BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192G18
Chromosome3 (Build37)
Map Location 64,216,136 - 64,342,388
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930518C23Rik, EG637053, LOC672951, EG639869, EG667060, EG667069
Upstream genePlch1, LOC100040836, E130311K13Rik, Slc33a1, Gmps, LOC670032, EG56544, LOC380739, EG637004, EG667031
Downstream geneLOC100040918, 4933425M15Rik, LOC670110, Kcnab1, Ssr3, EG433604, EG667093, LOC100041083, 4931440P22Rik, Tiparp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192G18.bB6Ng01-192G18.g
ACCGA015666GA015667
length1,1441,120
definitionB6Ng01-192G18.b B6Ng01-192G18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,341,259 - 64,342,388)(64,216,136 - 64,217,237)
sequence
gaattccttgcttatgaggaggccctggggttcacccttgtcatcctttc
catctttggagctcttgtggtcttggcagtcactgttgtgtatgtgatcc
acaggcacactccattggtgaaagccaatgaccgggagctgagcttcctc
attcaggtgtctctgggaatcacagtgctatcatccatgttgttcatagg
caagccatgcaactggtcctgcaagacccgtcaggtcactctggcactgg
gcttttgcctttgtttgtcttccattcttggaaagactgtttcactcttt
tttgcctacaggatttccatatctaaaactcggctaatatccatgcaccc
catttttcgtaaactcattgtgctgatctgtgttgtaggggagattggtg
tatgcacaacttacttagtgttggagcctccaagcctgttcaagaacatt
gaacctcaaaatgtaaagatcatctttgaatgcaatgaaggttctataga
gtttctgtgctccatttttgggtttgatgttcttttggctctgctgtgtt
ttgttaccacctttgtggctcgccagctgccagataactattatgaaggt
aaatgtatcacttttggaatgctggtctttttcattgtctggatctcttt
tgtccctgcttacttgggcaccaaaggcaaattcaatgtggctgtggaaa
tatttgccattttggcatccagctatggcttgttaggctgtgtatttctt
cccaagtgtttcattatcttgctgaggccaaagaggaacactgatgaaac
tgttgggtggaagagtccccactgttgacaggagcatccagctgacctca
gcttctgtgagcagtgagctttacagcacccacgggtgtccactgtcctg
ggatgagtagagcagttgagatccatgttgacatgcaaagcttggataat
ggcatagcctcaatctttcctctgaacattgtttttccaagccagctgct
gatgctcatggggtaatattggggggtttggacttttatgatatattctt
agctagggtaaataaaatcttattctgtaatgccattttgacatgattta
taatattgacactcatgaaattggtaatccattccatagaatat
gaattctatataaagtagtcttgtaaggggttctcaaacgaggagaattt
gcatttcgtgaagaaaatgtaaactgcttggagaacattagaactgcgtg
tgactaaggggactgtggaatgttaatggtgaaaaggaattatatagaac
taattttaaagaaatatgttaaaatataaaactaatatatatattactca
cttcttatacccttcactgtgaaaatggaaacaatttagagaaatgagga
aagtgttaattagggactcatcataaatctcattggtcagcaaccatact
gaaggttgctccttccagtaataacttggagcatgtataaaaagaaagga
ttcgtgattgatgttgatatcatgtaagaaacaaccaaatagctataaag
accaaacagcataatggaaaagtctgatgtattagttactatgtctaata
caattaatacctgtcctaccctcatattataacaatcttaagtttatttt
caaaacactcaaaaattgatataaaaaaataaaaatgcagtttttatggc
tatggaattggagactaatgttttgttttcttttcatttctggcattatt
ttttatgtctaatctctgtgtgtttgtacttgtataagacacatatatta
agagacattagtcctgtcccaactttcattttctgacaataattgttata
tttgagaattgagaattccgtttttgatacgataactttcaggagtcagc
agtagcaatagaagttttcctgaaagtcagaatccttatcatgaacattt
cctcagacataaggcagagttcccagaattgcacttaatgagctttgtat
cagttaacagtgaagctgcagcacattgtgcagcaattgagcttcttcaa
acctcagtgttcaccacacaccaaacagatgttctttttgaacatgtaga
tcctctttctgcaggtgtggtatgcaacccctgaattctaatatccctta
actagcctttaagaatactgcctgcttctgttccaaaggagaattgtctg
aaggaggtgccttttctgaagactctaatagaacttacctcccgctgtaa
acagagatgtcaaggcccag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_64341259_64342388
seq2: B6Ng01-192G18.b_47_1190 (reverse)

