BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148M10
Chromosome3 (Build37)
Map Location 117,898,312 - 118,028,384
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneD3Bwg0562e, 4833424O15Rik, EG668759, Snx7, LOC100043260
Downstream geneDpyd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148M10.bB6Ng01-148M10.g
ACCDH945291DH945292
length9901,026
definitionDH945291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M10, 5' end.DH945292|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,027,394 - 118,028,384)(117,898,312 - 117,899,341)
sequence
gaattctcctttaaataaaaacgaagtcagattttagaatgaaattctct
agtgctgtcaaactgtttgaaactggatttggcagttgtcctttcaaact
gttatttcagagcacgtgtcccagaagggacagctaagaatgcttgtcat
atttgaactctttccagaaccattcagcaggatactggcagtccacttgt
tcgtgttaattatttctgccctgattgcctggcaacacataacatgggaa
gtattatattttgctatttgagaatgcttccagcagaatgcagggagaaa
atggaatacaaagtcggctggaaatgtaacttaataagttaggtgtgtat
tttgattgaaaatttgttacagatgaagtggtttgtaatcccatgattgt
gttaaccacagtttcagagagcttgagggtgtctcagtggatattggtag
aatgaaactaatgatagatcttaatggccagcacaccacaatcgatgaac
atgaatggtctcccttgtaggcagaatggatgcatatgtgtgtgtgacca
tgtgttacacataggtatgatgggcagctgctcatgcaatgggatttgtt
tacctgtgcctctctggtggggttgggaagaagagagctttgaatgacag
actttatagcactctataatggtttttttgtgtgtgtgtgtgtgtgataa
tgttttattaccttgaagtcacataggcaccaccagtcccaacaacctcc
ttatttgcattctgcaaagtgatgggcaaataggaatacatatgactcac
acaagcatatgaactcaagcccagatcttttaatgtggcccctaaggact
aagtcccctcatgcttactcaacaagtgctgtccccaaaagggccatctt
cttagcctataaagccacatatttcatcctgggtaatttctccttctctc
tccgctcctctttctttccatctttccttggctgcttgct
gaattcaaaagcaatgccgttttcaaatgcaaaaactgatcataaactgt
aaactctttgtttatttagcagagctaaaaagatggcccaacaggtcagg
ctgcttgccaccaagcctgataactagaatccaatcctggataccatata
ttgaaggagaggatcaaatgatgcaggttgtaacaatgtgtgtccagata
tacacacatgatataagtatagaaagatgatattcaaataactgggtagg
agctgggactcagttgtcactagtgtttgcaatgcaagaatgaggatgtg
agtctggatctccagactcccataaacagctaagtacagcaatgtatgcc
catagtccccacgcttgaaggtagagacacagatgcaactctggctctca
ctgggcatccagatttgcctaatgggtgggctccaggttcactctgtctc
aaacattaaggagggaggttgctatagatgacccaccattaacttagcac
ttagttactgattcttttttaaggatcaggtaatagtgctactgagaatt
ggaagaagaactgagaaatgccctatggatatgaaatggttgatgccaca
tcaactcacaactcccggttgcctgcataagacctgtgcaagatcaaaca
ggtccgaactccaccatagatatgctgagtgtatgcatgagggagacttc
cagaggcctcacacctaacagaagagccattggcagtttacacctgctca
gagagggagaattgcacttcgttgggaatgtggctaattattggttgtcc
cagtgggatggtttcaaactcatgtgtttatggtctttgctagtttgaca
caggagttgtaagtaacaacaatagtgaaggacataaaattccagttgga
gctggtttgcttggttctgggggagtttgagagggaagtcaaggttagct
aaatcaaaatacattgcataaatgtaataaaattttctagatttaattta
aaatttaaattagcagggattgagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_118027394_118028384
seq2: B6Ng01-148M10.b_46_1035 (reverse)

seq1  AGCAAGCA---AAGGAAAGGATGGAAAGAAAGAGGAGCGGAAGAGAGGAA  47
      ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||
seq2  AGCAAGCAGCCAAGGAAA-GATGGAAAGAAAGAGGAGCGG-AGAGA-GAA  47

seq1  GGAGAAATTACCACAGGATGAAATAATGTGGCTTTATAGGCTAAGAAGAT  97
      |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAATTACC-CAGGATGAAAT-ATGTGGCTTTATAGGCTAAGAAGAT  95

