BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-192L22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 84,132,379 - 84,292,685
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6330505N24Rik
Upstream geneDchs2, 1700028M03Rik, LOC100042007, LOC100042091, Sfrp2, LOC633522, Tlr2, D930015E06Rik, Mnd1, Trim2, EG624713
Downstream geneArfip1, EG667788, EG627369, Tigd4, Tmem154, LOC624889, Fbxw7, Dear1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192L22.bB6Ng01-192L22.g
ACCGA015902GA015903
length839919
definitionB6Ng01-192L22.b B6Ng01-192L22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,291,848 - 84,292,685)(84,132,379 - 84,133,292)
sequence
gaattcctgctcactggtagtgaattgggctcacccaactaaggaagcat
tcacaattattaatctgctgacatttcattattacaatattttcctcctc
tcttgtcctctttgcagccttacgccgggcttgtggaagcagtttggttc
caagctgtaaagagcagacagctatcttcttcccaaggacacacttagtt
gtcttcagttgaagtcaggagtcctgtcctctctcaggtataaccaaaac
aggagaggttccacatgaaatgctttggtcctcatcctctttgctatgtc
cgtctccatctccatcactctccttcgcaagcttcgcaagcaagggagct
tgtgttgtttttcagtccacctgtgagctgccttgttttgggtcaagcac
cggcatgtcttctgaaatgtttaccggcctgtgcaagcctacgtctcttc
agttcaccataaaatgttaggatgcctgactgttgccttcatgtttttat
atcctgcttcaaagagcttgcatctatccaatggctccctccgtactgtg
gaggcctgtggaagacaagagctgttgtgaacgttttgtaatctccatat
taacaaatgtggcttgcatgtcgatacacggtgttctcagccaagaagga
ttattcctattactgaggcctctggccttgggtgactggagacccactgg
tgtcactgggtggttgcagggaaggaaggaccaattcagagagcatattt
atggttcagtatggaagctgctagctagccagataggcagtctcagttct
gtgctttgtggctgttgagggggctgctggtggtggtgg
gaattcttggcagtgggtgctgggcggggtctgggctgagttctggcctc
agtgagtcccatgaacttcctggtgcctattccattcagtgtctgtgtcc
aaatcccccaggtgagaaccccaggtgactcccgctgcctcagaatagga
aaaggttcacgagagggcaaactccatagctaggagaaacttgaagtaac
tttggaactgataaaatcaggaacttcaaagacctttggagtggtctgga
gactctgatagacagtggcccttcttaccccagagtcagcatctctaggt
ccagccgactgtgggttaaaggtatttgagatgcacacacactcacgatg
atcagcccttgaacagcacaacagagccatatttgcttaccattatgttg
agcattgtaagtgactcagcgctagcattaaagtacatgagagtattgca
taggttttatgcaaatatatacagttatatacatgactgaacatttgtgg
gtttgggtatcagagtagttgcaggaattcaggctccatagacactgaag
ggcacctgcattccttagaaggaacatagacctctgactcggcacttcct
gttgtaggagttcatctctggaaaccttccctaggaggatgctacatggt
ggccttgggtaaagctacatgatcgcctatgacaaatagaaatggtgata
ggcgcaccattctgaagcctgagagagggagttttggcgttgaggggtgg
ggatgaaggctaacattaaggaaatgtttgagtttgagatgtttctggag
cacccagtgagggtccccaaaccctttatgtggatggatggtttgcaagt
tgggagggcagaaacacccagcttgctgaaggagtgaattagcaagtcct
cctgcagtgcaccggccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_84291848_84292685
seq2: B6Ng01-192L22.b_46_884 (reverse)

seq1  CCACCACCACCAGCAGCCCCCTCAACAGCCAC-AAGCACAGAACTGAGAC  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CCACCACCACCAGCAGCCCCCTCAACAGCCACAAAGCACAGAACTGAGAC  50

