BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154F20
Chromosome3 (Build37)
Map Location 57,959,576 - 58,120,513
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040216, 4921539H07Rik
Upstream geneTm4sf1, LOC383862, Tm4sf4, Wwtr1, Commd2, Gm410, EG623114, Rnf13, LOC675537, Pfn2, EG433594
Downstream geneTsc22d2, D3Ucla1, Eif2a, 2810407C02Rik, 4932431H17Rik, LOC666680, LOC100040251, Siah2, LOC100040293, Clrn1, LOC100040416, Gpr171, P2ry14, Gpr87, P2ry13, P2ry12
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154F20.bB6Ng01-154F20.g
ACCDH949430DH949431
length1,1851,125
definitionDH949430|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154F20, 5' end.DH949431|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154F20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,119,320 - 58,120,513)(57,959,576 - 57,960,709)
sequence
gaattcataatcataaaaacaaagtaaggcatgagacattgaactggtgg
tgttaggatgcctgacatgcaaggtttactagcaggtcagtaagcctgcc
tttacaagtacagcagggtcctgccaaaggtcatgactgatggataggag
atttgaaccaggaaatgaaaaatagctgggatcagttagggagcatggag
ggtaaacaccgagattctaacacagtcaaggtaggggaatgggaaagttt
acatctgggttggttgttcctggaccaaggagaatgtcatcttgtcaaag
ttaatggcaggtggtttgggtcacagagctagcttctggagtggcagtta
ggaccatgtatatgattagaatctgtaaaagaatgtgtggggcttgttcg
aacgatgacacaagggaatgagcatggggacacaatttagagctgaagta
gggtggagttcacgttagctacacatttactgccattagggagagagaga
gaaaaaaatgtagtcagcaatgggacagaggattgtgaaggaggaagggg
gtacatcctcacctgaagcagatgaacaaaaaagccccagcacaggcgtg
tgagaaacggtggtattccagctggtccagaggacagcaaagatagagag
catgagtagagtaagggtcatggctatgtcagaagccacacatgagatgt
aacctatacttatagagaatgatagcacacagccaggccagagcatgaca
aatgaaaacataaggctaaccaactccaggggaacacataataggcaggc
cttaggctttgtctaaacatcagtgtacacccagtagctttggtgagaaa
taattatccttcctgacagcagtaagtggggcctggacttctcattctag
agaaacttgaaacaatgctagttgggaggtattgaatctgtattggaatg
tcacacaacccaattatcatatggactctacccttttagtcagccaggag
aggctctgatatcaaccctcagcactcagcttctgcatacccagcctagt
cttttgaaaggtctgactggagaggttcctaggcatagctagcattctgt
tccgaaaggagtgccaagttctgcaaaagtgaggccttcgacactctggc
tctgctcctatgcatcacgacatacattggcatag
gaattcatggaagaagagttatctagcttaaagatgcagtgggtgcatgg
atgtcaaggtgacttttaacaggatcaagcaatattcctaccctagagaa
ccaagaaactaactcagaatgcagccaaccaacatggctactccggctgg
aatacagacaccaccttggcacacacctttaattccaaacaaggaaggta
aagtagaaagaagcagccatgtttgaaagtgatgcctaattgatagtcaa
acaaagtgatgaatcagagaaagatttgtcagaataggatatgcccaact
ctcaagaacattgagaaaagagaggctacttaagagagagattttatcag
aacagttgtagagagacaggttgcagaaagagaacatgctagacacaggc
gaagaaaaaatgagccagagaattagaacatattgacaaagttagtatga
aggcaagcagagcaatttagtcagaagctgaaagaaatcagtttgaatca
gtcagcctagagaggggttttgagccagaacagctgaattaatcatccat
ccataattcagaaagagctagaaagggtgagcttagagatagtaagtccc
agaggctgaaaaacactctaggcctagataagattatatggaggctagaa
gcttccaggactagggctatgttagcatacagaggtagtaagcctctaag
atgacaattgcatcaggcaaattaaagatacttttacaagcttccatctt
gagaatttctctcttgttctctctggggtataccaactaccatgtgcaag
cctgtcctgtgttaagacctacatggcaaggcactaagagaagggaggct
tcagccaacagccaacaagttgggctgttgaagtccttagcccaacaacc
cacaagtataatctcctgtccacagctatgtgagtaagccaggacatggt
tttccctcctgagtcttcagaggacaacaaagcatcactcctgacacagt
ggaacagaagtacccactgagactatgctctgccacaccaaattgctaac
ttgggagaatttgtatcagtggaggcgttgctagagacggagctataaga
ctgacgttcagacaggtgcccactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_58119320_58120513
seq2: B6Ng01-154F20.b_49_1233 (reverse)

