BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130C24
Chromosome3 (Build37)
Map Location 137,281,060 - 137,454,583
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDdit4l, LOC668874
Upstream genePpp3ca, LOC668870, LOC100039447, Emcn, EG229862
Downstream geneH2afz, Dnajb14, Map2k1ip1, Dapp1, EG329763, LOC100039528, Mttp, Rg9mtd2, 4930579F01Rik, Adh7, Adh1, Adh6a, LOC639769, Adh4, Adh5, Metap1, EG383925, EG668879, Eif4e, EG545570, LOC668881, LOC668882, Ppia-ps3_1437.1, Tspan5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130C24.bB6Ng01-130C24.g
ACCDH931565DH931566
length1,1981,065
definitionDH931565|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130C24, 5' end.DH931566|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130C24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(137,453,378 - 137,454,583)(137,281,060 - 137,282,130)
sequence
gaattcttcttttgttgggagatggtgtcatgtatttcaggctggcctct
acctccatatgtacccgaggatgtccctaaatgaatcctgctgcttaaca
ccaagattggaggtgtgtaccaccacactccgtttaactgatgcaggaga
ctgaacccatgacttcatgtgtgccaggcatgttccttccacactagggt
gggtccctattctttgtaacttatctagagagacaactgtgatcaaacct
gacagtcttgctttctgtctagaatcccactggttccttcgtgcctacaa
agcccattaaggactgggctccatctgactccaggttccctctcctgccc
cagcttctggtcctgcagcccaggatccagcatctcctacatccatgact
ttattcactgcacaccagagatgacttttcagagcaggggtcagtatggg
tgctttactgtcagaagtctaaatagctgtcactactctgtgagccccag
atcccttccaaggatttattctttcttttggagtctcataattatttgca
tatagcattcacttaacatttattgtactggataattacattttcatttg
gaacaggcccagcatgatggtccacacttgtaaagccagcactggaaagg
cagagggctgaccatgagttcaaagccatctgagctacatacagtttagt
atgtacaacaaaaaaaaaatcaaaataaagcagagagcgagacagagaat
tcctgattgacttataattaattttaagatgagggtattatatcacctat
agccattatgtctatcacatagaagtactgaatacaggccaggcacatgc
atgcattcatctgcattgtatgtacttttgggttatatatcttatttctt
ccaagttttattcttctaactttttcaaaatgatgtatgtgtgtgatatg
catgcttgcgtatatccatgcttgcatatatgtggagctgtagtatatgc
gaaacgtgcggaggtctggagacatctgagacttactggatactccctat
tacagttactgggtcaggatcaaagcttgctgtatttggctggctaattg
actactccagaggtctttcctggtcactgctttcggaaggctgggatatc
aaagagaacatgactacttgggcaatccagtgtggattgattcatgct
gaattcagcactgtagaagacaaatctctgctctgataagttacccaacc
ttaggtattctttcacagaaacaacagagtgaaccaatgcaatggtaatt
ttgtatatctgctgcttatctaaccataattctcctggaatagaaataat
atttacctggcattctgttgtattttcaatgtctcctgtaattaatactc
agaacatcatcaaatgaattcctgtgcacaaatgataaaacttgtacaca
tactcttgagttcatacaaacattctcccagcaatgttatcataagaatg
tcaccagaacactggagggttttttttttccaaaggtacagtaaattttg
tcactgtaatcatggctaaaatttatacagtgagttatagtctcattacc
tgaatccctataactctaatagggaaaacttattttaattctcatcttaa
aaagtaaactgttccaacagaaatatccagttcattattcatatttacca
agctatcaaataccttctctggaatacaaacccaggcaggcgggctccac
agcccatgcacctaacttctactccctgagatggatgtacatcatggagt
cactccatggtttaactcactctgttttacagctgcagaatgccacgtgg
accacccaacagaaccctgtatctactcaacactttgggtaagttcttag
gttgaatcctcttctacagcaacccacagatttgtgtcataaaatagtgt
gtagttttggtgggacaggatgtaaagggcctaagacctaagaggactca
ctagattagggcactggagtggttcatggaggggtgctgttgaaggatgg
atactacatgggcatgtaagactatctacctatgtagaattccaggtaag
gtgtatatgacaagggtcttctcaattggagactttgaacagttttaaga
tgcatccctaaaaaaaaatgtgactctccatgtttctgtgacactgtctg
atactagtcacctgaaatgtaaccttccatagttcaataggacaccagat
ctgctatgcatgtat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_137453378_137454583
seq2: B6Ng01-130C24.b_40_1237 (reverse)