seq1  TGCCTATCTGGCTAGCTAGCAGCTTCCATACTGAACCATAAATATGCTCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTATCTGGCTAGCTAGCAGCTTCCATACTGAACCATAAATATGCTCT  100

seq1  CTGAATTGGTCCTTCCTTCCCTGCAACCACCCAGTGACACCAGTGGGTCT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTGGTCCTTCCTTCCCTGCAACCACCCAGTGACACCAGTGGGTCT  150

seq1  CCAGTCACCCAAGGCCAGAGGCCTCAGTAATAGGAATAATCCTTCTTGGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCACCCAAGGCCAGAGGCCTCAGTAATAGGAATAATCCTTCTTGGC  200

seq1  TGAGAACACCGTGTATCGACATGCAAGCCACATTTGTTAATATGGAGATT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAACACCGTGTATCGACATGCAAGCCACATTTGTTAATATGGAGATT  250

seq1  ACAAAACGTTCACAACAGCTCTTGTCTTCCACAGGCCTCCACAGTACGGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACGTTCACAACAGCTCTTGTCTTCCACAGGCCTCCACAGTACGGA  300

seq1  GGGAGCCATTGGATAGATGCAAGCTCTTTGAAGCAGGATATAAAAACATG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCCATTGGATAGATGCAAGCTCTTTGAAGCAGGATATAAAAACATG  350

seq1  AAGGCAACAGTCAGGCATCCTAACATTTTATGGTGAACTGAAGAGACGTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAACAGTCAGGCATCCTAACATTTTATGGTGAACTGAAGAGACGTA  400

seq1  GGCTTGCACAGGCCGGTAAACATTTCAGAAGACATGCCGGTGCTTGACCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGCACAGGCCGGTAAACATTTCAGAAGACATGCCGGTGCTTGACCC  450

seq1  AAAACAAGGCAGCTCACAGGTGGACTGAAAAACAACACAAGCTCCCTTGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAGGCAGCTCACAGGTGGACTGAAAAACAACACAAGCTCCCTTGC  500

seq1  TTGCGAAGCTTGCGAAGGAGAGTGATGGAGATGGAGACGGACATAGCAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCGAAGCTTGCGAAGGAGAGTGATGGAGATGGAGACGGACATAGCAAA  550

seq1  GAGGATGAGGACCAAAGCATTTCATGTGGAACCTCTCCTGTTTTGGTTAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATGAGGACCAAAGCATTTCATGTGGAACCTCTCCTGTTTTGGTTAT  600

seq1  ACCTGAGAGAGGACAGGACTCCTGACTTCAACTGAAGACAACTAAGTGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGAGAGAGGACAGGACTCCTGACTTCAACTGAAGACAACTAAGTGTG  650

seq1  TCCTTGGGAAGAAGATAGCTGTCTGCTCTTTACAGCTTGGAACCAAACTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGGAAGAAGATAGCTGTCTGCTCTTTACAGCTTGGAACCAAACTG  700

seq1  CTTCCACAAGCCCGGCGTAAGGCTGCAAAGAGGACAAGAGAGGAGGAAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACAAGCCCGGCGTAAGGCTGCAAAGAGGACAAGAGAGGAGGAAAA  750

seq1  TATTGTAATAATGAAATGTCAGCAGATTAATAATTGTGAATGCTTCCTTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTAATAATGAAATGTCAGCAGATTAATAATTGTGAATGCTTCCTTA  800

seq1  GTTGGGTGAGCCCAATTCACTACCAGTGAGCAGGAATTC  838
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGTGAGCCCAATTCACTACCAGTGAGCAGGAATTC  839

seq1: chr3_84132379_84133292
seq2: B6Ng01-192L22.g_67_985

seq1  GAATTCTTGGCAGTGGGTGCTGGGCGGGGTCTGGGCTGAGTTCTGGCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGCAGTGGGTGCTGGGCGGGGTCTGGGCTGAGTTCTGGCCTC  50

