BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-218B22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 111,775,881 - 111,904,422
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC625585
Upstream geneLOC100043190, LOC668712
Downstream geneEG229746, LOC668717, Utp14B-ps, EG433643
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-218B22.bB6Ng01-218B22.g
ACCGA034333GA034334
length1,175985
definitionB6Ng01-218B22.b B6Ng01-218B22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(111,775,881 - 111,776,770)(111,903,419 - 111,904,422)
sequence
gaattctcaactgaggaaattagaatggccaagaaacatctgaataaatg
ttgaacatacttagtcatcagggaaatgcaaatcaaaacaacactgagat
tccatctcacaccagttaagataaaaaactcaggtgacaacgcatgttgg
cgaggatgtggagaaagagtaacacttttccattgctggtgggattgctg
gtgggattgcaagctgaatcaaacactctggaaatctgtctggtggtttc
tcagaaaattggacatagtactacctgaggacccagctatacgattcctg
ggcatatagccaaaagattcttcaacatataactaggacacatgctctac
tacgttaatagctatatttatgatagccagaagctgtaaagaatccagat
gtccttcaacagagggatggatacagaaaatgggatatatttacacaatg
aaactcagctattaaaaacaaaaacttcatgaaattcaatgaaatttgca
agcaaatggatggaacttgagcatatcatcctgagtggatgatatgaggt
aactcagacaaaaaagaacacaaacagcatatactcactaagaagtggat
gttaacccataagtttggaatatccaagattcaattcacagaccatatga
agctgaaaaaggaagaccacaatgtggatgcttcagtgcttcttagaagg
gaaaaccaaatattcactggaggaaatatggagacaaagtatggagaaga
gactgaaggaaaggccatccagagattgcccaatatatatcaataagtaa
tattaagattattgctccacattctacattatgtttgggagactagattc
agtctttagaataataaaatattagatttatttaaaatgttacttgcaca
tatattttttattaataattttattcatttacattttaaatgttatctcc
cttcttaattacccctttacaaacccccaatcccattcccactctttctc
ccctttgcctctatgagtgtactaactcacccactcatgcacccccaact
cactgctctagcatctctctaagctgaagcatcatgcctccacagcacag
acttctcctcccaattgatgtcagaaataagtcaatgcattgctacatat
gtgtttactgtagcaatggcctctt
gaattccctgattattaagttatataagatgttatctttactagaagtag
tatggatttatgcttttatacctacaggggttttatttcacatgcaaata
cattggtttatttctcaaagtgttattacattctctgggtatgtaaatga
attcactattgtagattttagtaataccctttacattcttttttgtttgt
gcagataattactgtcactgaaacacatgaactataagccacttacagtc
tacttgagtcattgaatatctaaaataatttaaagtgtaaggtgagtgaa
aatcctagatgatttcttctttctttcttcttttttttttcctctcctat
tcaacttcactttcagtctaaagagtggaaaagttactttcactgtaaag
aaaattccatgctgtacatttggcttttagtgcatcctaatcctcaatac
caattagcacattttatgactctatttggatgctatccaagtttatatct
atgctactacccttcataattactttatttaaagaggctgcctcagccct
tgctgcttggaggtggtctgttatcaacttctggaattgctacatatatt
aaacagatgtctctgctacagagttttaattagttgcagagtatttgtaa
ttttcttcatatttacaaggatcatagtcatctattgccagatctccagg
tcaccactaaaatcacacaaaatacaccccagggaaggtactctctaagg
ccaaacatatgtcctagcagtctctccgtttaacaacttagtaatggaag
caaaaataaacaaccaatgagaggaagagggataggaatgaagaagaaag
aaaaaatataaaaaactaaagaaaagatttcttctctcttccaagtcctc
acttgggcacttcagcttgtagacctctttgagttctatggactgtatct
tgggtattctgtgttgttgttgttgttgttgttgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_111775881_111776770
seq2: B6Ng01-218B22.b_327_1217

seq1  AGCTATACGATTCCTGGGCATATAGCCAAAAGATTCTTCAACATATAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATACGATTCCTGGGCATATAGCCAAAAGATTCTTCAACATATAACT  50

seq1  AGGACACATGCTCTACTACGTTAATAGCTATATTTATGATAGCCAGAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACATGCTCTACTACGTTAATAGCTATATTTATGATAGCCAGAAGC  100

seq1  TGTAAAGAATCCAGATGTCCTTCAACAGAGGGATGGATACAGAAAATGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAGAATCCAGATGTCCTTCAACAGAGGGATGGATACAGAAAATGGG  150

seq1  ATATATTTACACAATGAAACTCAGCTATTAAAAACAAAAACTTCATGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTTACACAATGAAACTCAGCTATTAAAAACAAAAACTTCATGAAA  200

seq1  TTCAATGAAATTTGCAAGCAAATGGATGGAACTTGAGCATATCATCCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGAAATTTGCAAGCAAATGGATGGAACTTGAGCATATCATCCTGA  250

seq1  GTGGATGATATGAGGTAACTCAGACAAAAAAGAACACAAACAGCATATAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATGATATGAGGTAACTCAGACAAAAAAGAACACAAACAGCATATAC  300

seq1  TCACTAAGAAGTGGATGTTAACCCATAAGTTTGGAATATCCAAGATTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAAGAAGTGGATGTTAACCCATAAGTTTGGAATATCCAAGATTCAA  350

seq1  TTCACAGACCATATGAAGCTGAAAAAGGAAGACCACAATGTGGATGCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGACCATATGAAGCTGAAAAAGGAAGACCACAATGTGGATGCTTC  400

seq1  AGTGCTTCTTAGAAGGGAAAACCAAATATTCACTGGAGGAAATATGGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTTCTTAGAAGGGAAAACCAAATATTCACTGGAGGAAATATGGAGA  450

seq1  CAAAGTATGGAGAAGAGACTGAAGGAAAGGCCATCCAGAGATTGCCCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTATGGAGAAGAGACTGAAGGAAAGGCCATCCAGAGATTGCCCAAT  500

seq1  ATATATCAATAAGTAATATTAAGATTATTGCTCCACATTCTACATTATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATCAATAAGTAATATTAAGATTATTGCTCCACATTCTACATTATGT  550

seq1  TTGGGAGACTAGATTCAGTCTTTAGAATAATAAAATATTAGATTTATTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAGACTAGATTCAGTCTTTAGAATAATAAAATATTAGATTTATTTA  600

seq1  AAATGTTACTTGCACATATATTTTTTATTAATAATTTTATTCATTTACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTTACTTGCACATATATTTTTTATTAATAATTTTATTCATTTACAT  650

seq1  TTTAAATGTTATCTCCCTTCTTAATTACCCCTTTACAAACCCCCAATCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATGTTATCTCCCTTCTTAATTACCCCTTTACAAACCCCCAATCCC  700

seq1  ATTCCCACTCTTTTCCTCCCCTTTGCCTCTATGAGTGTACTACTCCACCC  750
      |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  ATTCCCACTCTTT--CTCCCCTTTGCCTCTATGAGTGTACTAACTCACCC  748

seq1  ACTCATGCACCCCCACCTCACTGCTCTAGCATCTCTCTAAGCTGAGGCAT  800
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACTCATGCACCCCCAACTCACTGCTCTAGCATCTCTCTAAGCTGAAGCAT  798

seq1  CATGCCTCCACAGCACCAAGGCCTTCTCCTCCC-ATTGATGTCAG--ATA  847
      ||||||||||||||||    | ||||||||||| |||||||||||  |||
seq2  CATGCCTCCACAGCAC---AGACTTCTCCTCCCAATTGATGTCAGAAATA  845

seq1  AGTCCATCCTTTGCTACATATG---TTTCTGTAGCCATGGCTTCTT  890
      |||| || | ||||||||||||   || ||||||| ||||| ||||
seq2  AGTCAATGCATTGCTACATATGTGTTTACTGTAGCAATGGCCTCTT  891

seq1: chr3_111903419_111904422
seq2: B6Ng01-218B22.g_63_1047 (reverse)

seq1  ACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAGAATA  50
                        ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ------------------ACAACAACAACAACAACAACAAC-ACAGAATA  31

