BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203B11
Chromosome3 (Build37)
Map Location 151,577,880 - 151,765,045
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040741, LOC100040597, LOC676548, Gipc2
Upstream geneEltd1, Ifi44, H28, Ptgfr
Downstream geneDnajb4, Fubp1, Nexn, C030011O14Rik, Usp33, Zzz3, Ak5, LOC100040705, Pigk, Rpl29-ps1, St6galnac5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203B11.bB6Ng01-203B11.g
ACCGA023405GA023406
length9831,015
definitionB6Ng01-203B11.b B6Ng01-203B11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,764,059 - 151,765,045)(151,577,880 - 151,578,892)
sequence
gaattcatgaacagttggcttggcactaggatttctgggtgtttcctagg
taattttttaatgttactattaacatgacaaggtcttgattcattaacta
aggtttgtgcttgctaccctaccggtagcaaatattgcaaaacaaaacta
aagcaaaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaaacaattccaactatattt
aaggtgggaaaaaaataagagaaatttgtggtttttataactaaaacatc
cagaggtggatcttgtcttcaaaaatggctggctctggagctggagagct
ggctcggaagttaaggtcacttttcctgctcctgtagatgatctgagttc
agctcccagcactcactcacacggcagcccataaacatttgtagcttcag
ttccaggggctctgacgccctcttctggcccccgtgagcactgcacacac
acgctgcacatacgtatactcatacataaaacaaatagaacactagatgg
gtaactccagagatagtatggatgatacggtgcctgagcagctgcctcca
tgtgatgagaagagttggggtaacaaagaacaaactctgctccgaggagg
aaggatgggaaaagccatcaagggagcgatgggagagctgaacaaaaggg
ggactcagaaaggagactcagcacaaagaagccaacagagcgaagcttgt
actgtgtggtccctgctagtgggatgaggggagcggaagcctcacatcag
aggtaagtcaagaagtactggaaacgcgtcctgctcttgcgagcccagac
acaactggggttttgaagagacagcgattcttcaggcatggtacatcgac
actttaacaggacgtccactgtgtcgctctccatgtctcacgcggctgtg
gctgggcatcttgctctgagaggtgactgctcaaattgatcccctctgcc
tgatcctgtctgttgcatgtagttcaaccactc
gaattctcagggaatctggaggctcttaaacctctccatcaggatgcttg
ggcacaccacgggtgggcgtacctagactttccgtggtggctggctctaa
gaggagaagctctaagagacaagaaaaggaaaagcagtctatgaagaaca
ggcctagaaatggctctagcattgctctacagtccattggtagatcctgc
cttccgtggggaccacggcttcagcttgttggaattgtacgataacgagc
atcccatgctgctatgtggttggttgtaaggatgtcgggatagagagaaa
ggctgggaaaaatccctcttaggtcagtttctcagaagtcatcagtgaac
aagtcgttcctttgtcccttgttctttattgctggctttcctctttggct
tatgtggaaatccactgttatttccctcctacttatgagactgtgttcat
tgctccatttacttagcttacatcattagctgaatggtcctcacttcttt
tctcttttcctgtctgtttctctgtggcttatgtaagttacatctgtggt
aagttgtttttggataacaaggttgattcttaaaggacatacgggaaggg
aaattatcaacttaaaacactttatcacttatgcatactattatatcttt
ctgtaaatagcaatagcttgacttcttcttttccaatttatatgccctga
cctcctttagttgtcttattgctctagctagaaatttaagtactataatg
gatagaatatggaaagagtggataactttatcttgtccttgatttccgtg
gagatgttttacatttctctccatttaaattgaatgttggttattggctt
gctgtatgtgcccgtctaatgtgtagcatgcgcccttgtatccctgacct
ctccaggactttttaatctgaagaagtgcaggatttagtcaaaggaattc
tcagcaactaatgagatgatcatgtggctttttgtctttcaatttgtttg
tatgttgcgttatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_151764059_151765045
seq2: B6Ng01-203B11.b_41_1023 (reverse)

seq1  GAGTGGTAGAAACTACATGCTACAGACAGGAATCAGGCAGAGGGGCTCAA  50
      ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  GAGTGGTTG-AACTACATGCAACAGACAGG-ATCAGGCAGAGGGGATCAA  48

seq1  TTTTGAGCAGTCACCTCTCAGAGCAAGGATGCCCAGCCACAGCCCTGTGA  100
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||
seq2  -TTTGAGCAGTCACCTCTCAGAGCAA-GATGCCCAGCCACAGCCGCGTGA  96

