BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137N15
Chromosome3 (Build37)
Map Location 15,583,961 - 15,793,391
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100038947, LOC622425
Upstream geneE2f5, 1810022K09Rik, LOC100039929, Car13, EG545507, Car1, LOC100041785, Car3, Car2, EG634323, LOC100039985, LOC751864, Sirpb1, LOC668101
Downstream geneLOC664795, LOC381484, Ythdf3, LOC100040034
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137N15.bB6Ng01-137N15.g
ACCDH937259DH937260
length1,114925
definitionDH937259|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137N15, 5' end.DH937260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137N15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,792,338 - 15,793,391)(15,583,961 - 15,584,888)
sequence
gaattctttgcttagttctataccccatttttaatggggttatttgaatt
tctggagtccagcttcttgagctctttgtacagcgacagacaggtagatc
aatgaaatacaattgaagacccaaaaatgaatccacacagctatggtcac
ttgatctttgacaagggagctaaaaccatccagtggaaaaaaagacagca
ttttcaacaaatggtgctggcacaactggtggttatcatgtagaaggatg
tgaattgatccattcttatctccttgtacaaagctcaagtctaagtggat
caaagatctccgcataaaactagagacactgaaatttatagaggataaag
tggggaaaagcctcgaagatatgggcactggggaaaaattcctaaacaga
acaacaatggcttgtgctgtaacatcaagatttgacaaatgggacctcat
gaaattgcaaagcttctgtaaggcaaaagacactgtcaataagacaaaaa
ggccaccaacagattgggaaagaatttttaccaatcctaagtcagatagg
ggactaatatccttttgtgtacttgtatcttttcagatggtgttgctttg
acatgacttgaattatttagttattttatggttaacatcaactgtttctc
ttgctgtttcttcctcattgataaacaaccctgtggttaatacacttgag
tcaacaagagtaacatttattgcagaccagcatggtgagctgaccttggt
gctaaatacatttaatgtttactgttctctctgtataactgtggtcctac
agctgggatgctatagaatctatttgcaattctcttaacaaacctaccta
attgagctgatgagctatctttgcggcatccacagtctggccttcaccat
gagcatcccagccctttatcaatatcagcagagatgcccaggctgttgat
cattgggctaatctgaagtcaaatgagatgaaatctcagaagaagactgg
aatgttgacttcatgtagatttagctcagattattgaagtctgtatgtgt
gtctaaggagatgataagatgaagaagtgtaatgaacatgttgtgtctcc
tcctattgatcttg
gaattctagttcttaagagaatcctaacaaaaagatgacagaaatgaggc
cataactcaccaaatccttaggagtagaacaaaagttgagaacgatgttc
tctaggtttaagagttcatgtactctctgttttgaacagactggggcctt
tcattttgtgctttccaatcattcccctttgaaaaaatatggctaccctt
tgcttgtcccagtgtttcatttatatgtagatgatttttagtgatttcag
ttttacaactgaagtgaatttgcccctaaatagttcatgccttgagtctc
acctatatttaatatgagtggtcttttgagtcagtgctataagaaagggt
taagaccttgagattatttgaacttaatttatgtgtttagacacacattt
gtgagaaatgacagaatgctatggttccaatctatcctctaaagtttgtg
catatgtcgaaaaattaatcctctaattttaggataatagtatttggtga
gaggtctttggagttagttagatgagatcccatatacaaccaccaaactc
agacaccattgtggatgccaacaggatcctgatatagttgtctcctgaga
cactctgccagtgcctgacaaatacagaagtggatgttcacagtcatcca
ttggactgagaacaggatccccaagaaggagctagggaaagtactcaagg
aactgaaagggtttgcagccgcataggaggaactacaatatgaactaaca
agtacccccagagctcccttggtctaaaccaccaatcaaagaaaatacat
ggtgggactcatggttctagctgcatatgtagcagaggatggcctagttg
gtcatcaataggaggagaggctcttggtccctgtgaagttctatattcag
ggctagaagtagagtgggtaggttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_15792338_15793391
seq2: B6Ng01-137N15.b_112_1161 (reverse)

seq1  CAAGATCAATAGGA-GAGACACAACACTGTTCATTACACTTTCTTCATCT  49
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| 
seq2  CAAGATCAATAGGAGGAGACACAACA-TGTTCATTACAC-TTCTTCATC-  47

seq1  TTATCATCTTCCTTAGACACACATTACAGACTTCAATAATCTGAGCTAAA  99
      |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATC-TCCTTAGACACACA-TACAGACTTCAATAATCTGAGCTAAA  95

seq1  TCTACATGAAGTCCACATTCCAAGTTCTCTTCTGAGATCTCATCTCATTT  149
      ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||
seq2  TCTACATGAAGTCAACATTCC-AGTCTTCTTCTGAGATTTCATCTCATTT  144

seq1  GACTTCAGATTAGCCCAATGATCAACAGCCTGGGCATCTCTGCTGATATT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCAGATTAGCCCAATGATCAACAGCCTGGGCATCTCTGCTGATATT  194

seq1  GATAAA-GGCTGGGATGCTCATGGTGAAGGCCAGACTGTGGATGCCGCAA  248
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGGGCTGGGATGCTCATGGTGAAGGCCAGACTGTGGATGCCGCAA  244

seq1  AGATAGCTCATCAGCTCAATTAGGTAGGTTTGTTAAGAGAATTGCAAATA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCTCATCAGCTCAATTAGGTAGGTTTGTTAAGAGAATTGCAAATA  294

seq1  GATTCTATAGCATCCCAGCTGTAGGACCACAGTTATACAGAGAGAACAGT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTATAGCATCCCAGCTGTAGGACCACAGTTATACAGAGAGAACAGT  344

seq1  AAACATTAAATGTATTTAGCACCAAGGTCAGCTCACCATGCTGGTCTGCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTAAATGTATTTAGCACCAAGGTCAGCTCACCATGCTGGTCTGCA  394

seq1  ATAAATGTTACTCTTGTTGACTCAAGTGTATTAACCACAGGGTTGTTTAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTTACTCTTGTTGACTCAAGTGTATTAACCACAGGGTTGTTTAT  444

seq1  CAATGAGGAAGAAACAGCAAGAGAAACAGTTGATGTTAACCATAAAATAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGGAAGAAACAGCAAGAGAAACAGTTGATGTTAACCATAAAATAA  494

seq1  CTAAATAATTCAAGTCATGTCAAAGCAACACCATCTGAAAAGATACAAGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATAATTCAAGTCATGTCAAAGCAACACCATCTGAAAAGATACAAGT  544

seq1  ACACAAAAGGATATTAGTCCCCTATCTGACTTAGGATTGGTAAAAATTCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAAGGATATTAGTCCCCTATCTGACTTAGGATTGGTAAAAATTCT  594

seq1  TTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCT  644

seq1  TACAGAAGCTTTGCAATTTCATGAGGTCCCATTTGTCAAATCTTGATGTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAGCTTTGCAATTTCATGAGGTCCCATTTGTCAAATCTTGATGTT  694

seq1  ACAGCACAAGCCATTGTTGTTCTGTTTAGGAATTTTTCCCCAGTGCCCAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCACAAGCCATTGTTGTTCTGTTTAGGAATTTTTCCCCAGTGCCCAT  744

seq1  ATCTTCGAGGCTTTTCCCCACTTTATCCTCTATAAATTTCAGTGTCTCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCGAGGCTTTTCCCCACTTTATCCTCTATAAATTTCAGTGTCTCTA  794

seq1  GTTTTATGCGGAGATCTTTGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATGCGGAGATCTTTGATCCACTTAGACTTGAGCTTTGTACAAGGA  844

seq1  GATAAGAATGGATCAATTCACATCCTTCTACATGATAACCACCAGTTGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGAATGGATCAATTCACATCCTTCTACATGATAACCACCAGTTGTG  894

seq1  CCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTTCCACTGGATGGTTTTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTTTTTCCACTGGATGGTTTTA  944

seq1  GCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGCTGTGTGGATTCATTTTTGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGCTGTGTGGATTCATTTTTGG  994

seq1  GTCTTCAATTGTATTTCATTGATCTACCTGTCTGTCGCTGTACAAAGAGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCAATTGTATTTCATTGATCTACCTGTCTGTCGCTGTACAAAGAGC  1044

seq1  TCAAGA  1054
      ||||||
seq2  TCAAGA  1050

seq1: chr3_15583961_15584888
seq2: B6Ng01-137N15.g_68_992

seq1  GAATTCTAGTTCTTAAGAGAATCCTAACAAAAAGATGAGAGAAATGAGGC  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GAATTCTAGTTCTTAAGAGAATCCTAACAAAAAGATGACAGAAATGAGGC  50