seq1  AGTGAGTCCCATGAACTTCCTGGTGCCTATTCCATTCAGTGTCTGTGTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTCCCATGAACTTCCTGGTGCCTATTCCATTCAGTGTCTGTGTCC  100

seq1  AAATCCCCCAGGTGAGAACCCCAGGTGACTCCCGCTGCCTCAGAATAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCCCCAGGTGAGAACCCCAGGTGACTCCCGCTGCCTCAGAATAGGA  150

seq1  AAAGGTTCACGAGAGGGCAAACTCCATAGCTAGGAGAAACTTGAAGTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTTCACGAGAGGGCAAACTCCATAGCTAGGAGAAACTTGAAGTAAC  200

seq1  TTTGGAACTGATAAAATCAGGAACTTCAAAGACCTTTGGAGTGGTCTGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAACTGATAAAATCAGGAACTTCAAAGACCTTTGGAGTGGTCTGGA  250

seq1  GACTCTGATAGACAGTGGCCCTTCTTACCCCAGAGTCAGCATCTCTAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGATAGACAGTGGCCCTTCTTACCCCAGAGTCAGCATCTCTAGGT  300

seq1  CCAGCCGACTGTGGGTTAAAGGTATTTGAGATGCACACACACTCACGATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCGACTGTGGGTTAAAGGTATTTGAGATGCACACACACTCACGATG  350

seq1  ATCAGCCCTTGAACAGCACAACAGAGCCATATTTGCTTACCATTATGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCCCTTGAACAGCACAACAGAGCCATATTTGCTTACCATTATGTTG  400

seq1  AGCATTGTAAGTGACTCAGCGCTAGCATTAAAGTACATGAGAGTATTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTGTAAGTGACTCAGCGCTAGCATTAAAGTACATGAGAGTATTGCA  450

seq1  TAGGTTTTATGCAAATATATACAGTTATATACATGACTGAACATTTGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTTTATGCAAATATATACAGTTATATACATGACTGAACATTTGTGG  500

seq1  GTTTGGGTATCAGAGTAGTTGCAGGAATTCAGGCTCCATAGACACTGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGTATCAGAGTAGTTGCAGGAATTCAGGCTCCATAGACACTGAAG  550

seq1  GGCACCTGCATTCCTTAGAAGGAACATAGACCTCTGACTCGGCACTTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTGCATTCCTTAGAAGGAACATAGACCTCTGACTCGGCACTTCCT  600

seq1  GTTGTAGGAGTTCATCTCTGGAAACCTTCCCTAGGAGGATGCTACATGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTAGGAGTTCATCTCTGGAAACCTTCCCTAGGAGGATGCTACATGGT  650

seq1  GGCCTTGGGTAAAGCTACATGATCGCCTATGACAAATAGAAATGGTGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTGGGTAAAGCTACATGATCGCCTATGACAAATAGAAATGGTGATA  700

seq1  GGCGCACCATTCTGAAGCCTGAGAGAGGGAGTTTTGGCGTTGAGGGGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGCACCATTCTGAAGCCTGAGAGAGGGAGTTTTGGCGTTGAGGGGTGG  750

seq1  GGATGAAGGCTAACATTAAGGAAATG-TTGAGTTTGAGATGTTTCTGGAG  799
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGAAGGCTAACATTAAGGAAATGTTTGAGTTTGAGATGTTTCTGGAG  800

seq1  CACCCAGTGAGGGT-CCCAAACCC-TTATGTGGATGGATGGTTTGCAAGT  847
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAGTGAGGGTCCCCAAACCCTTTATGTGGATGGATGGTTTGCAAGT  850

seq1  TGGGAGGGCAGAGACACCCAGC-TGCTGAAGGAGTGAATTAGCAAGTCCT  896
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGGCAGAAACACCCAGCTTGCTGAAGGAGTGAATTAGCAAGTCCT  900

seq1  -CTGCAAGTGCA-CGGCCTT  914
       |||| |||||| ||||| |
seq2  CCTGC-AGTGCACCGGCCCT  919