAGAAGTACCTTCAGATGCTGAACACAATAGGAGTTCTA  774

seq1  AACATTTGCCAGGAGTTTGACTCATCAGAGAGAACTCCAAGCTGTGTTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTGCCAGGAGTTTGACTCATCAGAGAGAACTCCAAGCTGTGTTCT  824

seq1  CAGTTCTGAGCTAGCTTCTCATATGCATGCACTAAGAGATTTTTATATAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCTGAGCTAGCTTCTCATATGCATGCACTAAGAGATTTTTATATAG  874

seq1  TCTCAATAGTCATCCATGTTGTAAACTAATTAAACCAGAATATTTGGGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAATAGTCATCCATGTTGTAAACTAATTAAACCAGAATATTTGGGCA  924

seq1  TGGATCCAAGCACAGTGCTGTACTGTGTGAAAGTCTCTAATTCCTACGCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCAAGCACAGTGCTGTACTGTGTGAAAGTCTCTAATTCCTACGCA  974

seq1  GTCCAGAGAGAAAGACCCATCAACTGAAGATAATATATCGGCTACTAACT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGAGAGAAAGACCCATCAACTGAAGATAATATATCGGCTACTAACT  1024

seq1  GGGTAACAGTTAATAATTATGCTGTAGAACAGAAGGAGACAACTACAGTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAACAGTTAATAATTATGCTGTAGAACAGAAGGAGACAACTACAGTG  1074

seq1  GAGGCACTATAAGCAGAAGCCAGTGCACAAAGAATGAGAGATGCTGTTAT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCACTATAAGCAGAAGCCAGTGCACAAAGAATGAGAGATGCTGTTAT  1124

seq1  TTGTGTCTGAGTTAAGTTTACTGAGTGGAATGCGCTGTGAATTC  1193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCTGAGTTAAGTTTACTGAGTGGAATGCGCTGTGAATTC  1168

seq1: chr3_60700336_60701124
seq2: B6Ng01-054P18.g_66_855

seq1  GAATTCACTCTTGTGTAATTCACTTTGTAAATGGTTCATAGGCAACACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTTGTGTAATTCACTTTGTAAATGGTTCATAGGCAACACTA  50

seq1  ATTCACTATGGAAAAATCCAAGTTTACTGAAATGCAATGGCTTATTCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTATGGAAAAATCCAAGTTTACTGAAATGCAATGGCTTATTCTAT  100

seq1  TAGGCCACTGAAATGACTAACTTTAATACTCAGCTTGCTATAATGCAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCCACTGAAATGACTAACTTTAATACTCAGCTTGCTATAATGCAGAA  150

seq1  TCACCAAGGTGAAAATCTCAATGAAGGATTGTATCCATTGGGTTGACCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAGGTGAAAATCTCAATGAAGGATTGTATCCATTGGGTTGACCTA  200

seq1  TGGACATGTCTCAGGACAATGGTGTATTATCTTCATTAAGTTAGTTGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACATGTCTCAGGACAATGGTGTATTATCTTCATTAAGTTAGTTGATG  250

seq1  TTGAAAGATGAAGTTCATAGTGAATGGCACCACAGACATGCATTTCCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAGATGAAGTTCATAGTGAATGGCACCACAGACATGCATTTCCAAA  300

seq1  TAGGATCAGAGTAGAGAATGATGTCAAGCAGAAACAAGCAAGCAATGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATCAGAGTAGAGAATGATGTCAAGCAGAAACAAGCAAGCAATGAAG  350

seq1  CATGTTTGCAATATTTCTGTCTGTCCTGGGTATGGATGGATGTGATCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTGCAATATTTCTGTCTGTCCTGGGTATGGATGGATGTGATCAGC  400

seq1  TTTTAGTCTCCTGACTCTGTGACTTTACCATAGGGACGTATATTAGGGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGTCTCCTGACTCTGTGACTTTACCATAGGGACGTATATTAGGGTA  450

seq1  TTTTATCATATCATAAATGAACCTAGAACAGGCATTATGCCCTCATGTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATCATATCATAAATGAACCTAGAACAGGCATTATGCCCTCATGTTT  500

seq1  CTACCACCACTTAAGAGACCTCGCCTCCTACTTTCATCTCTTTAGGGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCACCACTTAAGAGACCTCGCCTCCTACTTTCATCTCTTTAGGGGTT  550

seq1  TGGTTGATGACTCAATGAAACAGCATGCAGATTCATTCTATAAAATTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGATGACTCAATGAAACAGCATGCAGATTCATTCTATAAAATTAAG  600

seq1  TTGAGAATAACATTAAAGAGAAAGATTACGTTAGGCTACATGACGAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAATAACATTAAAGAGAAAGATTACGTTAGGCTACATGACGAAAAA  650

seq1  GAACTTCCATTAATTAATCAATAATAATTAAAACAACACATTTTAAACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTCCATTAATTAATCAATAATAATTAAAACAACACATTTTAAACAT  700

seq1  CTTTGTGCACATTTTTATTGTGTTTAGTTCTTCATGTAAATGTCATAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGCACATTTTTATTGTGTTTAGTTCTTCATGTAAATGTCATAAAT  750

seq1  GTCACAC-TTGGAAGTGCCTAGCTCTTGGGGGGGGGGGGG  789
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACACTTTGGAAGTGCCTAGCTCTTGGGGGGGGGGGGG  790