BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213L24
Chromosome3 (Build37)
Map Location 130,124,645 - 130,241,081
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCol25a1
Upstream geneLOC435755, LOC668840, Elovl6, LOC100043758, Egf, Gm421, Rrh, Nola1, Cfi, Pla2g12a, Casp6, Ccdc109b, Sec24b, EG668844, EG668845
Downstream geneAgxt2l1, 2310008M10Rik, Rpl34, LOC546811, LOC545568, Lef1, 6720418B01Rik, Hadh, Cyp2u1, Sgms2, LOC100043443, Papss1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213L24.bB6Ng01-213L24.g
ACCGA031186GA031187
length1,0361,104
definitionB6Ng01-213L24.b B6Ng01-213L24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,124,645 - 130,125,667)(130,239,974 - 130,241,081)
sequence
gaattcctcctttctccatatcttctctcttgccttttttgatccatcct
aacaggtggagacatgaagtcttactgtaatttcgtttgctgattctcac
cccgattccctttctagttactcttcttgtcccaggctcccctctctttc
ttcctcccgggtattgtcaaaggcaggactacaaccgttaactccaagtg
ggatggttaaatgtgtagctcacagtatagattttagatttctcctgcat
ctgttccagcatccccattgccgttcttcacactggtgctgtggggaggg
aagtcagcaggatgactgactgtgctgtggtgtggggagtcagcagggtg
aacgcttggctttcccctgacaggcagaagcagtgatgattagattgaga
gaaatcaacaggtatcctatcacctatgttgaccagataaaatttcctac
catggctttgtcaatgtccctttcctgatgccaaccctctgagtcttgat
tgtgttgtcagtctagagtctgacaaaatcccctaatttggcttcttgtc
tcacctttcattagctttcattaatgttctccataaactctatgctttat
caaaaccaaagtgaaacttttatattgtctcttctatgatttttttttct
tttccttggggctccttcctcttaaacctcttgtctacatattcaaacat
aatcatctgtcacattgtagtactgtttcttcaggaagataattttcttc
tgtactaaaggcttttttttttcttccttttccagatttccatggaaagt
tagctatgtagctttgttatattgcattatactttgaaagagaacatggg
gggcttctaaatcaaagcaattgcaagtcttgatccaggttgtctagcct
tttagcctctgccttcctggaatgagtgactctttcactcttgggtagca
atgtcctttctttagacattgttgttaaaggtccaagtattgtgtattaa
atgatacctgaacattggtacggactaggaaaaaat
gaattccaaatgccttccacatggtgagaggactttcaaataactgcagg
aagctcacgagcagttggagatgaagtcatgcctggtcttagtgacttcc
cttatgtatgcctgcagtattagcacctttctcagagcgggacactgagg
tgatatcgagatgagtctggtgcctctacttaggccttggttcctgtccc
tgagagctgcagcaggcatgtgggggctcattaagtttccagctaattcc
cagagagcaacaggtgttgaaccaaagctctcctggtatgtaatggatgg
cttccttagtgtcttagacgcaacagatggcatatgcatgtcctctctgg
tagtggcagtcatggaggacatggcgggaaatatttccaaagcataaaag
gaacacatgggcctaagatcgagactgatgttttagttaccacacgtcct
atagtcacatgtaagggttttaattttaaatcctgttaacttaaactatg
aaatgagaatgaactgttttgtgtggttcaccaccatagcagaacgatga
aagttcaactagtaaggagcgtcccaagttaatggagtgacatcacaaaa
actttaagtctcctttgatgaacaacgtaccgtgaatactgactacctta
atgtgctcttacattgtcttttcctctaaagctatttgctcacatttagc
gcttgctacattataatgaaatcttatctttcatttgaactacagcgaga
agataaatcttgttaagccaaaaaatagagctaaggactgatctcaaaca
gtagaccatggcccaagtgtggccttcccattacacaaagagacatctct
agagaatactagcttttgtcaactgacaggctcactgccagagcagtcac
ttgtcagggacagggagggcagtgtctgtcagagccacaccaccttgaac
aaaggatttccagcactttctcagctggtgggaactcaagcccttactgg
aggtggcaagttacaatgaaaccctcccatccttgagagtcatgactttc
tattaaagggtcatggggtgactagggacatcagagtcagtgtagaccat
tgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_130124645_130125667
seq2: B6Ng01-213L24.b_46_1081

seq1  GAATTCCTCCTTTCTCCATATCTTCTCTCTTGCCTTTTTTGATCCATCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTTTCTCCATATCTTCTCTCTTGCCTTTTTTGATCCATCCT  50

seq1  AACAGGTGGAGACATGAAGTCTTACTGTAATTTCGTTTGCTGATTCTCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTGGAGACATGAAGTCTTACTGTAATTTCGTTTGCTGATTCTCAC  100

