BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157K17
Chromosome3 (Build37)
Map Location 155,602,523 - 155,603,251
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneTnni3k, Fpgt, Lrrc44, EG383956, Scp2-ps1, EG668902
Downstream geneLOC624519, LOC100040901, 4930570G19Rik, Negr1, LOC100041152, LOC668853
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157K17.bB6Ng01-157K17.g
ACCDH951840DH951841
length1,1041,057
definitionDH951840|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157K17, 5' end.DH951841|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157K17, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctcaactgaggaaactcaaatggtcaagaagcacctaaagacatg
ttcagcatccttagtcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggctaagaggaacaatccctccattgct
ggtgggattgcaatctggtacaaccactctagaaatcaatctgatggttc
ctcagaaaattggacttagtattctttgaggacctagctataccactcct
tggcatatgcacaaaagatgctccaacataaaacaaggacacgtgcttga
ttatgttcatagaagccttatttatagtagccagaagctggagagatcac
agatgtccttcaacagaggaatggatacaaaaattgtggtacatttacac
aatggagtactactcagttattaaaaacaatgaattaattaaaaacttag
gcaaatggaactagaaaatactgtcctgagtgaggtaacccaatcacaaa
agaacacacatggtatacattcactgataagtggataatagcacaaaagc
ttgaaataccaaagatatagttcacagaccacatgaagctcaagaagaag
gaagaccaatgtgtgggtgtttcggttcttcttagaaggtatatcaaaat
actcatgggagcaaatacagagacaaagtgtgggacagactgaaggaaag
gccatctaaagactgccttacctgaggatccatcccgtatacagtcacca
aacacagacactactgtgggtgctaataagtgcatgctgacaggaggctg
atatagctctctcctatgagactctaccagagcctgacatatacagagtc
agatgttcgcagccagccattgaactgagcacagggtccccaatggagag
ttaaaggactgaaggactgaagttgtttgcaaccccataggaaaacataa
tatcaacaaccagattctcagggtttaaccaccatcaggagtaccatgga
gggacccatgactacagccttaatgtagaaaggatggccttcttggcatc
atggtaaggaggcctttggtctgtgaaggcttgattgaagtggagatggt
tgta
gaattcagcatagcgacacactaatggcttattcaaacattaacagaaag
atcacagggcatcaggactttgttcctgtgggctgggggcttatctttgt
tcacatagcaaccagttgatgtatgactttacccggcgtcaaggggcaat
agatagaggggaggttctggccagatggtgttgacttagataatataggc
ctgctggtccttgcatacctttttatctttacagtcaggatgttcttagg
aatgccttaacaacagccctgccctggcatgcctgggggctgttctgctt
tgttctcagtttcaggctgtagcagtgggctcctaaacaactcacaagtt
acaatatttcatcttccttcactggatgactctgcatctctgttttactt
gactagaagatgctgaagataggactgtgaacacatttattcttttagtt
tctcattacattataattcaatcattgaaaccttctgattaataatactt
ctatcatctatctatgtacctatttacttatctacctatctgcctatcaa
ctatctatgcacatatctattttcacatattatatatatatgctcaattt
gtcatctatatatctgtaactctatctattaataatatttatctatgatt
tatatatcacatatttattcatgaatctacctcatatatctatatatcac
ttgtcatctatctattcatctttcatatatctacctatcatctatttata
acccatctatatatctgtcatctatctctctatatatttatcatcaatca
tgtatccattcatctatcatctatctgacatatataatgtatttattttg
tgtatcatctaacagatttatccatagtctatgtatctacctaactgcct
atcatatatctatgtagctatttattacacatcctacatatgcctaaata
tatcatatatctatgcatatctatctcctttatctacatatgcatctatc
aatatatctatatatcatctatcctgtatctaccatctatttatctatat
cctatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_155602523_155603251
seq2: B6Ng01-157K17.g_394_1124 (reverse)

seq1  TGATAGGATATAGATAAATAGATGGTAGATACA-GATAGATGATATATAG  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGATAGGATATAGATAAATAGATGGTAGATACAGGATAGATGATATATAG  50

seq1  ATATA-TGATAGATGCATATGTAGATAAAGGAGATAGATATGCATAGATA  98
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTGATAGATGCATATGTAGATAAAGGAGATAGATATGCATAGATA  100

seq1  TATGATATATTTAGGCATATGTAGGATGTGTAATAAATAGCTACATAGAT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATATATTTAGGCATATGTAGGATGTGTAATAAATAGCTACATAGAT  150

seq1  ATATGATAGGCAGTTAGGTAGATACATAGACTATGGATAAATCTGTTAGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGATAGGCAGTTAGGTAGATACATAGACTATGGATAAATCTGTTAGA  200

seq1  TGATACACAAAATAAATACATTATATATGTCAGATAGATGATAGATGAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACACAAAATAAATACATTATATATGTCAGATAGATGATAGATGAAT  250

seq1  GGATACATGATTGATGATAAATATATAGAGAGATAGATGACAGATATATA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACATGATTGATGATAAATATATAGAGAGATAGATGACAGATATATA  300

seq1  GATGGGTTATAAATAGATGATAGGTAGATATATGAAAGATGAATAGATAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTTATAAATAGATGATAGGTAGATATATGAAAGATGAATAGATAG  350

seq1  ATGACAAGTGATATATAGATATATGAGGTAGATTCATGAATAAATATGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAAGTGATATATAGATATATGAGGTAGATTCATGAATAAATATGTG  400

seq1  ATATATAAATCATAGATAAATATTATTAATAGATAGAGTTACAGATATAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAAATCATAGATAAATATTATTAATAGATAGAGTTACAGATATAT  450

seq1  AGATGACAAATTGAGCATATATATATAATATGTGAAAATAGATATGTGCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACAAATTGAGCATATATATATAATATGTGAAAATAGATATGTGCA  500

seq1  TAGATAGTTGATAGGCAGATAGGTAGATAAGTAAATAGGTACATAGATAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGTTGATAGGCAGATAGGTAGATAAGTAAATAGGTACATAGATAG  550

seq1  ATGATAGAAGTATTATTAATCAGAAGGTTTCAATGATTGAATTATAATGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAGAAGTATTATTAATCAGAAGGTTTCAATGATTGAATTATAATGT  600

seq1  AATGAGAAACTAAAAGAATAAATGTGTTCACAGTCCTATCTTCAGCATCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGAAACTAAAAGAATAAATGTGTTCACAGTCCTATCTTCAGCATCT  650

seq1  TCTAGTCAAGTAAAACAGAGATGCAGAGTCATCCAGTGAAGGAAGATGAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTCAAGTAAAACAGAGATGCAGAGTCATCCAGTGAAGGAAGATGAA  700

seq1  ATATTGTAACTTGTGAGTTGTTTAGGAGCCC  729
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTAACTTGTGAGTTGTTTAGGAGCCC  731