seq1: chr3_6628642_6629797
seq2: B6Ng01-055O22.b_49_1172
seq1 GAATTCCAAGCAGATTGGCTGGTCTGAGTTCCAGACGGCCTATCTGGTCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCAAGCAGATTGGCTGGTCTGAGTTCCAGACGGCCTATCTGGTCT 50
seq1 CTCTCCTCTAAGTATCTTGACTTGTTTCTCCCATTCAGGAACTTCCGTTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTCCTCTAAGTATCTTGACTTGTTTCTCCCATTCAGGAACTTCCGTTG 100
seq1 GTGCCTTCATCTTGACAGCTCAGCTGACTGGTCTCCTTCCTGGTAGCAAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGCCTTCATCTTGACAGCTCAGCTGACTGGTCTCCTTCCTGGTAGCAAA 150
seq1 TTTGGTCTTTCTCTTCAAAGCAGCTTCTCCTATCTCTCTTGGTTAGGCTG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGGTCTTTCTCTTCAAAGCAGCTTCTCCTATCTCTCTTGGTTAGGCTG 200
seq1 CTATTCCAGTCTCTGCTACTTCCACTGATTCTTTTTAGAATTTCCTGAAA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTATTCCAGTCTCTGCTACTTCCACTGATTCTTTTTAGAATTTCCTGAAA 250
seq1 CTTAATAAACATTGCTAAGAACTTGTGTCTTAAAGGAACTGGACTTCAGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTAATAAACATTGCTAAGAACTTGTGTCTTAAAGGAACTGGACTTCAGA 300
seq1 GGAAATTGCCACCATACTGAGTAATGTGAATCAGACCATATAGGTCTTCA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAAATTGCCACCATACTGAGTAATGTGAATCAGACCATATAGGTCTTCA 350
seq1 GTTATATCTGTATTGCCATCAAAATCATCTTTTATTCCTATGAGGAAGCC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTATATCTGTATTGCCATCAAAATCATCTTTTATTCCTATGAGGAAGCC 400
seq1 TCAGGGTTTTAGTGAGACTCTGTTCTGATAACTTCATTTTGCTTCATATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAGGGTTTTAGTGAGACTCTGTTCTGATAACTTCATTTTGCTTCATATT 450
seq1 CAAACAGAGGCTTTAGGTGAGGATAAAGCTTGGGCTGGAGTTGGATATAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAACAGAGGCTTTAGGTGAGGATAAAGCTTGGGCTGGAGTTGGATATAA 500
seq1 TTCTTTTTTAAATTTTTTAGCTTAAACTAGGAGGAAACCTCATCTGGCTA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTTTTTTAAATTTTTTAGCTTAAACTAGGAGGAAACCTCATCTGGCTA 550
seq1 TGGTGTGGTAAATGTATTTCCCTTGAACACAAACTTAAGATGAGTGAGTG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTGTGGTAAATGTATTTCCCTTGAACACAAACTTAAGATGAGTGAGTG 600
seq1 CTTTAGAATGGATTCTGTTGGTTTGGGTGTTTATTTGTTTATTTGTTGTT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTAGAATGGATTCTGTTGGTTTGGGTGTTTATTTGTTTATTTGTTGTT 650
seq1 CTTTGCCTCCTCTCTGCTAGAGCATGGGTAGAATTTTCTTTTGGCTTCAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTGCCTCCTCTCTGCTAGAGCATGGGTAGAATTTTCTTTTGGCTTCAG 700
seq1 AATGAGAAGGACCCAGTAGCAATCCTAGAATTGAAATTCAGGTAAATTTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGAGAAGGACCCAGTAGCAATCCTAGAATTGAAATTCAGGTAAATTTG 750
seq1 AGTATCTTTACTATGGCTACGTTCTCCAGGTTCCACATACCAGGTTTCCA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTATCTTTACTATGGCTACGTTCTCCAGGTTCCACATACCAGGTTTCCA 800
seq1 GGAATGGCTCCAAGCAGGGAGGTTCTACTAACAGCTTCCTCTTCTAAAAA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2 GGAATGGCTCCAAGCAGGGAGGTTCTACTAACAGCTTCCTCTTCT--AAA 848
seq1 AGAAAAGAAAAGAAAAAACAAACAAAAAACAAACAAACAAACAAAAAACC 900
||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||
seq2 AGAAA--GAAAGAAAAA--CAACAAAAA------CAACAACAACAAAACC 888
seq1 TGCTTTCTGCCTATTTTTGCTATACCATATGCAGAAGTTTGTACTGTGAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 TGCTTTCTGCCTATTTTTGCTATACCATATGCAGA--GTTGTACTGTGAT 936
seq1 CTGTATCCTCTGATGACTTTAACAATATTTTGTTAATGTCTTACTCTGCT 1000
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2 CTGTATCCTCTGATGACTTTAACAATATTT--GTAATGTCTTACTCTGCT 984
seq1 TAGCTTTTTTACTTATTGTTAACACGTGTTTCTTTTGTCCCCATGTCCAT 1050
|||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||
seq2 TAGC-TTTTTACT--ATGT--ACACGTGTTT-TTTTGTCCCCATGTCCAT 1028
seq1 GTGTCACACCACAAAC-TAGAATTCAAAAATGAAAGTTTTGAGATGAAAG 1099
|||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||
seq2 GTGTCAACCCCCAAACTTAGAAT--CAAAATGAA--GTTTGAGATGAAAG 1074
seq1 AAAAAATTTCAAATTTTCTCAGGCTGGACCAATATAATTGTCCAGAATAT 1149
|||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||| | |||||
seq2 AAAA---TTCAAATTCGTACA-GCTTGACCAATATAA-TGTCGA-AATAT 1118
seq1 CAAGAAT 1156
| |||||
seq2 C-AGAAT 1124
| seq1: chr3_6802535_6802744
seq2: B6Ng01-055O22.g_74_283 (reverse)
seq1 TAAAGTATCTGAAACTATATCAGAGTTTAGACTTTTTCATACAGAAATTG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAAAGTATCTGAAACTATATCAGAGTTTAGACTTTTTCATACAGAAATTG 50
seq1 ATGAGAGAGAGAAAATAACAGAGGCAGGGCTATTTGGTACTTGACTGTGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGAGAGAGAGAAAATAACAGAGGCAGGGCTATTTGGTACTTGACTGTGT 100
seq1 TCTCTCTCTAGCCAGATTTCAGTAAGACTGGAGTGAAGCGAAGGACGGAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTCTCTCTAGCCAGATTTCAGTAAGACTGGAGTGAAGCGAAGGACGGAC 150
seq1 ACACACACACACACACACAAACACACCTCCTGTCCCTCCTGCAGTGGTGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACACACACACACACACAAACACACCTCCTGTCCCTCCTGCAGTGGTGA 200
seq1 TAAGGTGTCT 210
||||||||||
seq2 TAAGGTGTCT 210
|
