BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184K17
Chromosome3 (Build37)
Map Location 50,223,701 - 50,436,161
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc7a11, EG621304, LOC100039667
Upstream geneLOC676568, LOC666247, LOC100039579, LOC100039587, LOC638779, Pcdh18, LOC100039628, LOC639469
Downstream geneCcrn4l, Elf2, A630062H14, 4930583H14Rik, LOC669130, Ndufc1, Narg1, Rab33b, Setd7, LOC100039684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184K17.bB6Ng01-184K17.g
ACCGA009987GA009988
length1,1931,015
definitionB6Ng01-184K17.b B6Ng01-184K17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(50,223,701 - 50,224,896)(50,435,336 - 50,436,161)
sequence
gaattcatatttgaaatatatagacagaaaaaatgcaatagcgataagtg
tgatataaaaagtgcacacatacacgcacataactaatgatgtgttttaa
caactagaaagttaaaaaaattaaaaacagcagttgttgttactctagga
gaatgcatataacattgttattctaggagatgaaactgtcgatgtgaccc
ttactgtgcacatgctccatttttcagtatttaacgcaagactggctggc
agaattataagggtggattataaatgagctactcctccctgctctgagta
tatcagggatagtgctgtggaatgtactatttgtgactgatttgacatgt
ttgttataagcctgaggcaacaggcagtatgcaaaccaaatgaaataaat
aagcaaacatataagtaacaccccaaactgaataaaccatatgaattaag
gaatatgccaggttttgtgtgtcagagatagccagttgcttcttaatagt
tgatgaactggtctttctcaacagccctaatgcaagaagggaactgtctg
tagaaagaatatgacttcaagtattttctcatgtccctaaagaatacagg
aaaggatagtgcctgggtacagtttggggagaagaggatgaaaatggatc
atttcagtgcaaaagttcacccactgtaggaaatacatcttgatgcctgt
ccagtctctagtaagtaggcccactgtattctctctcccctggcttagtc
ctcaaggtccctggtaactgctcacgaggtctattgtccaacgttctcta
tgactctgcataagtatgatggttggccctgcactgtaattgccaccttg
tacatgacttttcaaaggaaacagattctttaggtgagttgaaacaaagg
cgtacaataattcctggctgatgcttcaggagacgaaatccattgaggat
ccgattaaagagggcgacaaagacactgaaaaccaattttctatcacaca
gtgaaaagagagggaaaaaaaaaatctcaacacgctatgcttagcttgga
ccagaagatagggactgaaattgggtgactccctaagccacaggctgact
ggccagatgattcctctgaaatacggacatgggccaaataatttaagtgt
ggctcgccctgaactgtgacctgacctgataatgactcttttc
gaattccaggagcagagcaaaaaggaaggtgtactagatctggcatgtga
atgcctgtgcccttttattgctcacagatttggttagtgtataatatttg
catgaaaaaataagtttcatcatggcatcttgaaggctatctatagttaa
tttgaccatggtcataactcttactcattctcaagtccctgtcctacgag
ttcctgttctcttcctaatagtctcaattctttcatatctttattccctt
tttaaaatattgcaaaaatgagcaaaaacttgctaagcaattggtaattt
taaaatgtttatatccatgcatactttatgtaacttatcttgcaagtaac
atctaactttattttattatgatttgataaagtacaagaagtcttttcaa
tttcttttatgctttaagatatggtttaatatctcaaaatgtaatacact
ttagataaagtcccctggatggctgtcctagttagctttctgtattggtg
tgataaaacaccacaaccgagaacaacttggagaggaaagtccatcatta
ggggaagtcaggtcaggagctcaagcaggaacctggaggtaggaactgaa
gtagagataatgaaggaatgtttcttacaggcattcttgctctgatttgc
tcagctattttgctagtacagcccagcctaagtacctaaggatggtgcta
cccacatggtatatatgccctgcatatatgcccataggccaatccaatga
ggaagtttctcaaatgatgtttcctctttcctagtgtttcaagttgacac
ctaaaaatagtcattgaagctgctgagaatatgtatttctgctattgtga
catgttgttctgtagttgtctggtaagtctatttggtggtccatagcatc
acttaatgttttctttgtggcttcttaaagtgcagttgacttgtgtattc
ctgagaatgaagttgttgaagttactgtcactttattgggtcctatctgt
aggtttattgtcagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_50223701_50224896
seq2: B6Ng01-184K17.b_44_1236

seq1  GAATTCATATTTGAAATATATAGACAGAAAAAATGCAATAGCGATAAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATATTTGAAATATATAGACAGAAAAAATGCAATAGCGATAAGTG  50

