BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128I23
Chromosome3 (Build37)
Map Location 29,188,620 - 29,402,896
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6130401L20Rik
Upstream geneTnik, Slc2a2, EG624446, Eif5a2, Rpl22l1, Gm1527
Downstream geneLOC100040676, Evi1, Mds1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128I23.bB6Ng01-128I23.g
ACCDH930379DH930380
length8351,066
definitionDH930379|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I23, 5' end.DH930380|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,188,620 - 29,189,453)(29,401,828 - 29,402,896)
sequence
gaattcattagttaggtgggtaatgcaaatatattactttggcagtattg
caagacatcgcagagaacatgagaacccaaaaacacgcagcaaagccccg
tctgctgttgtacctcctcttcctggttatgttacagagagcacagagcc
aaaggtagtgtttgtaagtgtgatagaggcttagaaaagtgagagagttt
tatggaacccaaactaaagaaacaggatggccccatgcttgactgtatat
agaccaaagccaggactatagctcagcagtgtgctttcctagtgcacaga
aagccttgggttggatcttggtgacacataaaaccaggtttcttggtcca
ctcatataaacttcaacatttaggaggtagtgataagagaatcaaaagtt
caagctcctcctaaggtacatggctagttagaatctgatccctaaacaca
catacccatacagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga
gagagaaagagagagatagagacaggcagagagagagacagacagacaga
gacagggagacagagagagacagagatggagagggagagggacagagaga
gagagggagagggccagggagacaaagagttagaggcagagggagataca
gagtaacatataaagagactgaataagagggctgatggacagagggatag
agggctgtgtttgctatgtttatgtttatacaacgataacagtatgagta
gaagttaatctcctttaagagaagaatgtaacaccaaagaggaacaaaga
aaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattctcatctggattctggaagcctgacaggtacactgtagagaggtg
gctccaaagagcaaagaggtaagatgaaaaacattttattttaattcaaa
cctttctctaaaactcaatatatgtggcagcttagaatgcatacgtgtgc
tttatgtggaagagacttttgtgtatccttgtgaaaatttccacaaagtg
agtgtaaatcttgcatatcatcctgatttttaagtgagtgtcttttctga
ggttttgataaatgcatctcactacaggtagtgtctacagaaagccagcc
tagatgtctttaggcgttctgcttagtagaaatgtttgtaggttcaagga
aactactgcatctcttcccatcactagaagatacatgcatgccatatctt
agatccttctagtgacattgttgacattacagaatttaatcaaagtctag
aagttaccttttctgtaaattaaatgaatttggcaaaactggtaacttag
taaaggttcattaaactagacttgcaattgctattattattttcccaatg
gtaatttcattaaaattttattcttctttaaaagttcatgatacttatag
taaggttattttcaaaaacatattgtccttaattcaaattctttttgtgg
tttataaataattcttatcaattgactacacaaaaatgtgctctcttgag
cagtatgacttatgcaacatttgagcatacagtaattctgccattcttat
ttatgaaaataaggcccatgtgtacaatgaaacttagaaagaaaatctga
ttaaaaagtaaaattaccattattgagtatagtagatcgaagcatgtgct
atgaagacctcctgggaccttgagttggatctccaggacctatgaaaaat
tccctatgcagcgattaaactgtggggcaagtagactgtgagaggaggct
cgtaaggatgagctaaaggcttaaagctctggagacttatgagagactat
aggacttcacttgctcccagcaccaggccctgtcatgtagccacagccct
acatagagagaattgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_29188620_29189453
seq2: B6Ng01-128I23.b_50_884

seq1  GAATTCATTAGTTAGGTGGGTAATGCAAATATATTACTTTGGCAGTATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAGTTAGGTGGGTAATGCAAATATATTACTTTGGCAGTATTG  50

seq1  CAAGACATCGCAGAGAACATGAGAACCCAAAAACACGCAGCAAAGCCCCG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACATCGCAGAGAACATGAGAACCCAAAAACACGCAGCAAAGCCCCG  100

