BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-083G02
Chromosome3 (Build37)
Map Location 11,845,635 - 11,991,329
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383826, EG667978, LOC667999
Downstream geneEG621965, LOC100039798, EG668033, LOC668037
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-083G02.bB6Ng01-083G02.g
ACCDH897660DH897661
length1,119582
definitionDH897660|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083G02, 5' end.DH897661|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083G02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,845,635 - 11,846,757)(11,990,748 - 11,991,329)
sequence
gaattctccacagcaacatctgtgggactctcctctacttaacatgtaac
ttaattccctattttcaaaaccatctgacagctcagaaaatgttccaagt
ggggtgtaagtgtacatagcttaaatacaagacataatggtgtatagaaa
taagttactctcattttaagaatttgtttctctccatggtactaaggtaa
acaagtgggaagtgtgttgacttttcaaaatggagtttatgcagtatcac
taggaatagtaatgcaagaatctttaattggttactataatgcctctcaa
aatacaagaaaataaattaaaatgaaaacaaatgcatggatcaaattttc
tatctcatccaacacaaattatcatgaaataatttatcatatacatgaca
ttaaatatagtttattagtgccattatacatgtattattgggttgaaatt
ttaaatagagcattaacctaaaagcataaaaaataaaaatttagaactga
ctgctagctctatgaggttttctaaccttttacaagctgtagcatttttc
agggtactctctagtctatgcacactggactgatgaacttaggaagctgt
tttagaattctaaggaccaggggagaaacattcaaagaaccatattagtt
gttcttgtacctggcaagcatttcttcatggagaggttgcacagtttaat
atatattaatatatatgttatatatatatttatgtatataaatatatata
tatatacaatttgcacatacatcatgatcatatgacattaccagattcaa
gaaatggcagaatcttaatatttgtaactctagccacgatttcacaacta
gcatcaatgctgaacatgcaggacattgtctctctcttttggtgaattat
agtgtaatgttataatggtataaaattcttgttttgtagtcatgggaaac
caatgttatcatgttaccctcccagcacttgtcttttatagactagacaa
catttcagatacactatccatgataaacctgatacatttgtgctcttgat
actcctttagctaacagtttcagtgattatggaatattcttaaatagtgc
cagaaatttatgaaaaaaa
gaattcaataaaagtaagttaaaaaaaaggatataaatttgaggggttgg
gggcaaaggagttggagtggactgtaagagaggtggaaaggataggaaag
gatataagtatgatactcatttatgaaattatcaaaaaaagaatgatagt
agattttagcctaaactcttttatgtagtgacaatacaatcatggatggc
ataatgtttcattaccataattcattcatctgtgctttcttcatgtctgt
cttcctcctctcccctcccctcccttccaaccccctctcttttcctcaca
ctcttacttccatttccctactttccttttgatctttctatattggcaag
ccacagcacatgtgtggaggttagaggtcagcttgcatgagcaagttagt
tctcctcttgctccatgtgagcctttgggattccaaatcatcatctggtt
tggtgacaaactctttgaccagctgagccatatcactggcatgtattacc
ttaatttcctggcagagttaggtgaatactggccttttttgtgtttctga
gaagtctggtggtgatggtggtggtggtggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_11845635_11846757
seq2: B6Ng01-083G02.b_44_1162

seq1  GAATTCTCCACAGCAACATCTGTGGGACTCTCCTCTACTTAACATGTAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCACAGCAACATCTGTGGGACTCTCCTCTACTTAACATGTAAC  50

seq1  TTAATTCCCTATTTTCAAAACCATCTGACAGCTCAGAAAATGTTCCAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCCCTATTTTCAAAACCATCTGACAGCTCAGAAAATGTTCCAAGT  100

seq1  GGGGTGTAAGTGTACATAGCTTAAATACAAGACATAATGGTGTATAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGTAAGTGTACATAGCTTAAATACAAGACATAATGGTGTATAGAAA  150

seq1  TAAGTTACTCTCATTTTAAGAATTTGTTTCTCTCCATGGTACTAAGGTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTACTCTCATTTTAAGAATTTGTTTCTCTCCATGGTACTAAGGTAA  200

seq1  ACAAGTGGGAAGTGTGTTGACTTTTCAAAATGGAGTTTATGCAGTATCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGGGAAGTGTGTTGACTTTTCAAAATGGAGTTTATGCAGTATCAC  250

seq1  TAGGAATAGTAATGCAAGAATCTTTAATTGGTTACTATAATGCCTCTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATAGTAATGCAAGAATCTTTAATTGGTTACTATAATGCCTCTCAA  300

seq1  AATACAAGAAAATAAATTAAAATGAAAACAAATGCATGGATCAAATTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAAGAAAATAAATTAAAATGAAAACAAATGCATGGATCAAATTTTC  350

seq1  TATCTCATCCAACACAAATTATCATGAAATAATTTATCATATACATGACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCATCCAACACAAATTATCATGAAATAATTTATCATATACATGACA  400

seq1  TTAAATATAGTTTATTAGTGCCATTATACATGTATTATTGGGTTGAAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATATAGTTTATTAGTGCCATTATACATGTATTATTGGGTTGAAATT  450

seq1  TTAAATAGAGCATTAACCTAAAAGCATAAAAAATAAAAATTTAGAACTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAGAGCATTAACCTAAAAGCATAAAAAATAAAAATTTAGAACTGA  500