seq1  ATATTCTATTGAAATGGTTTCCAATTTCATTGATGTC-ATATTATAATCC  49
      ||||||||| |||  | || ||||||||||   |||| |||||||||  |
seq2  ATATTCTATGGAATGGATTACCAATTTCATGAGTGTCAATATTATAAATC  50

seq1  ATGTC-AAATGGCATTTAACAGAATAAGATTTTATTTACTAT-GCTAAGA  97
      ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  | |||||||
seq2  ATGTCAAAATGGCATT--ACAGAATAAGATTTTATTTACCCTAGCTAAGA  98

seq1  TTATATTATAAAAGTCCAAA-CCCCCAATATTA-CCCATGAGCATCAGCA  145
       ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATATATCATAAAAGTCCAAACCCCCCAATATTACCCCATGAGCATCAGCA  148

seq1  GCT-GCTT-GAAAAACAATGTTCAGAGG-AAGATTGA-GCTATGCCATTA  191
      ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  GCTGGCTTGGAAAAACAATGTTCAGAGGAAAGATTGAGGCTATGCCATTA  198

seq1  TCC-AGCTTTGCATGTC-ACATGGATCTC-ACTGCTCTACTCAT-CCAGG  237
      ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||
seq2  TCCAAGCTTTGCATGTCAACATGGATCTCAACTGCTCTACTCATCCCAGG  248

seq1  ACAGTGGACA-CCGT-GGTGCTGTTAAGCTCACTGCTCACAGAAGCTGAG  285
      |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGGACACCCGTGGGTGCTGTAAAGCTCACTGCTCACAGAAGCTGAG  298

seq1  GTCAGCTGGATGCTCCTGTCAACAGTGGGGACTCTTCCA-CCAACAGTTT  334
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTCAGCTGGATGCTCCTGTCAACAGTGGGGACTCTTCCACCCAACAGTTT  348

seq1  CATCAGTGTTCCTCTTTGGCCTCAGCAAGATAATGAAACACTTGGGAAGA  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGTGTTCCTCTTTGGCCTCAGCAAGATAATGAAACACTTGGGAAGA  398

seq1  AATACACAGCCTAACAAGCCATAGCTGGATGCCAAAATGGCAAATATTTC  434
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACACAGCCTAACAAGCCATAGCTGGATGCCAAAATGGCAAATATTTC  448

seq1  CACAGCCACATTGAATTTGCCTTTGGTGCCCAAGTAAGCAGGGACAAAAG  484
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCCACATTGAATTTGCCTTTGGTGCCCAAGTAAGCAGGGACAAAAG  498

seq1  AGATCCAGACAATGAAAAAGACCAGCATTCCAAAAGTGATACATTTACCT  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCAGACAATGAAAAAGACCAGCATTCCAAAAGTGATACATTTACCT  548

seq1  TCATAATAGTTATCTGGCAGCTGGCGAGCCACAAAGGTGGTAACAAAACA  584
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATAGTTATCTGGCAGCTGGCGAGCCACAAAGGTGGTAACAAAACA  598

seq1  CAGCAGAGCCAAAAGAACATCAAACCCAAAAATGGAGCACAGAAACTCTA  634
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAGCCAAAAGAACATCAAACCCAAAAATGGAGCACAGAAACTCTA  648

seq1  TAGAACCTTCATTGCATTCAAAGATGATCTTTACATTTTGAGGTTCAATG  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACCTTCATTGCATTCAAAGATGATCTTTACATTTTGAGGTTCAATG  698

seq1  TTCTTGAACAGGCTTGGAGGCTCCAACACTAAGTAAGTTGTGCATACACC  734
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGAACAGGCTTGGAGGCTCCAACACTAAGTAAGTTGTGCATACACC  748

seq1  AATCTCCCCTACAACACAGATCAGCACAATGAGTTTACGAAAAATGGGGT  784
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCCCCTACAACACAGATCAGCACAATGAGTTTACGAAAAATGGGGT  798

seq1  GCATGGATATTAGCCGAGTTTTAGATATGGAAATCCTGTAGGCAAAAAAG  834
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGATATTAGCCGAGTTTTAGATATGGAAATCCTGTAGGCAAAAAAG  848

seq1  AGTGAAACAGTCTTTCCAAGAATGGAAGACAAACAAAGGCAAAAGCCCAG  884
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAACAGTCTTTCCAAGAATGGAAGACAAACAAAGGCAAAAGCCCAG  898

seq1  TGCCAGAGTGACCTGACGGGTCTTGCAGGACCAGTTGCATGGCTTGCCTA  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGTGACCTGACGGGTCTTGCAGGACCAGTTGCATGGCTTGCCTA  948

seq1  TGAACAACATGGATGATAGCACTGTGATTCCCAGAGACACCTGAATGAGG  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAACATGGATGATAGCACTGTGATTCCCAGAGACACCTGAATGAGG  998

seq1  AAGCTCAGCTCCCGGTCATTGGCTTTCACCAATGGAGTGTGCCTGTGGAT  1034
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCAGCTCCCGGTCATTGGCTTTCACCAATGGAGTGTGCCTGTGGAT  1048

seq1  CACATACACAACAGTGACTGCCAAGACCACAAGAGCTCCAAAGATGGAAA  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATACACAACAGTGACTGCCAAGACCACAAGAGCTCCAAAGATGGAAA  1098

seq1  GGATGACAAGGGTGAACCCCAGGGCCTCCTCATAAGCAAGGAATTC  1130
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGACAAGGGTGAACCCCAGGGCCTCCTCATAAGCAAGGAATTC  1144

seq1: chr3_64216136_64217237
seq2: B6Ng01-192G18.g_68_1187

seq1  GAATTCTATATAAAGTAGTCTTGTAAGGGGTTCTCAAACGAGGAGAATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATAAAGTAGTCTTGTAAGGGGTTCTCAAACGAGGAGAATTT  50

seq1  GCATTTCGTGAAGAAAATGTAAACTGCTTGGAGAACATTAGAACTGCGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTCGTGAAGAAAATGTAAACTGCTTGGAGAACATTAGAACTGCGTG  100

seq1  TGACTAAGGGGACTGTGGAATGTTAATGGTGAAAAGGAATTATATAGAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAAGGGGACTGTGGAATGTTAATGGTGAAAAGGAATTATATAGAAC  150

seq1  TAATTTTAAAGAAATATGTTAAAATATAAAACTAATATATATATTACTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTAAAGAAATATGTTAAAATATAAAACTAATATATATATTACTCA  200

seq1  CTTCTTATACCCTTCACTGTGAAAATGGAAACAATTTAGAGAAATGAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTATACCCTTCACTGTGAAAATGGAAACAATTTAGAGAAATGAGGA  250

seq1  AAGTGTTAATTAGGGACTCATCATAAATCTCATTGGTCAGCAACCATACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTAATTAGGGACTCATCATAAATCTCATTGGTCAGCAACCATACT  300

seq1  GAAGGTTGCTCCTTCCAGTAATAACTTGGAGCATGTATAAAAAGAAAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTTGCTCCTTCCAGTAATAACTTGGAGCATGTATAAAAAGAAAGGA  350

