BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-237K13
Chromosome3 (Build37)
Map Location 146,755,646 - 146,962,527
singlet/doubletdoublet
Overlap genePpia-ps3_1528.1
Upstream geneWdr63, Mcoln3, Mcoln2, Edg7, Ssx2ip, Ctbs, Spata1, Gng5, Bxdc5, LOC100040473, Dnase2b, Uox, 4930503B20Rik, Gm1652, LOC670100, Prkacb, LOC100040540, Ttll7
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-237K13.bB6Ng01-237K13.g
ACCGA048556GA048557
length1,1261,056
definitionB6Ng01-237K13.b B6Ng01-237K13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,961,405 - 146,962,527)(146,755,646 - 146,756,703)
sequence
gaattccaaagaaatgtgtggggagagagggagagaaagaaagagacaga
aagacagacagacagacagacagacagacagacaacagacagagatggag
atagagacagtgacagatagagacaaacagagatagagagacagacagac
agaatgcctgcctgcctttactactgctgcttgtagtactactacaacct
tgattgacatcagacactaacttcatgatcttcccacgtggcctcactat
ggaactcactcatggaacttttactcccagatcttgtcttgctgaagcat
cccaatgcttggcctgagcatcaactgagtcccttaaatctgcaacttgg
aaatgtctactgttgggctactccagcaccatcttataagccagtcttat
aattcaccatttgttgtttatgaatatacatatatgtatatgcacattca
tatatctacacacatatgtagatgtatatgtaatgtgtgtatgtaacctt
atattatatatacaaatgtgtatataagagaatatacatttcttttttcc
caacataatattaatgaatactaatcgatgttctaatatttgagaatttc
ctacaatgcagcttgattgtcctaagcttctcatctctgccagttccacc
ccctacacttacaccctcccttcctttaaaaaacaatgaactttccagtg
gagttcactttacgttgccgatacactcactgaagcatggtcaaactccc
agtgtccagcccctttgagtccttacctgccaaccccgccccccagaagt
taagaagagctacacttcacttcagtatctttatcacacttttcaatgac
tctcttcagtattttcctctctgtgctgtttctttaggggaagtggaggt
gggcagagtttgtcactgaagtcttcaatgtgagaacacacactttctgt
tgacttctctatctattgaaaaatcctgcccatacagattgggtaccagc
agtgcagacattgctgctgttattgagaaacccatccatgagttcctatg
cgttcctaactgatctgtggggacgaaatgagagaatttcagagcctgta
gaccagagagcccttaaccgccataa
gaattctcttctgcagatgcctggagtggcaagtcaatacatgtctgtgt
tagctacagtccaatgcctgctctcacaattagggggcagaagagcaatt
ggaattggcgtggactgtaattagcaaggaaaatggttagctgggggtgt
ttaatcaaatgaaagtcaaaaatggtagggaactgcatttttgtgtagat
tttgaagctagacattcttaagatgaaattgtcaaataaacccagtctgg
ctttgtgttgaaattcatcaaaaatggctttgtttgcctccctttctgat
tgcaactgtcaatcacttgtccttaattgaataatttgcacgataccaag
agcagattttgtgaacaaaatgtccaaaaaaacatgcggtagagcgaaga
agcaaaatcataagggaaggcgttagtgtactggagcaaatcgcagccaa
gctttcccgatggccagaagcacaccaggagtagcaatgacacctttgcc
atgtaaaccacaggggaaagtaattaaatttaacagaagctgcccttgat
ttaaagccacaggggaagtaattaaatttaatagaagccactacttctaa
acaaagatatatggtatttctatcaccgaatgctacccctgctacttgtg
cctatggagtctagtggtctgccttgaaaaccagatccagaacaagggca
gggcatgctttagggaacagtctgagctaggtttctaggaatgaggctca
ctggtgaagtgctggtctagtgtgcgtgaagccttgggtttgatccctag
tgagtccttgggtttgatccctagtgagtcaagccagctgtctcagaaat
tcaaggccatccttggctacgtcatgggttaggagcccaacctgggatac
atgagactcagtttcaagcgaaacacaaccgagcaatgggttaaagcaat
ctttaatctggcgccagcacttccagctacaagtttcaagaactggggct
gccctcccatggaactaaaccacaccagtattcagctatagacacagaga
tctggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_146961405_146962527
seq2: B6Ng01-237K13.b_44_1169 (reverse)

seq1  TTATGGCGTTTTAGGGGCTCTCTAGTCTACA-GCTCTGAAA-TCTCTCAT  48
      ||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TTATGGCG-GTTAAGGGCTCTCTGGTCTACAGGCTCTGAAATTCTCTCAT  49

seq1  ATTCCT-CCCACAGATCAGTTTAGAACGCATAGAACCTCATGGATGGGTT  97
       ||| | ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||
seq2  -TTCGTCCCCACAGATCAGTTAGGAACGCATAGGAACTCATGGATGGGTT  98