seq1  CCCGATTCCCTTTCTAGTTACTCTTCTTGTCCCAGGCTCCCCTCTCTTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGATTCCCTTTCTAGTTACTCTTCTTGTCCCAGGCTCCCCTCTCTTTC  150

seq1  TTCCTCCCGGGTATTGTCAAAGGCAGGACTACAACCGTTAACTCCAAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCCGGGTATTGTCAAAGGCAGGACTACAACCGTTAACTCCAAGTG  200

seq1  GGATGGTTAAATGTGTAGCTCACAGTATAGATTTTAGATTTCTCCTGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGTTAAATGTGTAGCTCACAGTATAGATTTTAGATTTCTCCTGCAT  250

seq1  CTGTTCCAGCATCCCCATTGCCGTTCTTCACACTGGTGCTGTGGGGAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCAGCATCCCCATTGCCGTTCTTCACACTGGTGCTGTGGGGAGGG  300

seq1  AAGTCAGCAGGATGACTGACTGTGCTGTGGTGTGGGGAGTCAGCAGGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGCAGGATGACTGACTGTGCTGTGGTGTGGGGAGTCAGCAGGGTG  350

seq1  AACGCTTGGCTTTCCCCTGACAGGCAGAAGCAGTGATGATTAGATTGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGCTTGGCTTTCCCCTGACAGGCAGAAGCAGTGATGATTAGATTGAGA  400

seq1  GAAATCAACAGGTATCCTATCACCTATGTTGACCAGATAAAATTTCCTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAACAGGTATCCTATCACCTATGTTGACCAGATAAAATTTCCTAC  450

seq1  CATGGCTTTGTCAATGTCCCTTTCCTGATGCCAACCCTCTGAGTCTTGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTTTGTCAATGTCCCTTTCCTGATGCCAACCCTCTGAGTCTTGAT  500

seq1  TGTGTTGTCAGTCTAGAGTCTGACAAAATCCCCTAATTTGGCTTCTTGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGTCAGTCTAGAGTCTGACAAAATCCCCTAATTTGGCTTCTTGTC  550

seq1  TCACCTTTCATTAGCTTTCATTAATGTTCTCCATAAACTCTATGCTTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTTCATTAGCTTTCATTAATGTTCTCCATAAACTCTATGCTTTAT  600

seq1  CAAAACCAAAGTGAAACTTTTATATTGTCTCTTCTATGATTTTTTTTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACCAAAGTGAAACTTTTATATTGTCTCTTCTATGATTTTTTTTTCT  650

seq1  TTTCCTTGGGGCTCCTTCCTCTTAAACCTCTTGTCTACATATTCAAACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTGGGGCTCCTTCCTCTTAAACCTCTTGTCTACATATTCAAACAT  700

seq1  AATCATCTGTCACATTGTAGTACTGTTTCTTCAGGAAGATAATTTTCTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATCTGTCACATTGTAGTACTGTTTCTTCAGGAAGATAATTTTCTTC  750

seq1  TGTACTAAAGGC-TTTTTTTTTCTTCCTTTTCCAGATTTCCATGGAAAGT  799
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTAAAGGCTTTTTTTTTTCTTCCTTTTCCAGATTTCCATGGAAAGT  800

seq1  TAGCTATGTAGC-TTGTTATATTGCATTATAC-TTGAAAGAGAACAT-GG  846
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  TAGCTATGTAGCTTTGTTATATTGCATTATACTTTGAAAGAGAACATGGG  850

seq1  GGGCTTCT-AATCAAAGCAATTGCAAGTC-TGATCCAGGTTGTCTAG-CT  893
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  GGGCTTCTAAATCAAAGCAATTGCAAGTCTTGATCCAGGTTGTCTAGCCT  900

seq1  TTTAGCCTCTGCC-TCCTGG-ATGAGTGACTCTTTCACTC-TGGGTAGCA  940
      ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTAGCCTCTGCCTTCCTGGAATGAGTGACTCTTTCACTCTTGGGTAGCA  950

seq1  ATGTCCTTTCTTAAGACA-TGTTGTTAAA-GTTCAAGTATTGTGTATAAA  988
      |||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||
seq2  ATGTCCTTTCTTTAGACATTGTTGTTAAAGGTCCAAGTATTGTGTATTAA  1000

seq1  ATGATACCTGAACA-TGGTAAGGACTAGGAAAAAAT  1023
      |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  ATGATACCTGAACATTGGTACGGACTAGGAAAAAAT  1036

seq1: chr3_130239974_130241081
seq2: B6Ng01-213L24.g_66_1169 (reverse)

seq1  TTCAATGTTAAATGTCTACACTGACTCTTGGCCTGTCCCTAGTCA-CCCA  49
      |||||||      |||||||||||||||     |||||||||||| ||||
seq2  TTCAATG------GTCTACACTGACTCT---GATGTCCCTAGTCACCCCA  41

seq1  TGGACCTTT-ATAGAAGGTCATGGACTCTCAA-GATGGGAGGG-TTCATT  96
      ||  ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  TGACCCTTTAATAGAAAGTCAT-GACTCTCAAGGATGGGAGGGTTTCATT  90

