BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184H03
Chromosome3 (Build37)
Map Location 49,575,307 - 49,576,293
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneEG666230, 4932443G14, LOC545519, LOC676568, LOC666247, LOC100039579, LOC100039587, LOC638779, Pcdh18
Downstream geneLOC100039628, LOC639469, Slc7a11, EG621304, LOC100039667
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184H03.b
ACCGA009823
length986
definitionB6Ng01-184H03.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcttgtcgagtttgcatctgtgagagtaaaatgagtgtaatttgct
tctttgagtataggcaccaatatgtgtgctgtctcgttcataactttagt
atttctctccttttcctccctgtgcagctgagtcttgcccttcctccccc
ggagttctaagctctgctccagtacatctgaaaccgatctcagactgagt
cagaaaggagagctgaacaataaagcccagaaataattgatgagcctttt
tgtagctgtacctggacttgttccttacctggtatatcatccttgcctac
aggttcattcttatagataaacttcccatacaattcaaatatgtgatttt
ctaattctaagtcctggggtcttacaccaaactggttttgactattggct
atgtatgcacagcaagaagtcaatgatggcgactaggactaagtttggac
ctccttcctagcaacctcatcctttgtaccttctccacagggaagtccct
gtgatctctgggctgctaagtgctggtggaagggcaatttggagtgtgct
gccagccagcctggtcttctactctctacattagagtttctccccattta
cttagatgggtttcttagcatttgcatttagatagtctcttccctcatgg
acttgcactgtcagagccattgaccaaatccatgtgtcatacttgcctag
gtttggggcatgaacctttacaagtatttcaattgcctagtatataactg
aaaatgagagattcagagaaatcaaacatgtgccagctatgtaaattaca
tttcaaacatcacaaaaatttatagtgtgagaccttttaaaaacaagaac
agaatatggacagatatgttattaacttctaattcagaacagtgtgattt
atagtttgcaaacatgcctttgtcattgggatatatatatatatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatataa
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_49575307_49576293
seq2: B6Ng01-184H03.b_40_1025

seq1  GAATTCTTGTCAAAGTTTGCATCTGTGAGAGTAAAATGAGTGTTATTTGC  50
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAATTCTTGTC-GAGTTTGCATCTGTGAGAGTAAAATGAGTGTAATTTGC  49

seq1  TTCTTTGAGTATAGGCACCAATATGTGTGCTGTCTCGTTCATAACTTTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGAGTATAGGCACCAATATGTGTGCTGTCTCGTTCATAACTTTAG  99

seq1  TATTTCTCTCCTTTTCCTCCCTGTGCAGCTGAGTCTTGCCCTTCCTCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCTCTCCTTTTCCTCCCTGTGCAGCTGAGTCTTGCCCTTCCTCCCC  149

seq1  CGGAGTTCTAAGCTCTGCTCCAGTACATCTGAAACCGATCTCAGACTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGTTCTAAGCTCTGCTCCAGTACATCTGAAACCGATCTCAGACTGAG  199

seq1  TCAGAGAGGAGAGCTGAACAATAGAGCCCAGAAATAATTGATGAGCCTTT  250
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAGGAGAGCTGAACAATAAAGCCCAGAAATAATTGATGAGCCTTT  249

seq1  TTGTAGCTGTACCTGGACTTGTTCCTTACCTGGTATATCATCCTTGCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGCTGTACCTGGACTTGTTCCTTACCTGGTATATCATCCTTGCCTA  299

seq1  CAGGTTCATTCTTATAGATAAACTTCCCATACAATTCAAATATTTGATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAGGTTCATTCTTATAGATAAACTTCCCATACAATTCAAATATGTGATTT  349

seq1  TCTAATTCTAAGTCCTGGGGTCTTACACCAAACTGGTTTTGACTATTGCC  400
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TCTAATTCTAAGTCCTGGGGTCTTACACCAAACTGGTTTTGACTATTGGC  399

seq1  TATGTATGCACAGCAGGAAGTCAATGATGGCGACTAGGACTAAGTTTGGA  450
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGCACAGCAAGAAGTCAATGATGGCGACTAGGACTAAGTTTGGA  449

seq1  CCTCCTTCCTAGCAACCTCATCCTTTGTACCTTCTCCACAGGGAAGTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTCCTAGCAACCTCATCCTTTGTACCTTCTCCACAGGGAAGTCCC  499

seq1  TGTGATCTCTGGGCTGCTAAGTGCTGGTGGAAGGGCAATTTGGAGTGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATCTCTGGGCTGCTAAGTGCTGGTGGAAGGGCAATTTGGAGTGTGC  549

seq1  TGCCAGCCAGCCTGGTCTTCTACTCTCTACATTAGAGTTTCTCCCCATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGCCAGCCTGGTCTTCTACTCTCTACATTAGAGTTTCTCCCCATTT  599

seq1  ACTTAGATGGGTTTCTTAGCATTTGCATTTAGATAGTCTCTTCCCTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGATGGGTTTCTTAGCATTTGCATTTAGATAGTCTCTTCCCTCATG  649

seq1  GACTTGCACTGTCAGAGCCATTGACCAAATCCATGTGTCATACTTGCCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGCACTGTCAGAGCCATTGACCAAATCCATGTGTCATACTTGCCTA  699

seq1  GGTTTGGGGCATGAACCTTTACAAGTATTTCAATTGCCTAGTATATAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGGGCATGAACCTTTACAAGTATTTCAATTGCCTAGTATATAACT  749

seq1  GAAAATGAGAGATTCAGAGAAATCAAACATGTGCCAGCTATGTAAATTAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGAGAGATTCAGAGAAATCAAACATGTGCCAGCTATGTAAATTAC  799

seq1  ATTTCAAACATCACAAAAATTTATAGTGTGAGACCTTTTAAAAACAAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAAACATCACAAAAATTTATAGTGTGAGACCTTTTAAAAACAAGAA  849

seq1  CAGAATATGGACAGATATGTTATTAACTTCTAATTCAGAACAGTGTGATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATATGGACAGATATGTTATTAACTTCTAATTCAGAACAGTGTGATT  899

seq1  TATAGTTTGCAAACATGCCTTTGTCATTTGGATATATATATATATATATA  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTTTGCAAACATGCCTTTGTCATTGGGATATATATATATATATATA  949

seq1  TATATATATATATATATATATATATATATATATATAA  987
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATATAA  986