seq1  CCCAAGATACAGTCCATAGAACTCAAAGAGGTCTACAAGCTGAAGTGCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGATACAGTCCATAGAACTCAAAGAGGTCTACAAGCTGAAGTGCCC  81

seq1  AAGTGAGGACTTGGAAGAGAGAAGAAATCTTTTCTTTAGTTTTTTATATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAGGACTTGGAAGAGAGAAGAAATCTTTTCTTTAGTTTTTTATATT  131

seq1  TTTTCTTTCTTCTTCATTCCTATCCCTCTTCCTCTCATTGGTTGTTTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTCTTCTTCATTCCTATCCCTCTTCCTCTCATTGGTTGTTTATT  181

seq1  TTTGCTTCCATTACTAAGTTGTTAAACGGAGAGACTGCTAGGACATATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTCCATTACTAAGTTGTTAAACGGAGAGACTGCTAGGACATATGT  231

seq1  TTGGCCTTAGAGAGTACCTTCCCTGGGGTGTATTTTGTGTGATTTTAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCTTAGAGAGTACCTTCCCTGGGGTGTATTTTGTGTGATTTTAGTG  281

seq1  GTGACCTGGAGATCTGGCAATAGATGACTATGATCCTTGTAAATATGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCTGGAGATCTGGCAATAGATGACTATGATCCTTGTAAATATGAAG  331

seq1  AAAATTACAAATACTCTGCAACTAATTAAAACTCTGTAGCAGAGACATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTACAAATACTCTGCAACTAATTAAAACTCTGTAGCAGAGACATCT  381

seq1  GTTTAATATATGTAGCAATTCCAGAAGTTGATAACAGACCACCTCCAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAATATATGTAGCAATTCCAGAAGTTGATAACAGACCACCTCCAAGC  431

seq1  AGCAAGGGCTGAGGCAGCCTCTTTAAATAAAGTAATTATGAAGGGTAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGGGCTGAGGCAGCCTCTTTAAATAAAGTAATTATGAAGGGTAGTA  481

seq1  GCATAGATATAAACTTGGATAGCATCCAAATAGAGTCATAAAATGTGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGATATAAACTTGGATAGCATCCAAATAGAGTCATAAAATGTGCTA  531

seq1  ATTGGTATTGAGGATTAGGATGCACTAAAAGCCAAATGTACAGCATGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTATTGAGGATTAGGATGCACTAAAAGCCAAATGTACAGCATGGAA  581

seq1  TTTTCTTTACAGTGAAAGTAACTTTTCCACTCTTTAGACTGAAAGTGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTACAGTGAAAGTAACTTTTCCACTCTTTAGACTGAAAGTGAAG  631

seq1  TTGAATAGGAGAGGAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAAGAAGAAATCATCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAGGAGAGGAAAAAAAAAAGAAGAAAGAAAGAAGAAATCATCTAG  681

seq1  GATTTTCACTCACCTTACACTTTAAATTATTTTAGATATTCAATGACTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCACTCACCTTACACTTTAAATTATTTTAGATATTCAATGACTCA  731

seq1  AGTAGACTGTAAGTGGCTTATAGTTCATGTGTTTCAGTGACAGTAATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGACTGTAAGTGGCTTATAGTTCATGTGTTTCAGTGACAGTAATTAT  781

seq1  CTGCACAAACAAAAAAGAATGTAAAGGGTATTACTAAAATCTACAATAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCACAAACAAAAAAGAATGTAAAGGGTATTACTAAAATCTACAATAGT  831

seq1  GAATTCATTTACATACCCAGAGAATGTAATAACACTTTGAGAAATAAACC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTACATACCCAGAGAATGTAATAACACTTTGAGAAATAAACC  881

seq1  AATGTATTTGCATGTGAAATAAAACCCCTGTAGGTATAAAAGCATAAATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATTTGCATGTGAAATAAAACCCCTGTAGGTATAAAAGCATAAATC  931

seq1  CATACTACTTCTAGTAAAGATAACATCTTATATAACTTAATAATCAGGGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTACTTCTAGTAAAGATAACATCTTATATAACTTAATAATCAGGGA  981

seq1  ATTC  1004
      ||||
seq2  ATTC  985