seq1  CTATG-GAATGTA--CTGTGATGCCCATGAGAGCAGAGCCAGA-TGCCAA  46
      |||||  ||||||    ||||||  |||  ||||||||||||| || | |
seq2  CTATGCCAATGTATGTCGTGATG--CATAGGAGCAGAGCCAGAGTGTCGA  48

seq1  AGACATCACATTTTTGCAAGAACTTTGGCATCTCTTTCAGAACCAGAATG  96
      || | ||||  |||||| ||||| ||||||   ||||| ||| |||||||
seq2  AGGCCTCAC--TTTTGC-AGAAC-TTGGCACTCCTTTCGGAA-CAGAATG  93

seq1  CTTAGACTATTGCATAGGAAACTCTCCAGTCAGACTTCTCAAAAGACTAG  146
      | ||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||
seq2  C-TAG-CTA-TGCCTAGGAACCTCTCCAGTCAGACCTTTCAAAAGACTAG  140

seq1  GCTGGGGTATGCAGGAAGCTGAGTGCTGAGGGTTGATATTCAGAGCCTCT  196
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCT-GGGTATGCA-GAAGCTGAGTGCTGAGGGTTGATA-TCAGAGCCTCT  187

seq1  CCTGGCTGACTATATAGGGTAGAGTCCATATGATAATGGGTTTGTGTGAC  246
      |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||
seq2  CCTGGCTGACTA-AAAGGGTAGAGTCCATATGATAATTGGGTTGTGTGAC  236

seq1  ATTCCAATACAGATTCAATACCTCCCAACTAGCATTGTTTCAAGTTTCTC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAATACAGATTCAATACCTCCCAACTAGCATTGTTTCAAGTTTCTC  286

seq1  TAGAATGAGAAGTCCAGGCCCCACTTACTGCTGTCAGGAAGGATAATTAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGAGAAGTCCAGGCCCCACTTACTGCTGTCAGGAAGGATAATTAT  336

seq1  TTCTCACC-AAGCTACTGGGTGTACACTGATGTTTAGACAAAGCCTAAGG  395
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCACCAAAGCTACTGGGTGTACACTGATGTTTAGACAAAGCCTAAGG  386

seq1  CCTGCCTATTATGTGTTCCCCTGGAGTTGGTTAGCCTTATGTTTTCATTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTATTATGTGTTCCCCTGGAGTTGGTTAGCCTTATGTTTTCATTT  436

seq1  GTCATGCTCTGGCCTGGCTGTGTGCTATCATTCTCTATAAGTATAGGTTA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGCTCTGGCCTGGCTGTGTGCTATCATTCTCTATAAGTATAGGTTA  486

seq1  CATCTCATGTGTGGCTTCTGACATAGCCATGACCCTTACTCTACTCATGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCATGTGTGGCTTCTGACATAGCCATGACCCTTACTCTACTCATGC  536

seq1  TCTCTATCTTTGCTGTCCTCTGGACCAGCTGGAATACCACCGTTTCTCAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATCTTTGCTGTCCTCTGGACCAGCTGGAATACCACCGTTTCTCAC  586

seq1  ACGCCTGTGCTGGGGCTTTTTTGTTCATCTGCTTCAGGTGAGGATGTACC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTGTGCTGGGGCTTTTTTGTTCATCTGCTTCAGGTGAGGATGTACC  636

