BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186K15
Chromosome3 (Build37)
Map Location 18,934,311 - 19,057,652
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArmc1
Upstream geneBhlhb5, Cyp7b1, LOC622921, LOC100040153
Downstream geneMtfr1, Pde7a, Dnajc5b, EG620290, Trim55, Crh, LOC665002, LOC100039304, LOC100040237, 4632415L05Rik, Cp, Hps3, Hltf, Gyg
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186K15.bB6Ng01-186K15.g
ACCGA011445GA011446
length4911,180
definitionB6Ng01-186K15.b B6Ng01-186K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,057,156 - 19,057,652)(18,934,311 - 18,935,506)
sequence
atcctcttctactatgaatgaagaacctgatgctctatcagtagttaacc
agctacgggatttagcagcagatccactaaatagaagagccatcgtccag
gatcagggatgtttgcctggccttattttatttatggaccatccaaaccc
tcctgtcgttcactcagctttgcttgtaagttgcttttaatactttgtgt
tgtggttttaataatgcaaatacgaattttcaaagacctttgataacatg
gtaaaagactaagacattagatcatacagtctgtattctggcatgtaaaa
aacatggaaaccatggcatatatgtagttcttcaacacaaatagcaacat
gttgattttgttttttaatgtaaatggtaactataacacatatagttata
atatgttctgacccttggtattttcagttaacatggtgatctgttgtttg
gttggttttcttttttggggggtatttcttttggggggggg
gaattccaggcaggctgctccacctacctggcccttatgtggactctgag
catcccagctcctatcctcatgcttccacatgctctaaccatggagaaag
cacctcagccaggtcttaaggacattttagatctcatcttgaaggataat
cttcacaatgaaagaatttcctattaccccaagagatttattccttgaaa
catgaagccaattcctttgtaagatatatgtggtatatgacccacaagga
cttctaagacactcatatacaaatgacagcttcatatcgacctcagcttg
actctttagcaagcctgaaatcagccaggtgcttctcacactgtcacttg
aaaatgttcggtgccccaatgttcttacacacaaacacttacagagtcat
ttctcaagtgacaggacagagaggagtttctgggtctctggaagattagg
tgaggacgagcacggtctggagtctctcctgcgaatcccctgagggagtg
gcagtatgttttcatgtgctctagtagtgagaagtgctgtccatggtcac
gaagagaaagctgaaatcccagaacccattacaaaggagaactgtcagca
gctgggtgagcagctccaacagcagccaagtcccattccctaccccattg
tcacatcttcaggaggtaccataggaggtgattgcacacttgaaacattt
gtgacatttgtcccttatttgaaagaatatgaccaatggattgccctata
atcaatcaaaacctaatttcagacagcacacctgaccatctcataaatat
gcaatacaaagtgatacatgcatggttaaggcttgtatgagtttgccatc
tgttgctgcaataaacatcataaacatcataaacttgggaagcaaagtat
ttattccatcatataactctcaagtaacaatctataattgagtgaagttg
gggcaagaactgaagtagaagccatggagggtgctattccctggcttgct
ccacttggctgctcagctgctataccacctggaccatcagcagagaggac
atcacccaacaatggagctagtcctccaagtcatcatatcatacaatctc
tccaatagacaacttatggagtattttcagctgagttctgggttgtgtta
agctgaccggaaaaggtaaccaggtacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_19057156_19057652
seq2: B6Ng01-186K15.b_34_530 (reverse)

seq1  CCCCCCCCCAAAAGAAATACCCCCCAAAAAAGAAAACCAACCAAACAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCAAAAGAAATACCCCCCAAAAAAGAAAACCAACCAAACAACA  50

seq1  GATCACCATGTTAACTGAAAATACCAAGGGTCAGAACATATTATAACTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACCATGTTAACTGAAAATACCAAGGGTCAGAACATATTATAACTAT  100

seq1  ATGTGTTATAGTTACCATTTACATTAAAAAACAAAATCAACATGTTGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTATAGTTACCATTTACATTAAAAAACAAAATCAACATGTTGCTA  150

seq1  TTTGTGTTGAAGAACTACATATATGCCATGGTTTCCATGTTTTTTACATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGTTGAAGAACTACATATATGCCATGGTTTCCATGTTTTTTACATG  200

seq1  CCAGAATACAGACTGTATGATCTAATGTCTTAGTCTTTTACCATGTTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATACAGACTGTATGATCTAATGTCTTAGTCTTTTACCATGTTATC  250

seq1  AAAGGTCTTTGAAAATTCGTATTTGCATTATTAAAACCACAACACAAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCTTTGAAAATTCGTATTTGCATTATTAAAACCACAACACAAAGT  300

seq1  ATTAAAAGCAACTTACAAGCAAAGCTGAGTGAACGACAGGAGGGTTTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAGCAACTTACAAGCAAAGCTGAGTGAACGACAGGAGGGTTTGGA  350

seq1  TGGTCCATAAATAAAATAAGGCCAGGCAAACATCCCTGATCCTGGACGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCATAAATAAAATAAGGCCAGGCAAACATCCCTGATCCTGGACGAT  400

seq1  GGCTCTTCTATTTAGTGGATCTGCTGCTAAATCCCGTAGCTGGTTAACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTTCTATTTAGTGGATCTGCTGCTAAATCCCGTAGCTGGTTAACTA  450

seq1  CTGATAGAGCATCAGGTTCTTCATTCATAGTAGAAGAGGATGAATTC  497
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATAGAGCATCAGGTTCTTCATTCATAGTAGAAGAGGATGAATTC  497

seq1: chr3_18934311_18935506
seq2: B6Ng01-186K15.g_61_1240

seq1  GAATTCCAGGCAGGCTGCTCCACCTACCTGGCCCTTATGTGGACTCTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCAGGCTGCTCCACCTACCTGGCCCTTATGTGGACTCTGAG  50

seq1  CATCCCAGCTCCTATCCTCATGCTTCCACATGCTCTAACCATGGAGAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCAGCTCCTATCCTCATGCTTCCACATGCTCTAACCATGGAGAAAG  100

seq1  CACCTCAGCCAGGTCTTAAGGACATTTTAGATCTCATCTTGAAGGATAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCAGCCAGGTCTTAAGGACATTTTAGATCTCATCTTGAAGGATAAT  150

seq1  CTTCACAATGAAAGAATTTCCTATTACCCCAAGAGATTTATTCCTTGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACAATGAAAGAATTTCCTATTACCCCAAGAGATTTATTCCTTGAAA  200

seq1  CATGAAGCCAATTCCTTTGTAAGATATATGTGGTATATGACCCACAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAGCCAATTCCTTTGTAAGATATATGTGGTATATGACCCACAAGGA  250

seq1  CTTCTAAGACACTCATATACAAATGACAGCTTCATATCGACCTCAGCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAAGACACTCATATACAAATGACAGCTTCATATCGACCTCAGCTTG  300

seq1  ACTCTTTAGCAAGCCTGAAATCAGCCAGGTGCTTCTCACACTGTCACTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTTAGCAAGCCTGAAATCAGCCAGGTGCTTCTCACACTGTCACTTG  350

seq1  AAAATGTTCGGTGCCCCAATGTTCTTACACACAAACACTTACAGAGTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTTCGGTGCCCCAATGTTCTTACACACAAACACTTACAGAGTCAT  400

seq1  TTCTCAAGTGACAGGACAGAGAGGAGTTTCTGGGTCTCTGGAAGATTAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAGTGACAGGACAGAGAGGAGTTTCTGGGTCTCTGGAAGATTAGG  450

seq1  TGAGGACGAGCACGGTCTGGAGTCTCTCCTGCGAATCCCCTGAGGGAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGACGAGCACGGTCTGGAGTCTCTCCTGCGAATCCCCTGAGGGAGTG  500

seq1  GCAGTATGTTTTCATGTGCTCTAGTAGTGAGAAGTGCTGTCCATGGTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTATGTTTTCATGTGCTCTAGTAGTGAGAAGTGCTGTCCATGGTCAC  550

seq1  GAAGAGAAAGCTGAAATCCCAGAACCCATTACAAAGGAGAACTGTCAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGAAAGCTGAAATCCCAGAACCCATTACAAAGGAGAACTGTCAGCA  600

seq1  GCTGGGTGAGCAGCTCCAACAGCAGCCAAGTCCCATTCCCTACCCCATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTGAGCAGCTCCAACAGCAGCCAAGTCCCATTCCCTACCCCATTG  650

seq1  TCACATCTTCAGGAGGTACCATAGGAGGTGATTGCACACTTGAAACATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCTTCAGGAGGTACCATAGGAGGTGATTGCACACTTGAAACATTT  700

seq1  GTGACATTTGTCCCTTATTTGAAAGAATATGACCAATGGATTGCCCTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACATTTGTCCCTTATTTGAAAGAATATGACCAATGGATTGCCCTATA  750

seq1  ATCAATCAAAACCTAATTTCAGACAGCACACCTGACCATCTCATAAATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATCAAAACCTAATTTCAGACAGCACACCTGACCATCTCATAAATAT  800

seq1  GCAATACAAAGTGATACATGCATGGTTAAGGCTTGTATGAGTTTGCCATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATACAAAGTGATACATGCATGGTTAAGGCTTGTATGAGTTTGCCATC  850

seq1  TGTTGCTGCAATAAACATCATAAACATCATAAACTTGGGAAGCAAAGTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCTGCAATAAACATCATAAACATCATAAACTTGGGAAGCAAAGTAT  900

seq1  TTATTCCATCATATAACTCTCAAGTAACAATCTATAATTGAGTGAAGTTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCCATCATATAACTCTCAAGTAACAATCTATAATTGAGTGAAGTTG  950

seq1  GGGCAAGAACTGAAGTAGAAGCCATGGAGGGGTGCTATTCCCTGGCTTGC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGAACTGAAGTAGAAGCCATGGA-GGGTGCTATTCCCTGGCTTGC  999

seq1  TCCACTTGGCTTGCTCAGCCTGCTTATACCACCTGGACCATCAGCCAAGA  1050
      |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||
seq2  TCCACTTGGC-TGCTCAG-CTGC-TATACCACCTGGACCATCAGC--AGA  1044

seq1  GAGGACATCACCC-ACAAT-GAGCTAGTCCCTCCCAAGTCAATCATTAAT  1098
      ||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||| |||||  ||
seq2  GAGGACATCACCCAACAATGGAGCTAGTCC--TCCAAGTC-ATCAT--AT  1089

seq1  CAATACAATCTCTCC-ATAGACCAACCTAATGGAGGTATTTTTCAGCTGA  1147
      | ||||||||||||| ||||||  | || ||||| ||| |||||||||| 
seq2  C-ATACAATCTCTCCAATAGAC--AACTTATGGA-GTA-TTTTCAGCTG-  1133

seq1  AGTTCCTTGGGGTTTGTGTTAAGTTGA-CAGAAAAAGTAACCAGG-ACAG  1195
      |||||  ||||  |||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||
seq2  AGTTC--TGGG--TTGTGTTAAGCTGACCGGAAAAGGTAACCAGGTACAG  1179

seq1  G  1196
      |
seq2  G  1180