seq1  TGATATAAAAAGTGCACACATACACGCACATAACTAATGATGTGTTTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATAAAAAGTGCACACATACACGCACATAACTAATGATGTGTTTTAA  100

seq1  CAACTAGAAAGTTAAAAAAATTAAAAACAGCAGTTGTTGTTACTCTAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAGAAAGTTAAAAAAATTAAAAACAGCAGTTGTTGTTACTCTAGGA  150

seq1  GAATGCATATAACATTGTTATTCTAGGAGATGAAACTGTCGATGTGACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCATATAACATTGTTATTCTAGGAGATGAAACTGTCGATGTGACCC  200

seq1  TTACTGTGCACATGCTCCATTTTTCAGTATTTAACGCAAGACTGGCTGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGTGCACATGCTCCATTTTTCAGTATTTAACGCAAGACTGGCTGGC  250

seq1  AGAATTATAAGGGTGGATTATAAATGAGCTACTCCTCCCTGCTCTGAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTATAAGGGTGGATTATAAATGAGCTACTCCTCCCTGCTCTGAGTA  300

seq1  TATCAGGGATAGTGCTGTGGAATGTACTATTTGTGACTGATTTGACATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGGGATAGTGCTGTGGAATGTACTATTTGTGACTGATTTGACATGT  350

seq1  TTGTTATAAGCCTGAGGCAACAGGCAGTATGCAAACCAAATGAAATAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATAAGCCTGAGGCAACAGGCAGTATGCAAACCAAATGAAATAAAT  400

seq1  AAGCAAACATATAAGTAACACCCCAAACTGAATAAACCATATGAATTAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAACATATAAGTAACACCCCAAACTGAATAAACCATATGAATTAAG  450

seq1  GAATATGCCAGGTTTTGTGTGTCAGAGATAGCCAGTTGCTTCTTAATAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATGCCAGGTTTTGTGTGTCAGAGATAGCCAGTTGCTTCTTAATAGT  500

seq1  TGATGAACTGGTCTTTCTCAACAGCCCTAATGCAAGAAGGGAACTGTCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACTGGTCTTTCTCAACAGCCCTAATGCAAGAAGGGAACTGTCTG  550

seq1  TAGAAAGAATATGACTTCAAGTATTTTCTCATGTCCCTAAAGAATACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGAATATGACTTCAAGTATTTTCTCATGTCCCTAAAGAATACAGG  600

seq1  AAAGGATAGTGCCTGGGTACAGTTTGGGGAGAAGAGGATGAAAATGGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGATAGTGCCTGGGTACAGTTTGGGGAGAAGAGGATGAAAATGGATC  650

seq1  ATTTCAGTGCAAAAGTTCACCCACTGTAGGAAATACATCTTGATGCCTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAGTGCAAAAGTTCACCCACTGTAGGAAATACATCTTGATGCCTGT  700

seq1  CCAGTCTCTAGTAAGTAGGCCCACTGTATTCTCTCTCCCCTGGCTTAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCTCTAGTAAGTAGGCCCACTGTATTCTCTCTCCCCTGGCTTAGTC  750

seq1  CTCAAGGTCCCTGGTAACTGCTCACGAGGTCTATTGTCCAACGTTCTCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGTCCCTGGTAACTGCTCACGAGGTCTATTGTCCAACGTTCTCTA  800

seq1  TGACTCTGCATAAGTATGATGGTTGGCCCTGCACTGTAATTGCCAACCTT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGACTCTGCATAAGTATGATGGTTGGCCCTGCACTGTAATTGCC-ACCTT  849

seq1  GTACATGACTTTTCAAAGGAAACAGATTCTTTAGGTGAGTTGAAACAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGACTTTTCAAAGGAAACAGATTCTTTAGGTGAGTTGAAACAAAG  899

seq1  GCGTACAATAA-TCCTGGCTGATGCTTCAGGGAGACGAAATCCATTGAGG  949
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GCGTACAATAATTCCTGGCTGATGCTTCA-GGAGACGAAATCCATTGAGG  948

seq1  ATCCGATTAAAGAGGGCGACAAAAGACACTGAAAACCAATTTTCTATCAC  999
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGATTAAAGAGGGCGAC-AAAGACACTGAAAACCAATTTTCTATCAC  997

seq1  ACAGTGAAAAGAGAGGG-AAAAAAAAATCTCAACACGCTATGCTTAGCTT  1048
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACAGTGAAAAGAGAGGGAAAAAAAAAATCTCAACACGCTATGCTTAGC-T  1046

