BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133N09
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,066,394 - 75,198,336
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpini2, Wdr49
Upstream geneLOC667434, LOC100041551, EG667459, BC050789
Downstream genePdcd10, Serpini1, Golph4, Fstl5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133N09.bB6Ng01-133N09.g
ACCDH934284DH934285
length1,1041,060
definitionDH934284|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133N09, 5' end.DH934285|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133N09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,197,225 - 75,198,336)(75,066,394 - 75,067,462)
sequence
gaattcactgtgacagattaagtctgggagttcttgtggaaatctggatt
cgctataccagcctcaaagctcgaagcctgcataggactgctgttcaccc
ataattccatttgatcacaagtaaataaagcacaaattcaagttcaaaag
tagttctcacactctgatcttaatcctcgggagactcaaatctttgggga
atctgagatgtcaagagtatttttcttgtcagtttttcacaggtttacaa
tagatctttctagaggctacatgatgtatggagacctaattgatctggac
attaagggaatgtatgctcttgtattttgttttaacagttaatactttac
ttatgcaatgtagcaaatatataggttttattgggtatagatgaaagcta
ttttgattgaacaatgatttataaaactgtagagaaatctcaagaccaaa
agttttgagaaccacagggatagaatggtgggtagagtacttgatgtcaa
tttccaaaatgtgtgtctaagaggatcaaggaatcataatgcagccctct
ccaagggttgcctttataaggctggccgctgatctcttcaaagcaattcc
ctgactgtactgctatttactggaaacattctgctttgaggaatcttact
ttcttactaacttctaagaaatcctttctcttttgttttaaacgtgtgtc
gggatagacgtttataaatctgggatatagccaatgggttctactctctg
tctccttttgtgccatctttaaggcttttgttttgtctggatttgacgat
gatcttctctcctattgtagattttgcattctgcccacatttcaatgtta
tttcattccagctgggcttcagagtggaagcctcaccttggcttccataa
aagcagcttgcatatttctgcaaatttattatgtctgtgtcgacttttcc
tttcttccccccccccccccactcctctctaagagatgtgcttagcttcc
acagagtctttcaagcactgctgttctcacagccagccagaagaccttta
tgtggacctgctgagagacccctgggaagccattttggaagttaagtaac
tgaa
gaattctaaagtaatattcaggcatttataatgtatggacacctttaaac
gatggtggggaaaatagagaggaagagaaaaaatagctgtacatcagttg
tcagagcaaatagaataatgtcatatacttaaagtctaagacctgtgaaa
cacagttgacctttgataaattactgagcacctaaatcaatggaaaacta
tcaccaactattgcaccattgaaggagactataaaattattggccttata
aacttgattatatttacaggttaatgacctcatttaacacagatcaaaga
gaatgaatatgcatgactgctaatcagcaatgagaaaaacatttaatttc
ttaaaatagaaccttggaacccagatgatcgggtgaatcagttggattga
accagccctctagaaattctaactctattctagcactgttttgtagctgt
ctttgactacattgtgggttctttcttccacccttttctacccttttcct
tcacccctttcaaaccctatcagtagataggagagataaaaatagagatg
aagggagcaatgttatctctagactaatttctgctatttgggggcattaa
gttacttgttaaagtttcctcttcctgtcaggatatctaattttttcttc
ttgttgtttattctttgtgcacaattaattaacaaactgtgcccaacagc
aaccaatgaacaaccaacaacaaccttacacccacaactacaccaccacc
ttacctctcaggaccctagcatttgtaccctctgaaaagtccccagagtt
ccaaatatcacacacaatcacagaaactgtctgcagctggcaaaaccatg
cccctgctagagcatgagttaaattatagtcagctgctgcagacaatctg
aaccagccccgtatgccacatctgggattaaaatgaaaacatattcctat
atatttctgtgtttttcaatggaacaaaacacaaatatcactctactagc
tctcttctctgatgtcaaaaccaatgtcagagagagagagggagaagaga
gggaggggca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_75197225_75198336
seq2: B6Ng01-133N09.b_48_1151 (reverse)

seq1  TTCAGTTACTTTAACTCTCAAAATGGCTTTCCAGGGGTCTTCCTCAGCAG  50
      ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||
seq2  TTCAGTTAC-TTAACTTCCAAAATGGCTTCCCAGGGGTCT--CTCAGCAG  47

seq1  GT-CACAT-AAGGTC-TCTGGCTGGCTGTGAGAACATGCAGTGCTTTTAA  97
      || ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |
seq2  GTCCACATAAAGGTCTTCTGGCTGGCTGTGAGAACA-GCAGTGC--TTGA  94

seq1  TAGACTCTGT-GTAGCTTAGCACATTCTCTTAGAGAGGAGTTGGGGGGGG  146
       ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAGACTCTGTGGAAGCTAAGCACA-TCTCTTAGAGAGGAG-TGGGGGGGG  142