seq1  AGCATGGAATCAGAATCCACAC--GAATG-CCAAGTAGTCATGGTGCTCT  47
      ||||| |||||  |||||||||  || || |||||||||||| || ||||
seq2  AGCAT-GAATC--AATCCACACTGGATTGCCCAAGTAGTCAT-GTTCTCT  46

seq1  TTGTAATCCCAGCCTTCTGGACGCAGTGA-CAGGGAAGACTCCTGGAGTA  96
      |||  |||||||||||| | | ||||||| |||| |||||  ||||||||
seq2  TTGATATCCCAGCCTTCCGAAAGCAGTGACCAGGAAAGACCTCTGGAGTA  96

seq1  TGTCACTAGGCCAGCCATAT-CAGCAAGCTTTGGATCCTGGCCCAGTGAC  145
       |||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||
seq2  -GTCAATTAGCCAGCCAAATACAGCAAGCTTT-GATCCTGACCCAGTAAC  144

seq1  TGTAATAGGGAGTAATCCAGTAAGTCTCCAGATGTCTCCAGACCTCCGCA  195
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATAGGGAGT-ATCCAGTAAGTCT-CAGATGTCTCCAGACCTCCGCA  192

seq1  CGTTTTCGCATATACCTACAAGCTCCAACATATATGCAAGCATGGATATA  245
      || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CG-TTTCGCATATA-CTAC-AGCTCC-ACATATATGCAAGCATGGATATA  238

seq1  CGCAAGCATGCATATCACACACATACATCATTTTTGAAAAAGTTAGAAGA  295
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CGCAAGCATGCATATCACACACATACATCA-TTTTGAAAAAGTTAGAAGA  287

seq1  ATAAAACTTGGAAGAAATAAGATATATAACCCAAAAGTACATACAATGCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAACTTGGAAGAAATAAGATATATAACCCAAAAGTACATACAATGCA  337

seq1  GATGAATGCATGCATGTGCCTGGCCTGTATTCAGTACTTCTATGTGATAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAATGCATGCATGTGCCTGGCCTGTATTCAGTACTTCTATGTGATAG  387

seq1  ACATAATGGCTATAGGTGATATAATACCCTCATCTTAAAATTAATTATAA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAATGGCTATAGGTGATATAATACCCTCATCTTAAAATTAATTATAA  437

seq1  GTCAATCAGGAATTCTCTGTCTCGCTCTCTGCTTTATTTTGATTTTTTTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAATCAGGAATTCTCTGTCTCGCTCTCTGCTTTATTTTGATTTTTTTT  487

seq1  TTGTTGTACATACTAAACTGTATGTAGCTCAGATGGCTTTGAACTCATGG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTACATACTAAACTGTATGTAGCTCAGATGGCTTTGAACTCATGG  537

seq1  TCAGCCCTCTGCCTTTCCAGTGCTGGCTTTACAAGTGTGGACCATCATGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCCTCTGCCTTTCCAGTGCTGGCTTTACAAGTGTGGACCATCATGC  587

seq1  TGGGCCTGTTCCAAATGAAAATGTAATTATCCAGTACAATAAATGTTAAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCTGTTCCAAATGAAAATGTAATTATCCAGTACAATAAATGTTAAG  637