seq1  CATAACTCACCAAACCCTTAGGAGTAGAACAAAATTTGAGAACGATGTTC  100
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CATAACTCACCAAATCCTTAGGAGTAGAACAAAAGTTGAGAACGATGTTC  100

seq1  TCTATGTTTAAGTGTTCATGTTCTCTCTGTTTTGAACAGACTGGGGCCTT  150
      |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTTTAAGAGTTCATGTACTCTCTGTTTTGAACAGACTGGGGCCTT  150

seq1  TCATTTTGTGCTTTCCAATCATTCCCCTTTGAAAAAATATGGCTGCCCTT  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCATTTTGTGCTTTCCAATCATTCCCCTTTGAAAAAATATGGCTACCCTT  200

seq1  TGCTTGTCCCAGTGTTTCATTTATATGTAGATGATTTTTAGTGATTTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTCCCAGTGTTTCATTTATATGTAGATGATTTTTAGTGATTTCAG  250

seq1  TTTTACAACTGAAGTGAATTTGCCCCTAAATAGTTCATGCCTTGAGTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACAACTGAAGTGAATTTGCCCCTAAATAGTTCATGCCTTGAGTCTC  300

seq1  ACCCATATTTAATATGAGTGGTCTTTTGAGTCAGTGCTATCAGGAAGGGT  350
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
seq2  ACCTATATTTAATATGAGTGGTCTTTTGAGTCAGTGCTATAAGAAAGGGT  350

seq1  TAAGACCTTAAGATTATTTGAATTTAATTTATGTGTTTAGACACACATTT  400
      ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACCTTGAGATTATTTGAACTTAATTTATGTGTTTAGACACACATTT  400

seq1  GTGAGAAATGACAGAATGCTATGGTTCCAATCTATCCTCTAAAGTTTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAATGACAGAATGCTATGGTTCCAATCTATCCTCTAAAGTTTGTG  450

seq1  CATATGTTGAAAAATTAATCCTCTAATTTTAGGTTAATGGTATTTGGTGA  500
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  CATATGTCGAAAAATTAATCCTCTAATTTTAGGATAATAGTATTTGGTGA  500

seq1  GAGGTCTTTTGAGATAGTTAGATGAGATCATATATACAACCACCAAACCC  550
      ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |
seq2  GAGGTCTTTGGAGTTAGTTAGATGAGATCCCATATACAACCACCAAACTC  550

seq1  AGACATCATTGTGGATGCCAACAGGAGCCTGATATAGCTGTCTCCTGAGA  600
      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  AGACACCATTGTGGATGCCAACAGGATCCTGATATAGTTGTCTCCTGAGA  600

seq1  CACTATACCAGTACCTGACAAATACAGAAGTGGATACTCACAGTCATCCA  650
      |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
seq2  CACTCTGCCAGTGCCTGACAAATACAGAAGTGGATGTTCACAGTCATCCA  650

seq1  TTGGACTGAGCACAGGGTCCCCAATGAAGGAGCTAGAGAAAGTACTCAAG  700
      |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTGGACTGAGAACAGGATCCCCAA-GAAGGAGCTAGGGAAAGTACTCAAG  699

seq1  GAACTGAAAGGGTTTGCAGCCCCATAGGAGGAACTACAATATGAACTAAC  750
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAAAGGGTTTGCAGCCGCATAGGAGGAACTACAATATGAACTAAC  749

seq1  AAGTACCCCCAGAGCTCCCTTTGTCTAAACCACCAATCAAAGAAAATACG  800
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAGTACCCCCAGAGCTCCCTTGGTCTAAACCACCAATCAAAGAAAATACA  799

seq1  TGGTGGGACTCATGGTTCTAGGTGCATATGTAGCAGAGGATGGCCTCCTT  850
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  TGGTGGGACTCATGGTTCTAGCTGCATATGTAGCAGAGGATGGCCTAGTT  849

seq1  GGTCATCAATAGGAGGAGAGGCCCTTGGT-CCTGCGAAGGTTCTATACTC  899
      |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||
seq2  GGTCATCAATAGGAGGAGAGGCTCTTGGTCCCTGTGAA-GTTCTATATTC  898

seq1  AGGGCTAGGAAGTATGAGTGGGTGGGTTG  928
      ||||||| |||||| |||||||| |||||
seq2  AGGGCTA-GAAGTA-GAGTGGGTAGGTTG  925