BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184I10
Chromosome3 (Build37)
Map Location 146,570,192 - 146,751,933
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTtll7
Upstream geneBcl10, 2410004B18Rik, Syde2, Wdr63, Mcoln3, Mcoln2, Edg7, Ssx2ip, Ctbs, Spata1, Gng5, Bxdc5, LOC100040473, Dnase2b, Uox, 4930503B20Rik, Gm1652, LOC670100, Prkacb, LOC100040540
Downstream genePpia-ps3_1528.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184I10.bB6Ng01-184I10.g
ACCGA009879GA009880
length1,0741,168
definitionB6Ng01-184I10.b B6Ng01-184I10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,570,192 - 146,571,259)(146,750,749 - 146,751,933)
sequence
gaattcttttccagtttaaagtaaacagtgccaacaaacaggaggtgtgg
tgctacctcctgtgtctgacgcaagattatcatgagtttcatccaatatg
ggctacacagtgagttccaggttatccagtgagatcatattccaaaacaa
acaaacaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
aaacataccacacaaacaggctccatctaaattagcaaaataacatgaaa
agtctaaaacacaaatgccataaacagggccagctctgtctcacacttgc
tcttaagacatctgtagacagcatgaagacagcatgtagatatctgtaga
caccatgtagacatcaaaatcatgtacatatctagagatatcatatagat
atctgtggacagcgtgtagacagcatgtagacagcatgtaaacatctata
gacagtgacagtatgtagaaatctatagacagcatgtagatctctgtaga
taccatgtagacatcatacagacatcatgtagacatctgtagacacatat
agacattatgtagacatctgtggacagcatgtagacaccatgtaggcagc
cttatcaaatacgtggtggccacctggtgcttccaggtgctctgcctgtc
aagccatcctgcagtactaacattcatggtcttcttgaaagaaatgtgcc
actttatctcactggaacatatttaagcaacccaagtcatcagttggtac
agtttggaggtttgtgtttttaattagcatatattaattatatattataa
tgggcttcattatgacatttttcacatatgcatatgacaggttttgatca
tatttcccccagtgctctttcttgcgctcctcacaccctctttcacaccc
tctctcttcctaactttccttctttttttacatgcatgtctgtctgtcta
tctatctatctatctatcaatcaatcctatcgatccatcaatctatttag
ttctatttgttgtttcttacatggccatataggtaaggcttgtttacaag
agcataggcaacttactagctagc
gaattcattaaatgctcaacacttcctctaacatcatggaatgacagcca
gcagcagtgtcatctgatttgaaagcaggctggcaccaaagaagtttaga
cttcagaattaagaggagataggagaatgtttcctctattactgagctag
ttcccccaagttataagaataattacctgacccttaaatattatttttat
gtgtaatttgtccaatagctcctggctaccaaagtgataaaagggagact
cttctttcttcacatttcaaaccgaggcagagcagcatgattttctagca
ggatgtgctaacaggttttcatcaattggagttcctgccattttcctcaa
tgtccacacattggagagtaaccctttcaaaggtttccctggatgtcatt
cactgcccagtgtgggggtaacagcatcctgactggagccttattttata
aagaggtatctaacaaaagaagcaataccagcatcttggcctctactata
aagtgaccttgtcttggcgctgtcatgcctctccagccagttgatcccgc
ttggctagaccagtgctgcttctcttcagtttcacaatgatgaaatgaat
caacatgcagccaacgaggtcacagaccgggagatgggagtgctgggatg
ggctacacaaaaggccagccacaagtcttcttaatgaataagtatacgag
cccatctctaaaaaacattctcaaggtcatgtccacctgtaagcctcacg
tgccccaggaaagctagatatgtggtccaacacaaatcataaacttattt
aaaacaccatagttggtagtgcaattcaatggttcagttctcaagcatga
acttttaaggacactatgtgttagtgatgtcattattaggcatgcctggg
tgatgtctggcagagattctgttagtattaaggtgtagagaagctaagat
tttttaggatcctggcttttgttgttgtgctgctgctgctgctgctgtgc
tggtgctgtctgacaattccaatgccatccataagctaaatttgcatact
attgcccccacctgttaagacagggaattcaagtggatgagaattgtttc
acaaagcctaaaatgtcactaccaggtcctataattttcctttactgaat
tattggaacttatgggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_146570192_146571259
seq2: B6Ng01-184I10.b_34_1107

seq1  GAATTCTTTTCCAGTTTAAAGTAAACAGTGCCAACAAACAGGAGGTGTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTCCAGTTTAAAGTAAACAGTGCCAACAAACAGGAGGTGTGG  50

seq1  TGCTACCTCCTGTGTCTGACGCAAGATTATCATGAGTTTCATCCAATATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCTCCTGTGTCTGACGCAAGATTATCATGAGTTTCATCCAATATG  100

seq1  GGCTACACAGTGAGTTCCAGGTTATCCAGTGAGATCATATTCCAAAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACACAGTGAGTTCCAGGTTATCCAGTGAGATCATATTCCAAAACAA  150