seq1  TGAATGCTATATGCAAATAATTATGAGACTCCAAAAGAAAGAATAAATCC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGCTATATGCAAATAATTATGAGACTCCAAAAGAAAGAATAAATCC  687

seq1  TTGGAAGGGATCTGGGGCTCACAGAGTAGTGACAGCTATTTAGACTTCTG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGGGATCTGGGGCTCACAGAGTAGTGACAGCTATTTAGACTTCTG  737

seq1  ACAGTAAAGCACCCATACTGACCCCTGCTCTGAAAAGTCATCTCTGGTGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAAAGCACCCATACTGACCCCTGCTCTGAAAAGTCATCTCTGGTGT  787

seq1  GCAGTGAATAAAGTCATGGATGTAGGAGATGCTGGATCCTGGGCTGCAGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGAATAAAGTCATGGATGTAGGAGATGCTGGATCCTGGGCTGCAGG  837

seq1  ACCAGAAGCTGGGGCAGGAGAGGGAACCTGGAGTCAGATGGAGCCCAGTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGAAGCTGGGGCAGGAGAGGGAACCTGGAGTCAGATGGAGCCCAGTC  887

seq1  CTTAATGGGCTTTGTAGGCACGAAGGAACCAGTGGGATTCTAGACAGAAA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATGGGCTTTGTAGGCACGAAGGAACCAGTGGGATTCTAGACAGAAA  937

seq1  GCAAGACTGTCAGGTTTGATCACAGTTGTCTCTCTAGATAAGTTACAAAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGACTGTCAGGTTTGATCACAGTTGTCTCTCTAGATAAGTTACAAAG  987

seq1  AATAGGGACCCACCCTAGTGTGGAAGGAACATGCCTGGCACACATGAAGT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGGACCCACCCTAGTGTGGAAGGAACATGCCTGGCACACATGAAGT  1037

seq1  CATGGGTTCAGTCTCCTGCATCAGTTAAACGGAGTGTGGTGGTACACACC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGTTCAGTCTCCTGCATCAGTTAAACGGAGTGTGGTGGTACACACC  1087

seq1  TCCAATCTTGGTGTTAAGCAGCAGGATTCATTTAGGGACATCCTCGGGTA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATCTTGGTGTTAAGCAGCAGGATTCATTTAGGGACATCCTCGGGTA  1137

seq1  CATATGGAGGTAGAGGCCAGCCTGAAATACATGACACCATCTCCCAACAA  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGAGGTAGAGGCCAGCCTGAAATACATGACACCATCTCCCAACAA  1187

seq1  AAGAAGAATTC  1206
      |||||||||||
seq2  AAGAAGAATTC  1198

seq1: chr3_137281060_137282130
seq2: B6Ng01-130C24.g_69_1133

seq1  GAATTCAGCACTGTAGAAGACAAATCTCTGCTCTGATAAGTTACCCAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCACTGTAGAAGACAAATCTCTGCTCTGATAAGTTACCCAACC  50

seq1  TTAGGTATTCTTTCACAGAAACAACAGAGTGAACCAATGCAATGGTAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTATTCTTTCACAGAAACAACAGAGTGAACCAATGCAATGGTAATT  100

seq1  TTGTATATCTGCTGCTTATCTAACCATAATTCTCCTGGAATAGAAATAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATCTGCTGCTTATCTAACCATAATTCTCCTGGAATAGAAATAAT  150

seq1  ATTTACCTGGCATTCTGTTGTATTTTCAATGTCTCCTGTAATTAATACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACCTGGCATTCTGTTGTATTTTCAATGTCTCCTGTAATTAATACTC  200

seq1  AGAACATCATCAAATGAATTCCTGTGCACAAATGATAAAACTTGTACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACATCATCAAATGAATTCCTGTGCACAAATGATAAAACTTGTACACA  250