seq1  GACATGGAGAGCGACACAGTGGACCTCCTGTTCAAGTGTCGATGTACCAT  150
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  GACATGGAGAGCGACACAGTGGACGTCCTGTTAAAGTGTCGATGTACCAT  146

seq1  GCCTGAAGAATCGCTGTCTCCTCAAAACCCCAGTTGTGTCTGGGCTTGCA  200
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GCCTGAAGAATCGCTGTCTCTTCAAAACCCCAGTTGTGTCTGGGCTCGCA  196

seq1  AGAGCAGGACGCGTTTCCAGTACTTCTTGACTTACCTCTGATGTGAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGGACGCGTTTCCAGTACTTCTTGACTTACCTCTGATGTGAGGCT  246

seq1  TCCGCTCCCCTCATCCCACTAGCAGGGACCACACAGTCCAAGCTTCGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCCGCTCCCCTCATCCCACTAGCAGGGACCACACAGTACAAGCTTCGCTC  296

seq1  TGTTGGCTTCTTTGTGCTGAGTCTCCTTTCTGAGTCCCCCTTTTGTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGCTTCTTTGTGCTGAGTCTCCTTTCTGAGTCCCCCTTTTGTTCAG  346

seq1  CTCTCCCATCGCTCCCTTGATGGCTTTTCCCATCCTTCCTCCTCGGAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCATCGCTCCCTTGATGGCTTTTCCCATCCTTCCTCCTCGGAGCA  396

seq1  GAGTTTGTTCTTTGTTACCCCAACTCTTCTCATCACATGGAGGCAGCTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTGTTCTTTGTTACCCCAACTCTTCTCATCACATGGAGGCAGCTGC  446

seq1  TCAGGCACCGTATCATCCATACTATCTCTGGAGTTACCCATCTAGTGTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCACCGTATCATCCATACTATCTCTGGAGTTACCCATCTAGTGTTC  496

seq1  TATTTGTTTTATGTATGAGTATATGTATGTGCAGCGTGTGTGTGCAGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTTTTATGTATGAGTATACGTATGTGCAGCGTGTGTGTGCAGTGC  546

seq1  TCACGGGGGCCAGAAGAGGGCGTCAGAGCCCCTGGAACTGAAGCTACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGGGGGCCAGAAGAGGGCGTCAGAGCCCCTGGAACTGAAGCTACAAA  596

seq1  TGTTTATGGGCTGCCGTGTGAGTGAGTGCTGGGAGCTGAACTCAGATCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATGGGCTGCCGTGTGAGTGAGTGCTGGGAGCTGAACTCAGATCAT  646

seq1  CTACAGGAGCAGGAAAAGTGACCTTAACTTCCGAGCCAGCTCTCCAGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGAGCAGGAAAAGTGACCTTAACTTCCGAGCCAGCTCTCCAGCTC  696

seq1  CAGAGCCAGCCATTTTTGAAGACAAGATCCACCTCTGGATGTTTTAGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCCAGCCATTTTTGAAGACAAGATCCACCTCTGGATGTTTTAGTTA  746

seq1  TAAAAACCACAAATTTCTCTTATTTTTTTCCCACCTTAAATATAGTTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACCACAAATTTCTCTTATTTTTTTCCCACCTTAAATATAGTTGGA  796

seq1  ATTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGCTTTAGTTTTGTTTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGCTTTAGTTTTGTTTTG  846

seq1  CAATATTTGCTACCGGTAGGGTAGCAAGCACAAACCTTAGTTAATGAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATTTGCTACCGGTAGGGTAGCAAGCACAAACCTTAGTTAATGAATC  896

seq1  AAGACCTTGTCATGTTAATAGTAACATTAAAAAATTACCTAGGAAACACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCTTGTCATGTTAATAGTAACATTAAAAAATTACCTAGGAAACACC  946

seq1  CAGAAATCCTAGTGCCAAGCCAACTGTTCATGAATTC  987
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAATCCTAGTGCCAAGCCAACTGTTCATGAATTC  983

seq1: chr3_151577880_151578892
seq2: B6Ng01-203B11.g_64_1078

seq1  GAATTCTCAGGGAATCTGGAGGCTCTTAGACCTCTCCATCAGGATGCTTG  50
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGGAATCTGGAGGCTCTTAAACCTCTCCATCAGGATGCTTG  50