seq1  GGCCCTTTGGGGAACAGCACTTGTTGAGTAAGCATGA-GGGACTTAGTCC  146
      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGCCCTTTTGGGGACAGCACTTGTTGAGTAAGCATGAGGGGACTTAGTCC  145

seq1  TTAGGGGCCACATTAAAAGATCTGGGCTTGAGTTCATATGCTTGTGTGAG  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGCCACATTAAAAGATCTGGGCTTGAGTTCATATGCTTGTGTGAG  195

seq1  TCATATGTATTCCTATTTGCCCATCACTTTGCAGAATGCAAATAAGGAGG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATGTATTCCTATTTGCCCATCACTTTGCAGAATGCAAATAAGGAGG  245

seq1  TTGTTGGGACTGGTGGTGCCTATGTGACTTCAAGGTAATAAAACATTATC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGGGACTGGTGGTGCCTATGTGACTTCAAGGTAATAAAACATTATC  295

seq1  ACACACACACACACACAAAAAAACCATTATAGAGTGCTATAAAGTCTGTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACAAAAAAACCATTATAGAGTGCTATAAAGTCTGTC  345

seq1  ATTCAAAGCTCTCTTCTTCCCAACCCCACCAGAGAGGCACAGGTAAACAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAAGCTCTCTTCTTCCCAACCCCACCAGAGAGGCACAGGTAAACAA  395

seq1  ATCCCATTGCATGAGCAGCTGCCCATCATACCTATGTGTAACACATGGTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCATTGCATGAGCAGCTGCCCATCATACCTATGTGTAACACATGGTC  445

seq1  ACACACACATATGCATCCATTCTGCCTACAAGGGAGACCATTCATGTTCA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACATATGCATCCATTCTGCCTACAAGGGAGACCATTCATGTTCA  495

seq1  TCGATTGTGGTGTGCTGGCCATTAAGATCTATCATTAGTTTCATTCTACC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATTGTGGTGTGCTGGCCATTAAGATCTATCATTAGTTTCATTCTACC  545

seq1  AATATCCACTGAGACACCCTCAAGCTCTCTGAAACTGTGGTTAACACAAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCACTGAGACACCCTCAAGCTCTCTGAAACTGTGGTTAACACAAT  595

seq1  CATGGGATTACAAACCACTTCATCTGTAACAAATTTTCAATCAAAATACA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGATTACAAACCACTTCATCTGTAACAAATTTTCAATCAAAATACA  645

seq1  CACCTAACTTATTAAGTTACATTTCCAGCCGACTTTGTATTCCATTTTCT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAACTTATTAAGTTACATTTCCAGCCGACTTTGTATTCCATTTTCT  695

seq1  CCCTGCATTCTGCTGGAAGCATTCTCAAATAGCAAAATATAATACTTCCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCATTCTGCTGGAAGCATTCTCAAATAGCAAAATATAATACTTCCC  745

seq1  ATGTTATGTGTTGCCAGGCAATCAGGGCAGAAATAATTAACACGAACAAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTATGTGTTGCCAGGCAATCAGGGCAGAAATAATTAACACGAACAAG  795

seq1  TGGACTGCCAGTATCCTGCTGAATGGTTCTGGAAAGAGTTCAAATATGAC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGCCAGTATCCTGCTGAATGGTTCTGGAAAGAGTTCAAATATGAC  845

seq1  AAGCATTCTTAGCTGTCCCTTCTGGGACACGTGCTCTGAAATAACAGTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTCTTAGCTGTCCCTTCTGGGACACGTGCTCTGAAATAACAGTTT  895

seq1  GAAAGGACAACTGCCAAATCCAGTTTCAAACAGTTTGACAGCACTAGAGA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGACAACTGCCAAATCCAGTTTCAAACAGTTTGACAGCACTAGAGA  945

seq1  ATTTCATTCTAAAATCTGACTTCGTTTTTATTTAAAGGAGAATTC  991
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATTCTAAAATCTGACTTCGTTTTTATTTAAAGGAGAATTC  990

seq1: chr3_117898312_117899341
seq2: B6Ng01-148M10.g_66_1091

seq1  GAATTCAAAAGCAATGCCGTTTTCAAATGCAAAAACTGATCATAAACTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAGCAATGCCGTTTTCAAATGCAAAAACTGATCATAAACTGT  50

seq1  AAACTCTTTGTTTATTTAGCAGAGCTAAAAAGATGGCCCAACAGGTCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCTTTGTTTATTTAGCAGAGCTAAAAAGATGGCCCAACAGGTCAGG  100