seq1  TTCGTGATTGATGTTGATATCATGTAAGAAACAACCAAATAGCTATAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTGATTGATGTTGATATCATGTAAGAAACAACCAAATAGCTATAAAG  400

seq1  ACCAAACAGCATAATGGAAAAGTCTGATGTATTAGTTACTATGTCTAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACAGCATAATGGAAAAGTCTGATGTATTAGTTACTATGTCTAATA  450

seq1  CAATTAATACCTGTCCTACCCTCATATTATAACAATCTTAAGTTTATTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTAATACCTGTCCTACCCTCATATTATAACAATCTTAAGTTTATTTT  500

seq1  CAAAACACTCAAAAATTGATATAAAAAAATAAAAATGCAGTTTTTATGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACACTCAAAAATTGATATAAAAAAATAAAAATGCAGTTTTTATGGC  550

seq1  TATGGAATTGGAGACTAATGTTTTGTTTTCTTTTCATTTCTGGCATTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAATTGGAGACTAATGTTTTGTTTTCTTTTCATTTCTGGCATTATT  600

seq1  TTTTATGTCTAATCTCTGTGTGTTTGTACTTGTATAAGACACATATATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGTCTAATCTCTGTGTGTTTGTACTTGTATAAGACACATATATTA  650

seq1  AGAGACATTAGTCCTGTCCCAACTTTCATTTTCTGACAATAATTGTTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACATTAGTCCTGTCCCAACTTTCATTTTCTGACAATAATTGTTATA  700

seq1  TTTGAGAATTGAGAATTCCGTTTTTGATACGATAACTTTCAGGAGTCAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGAATTGAGAATTCCGTTTTTGATACGATAACTTTCAGGAGTCAGC  750

seq1  AGTAGCAATAGAAGTTTTCCTGAAAGTCAGAATCC-TATCATGAACATTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGTAGCAATAGAAGTTTTCCTGAAAGTCAGAATCCTTATCATGAACATTT  800

seq1  CCTCAGACATAAGGCAGAGTTCCCAGAA-TGCACTTAATGAGC-TTGTAT  847
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  CCTCAGACATAAGGCAGAGTTCCCAGAATTGCACTTAATGAGCTTTGTAT  850

seq1  CAGTTAACAGTGAAGCTGCAGCACATTGTGCAGCATTTGAGCTTC-TCAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  CAGTTAACAGTGAAGCTGCAGCACATTGTGCAGCAATTGAGCTTCTTCAA  900

seq1  ACCTCAGTGTTCA-CACACACC-AACAGATGT--CTTTTGAACATGTAGA  942
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||
seq2  ACCTCAGTGTTCACCACACACCAAACAGATGTTCTTTTTGAACATGTAGA  950

seq1  TTCTC-TTCTGCAGGTGTGGTATGCAACCCCTG-ATTCT-ATAT-CCTTA  988
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||
seq2  TCCTCTTTCTGCAGGTGTGGTATGCAACCCCTGAATTCTAATATCCCTTA  1000

seq1  ACTAGCTTTTA--GATACTG-CTGCTTCTGTTCCAA--GAGAATTGTCTG  1033
      |||||| ||||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||
seq2  ACTAGCCTTTAAGAATACTGCCTGCTTCTGTTCCAAAGGAGAATTGTCTG  1050

seq1  -AGGA-GTGCC-TTTCTGAGAACCTTCT-ATAGAAAACTACTCCCGCTGT  1079
       |||| ||||| |||||||  ||  ||| ||||||     ||||||||||
seq2  AAGGAGGTGCCTTTTCTGAAGAC--TCTAATAGAACTTACCTCCCGCTGT  1098

seq1  AAACAGAGATTGTCAGGGCCCAG  1102
      ||||||||| ||||| |||||||
seq2  AAACAGAGA-TGTCAAGGCCCAG  1120