seq1  TCTGCTGTTGTACCTCCTCTTCCTGGTTATGTTACAGAGAGCACAGAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGTTGTACCTCCTCTTCCTGGTTATGTTACAGAGAGCACAGAGCC  150

seq1  AAAGGTAGTGTTTGTAAGTGTGATAGAGGCTTAGAAAAGTGAGAGAGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTAGTGTTTGTAAGTGTGATAGAGGCTTAGAAAAGTGAGAGAGTTT  200

seq1  TATGGAACCCAAACTAAAGAAACAGGATGGCCCCATGCTTGACTGTATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAACCCAAACTAAAGAAACAGGATGGCCCCATGCTTGACTGTATAT  250

seq1  AGACCAAAGCCAGGACTATAGCTCAGCAGTGTGCTTTCCTAGTGCACAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAAAGCCAGGACTATAGCTCAGCAGTGTGCTTTCCTAGTGCACAGA  300

seq1  AAGCCTTGGGTTGGATCTTGGTGACACATAAAACCAGGTTTCTTGGTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTGGGTTGGATCTTGGTGACACATAAAACCAGGTTTCTTGGTCCA  350

seq1  CTCATATAAACTTCAACATTTAGGAGGTAGTGATAAGAGAATCAAAAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATATAAACTTCAACATTTAGGAGGTAGTGATAAGAGAATCAAAAGTT  400

seq1  CAAGCTCCTCCTAAGGTACATGGCTAGTTAGAATCTGATCCCTAAACACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTCCTCCTAAGGTACATGGCTAGTTAGAATCTGATCCCTAAACACA  450

seq1  CATACCCATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCCATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  500

seq1  GAGAGAAAGAGAGAGATAGAGACAGGCAGAGAGAGAGACAGACAGACAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAAAGAGAGAGATAGAGACAGGCAGAGAGAGAGACAGACAGACAGA  550

seq1  GACAGGGAGACAGAGAGAGACAGAGATGGAGAGGGAGAGGGACAGAGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGGAGACAGAGAGAGACAGAGATGGAGAGGGAGAGGGACAGAGAGA  600

seq1  GAGAGGGAGAGGGCCAGGGAGACAAAGAGTTAGAGGCAGAGGGAGATACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGAGAGGGCCAGGGAGACAAAGAGTTAGAGGCAGAGGGAGATACA  650

seq1  GAGTAACATATAAAGAGACTGAATAAGAGGGCTGATGGACAGAGGGATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAACATATAAAGAGACTGAATAAGAGGGCTGATGGACAGAGGGATAG  700

seq1  AGGGCTGTG-TTGCTATGTTTATGTTTATACAACGATAACAGTATGAGTA  749
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGTGTTTGCTATGTTTATGTTTATACAACGATAACAGTATGAGTA  750

seq1  GAAGTTAATCTCCTTTAAGAGAAGAATGTAACACCAAAGAGGAACAAAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTAATCTCCTTTAAGAGAAGAATGTAACACCAAAGAGGAACAAAGA  800

seq1  AAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  834
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  835

seq1: chr3_29401828_29402896
seq2: B6Ng01-128I23.g_69_1134 (reverse)

seq1  ACAATTCTCTCTATGTAGGGCTGTGGCTACATGACAGGGGCCTGGTGCTG  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACAATTCTCTCTATGTAGGGCTGTGGCTACATGACA-GGGCCTGGTGCTG  49

seq1  GGAGCAAGTGAAGTTCCTATAGTCTCTTCAT-AGTCTCCAGAGCTTTAAG  99
      ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAAGTGAAG-TCCTATAGTCTC-TCATAAGTCTCCAGAGCTTTAAG  97

seq1  CC-TTAGCTCATCCTTACGAGGCTTCTTCTCACAGTCTACTTGCCCCACA  148
      || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGCTCATCCTTACGA-GCCTCCTCTCACAGTCTACTTGCCCCACA  146

seq1  GTTTAATCGCTGCATAGGGAATTTTTTCATAGGTCCTGGAGATCCAACTC  198
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAATCGCTGCATAGGGAA-TTTTTCATAGGTCCTGGAGATCCAACTC  195

seq1  AAGGTCCCAGGAGGTCTTCATAGCACATGCTTCGATCTACTATACTCAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCCCAGGAGGTCTTCATAGCACATGCTTCGATCTACTATACTCAAT  245

seq1  AATGGTAATTTTACTTTTTAATCAGATTTTCTTTCTAAGTTTCATTGTAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTAATTTTACTTTTTAATCAGATTTTCTTTCTAAGTTTCATTGTAC  295

seq1  ACATGGGCCTTATTTTCATAAATAAGAATGGCAGAATTACTGTATGCTCA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGCCTTATTTTCATAAATAAGAATGGCAGAATTACTGTATGCTCA  345

seq1  AATGTTGCATAAGTCATACTGCTCAAGAGAGCACATTTTTGTGTAGTCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTGCATAAGTCATACTGCTCAAGAGAGCACATTTTTGTGTAGTCAA  395

seq1  TTGATAAGAATTATTTATAAACCACAAAAAGAATTTGAATTAAGGACAAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAGAATTATTTATAAACCACAAAAAGAATTTGAATTAAGGACAAT  445

seq1  ATGTTTTTGAAAATAACCTTACTATAAGTATCATGAACTTTTAAAGAAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTTGAAAATAACCTTACTATAAGTATCATGAACTTTTAAAGAAGA  495

seq1  ATAAAATTTTAATGAAATTACCATTGGGAAAATAATAATAGCAATTGCAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATTTTAATGAAATTACCATTGGGAAAATAATAATAGCAATTGCAA  545

seq1  GTCTAGTTTAATGAACCTTTACTAAGTTACCAGTTTTGCCAAATTCATTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAGTTTAATGAACCTTTACTAAGTTACCAGTTTTGCCAAATTCATTT  595

seq1  AATTTACAGAAAAGGTAACTTCTAGACTTTGATTAAATTCTGTAATGTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTACAGAAAAGGTAACTTCTAGACTTTGATTAAATTCTGTAATGTCA  645

seq1  ACAATGTCACTAGAAGGATCTAAGATATGGCATGCATGTATCTTCTAGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGTCACTAGAAGGATCTAAGATATGGCATGCATGTATCTTCTAGTG  695

seq1  ATGGGAAGAGATGCAGTAGTTTCCTTGAACCTACAAACATTTCTACTAAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAAGAGATGCAGTAGTTTCCTTGAACCTACAAACATTTCTACTAAG  745

seq1  CAGAACGCCTAAAGACATCTAGGCTGGCTTTCTGTAGACACTACCTGTAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACGCCTAAAGACATCTAGGCTGGCTTTCTGTAGACACTACCTGTAG  795

seq1  TGAGATGCATTTATCAAAACCTCAGAAAAGACACTCACTTAAAAATCAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGCATTTATCAAAACCTCAGAAAAGACACTCACTTAAAAATCAGG  845

seq1  ATGATATGCAAGATTTACACTCACTTTGTGGAAATTTTCACAAGGATACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATGCAAGATTTACACTCACTTTGTGGAAATTTTCACAAGGATACA  895

seq1  CAAAAGTCTCTTCCACATAAAGCACACGTATGCATTCTAAGCTGCCACAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTCTCTTCCACATAAAGCACACGTATGCATTCTAAGCTGCCACAT  945

seq1  ATATTGAGTTTTAGAGAAAGGTTTGAATTAAAATAAAATGTTTTTCATCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGAGTTTTAGAGAAAGGTTTGAATTAAAATAAAATGTTTTTCATCT  995

seq1  TACCTCTTTGCTCTTTGGAGCCACCTCTCTACAGTGTACCTGTCAGGCTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTTTGCTCTTTGGAGCCACCTCTCTACAGTGTACCTGTCAGGCTT  1045

seq1  CCAGAATCCAGATGAGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATCCAGATGAGAATTC  1066