BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169G03
Chromosome3 (Build37)
Map Location 75,992,150 - 76,101,962
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFstl5
Upstream geneSerpini2, Wdr49, Pdcd10, Serpini1, Golph4
Downstream geneLOC100041625, LOC100041635
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169G03.bB6Ng01-169G03.g
ACCDH960375DH960376
length1,1731,113
definitionDH960375|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169G03, 5' end.DH960376|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169G03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,100,776 - 76,101,962)(75,992,150 - 75,993,265)
sequence
gaattcctcaaaattgttaaaccaaagtgcctttctgcactaacagtata
ttatataatggaaaatcaaaatacacccttataaaggctacttttaaaat
atggcatctcattttcagtattaaagaattgtttgttaacatgaaatgta
agaaacaggtcttgaaaatgggtcagtagttaagaatgtgctcttcttgc
aaagaacctagttccatttcaagcaaccatattgagaagttcatctggat
ctcaactctaactccaggtcatttgttacctctggcctcatgaaccacca
tatgctgacccatgcctacacataattaaaaacataaaaataaagtttaa
agataaatctaaattatgagtcaacaaaaggggggacataattttccctt
tctctatgaccaacctcacaacattttccttctttcagcatgagattcct
ggataaattctcatatcttgaaggcatagtctgatagtgaaattgaagac
catagtgtctatttagaatattttcattttggccaggccatttgtataag
tgggttttgttttgtttttatgttaatgtctgtcttctttactgtgactc
agactcttctcttcattctgttttttctatatcactctcctccacctcat
gaaaattaaaaacacagaaacagaattatccagtattgtccattcccatt
cagtcaccttggaatatagaacagaaaaaagattaaaagtatttgcagac
agaggggagccttcagggtaacactaccctcatgaggacaattacttgtg
acaactaagtcacagactaaagcagatatgataggagcctctctctggat
acaacaataattaacagattaacagtccattagatgctacagaggacact
ccgtgcataagcttttcatctcttttaacctatagctaaaacagtaatca
aatgaccttaaggtatgaatgctctttactgtccccacaccacacacaca
cacacacacacacacactaacacacacaaccaaaatgtcttccacactga
actgtcctcttgatggcttttgtcagcactcacctttgtgaatggtgtat
tgtataggcatgccagctatgttgacaatgcctatgaggcggacctaaat
gattggcctaagctgcaagtggg
gaattccacctgtattgaagagcacttttgtttgtgctataataataata
gtgatagaaaagcaattatcctctcaaaggggataagaggtagtatattc
cgggacccattttgagtgattgtagtccagaatctgaggtttaggttact
tcaaataccatgtttcaatgtagaaacagtttattaagcttcaataacaa
caaataagaatatcataaatgaatgactttccaaatataatggaggaaac
atccaataggtaggttgaagcaaaaatgtaggccctgttataggtcccag
aaaatatctgatggcatttatagctcttccttgtctggaaactagtgctc
tgtttgtaaattacaaactatgtatctaatggtcacaaagatgttaacta
agttatagaggatgacaattacgggggataaaggtgcccaaagataagga
acccatggaactgcaatatttgagtctattgccacaagaattctagtgcc
ttaatcagccctgcagagtacttatggaaaggtgcaactttttggtaaat
ttgttcacagtacttagagtacaatcatgccttatttttgtctgctatgt
gatatgtctccagttggatgtttacgctaagatagtaatttgaagttctc
tgttgtagaagtcctgagaaaaccatctttaagtaataatgctgagaggc
ctgggcagaaaaggagttaatttacagtgagcttataatataggttctga
ttatccccaaagggagtactaggatagcctagttttgcacaaggatgaca
gattttgtaacctgttattagccagttaccatggtggctcacccttagaa
ataaataaagtagctctttggctatttcttcactgcatggggtgagttgg
gatataaagacaaatagcaaaattcttgaatcttaaactttctgtttgtc
attaatagtttagtcatttcctataatatagtagactggtattgccagcc
accagcaaattagaagaccctcatattatgtaggaaatcatttctacagc
ttcttccagtttttaatattggaattgttaaactgaaagaaaaggaagaa
ctttcttgtccaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_76100776_76101962
seq2: B6Ng01-169G03.b_45_1217 (reverse)

seq1  CCCACATTGCAGCTTCTAAGTGCAAATCCAATTTTAGGTCTGCCTCCATA  50
      ||||| |||||||||   || || ||||    |||||||| |||| ||||
seq2  CCCAC-TTGCAGCTT---AG-GCCAATC---ATTTAGGTCCGCCT-CATA  41

seq1  GGCATTGTCAAACACTAGGCTGGGCCATGCCTAT-CAATACACCATTCAC  99
      ||||||||| |||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||
seq2  GGCATTGTC-AACA-TA-GCTGG--CATGCCTATACAATACACCATTCAC  86

seq1  AAAGATGAGTGCTGACAAAAAGCATCAAGA-GACAGTTCAGTGTGG-AGA  147
      |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  AAAGGTGAGTGCTGACAAAAGCCATCAAGAGGACAGTTCAGTGTGGAAGA  136

seq1  CATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  197
      ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATTTTG-GT-TGTGTGTGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGG  184

seq1  GGTGGGGACAGTAAAGAGCATTCATACCTTAAGGTCATTTGATTACTGTT  247
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTGGGGACAGTAAAGAGCATTCATACCTTAAGGTCATTTGATTACTG-T  233

seq1  TTTAGCTATAGGTTAAAAGAGATGAAAAGCTTATGCACGGAGTGTCCTCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTATAGGTTAAAAGAGATGAAAAGCTTATGCACGGAGTGTCCTCT  283

seq1  GTAGCATCTAATGGACTGTTAATCTGTTAATTATTGTTGTATCCAGAGAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCATCTAATGGACTGTTAATCTGTTAATTATTGTTGTATCCAGAGAG  333

seq1  AGGCTCCTATCATATCTGCTTTAGTCTGTGACTTAGTTGTCACAAGTAAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCCTATCATATCTGCTTTAGTCTGTGACTTAGTTGTCACAAGTAAT  383

seq1  TGTCCTCATGAGGGTAGTGTTACCCTGAAGGCTCCCCTCTGTCTGCAAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCATGAGGGTAGTGTTACCCTGAAGGCTCCCCTCTGTCTGCAAAT  433

seq1  ACTTTTAATCTTTTTTCTGTTCTATATTCCAAGGTGACTGAATGGGAATG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTAATCTTTTTTCTGTTCTATATTCCAAGGTGACTGAATGGGAATG  483

seq1  GACAATACTGGATAATTCTGTTTCTGTGTTTTTAATTTTCATGAGGTGGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATACTGGATAATTCTGTTTCTGTGTTTTTAATTTTCATGAGGTGGA  533

seq1  GGAGAGTGATATAGAAAAAACAGAATGAAGAGAAGAGTCTGAGTCACAGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGTGATATAGAAAAAACAGAATGAAGAGAAGAGTCTGAGTCACAGT  583

seq1  AAAGAAGACAGACATTAACATAAAAACAAAACAAAACCCACTTATACAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGACAGACATTAACATAAAAACAAAACAAAACCCACTTATACAAA  633

seq1  TGGCCTGGCCAAAATGAAAATATTCTAAATAGACACTATGGTCTTCAATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTGGCCAAAATGAAAATATTCTAAATAGACACTATGGTCTTCAATT  683

seq1  TCACTATCAGACTATGCCTTCAAGATATGAGAATTTATCCAGGAATCTCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTATCAGACTATGCCTTCAAGATATGAGAATTTATCCAGGAATCTCA  733

seq1  TGCTGAAAGAAGGAAAATGTTGTGAGGTTGGTCATAGAGAAAGGGAAAAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAAAGAAGGAAAATGTTGTGAGGTTGGTCATAGAGAAAGGGAAAAT  783

seq1  TATGTCCCCCCTTTTGTTGACTCATAATTTAGATTTATCTTTAAACTTTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCCCCCTTTTGTTGACTCATAATTTAGATTTATCTTTAAACTTTA  833

seq1  TTTTTATGTTTTTAATTATGTGTAGGCATGGGTCAGCATATGGTGGTTCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATGTTTTTAATTATGTGTAGGCATGGGTCAGCATATGGTGGTTCA  883

seq1  TGAGGCCAGAGGTAACAAATGACCTGGAGTTAGAGTTGAGATCCAGATGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCCAGAGGTAACAAATGACCTGGAGTTAGAGTTGAGATCCAGATGA  933

seq1  ACTTCTCAATATGGTTGCTTGAAATGGAACTAGGTTCTTTGCAAGAAGAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCAATATGGTTGCTTGAAATGGAACTAGGTTCTTTGCAAGAAGAG  983

seq1  CACATTCTTAACTACTGACCCATTTTCAAGACCTGTTTCTTACATTTCAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCTTAACTACTGACCCATTTTCAAGACCTGTTTCTTACATTTCAT  1033

seq1  GTTAACAAACAATTCTTTAATACTGAAAATGAGATGCCATATTTTAAAAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACAAACAATTCTTTAATACTGAAAATGAGATGCCATATTTTAAAAG  1083

seq1  TAGCCTTTATAAGGGTGTATTTTGATTTTCCATTATATAATATACTGTTA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTTTATAAGGGTGTATTTTGATTTTCCATTATATAATATACTGTTA  1133

seq1  GTGCAGAAAGGCACTTTGGTTTAACAATTTTGAGGAATTC  1187
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGAAAGGCACTTTGGTTTAACAATTTTGAGGAATTC  1173

seq1: chr3_75992150_75993265
seq2: B6Ng01-169G03.g_65_1177

seq1  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACCTGTATTGAAGAGCACTTTTGTTTGTGCTATAATAATAATA  50

seq1  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGAAAAGCAATTATCCTCTCAAAGGGGATAAGAGGTAGTATATTC  100

seq1  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGACCCATTTTGAGTGATTGTAGTCCAGAATCTGAGGTTTAGGTTACT  150

seq1  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATACCATGTTTCAATGTAGAAACAGTTTATTAAGCTTCAATAACAA  200

seq1  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGAATATCATAAATGAATGACTTTCCAAATATAATGGAGGAAAC  250

seq1  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAATAGGTAGGTTGAAGCAAAAATGTAGGCCCTGTTATAGGTCCCAG  300

seq1  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTGATGGCATTTATAGCTCTTCCTTGTCTGGAAACTAGTGCTC  350

seq1  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTAAATTACAAACTATGTATCTAATGGTCACAAAGATGTTAACTA  400

seq1  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATAGAGGATGACAATTACGGGGGATAAAGGTGCCCAAAGATAAGGA  450

seq1  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGGAACTGCAATATTTGAGTCTATTGCCACAAGAATTCTAGTGCC  500

seq1  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAGCCCTGCAGAGTACTTATGGAAAGGTGCAACTTTTTGGTAAAT  550

seq1  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCACAGTACTTAGAGTACAATCATGCCTTATTTTTGTCTGCTATGT  600

seq1  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGTCTCCAGTTGGATGTTTACGCTAAGATAGTAATTTGAAGTTCTC  650

seq1  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAGAAGTCCTGAGAAAACCATCTTTAAGTAATAATGCTGAGAGGC  700

seq1  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCAGAAAAGGAGTTAATTTACAGTGAGCTTATAATATAGGTTCTGA  750

seq1  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCCCAAAGGGAGTACTAGGATAGCCTAGTTTTGCACAAGGATGACA  800

seq1  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTGTAACCTGTTATTAGCCAGTTACCATGGTGGCTCACCCTTAGAA  850

seq1  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAAAGTAGCTCTTTGGCTATTTCTTCACTGCATGGGGTGAGTTGG  900

seq1  GATATAAAGACAAATAGCAAAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTGTTTTGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GATATAAAGACAAATAGCAAAATTCTTGAATCTTAAACTTTCTG-TTTGT  949

seq1  CATTAATAGTTTAGTCATTTTCCTATAATATAGTAGACTGGTATTGCCAG  1000
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATAGTTTAGTCA-TTTCCTATAATATAGTAGACTGGTATTGCCAG  998

seq1  CCACCAGCAAAATTAGAAGACTCTCATTATTATGTAAGGAAAATCATTCC  1050
      |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |
seq2  CCACCAGC-AAATTAGAAGACCCTCA-TATTATGTA--GGAAATCATTTC  1044

seq1  TACAGCTTC-TCCAGTTCTTAATATTGAAATTGTTAAAACTGATAGACA-  1098
      ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | 
seq2  TACAGCTTCTTCCAGTTTTTAATATTGGAATTGTT-AAACTGAAAGAAAA  1093

seq1  -GCAG-ACTTTCTTGTCCAA  1116
       | || ||||||||||||||
seq2  GGAAGAACTTTCTTGTCCAA  1113