seq1  TCTC-ATAACAGCAGCAATGTCTGCACTGCTGGTACCCAATCTGTATTGG  146
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCTCAATAACAGCAGCAATGTCTGCACTGCTGGTACCCAATCTGTATGGG  148

seq1  CAGGATTTTTCAATAGATAGAG-AGTCAACAGAAAGTGTGTGTTCTCACA  195
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTTTTCAATAGATAGAGAAGTCAACAGAAAGTGTGTGTTCTCACA  198

seq1  TTGAAGACTTCAGTGACAAACTCTGCCCACCTCCACTTCCCCTAAAGAAA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGACTTCAGTGACAAACTCTGCCCACCTCCACTTCCCCTAAAGAAA  248

seq1  CAGCACAGAGAGGAAAATACTGAAGAGAGTCATTGAAAAGTGTGATAAAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAGAGAGGAAAATACTGAAGAGAGTCATTGAAAAGTGTGATAAAG  298

seq1  ATACTGAAGTGAAGTGTAGCTCTTCTTAACTTCTGGGGGGCGGGGTTGGC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGAAGTGAAGTGTAGCTCTTCTTAACTTCTGGGGGGCGGGGTTGGC  348

seq1  AGGTAAGGACTCAAAGGGGCTGGACACTGGGAGTTTGACCATGCTTCAGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGGACTCAAAGGGGCTGGACACTGGGAGTTTGACCATGCTTCAGT  398

seq1  GAGTGTATCGGCAACGTAAAGTGAACTCCACTGGAAAGTTCATTGTTTTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTATCGGCAACGTAAAGTGAACTCCACTGGAAAGTTCATTGTTTTT  448

seq1  TAAAGGAAGGGAGGGTGTAAGTGTAGGGGGTGGAACTGGCAGAGATGAGA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGAAGGGAGGGTGTAAGTGTAGGGGGTGGAACTGGCAGAGATGAGA  498

seq1  AGCTTAGGACAATCAAGCTGCATTGTAGGAAATTCTCAAATATTAGAACA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAGGACAATCAAGCTGCATTGTAGGAAATTCTCAAATATTAGAACA  548

seq1  TCGATTAGTATTCATTAATATTATGTTGGGAAAAAAGAAATGTATATTCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATTAGTATTCATTAATATTATGTTGGGAAAAAAGAAATGTATATTCT  598

seq1  CTTATATACACATTTGTATATATAATATAAGGTTACATACACACATTACA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATATACACATTTGTATATATAATATAAGGTTACATACACACATTACA  648

seq1  TATACATCTACATATGTGTGTAGATATATGAATGTGCATATACATATATG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATCTACATATGTGTGTAGATATATGAATGTGCATATACATATATG  698

seq1  TATATTCATAAACAACAAATGGTGAATTATAAGACTGGCTTATAAGATGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCATAAACAACAAATGGTGAATTATAAGACTGGCTTATAAGATGG  748

seq1  TGCTGGAGTAGCCCAACAGTAGACATTTCCAAGTTGCAGATTTAAGGGAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGAGTAGCCCAACAGTAGACATTTCCAAGTTGCAGATTTAAGGGAC  798

seq1  TCAGTTGATGCTCAGGCCAAGCATTGGGATGCTTCAGCAAGACAAGATCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTGATGCTCAGGCCAAGCATTGGGATGCTTCAGCAAGACAAGATCT  848

seq1  GGGAGTAAAAGTTCCATGAGTGAGTTCCATAGTGAGGCCACGTGGGAAGA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTAAAAGTTCCATGAGTGAGTTCCATAGTGAGGCCACGTGGGAAGA  898

seq1  TCATGAAGTTAGTGTCTGATGTCAATCAAGGTTGTAGTAGTACTACAAGC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAGTTAGTGTCTGATGTCAATCAAGGTTGTAGTAGTACTACAAGC  948

seq1  AGCAGTAGTAAAGGCAGGCAGGCATTCTGTCTGTCTGTCTCTCTATCTCT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTAGTAAAGGCAGGCAGGCATTCTGTCTGTCTGTCTCTCTATCTCT  998

seq1  GTTTGTCTCTATCTGTCACTGTCTCTATCTCCATCTCTGTCTGTTGTCTG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCTCTATCTGTCACTGTCTCTATCTCCATCTCTGTCTGTTGTCTG  1048

seq1  TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTGTCTCTTTCTTTCTCTCCC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTGTCTCTTTCTTTCTCTCCC  1098

seq1  TCTCTCCCCACACATTTCTTTGGAATTC  1123
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCCCACACATTTCTTTGGAATTC  1126

seq1: chr3_146755646_146756703
seq2: B6Ng01-237K13.g_66_1121

seq1  GAATTCTCTTCTGCAGATGCCTGGAGTGGCAAGTCAATACATGTCTGTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTCTGCAGATGCCTGGAGTGGCAAGTCAATACATGTCTGTGT  50

