BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-114A07
Chromosome3 (Build37)
Map Location 120,050,789 - 120,171,603
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream gene2510027J23Rik, LOC435752, Tmem56, LOC668778, LOC668780, Alg14, Ppia-ps3_1234.1, Cnn3, Slc44a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-114A07.bB6Ng01-114A07.g
ACCDH919650DH919651
length1,0061,152
definitionDH919650|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114A07, 5' end.DH919651|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-114A07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,170,598 - 120,171,603)(120,050,789 - 120,051,948)
sequence
gaattctagaagcctgagtttatctctttaaagggcattagggaaaatat
tattgtgttgacatgatatttttcccttcagaaatcttgtctgtgaccta
gacagatataacttgtaatgtgagtggtaatggaactaaatgcttaagac
cgtggtgctttttgacatggcttaatggcaaaatgtccaaagaaaatatt
ttttggtgcttttatttggggatagcttttgtctctcgtttctccaatgt
ctgagtgataaggcgtggctgctgtttttgaggtggaaagtcacccaatt
gattttgcttttatctttccccctaaacctaaagaagtaagatgtagccc
agattttacccaggatgctggctatagtctggctctactccatccatcca
tccatccatccatccatggattgattcatccttccgtctatgtatctttg
tgttattctctctctctctcacacacacacacactctattcatctatcat
ccatctctcaactatctatctatctatctatctatccatctatcttcatt
atcatctctctctgtctcattttctgtctgtttctctgggtctctgtctg
tctttgtctctttctttctctcattgtagccagcctcttctcccacagaa
caaaaggctttgaacaagatgaagtagatgctgtttggtgttcatgtgtc
tattcttacaaagtccctataaagaagatactattaccattatctctgtt
tgtacaggaggaatcagagtaaagcaggtggagtcaattgtccatttttc
acattgggggatgactgaatttgcatgatctgatagtcatgagacaacac
tgacttttaaagtaaggcaatatatgcacatcaggaccccattcaaagga
catcatctacaggttttagtcatagtggaatgcagtgcatgcagggaaaa
cgacagaggtacatacccactcatgtcatttgcgttcacatcatttggtg
aatgat
gaattccaagaaaacacactgcaggaaaaaaaaaatccaagatgatccga
ccagcaaacccacaccttcctgagcaagaacagctggaatataggctggg
atataaataggaactagacagaagtggaaacatgaagaaagatacccagc
agagccaaagatgcatcttagaatcctacaccaccccaaaatgaacaagt
cattaaacaggccatgctgaaagacatggcctttacccagtgggacagca
gctggcgaagcaggtgggtggcatacaactcacctgttatgtgctcctga
agtaaactaggctgcagaagagactgcacatttagaagaaagtaaccctt
gagggtaatgaatgtgatgtctttgacctttgctggcttaaaagatgcag
gcaccccactaagagctctatgagagccagggcattaccaagtacaggaa
actgaagctcactcaggacagctactcaatcaatatgcattcaatagaca
tcaaggaaagaatggggaaagaacgccccagacttgagtgaggaaatatg
gcagaacatgtgagcaagcttttctccgggcaaaggcaagtcaacagaaa
aacagaagttatctacaaagcagaggataatgctaggtgaatattgaagg
aaagccgagacatttctacgttgttgttttaaatgtagaatgagggaaat
taaagcattctgatgagaacagaaatgtaataaaacatggaagaaggaaa
gcagccactagcattccattgccaagcatcccccccccacaagtccacag
tgcctgtgggtctgtaaagggcaccgagatgaaccactctggagaaggtt
tcaagtagtgtctgctttactgtatgtgaacaactgcgtatacagtagaa
gcctctctaccgtgattggttagcacattatctcagattgggcagtgaac
ggtcataccaccaccatctctatgctaaagagggcataaaagacagcacg
gactcatcagcctactagctaccagctattacattagtccagaatttcat
gtttctgacttcttggaatcttgggagactatatgcatgcttctattaga
aaccagtgtgccaggtaggctgcttccaggtcatgcctgctttctttcct
ac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_120170598_120171603
seq2: B6Ng01-114A07.b_44_1049 (reverse)

seq1  ATCATTCATCAAATGATGTGAACGCAAATGACATGAGTGGGTATGTACCT  50
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTCACCAAATGATGTGAACGCAAATGACATGAGTGGGTATGTACCT  50

seq1  CTGTCGTTTTCCCCTGCATGCACTGCATTCCACTATGACTAAACACTGTA  100
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
seq2  CTGTCGTTTT-CCCTGCATGCACTGCATTCCACTATGACTAAAACCTGTA  99

seq1  GATGATGTCCTTTGAATGGGGTCCTGATGTGCATATATTGCCTTACTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATGTCCTTTGAATGGGGTCCTGATGTGCATATATTGCCTTACTTTA  149

seq1  AAAGTCAGTGTTGTCTCATGACTATCAGATCATGCAAATTCAGTCAT-CC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAAGTCAGTGTTGTCTCATGACTATCAGATCATGCAAATTCAGTCATCCC  199

seq1  CCAATGTGAAAAATGGACAATTGACTCCACCTGCTTTACTCTGATTCCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGTGAAAAATGGACAATTGACTCCACCTGCTTTACTCTGATTCCTC  249

seq1  CTGTACAAACAGAGATAATGGTAATAGTATCTTCTTTATAGGGACTTTGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACAAACAGAGATAATGGTAATAGTATCTTCTTTATAGGGACTTTGT  299

seq1  AAGAATAGACACATGAACACCAAACAGCATCTACTTCATCTTGTTCAAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAGACACATGAACACCAAACAGCATCTACTTCATCTTGTTCAAAG  349

seq1  CCTTTTGTTCTGTGGGAGAAGAGGCTGGCTACAATGAGAGAAAGAAAGAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTTCTGTGGGAGAAGAGGCTGGCTACAATGAGAGAAAGAAAGAG  399

seq1  ACAAAGACAGACAGAGACCCAGAGAAACAGACAGAAAATGAGACAGAGAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGACAGACAGAGACCCAGAGAAACAGACAGAAAATGAGACAGAGAG  449

seq1  AGATGATAATGAAGATAGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGTTGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGATAATGAAGATAGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGTTGA  499

seq1  GAGATGGATGATAGATGAATAGAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGATGATAGATGAATAGAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAG  549

seq1  AATAACACAAAGATACATAGACGGAAGGATGAATCAATCCATGGATGGAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACACAAAGATACATAGACGGAAGGATGAATCAATCCATGGATGGAT  599

seq1  GGATGGATGGATGGATGGAGTAGAGCCAGACTATAGCCAGCATCCTGGGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGATGGATGGATGGAGTAGAGCCAGACTATAGCCAGCATCCTGGGT  649

seq1  AAAATCTGGGCTACATCTTACTTCTTTAGGTTTAGGGGGAAAGATAAAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTGGGCTACATCTTACTTCTTTAGGTTTAGGGGGAAAGATAAAAG  699

seq1  CAAAATCAATTGGGTGACTTTCCACCTCAAAAACAGCAGCCACGCCTTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATCAATTGGGTGACTTTCCACCTCAAAAACAGCAGCCACGCCTTAT  749

seq1  CACTCAGACATTGGAGAAACGAGAGACAAAAGCTATCCCCAAATAAAAGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGACATTGGAGAAACGAGAGACAAAAGCTATCCCCAAATAAAAGC  799

seq1  ACCAAAAAATATTTTCTTTGGACATTTTGCCATTAAGCCATGTCAAAAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAAAAATATTTTCTTTGGACATTTTGCCATTAAGCCATGTCAAAAAG  849

seq1  CACCACGGTCTTAAGCATTTAGTTCCATTACCACTCACATTACAAGTTAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACGGTCTTAAGCATTTAGTTCCATTACCACTCACATTACAAGTTAT  899

seq1  ATCTGTCTAGGTCACAGACAAGATTTCTGAAGGGAAAAATATCATGTCAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTCTAGGTCACAGACAAGATTTCTGAAGGGAAAAATATCATGTCAA  949

seq1  CACAATAATATTTTCCCTAATGCCCTTTAAAGAGATAAACTCAGGCTTCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATAATATTTTCCCTAATGCCCTTTAAAGAGATAAACTCAGGCTTCT  999

seq1  AGAATTC  1006
      |||||||
seq2  AGAATTC  1006

seq1: chr3_120050789_120051948
seq2: B6Ng01-114A07.g_68_1219

seq1  GAATTCCAAGAAAACACACTGCAGGAAAAAAAAAATCCAAGATGATCCGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGAAAACACACTGCAGGAAAAAAAAAATCCAAGATGATCCGA  50

seq1  CCAGCAAACCCACACCTTCCTGAGCAAGAACAGCTGGAATATAGGCTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAAACCCACACCTTCCTGAGCAAGAACAGCTGGAATATAGGCTGGG  100

seq1  ATATAAATAGGAACTAGACAGAAGTGGAAACATGAAGAAAGATACCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATAGGAACTAGACAGAAGTGGAAACATGAAGAAAGATACCCAGC  150

seq1  AGAGCCAAAGATGCATCTTAGAATCCTACACCACCCCAAAATGAACAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAAAGATGCATCTTAGAATCCTACACCACCCCAAAATGAACAAGT  200

seq1  CATTAAACAGGCCATGCTGAAAGACATGGCCTTTACCCAGTGGGACAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAACAGGCCATGCTGAAAGACATGGCCTTTACCCAGTGGGACAGCA  250

seq1  GCTGGCGAAGCAGGTGGGTGGCATACAACTCACCTGTTATGTGCTCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGAAGCAGGTGGGTGGCATACAACTCACCTGTTATGTGCTCCTGA  300

seq1  AGTAAACTAGGCTGCAGAAGAGACTGCACATTTAGAAGAAAGTAACCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAACTAGGCTGCAGAAGAGACTGCACATTTAGAAGAAAGTAACCCTT  350

seq1  GAGGGTAATGAATGTGATGTCTTTGACCTTTGCTGGCTTAAAAGATGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTAATGAATGTGATGTCTTTGACCTTTGCTGGCTTAAAAGATGCAG  400

seq1  GCACCCCACTAAGAGCTCTATGAGAGCCAGGGCATTACCAAGTACAGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCCACTAAGAGCTCTATGAGAGCCAGGGCATTACCAAGTACAGGAA  450

seq1  ACTGAAGCTCACTCAGGACAGCTACTCAATCAATATGCATTCAATAGACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGCTCACTCAGGACAGCTACTCAATCAATATGCATTCAATAGACA  500

seq1  TCAAGGAAAGAATGGGGAAAGAACGCCCCAGACTTGAGTGAGGAAATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGAAAGAATGGGGAAAGAACGCCCCAGACTTGAGTGAGGAAATATG  550

seq1  GCAGAACATGTGAGCAAGCTTTTCTCCGGGCAAAGGCAAGTCAACAGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACATGTGAGCAAGCTTTTCTCCGGGCAAAGGCAAGTCAACAGAAA  600

seq1  AACAGAAGTTATCTACAAAGCAGAGGATAATGCTAGGTGAATATTGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAGTTATCTACAAAGCAGAGGATAATGCTAGGTGAATATTGAAGG  650

seq1  AAAGCCGAGACATTTCTACGTTGTTGTTTTAAATGTAGAATGAGGGAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCGAGACATTTCTACGTTGTTGTTTTAAATGTAGAATGAGGGAAAT  700

seq1  TAAAGCATTCTGATGAGAACAGAAATGTAATAAAACATGGAAGAAGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCATTCTGATGAGAACAGAAATGTAATAAAACATGGAAGAAGGAAA  750

seq1  GCAGCCACTAGCATTCCATTGCCAAGCATCCCCCCCCCACAAGTCCACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCACTAGCATTCCATTGCCAAGCATCCCCCCCCCACAAGTCCACAG  800

seq1  TGCCTGTGGGTCTGTAAAGGGCACCGAGATGAACCACTCTGGAGAAGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTGGGTCTGTAAAGGGCACCGAGATGAACCACTCTGGAGAAGGTT  850

seq1  TCAAGTAGTGTCTGCTTTACTGTATGTGAACAACTGCGTATACAGTAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTAGTGTCTGCTTTACTGTATGTGAACAACTGCGTATACAGTAGAA  900

seq1  GCCTCTCTACCGTGATTGGTTAGCACATTATCTCAGATTGGGCAGTGAAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCTACCGTGATTGGTTAGCACATTATCTCAGATTGGGCAGTGAAC  950

seq1  GGTCATACCACCACCATCTCTATGCTAAAGAGGGCATAAAAGACAAGCAC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGTCATACCACCACCATCTCTATGCTAAAGAGGGCATAAAAGAC-AGCAC  999

seq1  AGACTCATCAGCCTACTAGCTACCAGCTATTCACATTAGTCCAGAATTCC  1050
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  GGACTCATCAGCCTACTAGCTACCAGCTATT-ACATTAGTCCAGAATTTC  1048

seq1  ATG-TTCTGACTTCTGGGAATACTTGGGAGCACTATATGCCATGCTTCTT  1099
      ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| 
seq2  ATGTTTCTGACTTCTTGGAAT-CTTGGGAG-ACTATATG-CATGCTTCT-  1094

seq1  ATTTAGAAACACAGTGTGCCAGGTAGGCTGGCTACCAGGTCATGCCTGCT  1149
        |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  -ATTAGAAAC-CAGTGTGCCAGGTAGGCT-GCTTCCAGGTCATGCCTGCT  1141

seq1  TTCTTTCCTAC  1160
      |||||||||||
seq2  TTCTTTCCTAC  1152