seq1  CCCTTCCTCCTTCACAATCCTCTGTCCCATTGCTGACTACATTTTTTTCT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTCCTCCTTCACAATCCTCTGTCCCATTGCTGACTACATTTTTTTCT  686

seq1  CTCTCTCTCCCTAATGGCAGTAAATGTGTAGCTAACGTGAACTCCACCCT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCCCTAATGGCAGTAAATGTGTAGCTAACGTGAACTCCACCCT  736

seq1  ACTTCAGCTCTAAATTGTGTCCCCATGCTCATTCCCTTGTGTCATCGTTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGCTCTAAATTGTGTCCCCATGCTCATTCCCTTGTGTCATCGTTC  786

seq1  GAACAAGCCCCACACATTCTTTTACAGATTCTAATCATATACATGGTCCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGCCCCACACATTCTTTTACAGATTCTAATCATATACATGGTCCT  836

seq1  AACTGCCACTCCAGAAGCTAGCTCTGTGACCCAAACCACCTGCCATTAAC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCCACTCCAGAAGCTAGCTCTGTGACCCAAACCACCTGCCATTAAC  886

seq1  TTTGACAAGATGACATTCTCCTTGGTCCAGGAACAACCAACCCAGATGTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACAAGATGACATTCTCCTTGGTCCAGGAACAACCAACCCAGATGTA  936

seq1  AACTTTCCCATTCCCCTACCTTGACTGTGTTAGAATCTCGGTGTTTACCC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTCCCATTCCCCTACCTTGACTGTGTTAGAATCTCGGTGTTTACCC  986

seq1  TCCATGCTCCCTAACTGATCCCAGCTATTTTTCATTTCCTGGTTCAAATC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCTCCCTAACTGATCCCAGCTATTTTTCATTTCCTGGTTCAAATC  1036

seq1  TCCTATCCATCAGTCATGACCTTTGGCAGGACCCTGCTGTACTTGTAAAG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCCATCAGTCATGACCTTTGGCAGGACCCTGCTGTACTTGTAAAG  1086

seq1  GCAGGCTTACTGACCTGCTAGTAAACCTTGCATGTCAGGCATCCTAACAC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCTTACTGACCTGCTAGTAAACCTTGCATGTCAGGCATCCTAACAC  1136

seq1  CACCAGTTCAATGTCTCATGCCTTACTTTGTTTTTATGATTATGAATTC  1194
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGTTCAATGTCTCATGCCTTACTTTGTTTTTATGATTATGAATTC  1185

seq1: chr3_57959576_57960709
seq2: B6Ng01-154F20.g_65_1189

seq1  GAATTCATGGAAGAAGAGTTATCTAGCTTAAAGATGCAGTGGGTGCATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGGAAGAAGAGTTATCTAGCTTAAAGATGCAGTGGGTGCATGG  50

seq1  ATGTCAAGGTGACTTTTAACAGGATCAAGCAATATTCCTACCCTAGAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAAGGTGACTTTTAACAGGATCAAGCAATATTCCTACCCTAGAGAA  100

seq1  CCAAGAAACTAACTCAGAATGCAGCCAACCAACATGGCTACTCCGGCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAACTAACTCAGAATGCAGCCAACCAACATGGCTACTCCGGCTGG  150

seq1  AATACAGACACCACCTTGGCACACACCTTTAATTCCAAACAAGGAAGGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGACACCACCTTGGCACACACCTTTAATTCCAAACAAGGAAGGTA  200

seq1  AAGTAGAAAGAAGCAGCCATGTTTGAAAGTGATGCCTAATTGATAGTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGAAAGAAGCAGCCATGTTTGAAAGTGATGCCTAATTGATAGTCAA  250

seq1  ACAAAGTGATGAATCAGAGAAAGATTTGTCAGAATAGGATATGCCCAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGTGATGAATCAGAGAAAGATTTGTCAGAATAGGATATGCCCAACT  300

seq1  CTCAAGAACATTGAGAAAAGAGAGGCTACTTAAGAGAGAGATTTTATCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAACATTGAGAAAAGAGAGGCTACTTAAGAGAGAGATTTTATCAG  350

seq1  AACAGTTGTAGAGAGACAGGTTGCAGAAAGAGAACATGCTAGACACAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTTGTAGAGAGACAGGTTGCAGAAAGAGAACATGCTAGACACAGGC  400

seq1  GAAGAAAAAATGAGCCAGAGAATTAGAACATATTGACAAAGTTAGTATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAAAATGAGCCAGAGAATTAGAACATATTGACAAAGTTAGTATGA  450

seq1  AGGCAAGCAGAGCAATTTAGTCAGAAGCTGAAAGAAATCAGTTTGAATCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGCAGAGCAATTTAGTCAGAAGCTGAAAGAAATCAGTTTGAATCA  500

seq1  GTCAGCCTAGAGAGGGGTTTTGAGCCAGAACAGCTGAATTAATCATCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCCTAGAGAGGGGTTTTGAGCCAGAACAGCTGAATTAATCATCCAT  550

seq1  CCATAATTCAGAAAGAGCTAGAAAGGGTGAGCTTAGAGATAGTAAGTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAATTCAGAAAGAGCTAGAAAGGGTGAGCTTAGAGATAGTAAGTCCC  600

seq1  AGAGGCTGAAAAACACTCTAGGCCTAGATAAGATTATATGGAGGCTAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTGAAAAACACTCTAGGCCTAGATAAGATTATATGGAGGCTAGAA  650

seq1  GCTTCCAGGACTAGGGCTATGTTAGCATACAGAGGTAGTAAGCCTCTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCAGGACTAGGGCTATGTTAGCATACAGAGGTAGTAAGCCTCTAAG  700

seq1  ATGACAATTGCATCAGGCAAATTAAAGATACTTTTACAAGCTTCCATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAATTGCATCAGGCAAATTAAAGATACTTTTACAAGCTTCCATCTT  750

seq1  GAGAATTTCTCTCTTGTTCTCTCTGGGGTATACCAACTACCATGTGCAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATTTCTCTCTTGTTCTCTCTGGGGTATACCAACTACCATGTGCAAG  800

seq1  CCTGTCCTGTGTTAAGACCTACATGGCAAGGCACTAAGAGAAGGGAGGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTGTGTTAAGACCTACATGGCAAGGCACTAAGAGAAGGGAGGCT  850

seq1  TCAGCCAACAGCCAACAAGTTGGGCTGTTGAAGTCCTTAGCCCAACAACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCAACAGCCAACAAGTTGGGCTGTTGAAGTCCTTAGCCCAACAACC  900

seq1  CACAAGTATAATCTCCTGTCCACAGCTATGTGAGTAAGCCAAGGACATGG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CACAAGTATAATCTCCTGTCCACAGCTATGTGAGTAAGCC-AGGACATGG  949

seq1  TTTTCCCTCCTGAGTCTTCAGAGGACAACAAAGCCAATCACCTCCTGACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||
seq2  TTTTCCCTCCTGAGTCTTCAGAGGACAACAAAGC--ATCA-CTCCTGACA  996

seq1  CAGTGGAACAGGAAGTACCCCACTGAGACTATGCTCTGCCACACCAAATT  1050
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGAACA-GAAGTA-CCCACTGAGACTATGCTCTGCCACACCAAATT  1044

seq1  GCTAACTTGGGAGAATTTGTTATCAGTGAGGGCGTTGCTAGAGACAGGAA  1100
      ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |
seq2  GCTAACTTGGGAGAATTTG-TATCAGTGGAGGCGTTGCTAGAGAC--GGA  1091

seq1  GCTATAAAGACTGACGTTCAG-CAGGTGCCCACTC  1134
      ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCTAT-AAGACTGACGTTCAGACAGGTGCCCACTC  1125