seq1  TGGACCCAGAGATA-GGACTGAAATTGGTTGACTCCCCAAGGCCACAGGC  1097
      ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||
seq2  TGGACCAGAAGATAGGGACTGAAATTGGGTGACTCCCTAA-GCCACAGGC  1095

seq1  TGACTGG-CAGATGGATTCCTCTG-AATACGGACATTGGCAATAATATTA  1145
      ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |  ||| 
seq2  TGACTGGCCAGAT-GATTCCTCTGAAATACGGACATGGGCCAAATAATTT  1144

seq1  AAGTTGTGCTCG-CCTGACTCTGTGACCTGA-CTGAGTTAATGACTTCTT  1193
      ||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||
seq2  AAGTGTGGCTCGCCCTGA-ACTGTGACCTGACCTGA--TAATGAC-TCTT  1190

seq1  TTC  1196
      |||
seq2  TTC  1193

seq1: chr3_50435336_50436161
seq2: B6Ng01-184K17.g_66_891 (reverse)

seq1  TCAGCAGCTTCAATGACTATTTTTAGGTGTCAACTTGAAACACTAGGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGCTTCAATGACTATTTTTAGGTGTCAACTTGAAACACTAGGAAA  50

seq1  GAGGAAACATCATTTGAGAAACTTCCTCATTGGATTGGCCTATGGGCATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAACATCATTTGAGAAACTTCCTCATTGGATTGGCCTATGGGCATA  100

seq1  TATGCAGGGCATATATACCATGTGGGTAGCACCATCCTTAGGTACTTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGGGCATATATACCATGTGGGTAGCACCATCCTTAGGTACTTAGG  150

seq1  CTGGGCTGTACTAGCAAAATAGCTGAGCAAATCAGAGCAAGAATGCCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTGTACTAGCAAAATAGCTGAGCAAATCAGAGCAAGAATGCCTGT  200

seq1  AAGAAACATTCCTTCATTATCTCTACTTCAGTTCCTACCTCCAGGTTCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACATTCCTTCATTATCTCTACTTCAGTTCCTACCTCCAGGTTCCT  250

seq1  GCTTGAGCTCCTGACCTGACTTCCCCTAATGATGGACTTTCCTCTCCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGAGCTCCTGACCTGACTTCCCCTAATGATGGACTTTCCTCTCCAAG  300

seq1  TTGTTCTCGGTTGTGGTGTTTTATCACACCAATACAGAAAGCTAACTAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTCGGTTGTGGTGTTTTATCACACCAATACAGAAAGCTAACTAGG  350

seq1  ACAGCCATCCAGGGGACTTTATCTAAAGTGTATTACATTTTGAGATATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCCATCCAGGGGACTTTATCTAAAGTGTATTACATTTTGAGATATTA  400

seq1  AACCATATCTTAAAGCATAAAAGAAATTGAAAAGACTTCTTGTACTTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATATCTTAAAGCATAAAAGAAATTGAAAAGACTTCTTGTACTTTAT  450

seq1  CAAATCATAATAAAATAAAGTTAGATGTTACTTGCAAGATAAGTTACATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCATAATAAAATAAAGTTAGATGTTACTTGCAAGATAAGTTACATA  500

seq1  AAGTATGCATGGATATAAACATTTTAAAATTACCAATTGCTTAGCAAGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATGCATGGATATAAACATTTTAAAATTACCAATTGCTTAGCAAGTT  550

seq1  TTTGCTCATTTTTGCAATATTTTAAAAAGGGAATAAAGATATGAAAGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTCATTTTTGCAATATTTTAAAAAGGGAATAAAGATATGAAAGAAT  600

seq1  TGAGACTATTAGGAAGAGAACAGGAACTCGTAGGACAGGGACTTGAGAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTATTAGGAAGAGAACAGGAACTCGTAGGACAGGGACTTGAGAAT  650

seq1  GAGTAAGAGTTATGACCATGGTCAAATTAACTATAGATAGCCTTCAAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAGAGTTATGACCATGGTCAAATTAACTATAGATAGCCTTCAAGAT  700

seq1  GCCATGATGAAACTTATTTTTTCATGCAAATATTATACACTAACCAAATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGATGAAACTTATTTTTTCATGCAAATATTATACACTAACCAAATC  750

seq1  TGTGAGCAATAAAAGGGCACAGGCATTCACATGCCAGATCTAGTACACCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCAATAAAAGGGCACAGGCATTCACATGCCAGATCTAGTACACCT  800

seq1  TCCTTTTTGCTCTGCTCCTGGAATTC  826
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTTGCTCTGCTCCTGGAATTC  826