BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156A22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 60,555,405 - 60,758,459
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC676933, LOC100040501, EG666853
Upstream geneLOC433597, LOC433598, LOC100040407, LOC669780, EG666803, C130079G13Rik, LOC676914, Aadacl2, Aadac, Sucnr1, LOC669823, LOC100040485, Mbnl1
Downstream geneP2ry1, Rap2b, LOC666891
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156A22.bB6Ng01-156A22.g
ACCDH950665DH950666
length1,1241,093
definitionDH950665|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156A22, 5' end.DH950666|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156A22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,757,326 - 60,758,459)(60,555,405 - 60,556,503)
sequence
gaattcttgaagccccttgcctacatcatataaatagtgcagatgtctgg
catacttggtttttaacttgaggtttttaaaactcaacaatggaagagct
ttgaaaaatgactctaacatgttggctattttgagttaaaggcactcgaa
ggcaggcagcacaagaagataattctgacttcctttctgttttgtaaagg
caggaaatatgaacagcatcatccctacactaaaggaagcaataatctta
tcaccaaggacaggaagttcaagctagtagaattctatacagacccagct
aaaattagcttatcttctcagcttccccatgaaagctagctgttgtcttg
tgactcagtatccttgtccagctcagtgtgtatgcaactgatgccaaatg
cttctttgttgttgtttaccattttagaaaagttattttgtcctgaaaaa
cttctattcgctacatttctatgcttttctcccattgaggaataaacatg
gcaaaatctaccttatttctctacacctcttgtagcaattattttttttc
attctgttatttcttttgtctcatttatatattcttatccaaaacatgtt
ctagcaagagagctactatgtaaagtaacagtaaacttattataagccat
ttttaatttgtctgacctaatactattaattaggtctgttgggttaaatt
ttataaattattttcctactgatatttctcctagaagcaaaacatatact
tttcatcagtatagaatattttctggggtagaatttttttctatatctct
agattccattgttgagagcctgagaccgtaactgacaatgtgtacatcta
taagattaagaaatgggatctctgtgcatagggaaaatttaaaaggaata
gcttagtaagtgttcaccattgagcacatgtggccctgacatgcagtggt
gggggcaggtggagagacccttctatgggaggaacaatggctgcacagca
gcagagacagagtctacaacaatgttgtcatactttttttatgcagctgt
agatcattgattcacctgtggcttccactgcagccggaactccaatgaat
ggaggtgttctctggcagctgctt
gaattcttgtttccatgacatttatctcccacctaggaactgcctactaa
gtcccacagtttctctacatgctcctgagtctgctaccctttctttaccc
acttcccctcagacctaactgctctatctttccttgtgctcttcagggtc
tgtacattgcaagttttcttttctcctctgaagagctgcctgttatgtcc
cagagcttccttaagtccttctgagcctctgaaaccttgcccttctgttc
tctcagctccctcctggaagtcctgttgcttctctatgtatttctggttt
ctacagcaatggaagtcccttcagtaggattcctttttgtggttctttgt
tccttatggccacactgtcctctggctcttagcttccttatcctccctgg
gcagagttcttttaacaacccttcttccttccctccttagactcagtttc
tttcttggattcagagattttcttaaaacctagttgtcttactgacaatg
ccttggcctcagtgtagctagatggacaaatatggcacactcaagttcca
aaattttacagattgtagcaaccaatgtgacttcataggcaaatgatccc
aaagtcttttatctctaaggttctagaactttccacacttaaatcgttct
gctctcaagaaattttttgcgactattgtgtaaagagtctttatctcagg
atgattaacttcattggttataggtaaagaatctgtcaaaatctataaca
aaatttgttttaaagcttataagaaaaggcttagttaaaaacctatatgt
agatattcttaatttgctacaatctactgtatatgtgattcggccctaga
atatataatttggattcaattcttgttttgaaatagatctgctagaaaat
gtatctttcttctgtcttggctgacgacctcatcacataaagcaaccagt
tgactggcagccatctttactaaagttagagtacatgccatgtgacctca
ccatcttaaatgagcatatgtgtaaagacattataaaaactctcattccc
agtgagctcttaagtatacattgtatcttcctttggaggctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_60757326_60758459
seq2: B6Ng01-156A22.b_47_1170 (reverse)

seq1  AAGCAGCTGCCAGAGACACCCTTCCTTTTCATGGGAGTTTTCGGGCTGCA  50
      |||||||||||||||| || | |||  ||||| ||||  ||| |||||||
seq2  AAGCAGCTGCCAGAGA-ACACCTCC-ATTCATTGGAG--TTCCGGCTGCA  46

seq1  GTGGAAGCCACA-GTGAATCAATGATCTACAGCTGCAT-AAAAAAGTATG  98
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTGGAAGCCACAGGTGAATCAATGATCTACAGCTGCATAAAAAAAGTATG  96

seq1  ACAACATTGTTGTAGACCTTCCTGTCCTCCTGCTGGCTGTGCAGCCATTG  148
      |||||||||||||||||    |||||   ||||| |||||||||||||||
seq2  ACAACATTGTTGTAGAC---TCTGTC--TCTGCT-GCTGTGCAGCCATTG  140

seq1  TTCCTCCCATAGAAGGGTCTTCTCCACCTGCCCCCACCACTGCATTGTCA  198
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTCCTCCCATAGAAGGGTC-TCTCCACCTGCCCCCACCACTGCA-TGTCA  188

seq1  GGGCCACATGTGCTCAATGGTGAACACTTACTAAGCTATTCCTTTTAAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCACATGTGCTCAATGGTGAACACTTACTAAGCTATTCCTTTTAAAT  238

seq1  TTTCCCTATGCACAGAGATCCCATTTCTTAATCTTATAGATGTACACATT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTATGCACAGAGATCCCATTTCTTAATCTTATAGATGTACACATT  288

seq1  GTCAGTTACGGTCTCAGGCTCTCAACAATGGAATCTAGAGATATAGAAAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTACGGTCTCAGGCTCTCAACAATGGAATCTAGAGATATAGAAAA  338

seq1  AAATTCTACCCCAGAAAATATTCTATACTGATGAAAAGTATATGTTTTGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTCTACCCCAGAAAATATTCTATACTGATGAAAAGTATATGTTTTGC  388

seq1  TTCTAGGAGAAATATCAGTAGGAAAATAATTTATAAAATTTAACCCAACA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGAGAAATATCAGTAGGAAAATAATTTATAAAATTTAACCCAACA  438

seq1  GACCTAATTAATAGTATTAGGTCAGACAAATTAAAAATGGCTTATAATAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTAATTAATAGTATTAGGTCAGACAAATTAAAAATGGCTTATAATAA  488

seq1  GTTTACTGTTACTTTACATAGTAGCTCTCTTGCTAGAACATGTTTTGGAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACTGTTACTTTACATAGTAGCTCTCTTGCTAGAACATGTTTTGGAT  538

seq1  AAGAATATATAAATGAGACAAAAGAAATAACAGAATGAAAAAAAATAATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATATATAAATGAGACAAAAGAAATAACAGAATGAAAAAAAATAATT  588

seq1  GCTACAAGAGGTGTAGAGAAATAAGGTAGATTTTGCCATGTTTATTCCTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAAGAGGTGTAGAGAAATAAGGTAGATTTTGCCATGTTTATTCCTC  638

seq1  AATGGGAGAAAAGCATAGAAATGTAGCGAATAGAAGTTTTTCAGGACAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGAGAAAAGCATAGAAATGTAGCGAATAGAAGTTTTTCAGGACAAA  688

seq1  ATAACTTTTCTAAAATGGTAAACAACAACAAAGAAGCATTTGGCATCAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTTTTCTAAAATGGTAAACAACAACAAAGAAGCATTTGGCATCAGT  738

seq1  TGCATACACACTGAGCTGGACAAGGATACTGAGTCACAAGACAACAGCTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACACACTGAGCTGGACAAGGATACTGAGTCACAAGACAACAGCTA  788

seq1  GCTTTCATGGGGAAGCTGAGAAGATAAGCTAATTTTAGCTGGGTCTGTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCATGGGGAAGCTGAGAAGATAAGCTAATTTTAGCTGGGTCTGTAT  838

seq1  AGAATTCTACTAGCTTGAACTTCCTGTCCTTGGTGATAAGATTATTGCTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCTACTAGCTTGAACTTCCTGTCCTTGGTGATAAGATTATTGCTT  888

seq1  CCTTTAGTGTAGGGATGATGCTGTTCATATTTCCTGCCTTTACAAAACAG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGTGTAGGGATGATGCTGTTCATATTTCCTGCCTTTACAAAACAG  938

seq1  AAAGGAAGTCAGAATTATCTTCTTGTGCTGCCTGCCTTCGAGTGCCTTTA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAGTCAGAATTATCTTCTTGTGCTGCCTGCCTTCGAGTGCCTTTA  988

seq1  ACTCAAAATAGCCAACATGTTAGAGTCATTTTTCAAAGCTCTTCCATTGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAAATAGCCAACATGTTAGAGTCATTTTTCAAAGCTCTTCCATTGT  1038

seq1  TGAGTTTTAAAAACCTCAAGTTAAAAACCAAGTATGCCAGACATCTGCAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTTTAAAAACCTCAAGTTAAAAACCAAGTATGCCAGACATCTGCAC  1088

seq1  TATTTATATGATGTAGGCAAGGGGCTTCAAGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATATGATGTAGGCAAGGGGCTTCAAGAATTC  1124

seq1: chr3_60555405_60556503
seq2: B6Ng01-156A22.g_67_1159

seq1  GAATTCTTGTTTCCATGACATTTATCTCCCACCTAGGAACTGCCTACTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGTTTCCATGACATTTATCTCCCACCTAGGAACTGCCTACTAA  50

