BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074L03
Chromosome3 (Build37)
Map Location 119,519,851 - 119,661,896
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074L03.bB6Ng01-074L03.g
ACCDH891467DH891468
length9911,125
definitionDH891467|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074L03, 5' end.DH891468|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074L03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,660,906 - 119,661,896)(119,519,851 - 119,520,976)
sequence
gaattcctgtcacttcataaatatccctaggcgtgttgaaaggcagccac
catctggctgtgctgaggcccatcaacaaacagcctcagaactattcaaa
tcatgtatatttaataacaacaattcgtccaccttcctagtccttctggg
ccacacttgctttggttcttttagctattgatgctactctgtttgtttat
ttgttcttggacaagcacatggtgtaggtagctcatcatctgaaatatgt
ctgcagataatctcagtgttggaactagggagatggttcctagggcaaag
tgcagcttatcaagaggaaagaattccttgttaatttggattgcccacac
ccaaataaaagctgggcatgatgtgtgttcccataacctcagtgctggag
gacagaagcagacagatctctggggctcactgaacagccagtctatctaa
attgaacttttgattcagtgaaagattctatctcagaaaataaggtgaag
gatttggagagatcgtttaatggttaagaacatatgatgctctgactcag
aaactgggttcattgcccagtgcccatatcaggcgcctcataacggccag
aaactctagtttcagttaatcatacactttcttctagcatcaatagggtc
ccacactcacatacactacacacacacacacacacacacacacacacact
tagaaacaaactaaaactagattgatcatggtggctcatgtctttaatcc
cagcactgaagaagcagggtctggaagtttgagaccagcctcatctatat
agcaagttttaaactgtcaagggctatgtactaagaccctgtctcataaa
atcacaatcttttaaaacactggaaaggactagaagaatgatttgcagcg
accactggcttccacatgctcatacatgcacaagtaagtacacagacatc
acattagcaaacacagatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattctataaaagattacatgatcctcaaatcctctcctggtttgaact
atttgtgatctttagggatggctggagaacagaaactaagacggggatag
aaatgcaagggatttattgggaaaagtgcttgtggaaggcataggagaag
gagcctaaggaactggaaacagcattcacacactgtgtggtataggcctg
gtatccaggagggagaagaggaagagggaggtagtaggaacagtatagac
tgaggcccagttagtttaggttaggtcaacagaatccctatgaaaaagcc
attcatttaaacagtgccctgccttatagcacaagctcatcaccctaaac
acacagcacatttccacaagtacatccacaaaccttcatagaccatccca
aaggctgcaggaaaggctgcttcatgatatctctgtataaaataccttgc
agagaccccaaccttaaagggattcctgacttgtgcgttaatgacaaatg
aatagtttaaaagaccagtggtagcgaggaatgaaatgattgtccacaaa
atacatcaggacaaattcaaattgctttgcctacattaatttggggctag
ttgtggctacaggagactttatttaaaaaaagcataacaaaaaacaacct
caaaacaccaaaatattaccgtacatgaatagactatggcctttggcaac
tgtgatgcataaagcaggctcaacagttaaagcaaatgtcaatccactgt
cgtggagcagggaatgaaagggctattcgcatatgtgggaaaataaggta
cacagtcttaattttgttgtgaatctaaaactgctaaaaaaaaaacagtc
ttaaaactaagtaaaatgataacatttccctttagtagtggtaaaataag
agattaatttctagtgaataatttgaaggggttgcatgttgtattcgcca
tattgagagtttccaagcatatactaagaaattggaaatcattgtcactt
ttggagatcaattactagatattctttattcaatggtcccaatttttggg
aaatgaatttctttttatttaattatgcatatgtggtctcctcttatgaa
tgaatgggtgggccatgtacacgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_119660906_119661896
seq2: B6Ng01-074L03.b_45_1035 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACAGATCTGTGTTTGCTAATGTGATGTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACAGATCTGTGTTTGCTAATGTGATGTCTGT  50

seq1  GTACTTACTTGTGCATGTATGAGCATGTGGAAGCCAGTGGTCGCTGCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTACTTGTGCATGTATGAGCATGTGGAAGCCAGTGGTCGCTGCAAA  100

seq1  TCATTCTTCTAGTCCTTTCCAGTGTTTTAAAAGATTGTGATTTTATGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTTCTAGTCCTTTCCAGTGTTTTAAAAGATTGTGATTTTATGAGA  150

seq1  CAGGGTCTTAGTACATAGCCCTTGACAGTTTAAAACTTGCTATATAGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTCTTAGTACATAGCCCTTGACAGTTTAAAACTTGCTATATAGATG  200

seq1  AGGCTGGTCTCAAACTTCCAGACCCTGCTTCTTCAGTGCTGGGATTAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGTCTCAAACTTCCAGACCCTGCTTCTTCAGTGCTGGGATTAAAG  250

seq1  ACATGAGCCACCATGATCAATCTAGTTTTAGTTTGTTTCTAAGTGTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGCCACCATGATCAATCTAGTTTTAGTTTGTTTCTAAGTGTGTGT  300