seq1  GGGGGGAAGAAAAGGAAAAGTCGACACAGACATAAATAAATTTGCAGAAA  196
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGGGGGAAG-AAAGGAAAAGTCGACACAGACAT-AATAAATTTGCAGAAA  190

seq1  TATTGCAAGCTGCTTTTATGGGAAGCCAAGGTGAGGCTTCCACTCTGAAG  246
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TA-TGCAAGCTGCTTTTAT-GGAAGCCAAGGTGAGGCTTCCACTCTGAAG  238

seq1  CCCAGCTGGAATGAAATAACATTGAAATGTGGGCAGAATGCAAAATCTAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTGGAATGAAATAACATTGAAATGTGGGCAGAATGCAAAATCTAC  288

seq1  AATAGGAGAGAAGATCATCGTCAAATCCAGACAAAACAAAAGCCTTAAAG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGAGAGAAGATCATCGTCAAATCCAGACAAAACAAAAGCCTTAAAG  338

seq1  ATGGCACAAAAGGAGACAGAGAGTAGAACCCATTGGCTATATCCCAGATT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCACAAAAGGAGACAGAGAGTAGAACCCATTGGCTATATCCCAGATT  388

seq1  TATAAACGTCTATCCCGACACACGTTTAAAACAAAAGAGAAAGGATTTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAACGTCTATCCCGACACACGTTTAAAACAAAAGAGAAAGGATTTCT  438

seq1  TAGAAGTTAGTAAGAAAGTAAGATTCCTCAAAGCAGAATGTTTCCAGTAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGTTAGTAAGAAAGTAAGATTCCTCAAAGCAGAATGTTTCCAGTAA  488

seq1  ATAGCAGTACAGTCAGGGAATTGCTTTGAAGAGATCAGCGGCCAGCCTTA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAGTACAGTCAGGGAATTGCTTTGAAGAGATCAGCGGCCAGCCTTA  538

seq1  TAAAGGCAACCCTTGGAGAGGGCTGCATTATGATTCCTTGATCCTCTTAG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGCAACCCTTGGAGAGGGCTGCATTATGATTCCTTGATCCTCTTAG  588

seq1  ACACACATTTTGGAAATTGACATCAAGTACTCTACCCACCATTCTATCCC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATTTTGGAAATTGACATCAAGTACTCTACCCACCATTCTATCCC  638

seq1  TGTGGTTCTCAAAACTTTTGGTCTTGAGATTTCTCTACAGTTTTATAAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTTCTCAAAACTTTTGGTCTTGAGATTTCTCTACAGTTTTATAAAT  688

seq1  CATTGTTCAATCAAAATAGCTTTCATCTATACCCAATAAAACCTATATAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTCAATCAAAATAGCTTTCATCTATACCCAATAAAACCTATATAT  738

seq1  TTGCTACATTGCATAAGTAAAGTATTAACTGTTAAAACAAAATACAAGAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTACATTGCATAAGTAAAGTATTAACTGTTAAAACAAAATACAAGAG  788

seq1  CATACATTCCCTTAATGTCCAGATCAATTAGGTCTCCATACATCATGTAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATTCCCTTAATGTCCAGATCAATTAGGTCTCCATACATCATGTAG  838

seq1  CCTCTAGAAAGATCTATTGTAAACCTGTGAAAAACTGACAAGAAAAATAC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTAGAAAGATCTATTGTAAACCTGTGAAAAACTGACAAGAAAAATAC  888

seq1  TCTTGACATCTCAGATTCCCCAAAGATTTGAGTCTCCCGAGGATTAAGAT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACATCTCAGATTCCCCAAAGATTTGAGTCTCCCGAGGATTAAGAT  938

seq1  CAGAGTGTGAGAACTACTTTTGAACTTGAATTTGTGCTTTATTTACTTGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGTGAGAACTACTTTTGAACTTGAATTTGTGCTTTATTTACTTGT  988

seq1  GATCAAATGGAATTATGGGTGAACAGCAGTCCTATGCAGGCTTCGAGCTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAATGGAATTATGGGTGAACAGCAGTCCTATGCAGGCTTCGAGCTT  1038

seq1  TGAGGCTGGTATAGCGAATCCAGATTTCCACAAGAACTCCCAGACTTAAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTGGTATAGCGAATCCAGATTTCCACAAGAACTCCCAGACTTAAT  1088

seq1  CTGTCACAGTGAATTC  1112
      ||||||||||||||||
seq2  CTGTCACAGTGAATTC  1104

seq1: chr3_75066394_75067462
seq2: B6Ng01-133N09.g_69_1128

seq1  GAATTCTAAAGTAATATTCAGGCATTTATAATGTATGGACACCTTTAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAAGTAATATTCAGGCATTTATAATGTATGGACACCTTTAAAC  50