seq1  GTCCCACAGTTTCTCTACATGCTCCTGAGTCTGCTACCCTTTCTTTACCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCACAGTTTCTCTACATGCTCCTGAGTCTGCTACCCTTTCTTTACCC  100

seq1  ACTTCCCCTCAGACCTAACTGCTCTATCTTTCCTTGTGCTCTTCAGGGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCCTCAGACCTAACTGCTCTATCTTTCCTTGTGCTCTTCAGGGTC  150

seq1  TGTACATTGCAAGTTTTCTTTTCTCCTCTGAAGAGCTGCCTGTTATGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACATTGCAAGTTTTCTTTTCTCCTCTGAAGAGCTGCCTGTTATGTCC  200

seq1  CAGAGCTTCCTTAAGTCCTTCTGAGCCTCTGAAACCTTGCCCTTCTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTTCCTTAAGTCCTTCTGAGCCTCTGAAACCTTGCCCTTCTGTTC  250

seq1  TCTCAGCTCCCTCCTGGAAGTCCTGTTGCTTCTCTATGTATTTCTGGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCTCCCTCCTGGAAGTCCTGTTGCTTCTCTATGTATTTCTGGTTT  300

seq1  CTACAGCAATGGAAGTCCCTTCAGTAGGATTCCTTTTTGTGGTTCTTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGCAATGGAAGTCCCTTCAGTAGGATTCCTTTTTGTGGTTCTTTGT  350

seq1  TCCTTATGGCCACACTGTCCTCTGGCTCTTAGCTTCCTTATCCTCCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATGGCCACACTGTCCTCTGGCTCTTAGCTTCCTTATCCTCCCTGG  400

seq1  GCAGAGTTCTTTTAACAACCCTTCTTCCTTCCCTCCTTAGACTCAGTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGTTCTTTTAACAACCCTTCTTCCTTCCCTCCTTAGACTCAGTTTC  450

seq1  TTTCTTGGATTCAGAGATTTTCTTAAAACCTAGTTGTCTTACTGACAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGGATTCAGAGATTTTCTTAAAACCTAGTTGTCTTACTGACAATG  500

seq1  CCTTGGCCTCAGTGTAGCTAGATGGACAAATATGGCACACTCAAGTTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCCTCAGTGTAGCTAGATGGACAAATATGGCACACTCAAGTTCCA  550

seq1  AAATTTTACAGATTGTAGCAACCAATGTGACTTCATAGGCAAATGATCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTACAGATTGTAGCAACCAATGTGACTTCATAGGCAAATGATCCC  600

seq1  AAAGTCTTTTATCTCTAAGGTTCTAGAACTTTCCACACTTAAATCGTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTTTTATCTCTAAGGTTCTAGAACTTTCCACACTTAAATCGTTCT  650

seq1  GCTCTCAAGAAATTTTTTGCGACTATTGTGTAAAGAGTCTTTATCTCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCAAGAAATTTTTTGCGACTATTGTGTAAAGAGTCTTTATCTCAGG  700

seq1  ATGATTAACTTCATTGGTTATAGGTAAAGAATCTGTCAAAATCTATAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTAACTTCATTGGTTATAGGTAAAGAATCTGTCAAAATCTATAACA  750

seq1  AAATTTGTTTTAAAGCTTATAAGAAAAGGCTTAGTTAAAAACCTATATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTGTTTTAAAGCTTATAAGAAAAGGCTTAGTTAAAAACCTATATGT  800

seq1  AGATATTCTTAATTTGCTACAATCTACTGTATATGTGATTCGGCCCTAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATTCTTAATTTGCTACAATCTACTGTATATGTGATTCGGCCCTAGA  850

seq1  ATATATAATTTGGATTCAATTCTTGTTTTGAAAATAGATCTGCTAGAAAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  ATATATAATTTGGATTCAATTCTTGTTTTG-AAATAGATCTGCTAG-AAA  898

seq1  ATGTATCTTTCTTCTGTCTTGGCTGACGACCTCATCAACATAAAAGCAAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
seq2  ATGTATCTTTCTTCTGTCTTGGCTGACGACCTCATC-ACAT-AAAGCAAC  946

seq1  CAGTTGACTGGCAGCCATCTTTACTAAAGTTAGAGTACATGCCATGTGAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGACTGGCAGCCATCTTTACTAAAGTTAGAGTACATGCCATGTGAC  996

seq1  CTCACCATCTTAAAATGAGCATATGTGTAAAGGAACAATTATAAAACTTC  1050
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||
seq2  CTCACCATCTT-AAATGAGCATATGTGTAAAG--AC-ATTATAAAAACTC  1042

seq1  TCATTCCCAGTGAGCTCTTAGGTTATCATTGTATC-TCCTTT-GAGGCTA  1098
      |||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||| |||||||
seq2  TCATTCCCAGTGAGCTCTTAAGTATACATTGTATCTTCCTTTGGAGGCTA  1092

seq1  A  1099
      |
seq2  A  1093