seq1  ACAAACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  200

seq1  AAACATACCACACAAACAGGCTCCATCTAAATTAGCAAAATAACATGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATACCACACAAACAGGCTCCATCTAAATTAGCAAAATAACATGAAA  250

seq1  AGTCTAAAACACAAATGCCATAAACAGGGCCAGCTCTGTCTCACACTTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTAAAACACAAATGCCATAAACAGGGCCAGCTCTGTCTCACACTTGC  300

seq1  TCTTAAGACATCTGTAGACAGCATGAAGACAGCATGTAGATATCTGTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAGACATCTGTAGACAGCATGAAGACAGCATGTAGATATCTGTAGA  350

seq1  CACCATGTAGACATCAAAATCATGTACATATCTAGAGATATCATATAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGTAGACATCAAAATCATGTACATATCTAGAGATATCATATAGAT  400

seq1  ATCTGTGGACAGCGTGTAGACAGCATGTAGACAGCATGTAAACATCTATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGGACAGCGTGTAGACAGCATGTAGACAGCATGTAAACATCTATA  450

seq1  GACAGTGACAGTATGTAGAAATCTATAGACAGCATGTAGATCTCTGTAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTGACAGTATGTAGAAATCTATAGACAGCATGTAGATCTCTGTAGA  500

seq1  TACCATGTAGACATCATACAGACATCATGTAGACATCTGTAGACACATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATGTAGACATCATACAGACATCATGTAGACATCTGTAGACACATAT  550

seq1  AGACATTATGTAGACATCTGTGGACAGCATGTAGACACCATGTAGGCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTATGTAGACATCTGTGGACAGCATGTAGACACCATGTAGGCAGC  600

seq1  CTTATCAAATACGTGGTGGCCACCTGGTGCTTCCAGGTGCTCTGCCTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATCAAATACGTGGTGGCCACCTGGTGCTTCCAGGTGCTCTGCCTGTC  650

seq1  AAGCCATCCTGCAGTACTAACATTCATGGTCTTCTTGAAAGAAATGTGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATCCTGCAGTACTAACATTCATGGTCTTCTTGAAAGAAATGTGCC  700

seq1  ACTTTATCTCACTGGAACATATTTAAGCAACCCAAGTCATCAGTTGGTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTATCTCACTGGAACATATTTAAGCAACCCAAGTCATCAGTTGGTAC  750

seq1  AGTTTGGAGGTTTGTGTTTTTAATTAGCATATATTAATTATATATTATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGAGGTTTGTGTTTTTAATTAGCATATATTAATTATATATTATAA  800

seq1  TGGGCTTCATTATGACA-TTTTCACATATGCATATGACAGGTTTTGATCA  849
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTTCATTATGACATTTTTCACATATGCATATGACAGGTTTTGATCA  850

seq1  TATTTCCCCCAGTGCTCTTTCTTGCGCTCCTCACACCCTCTTTCACACCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCCCCAGTGCTCTTTCTTGCGCTCCTCACACCCTCTTTCACACCC  900

seq1  TCTCTCTTCCTAAC-TTCCTTC-TTTTATACATGCATGTCTGTCTGTCTA  947
      |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTTCCTAACTTTCCTTCTTTTTTTACATGCATGTCTGTCTGTCTA  950

seq1  TCTATCTATCTATCTATCTATCTAT-CTATCTATCTATCTATCTATTTTA  996
      |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||| ||||| ||||
seq2  TCTATCTATCTATCTATCAATCAATCCTATCGATCCATCAATCTA-TTTA  999

seq1  GTTTCATT--GTGTTCCTTACATGGCCATA-GGGAAGGGCTTGTTTACAG  1043
      |||  |||   |||| ||||||||||||||  || | |||||||||||| 
seq2  GTTCTATTTGTTGTTTCTTACATGGCCATATAGGTAAGGCTTGTTTACAA  1049

seq1  GAGCATAGGCACCTTACTAGCTAGC  1068
      ||||||||||| |||||||||||||
seq2  GAGCATAGGCAACTTACTAGCTAGC  1074

seq1: chr3_146750749_146751933
seq2: B6Ng01-184I10.g_67_1234 (reverse)

seq1  TCCCCATAAGTTTTCATATATATTATCAGTTAAAAGGAAAATTTAATAGG  50
      ||||||||||||   |||   ||  |||||  |||||||||||  |||||
seq2  TCCCCATAAGTTCCAATA---AT--TCAGT--AAAGGAAAATT--ATAGG  41

seq1  ACCTGGTAGTGACATTTTTTAGCTTTGTGGAAACAA-TCTCATCCAACTT  99
      |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||   |
seq2  ACCTGGTAGTGACA-TTTTAGGCTTTGT-GAAACAATTCTCATCCA--CT  87

seq1  TGATTTCCTTGTCTTTACA-GTGGGGGCAAATAGTATGCAAATTTTAGCT  148
      ||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  TGAATTCCCTGTCTTAACAGGTGGGGGC-AATAGTATGCAAA-TTTAGCT  135