seq1  TAGCTACAGTCCAATGCCTGCTCTCACAATTAGGGGGCAGAAGAGCAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTACAGTCCAATGCCTGCTCTCACAATTAGGGGGCAGAAGAGCAATT  100

seq1  GGAATTGGCGTGGACTGTAATTAGCAAGGAAAATGGTTAGCTGGGGGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTGGCGTGGACTGTAATTAGCAAGGAAAATGGTTAGCTGGGGGTGT  150

seq1  TTAATCAAATGAAAGTCAAAAATGGTAGGGAACTGCATTTTTGTGTAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAAATGAAAGTCAAAAATGGTAGGGAACTGCATTTTTGTGTAGAT  200

seq1  TTTGAAGCTAGACATTCTTAAGATGAAATTGTCAAATAAACCCAGTCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGCTAGACATTCTTAAGATGAAATTGTCAAATAAACCCAGTCTGG  250

seq1  CTTTGTGTTGAAATTCATCAAAAATGGCTTTGTTTGCCTCCCTTTCTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGTTGAAATTCATCAAAAATGGCTTTGTTTGCCTCCCTTTCTGAT  300

seq1  TGCAACTGTCAATCACTTGTCCTTAATTGAATAATTTGCACGATACCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACTGTCAATCACTTGTCCTTAATTGAATAATTTGCACGATACCAAG  350

seq1  AGCAGATTTTGTGAACAAAATGTCCAAAAAAACATGCGGTAGAGCGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATTTTGTGAACAAAATGTCCAAAAAAACATGCGGTAGAGCGAAGA  400

seq1  AGCAAAATCATAAGGGAAGGCGTTAGTGTACTGGAGCAAATCGCAGCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAATCATAAGGGAAGGCGTTAGTGTACTGGAGCAAATCGCAGCCAA  450

seq1  GCTTTCCCGATGGCCAGAAGCACACCAGGAGTAGCAATGACACCTTTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCCGATGGCCAGAAGCACACCAGGAGTAGCAATGACACCTTTGCC  500

seq1  ATGTAAACCACAGGGGAAAGTAATTAAATTTAACAGAAGCTGCCCTTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAAACCACAGGGGAAAGTAATTAAATTTAACAGAAGCTGCCCTTGAT  550

seq1  TTAAAGCCACAGGGGAAGTAATTAAATTTAATAGAAGCCACTACTTCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCCACAGGGGAAGTAATTAAATTTAATAGAAGCCACTACTTCTAA  600

seq1  ACAAAGATATATGGTATTTCTATCACCGAATGCTACCCCTGCTACTTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGATATATGGTATTTCTATCACCGAATGCTACCCCTGCTACTTGTG  650

seq1  CCTATGGAGTCTAGTGGTCTGCCTTGAAAACCAGATCCAGAACAAGGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGGAGTCTAGTGGTCTGCCTTGAAAACCAGATCCAGAACAAGGGCA  700

seq1  GGGCATGCTTTAGGGAACAGTCTGAGCTAGGTTTCTAGGAATGAGGCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATGCTTTAGGGAACAGTCTGAGCTAGGTTTCTAGGAATGAGGCTCA  750

seq1  CTGGTGAAGTGCTGGTCTAGTGTGCGTGAAGCCTTGGGTTTGATCCCTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGAAGTGCTGGTCTAGTGTGCGTGAAGCCTTGGGTTTGATCCCTAG  800

seq1  TGAGTCCTTGGGTTTGATCCCTAGTGAGTCAAGCCAGCTGTCTCAGAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCCTTGGGTTTGATCCCTAGTGAGTCAAGCCAGCTGTCTCAGAAAT  850

seq1  TCAAGGCCATCCTTGGCTACGTCATGGGTTAGGAG-CCAACCTGGGATAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCAAGGCCATCCTTGGCTACGTCATGGGTTAGGAGCCCAACCTGGGATAC  900

seq1  ATGAGACTCAGTTTCAAGCGAAACACAAACCGAGCAATGGGTTAAAGCAA  949
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACTCAGTTTCAAGCGAAACAC-AACCGAGCAATGGGTTAAAGCAA  949

seq1  TCTTTAATCTGGCGCCAGCACTTCCAAGCTACA--GTTCAAGAACTGGGG  997
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||
seq2  TCTTTAATCTGGCGCCAGCACTTCC-AGCTACAAGTTTCAAGAACTGGGG  998

seq1  CTGCCCTCCCATGGAAACCTAACCACACCAGTATTCAGCTATAGACCACA  1047
      |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTGCCCTCCCATGG-AACTAAACCACACCAGTATTCAGCTATAGA-CACA  1046

seq1  GGAGATCTGGT  1058
       ||||||||||
seq2  -GAGATCTGGT  1056