seq1  CTGCTAGCTCTATGAGGTTTTCTAACCTTTTACAAGCTGTAGCATTTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTAGCTCTATGAGGTTTTCTAACCTTTTACAAGCTGTAGCATTTTTC  550

seq1  AGGGTACTCTCTAGTCTATGCACACTGGACTGATGAACTTAGGAAGCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTACTCTCTAGTCTATGCACACTGGACTGATGAACTTAGGAAGCTGT  600

seq1  TTTAGAATTCTAAGGACCAGGGGAGAAACATTCAAAGAACCATATTAGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAATTCTAAGGACCAGGGGAGAAACATTCAAAGAACCATATTAGTT  650

seq1  GTTCTTGTACCTGGCAAGCATTTCTTCATGGAGAGGTTGCACAGTTTAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTTGTACCTGGCAAGCATTTCTTCATGGAGAGGTTGCACAGTTTAAT  700

seq1  ATATATTAATATATATGTTATATATATATTTATGTATATAAATATATATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTAATATATATGTTATATATATATTTATGTATATAAATATATATA  750

seq1  TATATACAATTTGCACATACATCATGATCATATGACATTACCAGATTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATACAATTTGCACATACATCATGATCATATGACATTACCAGATTCAA  800

seq1  GAAATGGCAGAATCTTAATATTTGTAACTCTAGCCACGATTTCACAACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGCAGAATCTTAATATTTGTAACTCTAGCCACGATTTCACAACTA  850

seq1  GCATCAATGCTGAACATGCAGGACATTGTCTCTCTCTTTTGGTGAATTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAATGCTGAACATGCAGGACATTGTCTCTCTCTTTTGGTGAATTAT  900

seq1  AGTGTAATGTTATAATGGTATAAAATTCTTGTTTTGTAGTCATGGGAAAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGTGTAATGTTATAATGGTATAAAATTCTTGTTTTGTAGTCATGGG-AAA  949

seq1  CCAATGTTATCATGTTACCCTCCCAGCACTTGTCTTTTATAGACTAGACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCAATGTTATCATGTTACCCTCCCAGCACTTGTCTTTTATAGACTAGAC-  998

seq1  AACATTTCAGATAACACTATCCATGATAAACCTGATACATTTGTGCTCTT  1050
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTCAGAT-ACACTATCCATGATAAACCTGATACATTTGTGCTCTT  1047

seq1  GATACT-CTTTAGCTAAACAATTTCAGTGAATTATGGTATA-TCTT-AAT  1097
      |||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||
seq2  GATACTCCTTTAGCT-AACAGTTTCAGTG-ATTATGGAATATTCTTAAAT  1095

seq1  AGTGGCACAAAAATTTATGAAAAAAA  1123
      ||||   || ||||||||||||||||
seq2  AGTG--CCAGAAATTTATGAAAAAAA  1119

seq1: chr3_11990748_11991329
seq2: B6Ng01-083G02.g_71_652 (reverse)

seq1  CACCACCACCACCACCATCACCACCAGACTTCTCAGAAACACAAAAAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACCACCACCACCATCACCACCAGACTTCTCAGAAACACAAAAAAGG  50

seq1  CCAGTATTCACCTAACTCTGCCAGGAAATTAAGGTAATACATGCCAGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTATTCACCTAACTCTGCCAGGAAATTAAGGTAATACATGCCAGTGA  100

seq1  TATGGCTCAGCTGGTCAAAGAGTTTGTCACCAAACCAGATGATGATTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTCAGCTGGTCAAAGAGTTTGTCACCAAACCAGATGATGATTTGG  150

seq1  AATCCCAAAGGCTCACATGGAGCAAGAGGAGAACTAACTTGCTCATGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCAAAGGCTCACATGGAGCAAGAGGAGAACTAACTTGCTCATGCAA  200

seq1  GCTGACCTCTAACCTCCACACATGTGCTGTGGCTTGCCAATATAGAAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACCTCTAACCTCCACACATGTGCTGTGGCTTGCCAATATAGAAAGA  250

seq1  TCAAAAGGAAAGTAGGGAAATGGAAGTAAGAGTGTGAGGAAAAGAGAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAGGAAAGTAGGGAAATGGAAGTAAGAGTGTGAGGAAAAGAGAGGG  300

seq1  GGTTGGAAGGGAGGGGAGGGGAGAGGAGGAAGACAGACATGAAGAAAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGAAGGGAGGGGAGGGGAGAGGAGGAAGACAGACATGAAGAAAGCA  350

seq1  CAGATGAATGAATTATGGTAATGAAACATTATGCCATCCATGATTGTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGAATGAATTATGGTAATGAAACATTATGCCATCCATGATTGTATT  400

seq1  GTCACTACATAAAAGAGTTTAGGCTAAAATCTACTATCATTCTTTTTTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTACATAAAAGAGTTTAGGCTAAAATCTACTATCATTCTTTTTTTG  450

seq1  ATAATTTCATAAATGAGTATCATACTTATATCCTTTCCTATCCTTTCCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTCATAAATGAGTATCATACTTATATCCTTTCCTATCCTTTCCAC  500

seq1  CTCTCTTACAGTCCACTCCAACTCCTTTGCCCCCAACCCCTCAAATTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTACAGTCCACTCCAACTCCTTTGCCCCCAACCCCTCAAATTTAT  550

seq1  ATCCTTTTTTTTAACTTACTTTTATTGAATTC  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTTTTTTAACTTACTTTTATTGAATTC  582