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTATGTGAGTGTGGGACCCTATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTATGTGAGTGTGGGACCCTATT  350

seq1  GATGCTAGAAGAAAGTGTATGATTAACTGAAACTAGAGTTTCTGGCCGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTAGAAGAAAGTGTATGATTAACTGAAACTAGAGTTTCTGGCCGTT  400

seq1  ATGAGGCGCCTGATATGGGCACTGGGCAATGAACCCAGTTTCTGAGTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGCGCCTGATATGGGCACTGGGCAATGAACCCAGTTTCTGAGTCAG  450

seq1  AGCATCATATGTTCTTAACCATTAAACGATCTCTCCAAATCCTTCACCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCATATGTTCTTAACCATTAAACGATCTCTCCAAATCCTTCACCTT  500

seq1  ATTTTCTGAGATAGAATCTTTCACTGAATCAAAAGTTCAATTTAGATAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTGAGATAGAATCTTTCACTGAATCAAAAGTTCAATTTAGATAGA  550

seq1  CTGGCTGTTCAGTGAGCCCCAGAGATCTGTCTGCTTCTGTCCTCCAGCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGTTCAGTGAGCCCCAGAGATCTGTCTGCTTCTGTCCTCCAGCAC  600

seq1  TGAGGTTATGGGAACACACATCATGCCCAGCTTTTATTTGGGTGTGGGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTTATGGGAACACACATCATGCCCAGCTTTTATTTGGGTGTGGGCA  650

seq1  ATCCAAATTAACAAGGAATTCTTTCCTCTTGATAAGCTGCACTTTGCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAATTAACAAGGAATTCTTTCCTCTTGATAAGCTGCACTTTGCCCT  700

seq1  AGGAACCATCTCCCTAGTTCCAACACTGAGATTATCTGCAGACATATTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACCATCTCCCTAGTTCCAACACTGAGATTATCTGCAGACATATTTC  750

seq1  AGATGATGAGCTACCTACACCATGTGCTTGTCCAAGAACAAATAAACAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGATGAGCTACCTACACCATGTGCTTGTCCAAGAACAAATAAACAAA  800

seq1  CAGAGTAGCATCAATAGCTAAAAGAACCAAAGCAAGTGTGGCCCAGAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTAGCATCAATAGCTAAAAGAACCAAAGCAAGTGTGGCCCAGAAGG  850

seq1  ACTAGGAAGGTGGACGAATTGTTGTTATTAAATATACATGATTTGAATAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGAAGGTGGACGAATTGTTGTTATTAAATATACATGATTTGAATAG  900

seq1  TTCTGAGGCTGTTTGTTGATGGGCCTCAGCACAGCCAGATGGTGGCTGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGGCTGTTTGTTGATGGGCCTCAGCACAGCCAGATGGTGGCTGCC  950

seq1  TTTCAACACGCCTAGGGATATTTATGAAGTGACAGGAATTC  991
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACACGCCTAGGGATATTTATGAAGTGACAGGAATTC  991

seq1: chr3_119519851_119520976
seq2: B6Ng01-074L03.g_67_1191

seq1  GAATTCTATAAAAGATTACATGATCCTCAAATCCTCTCCTGGTTTGAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATAAAAGATTACATGATCCTCAAATCCTCTCCTGGTTTGAACT  50

seq1  ATTTGTGATCTTTAGGGATGGCTGGAGAACAGAAACTAAGACGGGGATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGATCTTTAGGGATGGCTGGAGAACAGAAACTAAGACGGGGATAG  100

seq1  AAATGCAAGGGATTTATTGGGAAAAGTGCTTGTGGAAGGCATAGGAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAAGGGATTTATTGGGAAAAGTGCTTGTGGAAGGCATAGGAGAAG  150

seq1  GAGCCTAAGGAACTGGAAACAGCATTCACACACTGTGTGGTATAGGCCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTAAGGAACTGGAAACAGCATTCACACACTGTGTGGTATAGGCCTG  200

seq1  GTATCCAGGAGGGAGAAGAGGAAGAGGGAGGTAGTAGGAACAGTATAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCAGGAGGGAGAAGAGGAAGAGGGAGGTAGTAGGAACAGTATAGAC  250

seq1  TGAGGCCCAGTTAGTTTAGGTTAGGTCAACAGAATCCCTATGAAAAAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCCCAGTTAGTTTAGGTTAGGTCAACAGAATCCCTATGAAAAAGCC  300

seq1  ATTCATTTAAACAGTGCCCTGCCTTATAGCACAAGCTCATCACCCTAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTAAACAGTGCCCTGCCTTATAGCACAAGCTCATCACCCTAAAC  350

seq1  ACACAGCACATTTCCACAAGTACATCCACAAACCTTCATAGACCATCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCACATTTCCACAAGTACATCCACAAACCTTCATAGACCATCCCA  400

seq1  AAGGCTGCAGGAAAGGCTGCTTCATGATATCTCTGTATAAAATACCTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTGCAGGAAAGGCTGCTTCATGATATCTCTGTATAAAATACCTTGC  450

seq1  AGAGACCCCAACCTTAAAGGGATTCCTGACTTGTGCGTTAATGACAAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCCCAACCTTAAAGGGATTCCTGACTTGTGCGTTAATGACAAATG  500

seq1  AATAGTTTAAAAGACCAGTGGTAGCGAGGAATGAAATGATTGTCCACAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTTTAAAAGACCAGTGGTAGCGAGGAATGAAATGATTGTCCACAAA  550

seq1  ATACATCAGGACAAATTCAAATTGCTTTGCCTACATTAATTTGGGGCTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATCAGGACAAATTCAAATTGCTTTGCCTACATTAATTTGGGGCTAG  600

seq1  TTGTGGCTACAGGAGACTTTATTTAAAAAAAGCATAACAAAAAACAACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGCTACAGGAGACTTTATTTAAAAAAAGCATAACAAAAAACAACCT  650

seq1  CAAAACACCAAAATATTACCGTACATGAATAGACTATGGCCTTTGGCAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACACCAAAATATTACCGTACATGAATAGACTATGGCCTTTGGCAAC  700

seq1  TGTGATGCATAAAGCAGGCTCAACAGTTAAAGCAAATGTCAATCCACTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGCATAAAGCAGGCTCAACAGTTAAAGCAAATGTCAATCCACTGT  750

seq1  CGTGGAGCAGGGAATGAAAGGGCTATTCGCATATGTGGGAAAATAAGGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGAGCAGGGAATGAAAGGGCTATTCGCATATGTGGGAAAATAAGGTA  800

seq1  CACAGTCTTAATTTTGTTGTGAATCTAAAACTGCTAAAAAAAAAAACAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CACAGTCTTAATTTTGTTGTGAATCTAAAACTGCT-AAAAAAAAAACAGT  849

seq1  CTTAAAACTAAGTAAAATGATAACATTTCCCTTTAGTAGTGGTAAAATAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAACTAAGTAAAATGATAACATTTCCCTTTAGTAGTGGTAAAATAA  899

seq1  GAGATTAATTTCTAGTGAATAATTTGAAGGTGGTTGCATGTTGTATTCGC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAGATTAATTTCTAGTGAATAATTTGAAGG-GGTTGCATGTTGTATTCGC  948

seq1  CATATTGAGAGTTTCCAAGCATATACTAAGAAAATTGGAAAATCATTGTC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  CATATTGAGAGTTTCCAAGCATATACTAAG-AAATTGG-AAATCATTGTC  996

seq1  ACTTTT-GAGATCAATTACTAGATTATTCTTTATTCAAT-GTCCCAATTT  1048
      |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ACTTTTGGAGATCAATTACTAGA-TATTCTTTATTCAATGGTCCCAATTT  1045

seq1  TTGGAAAATG-ATTTCTTTTATTTTTAATTATGCATATGT-GTCTCTCTT  1096
      |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||   |
seq2  TTGGGAAATGAATTTCTTTT-TATTTAATTATGCATATGTGGTCTCCTCT  1094

seq1  TATGTATGTATGTGTGGG-CATGTACACGTG  1126
      |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||
seq2  TATGAATGAATGGGTGGGCCATGTACACGTG  1125