seq1  TACTCTTGAGTTCATACAAACATTCTCCCAGCAATGTTATCATAAGAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTTGAGTTCATACAAACATTCTCCCAGCAATGTTATCATAAGAATG  300

seq1  TCACCAGAACACTGGAGGGTTTTTTTTTTCCAAAGGTACAGTAAATTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAGAACACTGGAGGGTTTTTTTTTTCCAAAGGTACAGTAAATTTTG  350

seq1  TCACTGTAATCATGGCTAAAATTTATACAGTGAGTTATAGTCTCATTACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTAATCATGGCTAAAATTTATACAGTGAGTTATAGTCTCATTACC  400

seq1  TGAATCCCTATAACTCTAATAGGGAAAACTTATTTTAATTCTCATCTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCCCTATAACTCTAATAGGGAAAACTTATTTTAATTCTCATCTTAA  450

seq1  AAAGTAAACTGTTCCAACAGAAATATCCAGTTCATTATTCATATTTACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAACTGTTCCAACAGAAATATCCAGTTCATTATTCATATTTACCA  500

seq1  AGCTATCAAATACCTTCTCTGGAATACAAACCCAGGCAGGCGGGCTCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATCAAATACCTTCTCTGGAATACAAACCCAGGCAGGCGGGCTCCAC  550

seq1  AGCCCATGCACCTAACTTCTACTCCCTGAGATGGATGTACATCATGGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCATGCACCTAACTTCTACTCCCTGAGATGGATGTACATCATGGAGT  600

seq1  CACTCCATGGTTTAACTCACTCTGTTTTACAGCTGCAGAATGCCACGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCATGGTTTAACTCACTCTGTTTTACAGCTGCAGAATGCCACGTGG  650

seq1  ACCACCCAACAGAACCCTGTATCTACTCAACACTTTGGGTAAGTTCTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCCAACAGAACCCTGTATCTACTCAACACTTTGGGTAAGTTCTTAG  700

seq1  GTTGAATCCTCTTCTACAGCAACCCACAGATTTGTGTCATAAAATAGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAATCCTCTTCTACAGCAACCCACAGATTTGTGTCATAAAATAGTGT  750

seq1  GTAGTTTTGGTGGGACAGGATGTAAAGGGCCTAAGACCTAAGAGGACTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTTTGGTGGGACAGGATGTAAAGGGCCTAAGACCTAAGAGGACTCA  800

seq1  CTAGATTAGGGCACTGGAGTGGTCCATGGAGGGGTGCTGTTGAAGGATGG  850
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTAGGGCACTGGAGTGGTTCATGGAGGGGTGCTGTTGAAGGATGG  850

seq1  ATAACTACATGGGCATGTAAGACTATCTACCTATGTAGAATTCCAGGTAA  900
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AT-ACTACATGGGCATGTAAGACTATCTACCTATGTAGAATTCCAGGTAA  899

seq1  AGTGTATATGACAAGGGTCTTCTCAAATTGGAGACTTTGAACAGTTTTAA  950
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATATGACAAGGGTCTTCTC-AATTGGAGACTTTGAACAGTTTTAA  948

seq1  GATGCATCCCTAGAAAAATATGTGACCTCCTCCATGTTTCTGGTTGACAC  1000
      |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||  ||||||
seq2  GATGCATCCCTAAAAAAAAATGTGAC--TCTCCATGTTTCTG--TGACAC  994

seq1  TGTCTGATACTAGTCACCTGAATTGTAAACCCTTCCATAGTTCAATAAGG  1050
      |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |
seq2  TGTCTGATACTAGTCACCTGAAATGTAA--CCTTCCATAGTTCAATA--G  1040

seq1  GAACACAGATCT----TGCATGCAT  1071
      ||   |||||||    |||||| ||
seq2  GACACCAGATCTGCTATGCATGTAT  1065