seq1  GTAACTTGCCACCTCCAGTAAGGGCTTGAGTTCCCACAGCCTGAGAAAGT  146
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||
seq2  GTAACTTGCCACCTCCAGTAAGGGCTTGAGTTCCCACCAGCTGAGAAAGT  140

seq1  GCTGGAAATCCTTTG-TCAAGGTGGTGTGGCTCTGACAGACACTGCCCT-  194
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTGGAAATCCTTTGTTCAAGGTGGTGTGGCTCTGACAGACACTGCCCTC  190

seq1  CCTGTCCCTGACAAGTGACTGCTCTGGCAGTGAGCCTGTCAGTTGACAAA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCCTGACAAGTGACTGCTCTGGCAGTGAGCCTGTCAGTTGACAAA  240

seq1  AGCTAGTATTCTCTAGAGATGTCTCTTTGTGTAATGGGAAGGCCACACTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGTATTCTCTAGAGATGTCTCTTTGTGTAATGGGAAGGCCACACTT  290

seq1  GGGCCATGGTCTACTGTTTGAGATCAGTCCTTAGCTCTATTTTTTGGCTT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATGGTCTACTGTTTGAGATCAGTCCTTAGCTCTATTTTTTGGCTT  340

seq1  AACAAGATTTATCTTCTCGCTGTAGTTCAAATGAAAGATAAGATTTCATT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGATTTATCTTCTCGCTGTAGTTCAAATGAAAGATAAGATTTCATT  390

seq1  ATAATGTAGCAAGCGCTAAATGTGAGCAAATAGCTTTAGAGGAAAAGACA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTAGCAAGCGCTAAATGTGAGCAAATAGCTTTAGAGGAAAAGACA  440

seq1  ATGTAAGAGCACATTAAGGTAGTCAGTATTCACGGTACGTTGTTCATCAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAGAGCACATTAAGGTAGTCAGTATTCACGGTACGTTGTTCATCAA  490

seq1  AGGAGACTTAAAGTTTTTGTGATGTCACTCCATTAACTTGGGACGCTCCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGACTTAAAGTTTTTGTGATGTCACTCCATTAACTTGGGACGCTCCT  540

seq1  TACTAGTTGAACTTTCATCGTTCTGCTATGGTGGTGAACCACACAAAACA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAGTTGAACTTTCATCGTTCTGCTATGGTGGTGAACCACACAAAACA  590

seq1  GTTCATTCTCATTTCATAGTTTAAGTTAACAGGATTTAAAATTAAAACCC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATTCTCATTTCATAGTTTAAGTTAACAGGATTTAAAATTAAAACCC  640

seq1  TTACATGTGACTATAGGACGTGTGGTAACTAAAACATCAGTCTCGATCTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGTGACTATAGGACGTGTGGTAACTAAAACATCAGTCTCGATCTT  690

seq1  AGGCCCATGTGTTCCTTTTATGCTTTGGAAATATTTCCCGCCATGTCCTC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCATGTGTTCCTTTTATGCTTTGGAAATATTTCCCGCCATGTCCTC  740

seq1  CATGACTGCCACTACCAGAGAGGACATGCATATGCCATCTGTTGCGTCTA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACTGCCACTACCAGAGAGGACATGCATATGCCATCTGTTGCGTCTA  790

seq1  AGACACTAAGGAAGCCATCCATTACATACCAGGAGAGCTTTGGTTCAACA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTAAGGAAGCCATCCATTACATACCAGGAGAGCTTTGGTTCAACA  840

seq1  CCTGTTGCTCTCTGGGAATTAGCTGGAAACTTAATGAGCCCCCACATGCC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTGCTCTCTGGGAATTAGCTGGAAACTTAATGAGCCCCCACATGCC  890

seq1  TGCTGCAGCTCTCAGGGACAGGAACCAAGGCCTAAGTAGAGGCACCAGAC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCAGCTCTCAGGGACAGGAACCAAGGCCTAAGTAGAGGCACCAGAC  940

seq1  TCATCTCGATATCACCTCAGTGTCCCGCTCTGAGAAAGGTGCTAATACTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCGATATCACCTCAGTGTCCCGCTCTGAGAAAGGTGCTAATACTG  990

seq1  CAGGCATACATAAGGGAAGTCACTAAGACCAGGCATGACTTCATCTCCAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCATACATAAGGGAAGTCACTAAGACCAGGCATGACTTCATCTCCAA  1040

seq1  CTGCTCGTGAGCTTCCTGCAGTTATTTGAAAGTCCTCTCACCATGTGGAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCGTGAGCTTCCTGCAGTTATTTGAAAGTCCTCTCACCATGTGGAA  1090

seq1  GGCATTTGGAATTC  1108
      ||||||||||||||
seq2  GGCATTTGGAATTC  1104