seq1  GGCACACCACGGGTGGGCGTACCTAGACTTTCCGTGGTGGCTGGCTCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACACCACGGGTGGGCGTACCTAGACTTTCCGTGGTGGCTGGCTCTAA  100

seq1  GAGGAGAAGCTCTAAGAGACAAGAAAAGGAAAAGCAGTCTATGAAGAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGAAGCTCTAAGAGACAAGAAAAGGAAAAGCAGTCTATGAAGAACA  150

seq1  GGCCTAGAAATGGCTCTAGCATTGCTCTACAGTCCATTGGTAGATCCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTAGAAATGGCTCTAGCATTGCTCTACAGTCCATTGGTAGATCCTGC  200

seq1  CTTCCGTGGGGACCACGGCTTCAGCTTGTTGGAATTGTACGATAACGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCGTGGGGACCACGGCTTCAGCTTGTTGGAATTGTACGATAACGAGC  250

seq1  ATCCCATGCTGCTATGTGGTTGGTTGTAAGGATGTCGGGATAGAGAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCATGCTGCTATGTGGTTGGTTGTAAGGATGTCGGGATAGAGAGAAA  300

seq1  GGCTGGGAAAAATCCCTCTTAGGTCAGTTTCTCAGAAGTCATCAGTGAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGGAAAAATCCCTCTTAGGTCAGTTTCTCAGAAGTCATCAGTGAAC  350

seq1  AAGTCGTTCCTTTGTCCCTTGTTCTTTATTGCTGGCTTTCCTCTTTGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCGTTCCTTTGTCCCTTGTTCTTTATTGCTGGCTTTCCTCTTTGGCT  400

seq1  TATGTGGAAATCCACTGTTATTTCCCTCCTACTTATGAGACTGTGTTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGAAATCCACTGTTATTTCCCTCCTACTTATGAGACTGTGTTCAT  450

seq1  TGCTCCATTTACTTAGCTTACATCATTAGCTGAATGGTCCTCACTTCTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCATTTACTTAGCTTACATCATTAGCTGAATGGTCCTCACTTCTTT  500

seq1  TCTCTTTTCCTGTCTGTTTCTCTGTGGCTTATGTAAGTTACATCTGTGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTTCCTGTCTGTTTCTCTGTGGCTTATGTAAGTTACATCTGTGGT  550

seq1  AAGTTGTTTTTGGATAACAAGGTTGATTCTTAAAGGACATACGGGAAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTTTTTGGATAACAAGGTTGATTCTTAAAGGACATACGGGAAGGG  600

seq1  AAATTATCAACTTAAAACACTTTATCACTTATGCATACTATTATATCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATCAACTTAAAACACTTTATCACTTATGCATACTATTATATCTTT  650

seq1  CTGTAAATAGCAATAGCTTGACTTCTTCTTTTCCAATTTATATGCCCTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAATAGCAATAGCTTGACTTCTTCTTTTCCAATTTATATGCCCTGA  700

seq1  CCTCCTTTAGTTGTCTTATTGCTCTAGCTAGAAATTTAAGTACTATAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTTAGTTGTCTTATTGCTCTAGCTAGAAATTTAAGTACTATAATG  750

seq1  GATAGAATATGGAAAGAGTGGATAACTTTATCTTGTCCTTGATTTTCGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GATAGAATATGGAAAGAGTGGATAACTTTATCTTGTCCTTGATTTCCGTG  800

seq1  GAGATGTTTTACATTTCTCTCCATTTAATTTG-ATGTTGGTTATTGGCTT  849
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
seq2  GAGATGTTTTACATTTCTCTCCATTTAAATTGAATGTTGGTTATTGGCTT  850

seq1  GCTGTATGTTGCCTGTCTTATGTGTAGTATGCG-CCTTGTATCCCTGACC  898
      |||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  GCTGTATG-TGCCCGTCTAATGTGTAGCATGCGCCCTTGTATCCCTGACC  899

seq1  TCTCCAGGACTTTTAAATATGAAGAAGTGTAGGATTTTGTCAAAGGCATT  948
      |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||
seq2  TCTCCAGGACTTTTTAATCTGAAGAAGTGCAGGATTTAGTCAAAGGAATT  949

seq1  CTCAGCATCTAATGAGATGATCATGTGG-TTTTTTTCTTTCAGTTTGTTT  997
      ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||
seq2  CTCAGCAACTAATGAGATGATCATGTGGCTTTTTGTCTTTCAATTTGTTT  999

seq1  GTATGTTGGGTTATGT  1013
      |||||||| |||||||
seq2  GTATGTTGCGTTATGT  1015