seq1  GATGGTGGGGAAAATAGAGAGGAAGAGAAAAAATAGCTGTACATCAGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGGGGAAAATAGAGAGGAAGAGAAAAAATAGCTGTACATCAGTTG  100

seq1  TCAGAGCAAATAGAATAATGTCATATACTTAAAGTCTAAGACCTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGCAAATAGAATAATGTCATATACTTAAAGTCTAAGACCTGTGAAA  150

seq1  CACAGTTGACCTTTGATAAATTACTGAGCACCTAAATCAATGGAAAACTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTGACCTTTGATAAATTACTGAGCACCTAAATCAATGGAAAACTA  200

seq1  TCACCAACTATTGCACCATTGAAGGAGACTATAAAATTATTGGCCTTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAACTATTGCACCATTGAAGGAGACTATAAAATTATTGGCCTTATA  250

seq1  AACTTGATTATATTTACAGGTTAATGACCTCATTTAACACAGATCAAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGATTATATTTACAGGTTAATGACCTCATTTAACACAGATCAAAGA  300

seq1  GAATGAATATGCATGACTGCTAATCAGCAATGAGAAAAACATTTAATTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAATATGCATGACTGCTAATCAGCAATGAGAAAAACATTTAATTTC  350

seq1  TTAAAATAGAACCTTGGAACCCAGATGATCGGGTGAATCAGTTGGATTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATAGAACCTTGGAACCCAGATGATCGGGTGAATCAGTTGGATTGA  400

seq1  ACCAGCCCTCTAGAAATTCTAACTCTATTCTAGCACTGTTTTGTAGCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCCCTCTAGAAATTCTAACTCTATTCTAGCACTGTTTTGTAGCTGT  450

seq1  CTTTGACTACATTGTGGGTTCTTTCTTCCACCCTTTTCTACCCTTTTCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGACTACATTGTGGGTTCTTTCTTCCACCCTTTTCTACCCTTTTCCT  500

seq1  TCACCCCTTTCAAACCCTATCAGTAGATAGGAGAGATAAAAATAGAGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCCTTTCAAACCCTATCAGTAGATAGGAGAGATAAAAATAGAGATG  550

seq1  AAGGGAGCAATGTTATCTCTAGACTAATTTCTGCTATTTGGGGGCATTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAGCAATGTTATCTCTAGACTAATTTCTGCTATTTGGGGGCATTAA  600

seq1  GTTACTTGTTAAAGTTTCCTCTTCCTGTCAGGATATCTAATTTTTTCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTTGTTAAAGTTTCCTCTTCCTGTCAGGATATCTAATTTTTTCTTC  650

seq1  TTGTTGTTTATTCTTTGTGCACAATTAATTAACAAACTGTGCCCAACAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTTTATTCTTTGTGCACAATTAATTAACAAACTGTGCCCAACAGC  700

seq1  AACCAATGAACAACCAACAACAACCTTACACCCACAACTACACCACCACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAATGAACAACCAACAACAACCTTACACCCACAACTACACCACCACC  750

seq1  TTACCTCTCAGGACCCTAGCATTTGTACCCTCTGAAAAGTCCCCAGAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTCTCAGGACCCTAGCATTTGTACCCTCTGAAAAGTCCCCAGAGTT  800

seq1  CCAAATATCACACACAATCACAGAAACTGTCTGCAGCTGGCAAAACCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATATCACACACAATCACAGAAACTGTCTGCAGCTGGCAAAACCATG  850

seq1  CCCCTGCTAGAGCATGAGTTAAATTATAGTCAGCTGCTGCAGACAATCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCTAGAGCATGAGTTAAATTATAGTCAGCTGCTGCAGACAATCTG  900

seq1  AACCAGCCCCGTATGCCACATCTGGAATTAAAATGAAAACATATTCCTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGCCCCGTATGCCACATCTGGGATTAAAATGAAAACATATTCCTAT  950

seq1  AATATTTCTGTGTTTTTCAATGGAACCAAAACTACAAAATTATCACTCTA  1000
       |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||
seq2  -ATATTTCTGTGTTTTTCAATGGAA-CAAAAC-ACAAA--TATCACTCTA  995

seq1  CTAGCTCTCTTCTCCTGATGTCAAAAACCCAAATGTCAGGAGAGAGAGAG  1050
      ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||
seq2  CTAGCTCTCTTCT-CTGATGTCAAAA---CCAATGTCA-GAGAGAGAGAG  1040

seq1  GGAG-AGAGAGGGAGGGGGA  1069
      |||| ||||||||||||| |
seq2  GGAGAAGAGAGGGAGGGGCA  1060