seq1  CTGCTTGCCACCAAGCCTGATAACTAGAATCCAATCCTGGATACCATATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTGCCACCAAGCCTGATAACTAGAATCCAATCCTGGATACCATATA  150

seq1  TTGAAGGAGAGGATCAAATGATGCAGGTTGTAACAATGTGTGTCCAGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGAGAGGATCAAATGATGCAGGTTGTAACAATGTGTGTCCAGATA  200

seq1  TACACACATGATATAAGTATAGAAAGATGATATTCAAATAACTGGGTAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACATGATATAAGTATAGAAAGATGATATTCAAATAACTGGGTAGG  250

seq1  AGCTGGGACTCAGTTGTCACTAGTGTTTGCAATGCAAGAATGAGGATGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGACTCAGTTGTCACTAGTGTTTGCAATGCAAGAATGAGGATGTG  300

seq1  AGTCTGGATCTCCAGACTCCCATAAACAGCTAAGTACAGCAATGTATGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGGATCTCCAGACTCCCATAAACAGCTAAGTACAGCAATGTATGCC  350

seq1  CATAGTCCCCACGCTTGAAGGTAGAGACACAGATGCAACTCTGGCTCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCCCCACGCTTGAAGGTAGAGACACAGATGCAACTCTGGCTCTCA  400

seq1  CTGGGCATCCAGATTTGCCTAATGGGTGGGCTCCAGGTTCACTCTGTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCATCCAGATTTGCCTAATGGGTGGGCTCCAGGTTCACTCTGTCTC  450

seq1  AAACATTAAGGAGGGAGGTTGCTATAGATGACCCACCATTAACTTAGCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTAAGGAGGGAGGTTGCTATAGATGACCCACCATTAACTTAGCAC  500

seq1  TTAGTTACTGATTCTTTTTTAAGGATCAGGTAATAGTGCTACTGAGAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTACTGATTCTTTTTTAAGGATCAGGTAATAGTGCTACTGAGAATT  550

seq1  GGAAGAAGAACTGAGAAATGCCCTATGGATATGAAATGGTTGATGCCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAGAACTGAGAAATGCCCTATGGATATGAAATGGTTGATGCCACA  600

seq1  TCAACTCACAACTCCCGGTTGCCTGCATAAGACCTGTGCAAGATCAAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTCACAACTCCCGGTTGCCTGCATAAGACCTGTGCAAGATCAAACA  650

seq1  GGTCCGAACTCCACCATAGATATGCTGAGTGTATGCATGAGGGAGACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCGAACTCCACCATAGATATGCTGAGTGTATGCATGAGGGAGACTTC  700

seq1  CAGAGGCCTCACACCTAACAGAAGAGCCATTGGCAGTTTACACCTGCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCCTCACACCTAACAGAAGAGCCATTGGCAGTTTACACCTGCTCA  750

seq1  GAGAGGGAGAATTGCACTTCGTTGGGAATGTGGCTAATTATTGGTTGTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGAGAATTGCACTTCGTTGGGAATGTGGCTAATTATTGGTTGTCC  800

seq1  CAGT-GGATGGTTTCAAACTCATGTGTTTATGGTCTTTGCTAGTTTGACA  849
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGATGGTTTCAAACTCATGTGTTTATGGTCTTTGCTAGTTTGACA  850

seq1  CAGGAG-TGTAAGTAACAACAATAGTGAAGGACATAAAA-TCCAGTTGGA  897
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAGGAGTTGTAAGTAACAACAATAGTGAAGGACATAAAATTCCAGTTGGA  900

seq1  GCTGGTTTGCTTGGTTCCTGGGGAGTTTGAGAGGGGAAGTCAGGGTTAGC  947
      |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GCTGGTTTGCTTGGTTCTGGGGGAGTTTGAGA-GGGAAGTCAAGGTTAGC  949

seq1  TAAAATCAAAATACATTGCATAAATGT-ATAAAATTTTCTAAGGATTAAA  996
      | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||
seq2  T-AAATCAAAATACATTGCATAAATGTAATAAAATTTTCTA--GATTTAA  996

seq1  TTTAAAATTTTAAAAATTAGGCAGGGATTGAGAA  1030
      ||||||||||   |||||| ||||||||||||||
seq2  TTTAAAATTT---AAATTA-GCAGGGATTGAGAA  1026