seq1  TATGGATGGCAATTGGATTTGTCAAGACAGCAACAGCAACAGCAGCAGCA  198
      |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||
seq2  TATGGATGGC-ATTGGAATTGTC-AGACAGCACCAGC-ACAGCAGCAGCA  182

seq1  GCAGCAGCAACAACAACAAAAGCCAGGATCCTAAAAATTCTTAGCCTTCT  248
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
seq2  GCAGCAGC-ACAACAACAAAAGCCAGGATCCTAAAAAATCTTAG-CTTCT  230

seq1  CTACACCTT-ATACTTACAGAATCTCTGCCAGACATCACCCAGGCATGCC  297
      ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCTTAATACTAACAGAATCTCTGCCAGACATCACCCAGGCATGCC  280

seq1  TAATAATTGACATCACTAACACATAGTGTCC-TAAAAGTTCATGCTTGAG  346
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAATAA-TGACATCACTAACACATAGTGTCCTTAAAAGTTCATGCTTGAG  329

seq1  AACTGAACCATTGAATTGCACTACCAACTATGGTGTTTTAAATAAGTTTA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAACCATTGAATTGCACTACCAACTATGGTGTTTTAAATAAGTTTA  379

seq1  TGATTTGTGTTGGACCACATATCTAGCTTTCCTGGGGCACGTGAGGCTTA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGTGTTGGACCACATATCTAGCTTTCCTGGGGCACGTGAGGCTTA  429

seq1  CAGGTGGACATGACCTTGAGAATGTTTTTTAGAGATGGGCTCGTATACTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGACATGACCTTGAGAATGTTTTTTAGAGATGGGCTCGTATACTT  479

seq1  ATTCATTAAGAAGACTTGTGGCTGGCCTTTTGTGTAGCCCATCCCAGCAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTAAGAAGACTTGTGGCTGGCCTTTTGTGTAGCCCATCCCAGCAC  529

seq1  TCCCATCTCCCGGTCTGTGACCTCGTTGGCTGCATGTTGATTCATTTCAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATCTCCCGGTCTGTGACCTCGTTGGCTGCATGTTGATTCATTTCAT  579

seq1  CATTGTGAAACTGAAGAGAAGCAGCACTGGTCTAGCCAAGCGGGATCAAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGAAACTGAAGAGAAGCAGCACTGGTCTAGCCAAGCGGGATCAAC  629

seq1  TGGCTGGAGAGGCATGACAGCGCCAAGACAAGGTCACTTTATAGTAGAGG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGGAGAGGCATGACAGCGCCAAGACAAGGTCACTTTATAGTAGAGG  679

seq1  CCAAGATGCTGGTATTGCTTCTTTTGTTAGATACCTCTTTATAAAATAAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGATGCTGGTATTGCTTCTTTTGTTAGATACCTCTTTATAAAATAAG  729

seq1  GCTCCAGTCAGGATGCTGTTACCCCCACACTGGGCAGTGAATGACATCCA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAGTCAGGATGCTGTTACCCCCACACTGGGCAGTGAATGACATCCA  779

seq1  GGGAAACCTTTGAAAGGGTTACTCTCCAATGTGTGGACATTGAGGAAAAT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAACCTTTGAAAGGGTTACTCTCCAATGTGTGGACATTGAGGAAAAT  829

seq1  GGCAGGAACTCCAATTGATGAAAACCTGTTAGCACATCCTGCTAGAAAAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAACTCCAATTGATGAAAACCTGTTAGCACATCCTGCTAGAAAAT  879

seq1  CATGCTGCTCTGCCTCGGTTTGAAATGTGAAGAAAGAAGAGTCTCCCTTT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGCTCTGCCTCGGTTTGAAATGTGAAGAAAGAAGAGTCTCCCTTT  929

seq1  TATCACTTTGGTAGCCAGGAGCTATTGGACAAATTACACATAAAAATAAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACTTTGGTAGCCAGGAGCTATTGGACAAATTACACATAAAAATAAT  979

seq1  ATTTAAGGGTCAGGTAATTATTCTTATAACTTGGGGGAACTAGCTCAGTA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGGTCAGGTAATTATTCTTATAACTTGGGGGAACTAGCTCAGTA  1029

seq1  ATAGAGGAAACATTCTCCTATCTCCTCTTAATTCTGAAGTCTAAACTTCT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGAAACATTCTCCTATCTCCTCTTAATTCTGAAGTCTAAACTTCT  1079

seq1  TTGGTGCCAGCCTGCTTTCAAATCAGATGACACTGCTGCTGGCTGTCATT  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGCCAGCCTGCTTTCAAATCAGATGACACTGCTGCTGGCTGTCATT  1129

seq1  CCATGATGTTAGAGGAAGTGTTGAGCATTTAATGAATTC  1185
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGATGTTAGAGGAAGTGTTGAGCATTTAATGAATTC  1168