BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-222F22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 77,310,081 - 77,310,791
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneFstl5, LOC100041625, LOC100041635
Downstream geneDnmt3a-ps1, EG626461, LOC667526, LOC626479, LOC100041691
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-222F22.bB6Ng01-222F22.g
ACCGA037408GA037409
length711180
definitionB6Ng01-222F22.b B6Ng01-222F22.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattccaagctcaattagtaattttgtaaagaaaggaaatatattctac
atacattagctaagaaaagttgcagaactgaacactctttatgcattgta
taattctcccaacttgcattatttcttccacatacttaaactatggagtc
agtcagcatatgtggtggttttcatatgcatggcccacagtcagtggctc
tattaggagttatggccttgttggagtaggtgtggccttgttggaggaag
tggaacactgtggaggtaggctttgaggtcctattctcaagctctaccaa
gcatgaagagagtctcctggctgcctatggatcaaagtggatgtaaaatt
ctcagcccctccagcagaaagtatggcctagtaggtatgtctcaaggtct
ggatcaaaagctcatgtctttaagactcaagatctgggtcacaggtgtgc
cctccatttctggattgttatttattcctgatatagttgattttacaacc
ataaatagccatcataatccttcccttgtgaactttaaacaaatcatatc
ttatgtccaaatgaaattaataactaggtcataaatactcctaacatgat
ataactatccctcatgcaaccacacatgcattgtaaatttagaatagatc
aatgtctcttggggagcatctttttactatcttgaacttaaatatgatat
cccttgctatt

tttgtttagctctgcaccccatttcttattacagtgtttatttcaaaatt
tttattaattgaaagctgggtgtggtggtgcactcctttaatcccagcac
tcaggaggcagaggctggcagatttcttgagttcgaggcaagcctggtct
acaaagtgtgttctaggacagccagggctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_77310081_77310791
seq2: B6Ng01-222F22.b_43_753

seq1  GAATTCCAAGCTCAATTAGTAATTTTGTAAAGAAAGGAAATATATTCTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGCTCAATTAGTAATTTTGTAAAGAAAGGAAATATATTCTAC  50

seq1  ATACATTAGCTAAGAAAAGTTGCAGAACTGAACACTCTTTATGCATTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTAGCTAAGAAAAGTTGCAGAACTGAACACTCTTTATGCATTGTA  100

seq1  TAATTCTCCCAACTTGCATTATTTCTTCCACATACTTAAACTATGGAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCTCCCAACTTGCATTATTTCTTCCACATACTTAAACTATGGAGTC  150

seq1  AGTCAGCATATGTGGTGGTTTTCATATGCATGGCCCACAGTCAGTGGCTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGCATATGTGGTGGTTTTCATATGCATGGCCCACAGTCAGTGGCTC  200

seq1  TATTAGGAGTTATGGCCTTGTTGGAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGGAGTTATGGCCTTGTTGGAGTAGGTGTGGCCTTGTTGGAGGAAG  250

seq1  TGGAACACTGTGGAGGTAGGCTTTGAGGTCCTATTCTCAAGCTCTACCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACACTGTGGAGGTAGGCTTTGAGGTCCTATTCTCAAGCTCTACCAA  300

seq1  GCATGAAGAGAGTCTCCTGGCTGCCTATGGATCAAAGTGGATGTAAAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAAGAGAGTCTCCTGGCTGCCTATGGATCAAAGTGGATGTAAAATT  350

seq1  CTCAGCCCCTCCAGCAGAAAGTATGGCCTAGTAGGTATGTCTCAAGGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCCCCTCCAGCAGAAAGTATGGCCTAGTAGGTATGTCTCAAGGTCT  400

seq1  GGATCAAAAGCTCATGTCTTTAAGACTCAAGATCTGGGTCACAGGTGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCAAAAGCTCATGTCTTTAAGACTCAAGATCTGGGTCACAGGTGTGC  450

seq1  CCTCCATTTCTGGATTGTTATTTATTCCTGATATAGTTGATTTTACAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATTTCTGGATTGTTATTTATTCCTGATATAGTTGATTTTACAACC  500

seq1  AGAAATAGCCATCATAATCCTTCCCTTGTGAACTTTAAACAAATCATATC  550
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAGCCATCATAATCCTTCCCTTGTGAACTTTAAACAAATCATATC  550

seq1  TTATGTCCAAATGAAATCAATAACTAGGTCATAAATACTCCTAACATGAT  600
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTCCAAATGAAATTAATAACTAGGTCATAAATACTCCTAACATGAT  600

seq1  ATAACTATCCCTCATGCAACCACACATGCATTGTAAATTTAGAATAGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTATCCCTCATGCAACCACACATGCATTGTAAATTTAGAATAGATC  650

seq1  AATGTCTCTTGGGGAGCATCTTTTTACTATCTTGAACTTAAATATGATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCTCTTGGGGAGCATCTTTTTACTATCTTGAACTTAAATATGATAT  700

seq1  CCCTTGCTATT  711
      |||||||||||
seq2  CCCTTGCTATT  711


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |