BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112N07
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,051,868 - 75,249,050
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpini2, Wdr49
Upstream geneLOC667434, LOC100041551, EG667459, BC050789
Downstream genePdcd10, Serpini1, Golph4, Fstl5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112N07.bB6Ng01-112N07.g
ACCDH918789DH918790
length8771,081
definitionDH918789|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112N07, 5' end.DH918790|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112N07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,248,172 - 75,249,050)(75,051,868 - 75,052,962)
sequence
gaattcatctcttattgtgacattcacaaaatgtttcaaatttttataat
acccaaataaggatcaatgtgctagaaatgtactgaaagaagttatagag
actgcttttgagttaagtgctatatgtccacacataaatgaacaaataaa
ttataatcacaaagcagtgcattctgaaatctacagcagtatttttgaaa
tttagttgattatttgagttccaatactttatggtaatatggataactaa
ggagaagtagcctgaagtatgagacttttgaaaggattaagattatatca
acaaagaatttctgcagatgagtcatgctcaaacatcttcctacctaaga
tgtactccaaattcttccttagtttcatttagacctcttaaaatcaatgt
atagcacaaaatccctatccaagagttatttgtcttcttgtctgccatat
gatattgttccataggtcagggtaaatttactgctcatcagattttcctc
atgtcattctcagctgttgtctggaaataagtcagaggagattttaccta
tgacctcagaaatcctatgtgaggttatacctctccaaatcatggtaaac
ttggaatgagcaacagaaataatatgcatatgttgtgttcatgcacttta
tatatgtttaatgatagatgaatgatcgttcatctatcatttagatagat
atttatatttatcatatatattcactcatatatcatattgaatttatgtt
agggttctctagaaaacagaataagtagaatgtgtgtacatgtataatgt
ttggagatgggcatatatgaatatatatatataatgactcacaagatacg
ctcaaaggcttaaatctaggtttgttt
gaattcattcagtatattggaaaatcagatgatttttttttgtgctcatg
agcattaacctcatatgaaaatatagttctggtttatctaaggatttaaa
gaatccatgaccggtcctccttgtttattgagcatagtaatgcaaatttc
tttaagaaatgacagaatggtaaagacacccagtgtgtcccacctaaatg
tcaaagttatggtactatgcagcactatgaattattaaggaaattattaa
cagatataattgatagtatttttcaataatactctttaaatgatgaacat
tttaaagcattaaaattcaagttatattggaaagttaaaacaaacttatg
aagaaattactcattctttttattattatttctggttgatttcaaagatt
tctatcagttgcctttgaaagtattatttacacacagcaaacatgttatt
caaaattctctttatttaatggagtgtagtagagaggttattcttaacct
tgaatgtactcacaagccacctagtgagttcagagagcctgacagagcag
gtctgcaatgagacttgtaattcctttttaaagaagtccctatgtaaagc
tcttgctgccagtctactaactgcacatgcagtattaaaggcaacttagt
gcttgctctacctggatgtatattgagattacttaagacgacttaagaaa
atcttagagcttgaacctcctctatagaaacacagattcaattattttaa
agctctgtctaggtggagatttgttaaaaaaaaaatcccaggtgactcta
atagacagctaagtatttgaacaaccactgagataataacaacaatgaaa
ttaaaagggtgatcactaagtcattttaattaagtgtaatgttaaagagg
acagtgatactgagcactcttaaccaggagattccaaagttgagttctga
catttctcccaagagcctatgtgctacttagagtgtttccaatctgcaga
tagaaaaatagcaatagtgaaggtcagtaccatcaaatcctttctttgat
ttgttaaagggaaggatgatgtacaataaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_75248172_75249050
seq2: B6Ng01-112N07.b_48_924 (reverse)

seq1  AAACAAAACCTAGAATATAAGCCTCTGAGCGTATC-TGTGAGTCA-TATA  48
      |||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||
seq2  AAAC-AAACCTAG-ATTTAAGCCTTTGAGCGTATCTTGTGAGTCATTATA  48

seq1  TATATATATTCATATTATGCCCATCTCCAAACATTATACATGTACACACA  98
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATTCATA-TATGCCCATCTCCAAACATTATACATGTACACACA  97

seq1  TTCTACTTATTCTGTTTTTCTAGAGAACCCTAATAATAGATATCAATATG  148
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||
seq2  TTCTACTTATTCTG-TTTTCTAGAGAACCCTAA-CATAAAT-TCAATATG  144

seq1  ATATATGAGTG-ATATATATGATAAATATAAATATCTATCTAAATGATAG  197
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGAGTGAATATATATGATAAATATAAATATCTATCTAAATGATAG  194

seq1  ATGAACGATCATTCATCTATCATT-AACATATAT-AAGTGCATGAACAC-  244
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| 
seq2  ATGAACGATCATTCATCTATCATTAAACATATATAAAGTGCATGAACACA  244

seq1  ACATATGCATATAATATTTCTGTTGCTCATTCCAAGTTTACAGTGATTTG  294
      ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  ACATATGCATAT--TATTTCTGTTGCTCATTCCAAGTTTACCATGATTTG  292

seq1  GAGAGGTATAACCTCACATAGGATTTCTGAGGTCATAGGTAAAATCTCCT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTATAACCTCACATAGGATTTCTGAGGTCATAGGTAAAATCTCCT  342

seq1  CTGACTTATTTCCAGACAACAGCTGAGAATGACATGAGGAAAATCTGATG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTATTTCCAGACAACAGCTGAGAATGACATGAGGAAAATCTGATG  392

seq1  AGCAGTAAATTTACCCTGACCTATGGAACAATATCATATGGCAGACAAGA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTAAATTTACCCTGACCTATGGAACAATATCATATGGCAGACAAGA  442

seq1  AGACAAATAACTCTTGGATAGGGATTTTGTGCTATACATTGATTTTAAGA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAATAACTCTTGGATAGGGATTTTGTGCTATACATTGATTTTAAGA  492

seq1  GGTCTAAATGAAACTAAGGAAGAATTTGGAGTACATCTTAGGTAGGAAGA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTAAATGAAACTAAGGAAGAATTTGGAGTACATCTTAGGTAGGAAGA  542

seq1  TGTTTGAGCATGACTCATCTGCAGAAATTCTTTGTTGATATAATCTTAAT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGAGCATGACTCATCTGCAGAAATTCTTTGTTGATATAATCTTAAT  592

seq1  CCTTTCAAAAGTCTCATACTTCAGGCTACTTCTCCTTAGTTATCCATATT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCAAAAGTCTCATACTTCAGGCTACTTCTCCTTAGTTATCCATATT  642

seq1  ACCATAAAGTATTGGAACTCAAATAATCAACTAAATTTCAAAAATACTGC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAAAGTATTGGAACTCAAATAATCAACTAAATTTCAAAAATACTGC  692

seq1  TGTAGATTTCAGAATGCACTGCTTTGTGATTATAATTTATTTGTTCATTT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGATTTCAGAATGCACTGCTTTGTGATTATAATTTATTTGTTCATTT  742

seq1  ATGTGTGGACATATAGCACTTAACTCAAAAGCAGTCTCTATAACTTCTTT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGGACATATAGCACTTAACTCAAAAGCAGTCTCTATAACTTCTTT  792

seq1  CAGTACATTTCTAGCACATTGATCCTTATTTGGGTATTATAAAAATTTGA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACATTTCTAGCACATTGATCCTTATTTGGGTATTATAAAAATTTGA  842

seq1  AACATTTTGTGAATGTCACAATAAGAGATGAATTC  879
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTGTGAATGTCACAATAAGAGATGAATTC  877

seq1: chr3_75051868_75052962
seq2: B6Ng01-112N07.g_70_1150

seq1  GAATTCATTCAGTATATTGGAAAATCAGATGATTTTTTTTTGTGCTCATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCAGTATATTGGAAAATCAGATGATTTTTTTTTGTGCTCATG  50

seq1  AGCATTAACCTCATATGAAAATATAGTTCTGGTTTATCTAAGGATTTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTAACCTCATATGAAAATATAGTTCTGGTTTATCTAAGGATTTAAA  100

seq1  GAATCCATGACCGGTCCTCCTTGTTTATTGAGCATAGTAATGCAAATTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCATGACCGGTCCTCCTTGTTTATTGAGCATAGTAATGCAAATTTC  150

seq1  TTTAAGAAATGACAGAATGGTAAAGACACCCAGTGTGTCCCACCTAAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGAAATGACAGAATGGTAAAGACACCCAGTGTGTCCCACCTAAATG  200

seq1  TCAAAGTTATGGTACTATGCAGCACTATGAATTATTAAGGAAATTATTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGTTATGGTACTATGCAGCACTATGAATTATTAAGGAAATTATTAA  250

seq1  CAGATATAATTGATAGTATTTTTCAATAATACTCTTTAAATGATGAACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATAATTGATAGTATTTTTCAATAATACTCTTTAAATGATGAACAT  300

seq1  TTTAAAGCATTAAAATTCAAGTTATATTGGAAAGTTAAAACAAACTTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGCATTAAAATTCAAGTTATATTGGAAAGTTAAAACAAACTTATG  350

seq1  AAGAAATTACTCATTCTTTTTATTATTATTTCTGGTTGATTTCAAAGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATTACTCATTCTTTTTATTATTATTTCTGGTTGATTTCAAAGATT  400

seq1  TCTATCAGTTGCCTTTGAAAGTATTATTTACACACAGCAAACATGTTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCAGTTGCCTTTGAAAGTATTATTTACACACAGCAAACATGTTATT  450

seq1  CAAAATTCTCTTTATTTAATGGAGTGTAGTAGAGAGGTTATTCTTAACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTCTCTTTATTTAATGGAGTGTAGTAGAGAGGTTATTCTTAACCT  500

seq1  TGAATGTACTCACAAGCCACCTAGTGAGTTCAGAGAGCCTGACAGAGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTACTCACAAGCCACCTAGTGAGTTCAGAGAGCCTGACAGAGCAG  550

seq1  GTCTGCAATGAGACTTGTAATTCCTTTTTAAAGAAGTCCCTATGTAAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAATGAGACTTGTAATTCCTTTTTAAAGAAGTCCCTATGTAAAGC  600

seq1  TCTTGCTGCCAGTCTACTAACTGCACATGCAGTATTAAAGGCAACTTAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCTGCCAGTCTACTAACTGCACATGCAGTATTAAAGGCAACTTAGT  650

seq1  GCTTGCTCTACCTGGATGTATATTGAGATTACTTAAGACGACTTAAGAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCTCTACCTGGATGTATATTGAGATTACTTAAGACGACTTAAGAAA  700

seq1  ATCTTAGAGCTTGAACCTCCTCTATAGAAACACAGATTCAATTATTTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTAGAGCTTGAACCTCCTCTATAGAAACACAGATTCAATTATTTTAA  750

seq1  AGCTCTGTCTAGGTGGAGATTTGTTAAAAAAAAAAATCCCAGGTGACTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGTCTAGGTGGAGATTTGTT-AAAAAAAAAATCCCAGGTGACTCT  799

seq1  AATAGACAGCTAAGTATTTGAACAACCACTGAGATAATAACAACAATGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGACAGCTAAGTATTTGAACAACCACTGAGATAATAACAACAATGAA  849

seq1  ATTAAAAAGGTGATCACTAAGTCAATTTAATTAAGTGTAATGTTAAAGAG  900
      ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAGGGTGATCACTAAGTCATTTTAATTAAGTGTAATGTTAAAGAG  899

seq1  GACAGTGATACTGAGCACTCTTAACCAGGAAGATTCCAAAGTTGAGTTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTGATACTGAGCACTCTTAACCAGG-AGATTCCAAAGTTGAGTTCT  948

seq1  GACATTTTCTCCCAAGAGCCTATGTGCTACTTAGGAGTGTTTCCAATCTG  1000
      |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GACA-TTTCTCCCAAGAGCCTATGTGCTACTTA-GAGTGTTTCCAATCTG  996

seq1  CAGATAAGAAAATAGCAATAGTTGAAGGTCAGTTACCAATCAAATCCTTT  1050
      ||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||
seq2  CAGATAGAAAAATAGCAATAG-TGAAGGTCAG-TACC-ATCAAATCCTTT  1043

seq1  TCTTTTGTATTGTGTTTAAAGGGAGAGATGGATGTACAAATAAAT  1095
         ||||  |||   |||||||||  ||| ||||||| |||||||
seq2  --CTTTGATTTG---TTAAAGGGAAGGAT-GATGTAC-AATAAAT  1081