BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-245G06
Chromosome3 (Build37)
Map Location 151,117,621 - 151,222,942
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEltd1
Upstream geneLOC100040455, LOC100040463, LOC623554
Downstream geneIfi44, H28, Ptgfr, LOC100040741, LOC100040597, LOC676548, Gipc2, Dnajb4, Fubp1, Nexn, C030011O14Rik, Usp33, Zzz3, Ak5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-245G06.bB6Ng01-245G06.g
ACCGA054287GA054288
length1,0331,076
definitionB6Ng01-245G06.b B6Ng01-245G06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,117,621 - 151,118,651)(151,221,871 - 151,222,942)
sequence
gaattcttaggaaatagtttgctttcagtgaatatttattaaaattagct
ataatatatattaacaccctttcctgttttattgatagaagtgaatacgt
ttacatgaaaataattgtgtttagtcccaaaaagtctctcattgaagtta
gatggttaaaaatacatgaaggagaaaggggtgcagttggagagatggct
cagtggttatggcatctgttgctcttacagaagactaaagattggttctc
agaacccaaacctgacagcttgcagccacccaaaaattcagctttagaga
attcaaagcaaacatatatatatatatatatatatatatatatatatata
tagtcacacacacacatatatatacaccctactcctcacacacgcaaaaa
attaagtatatctttaaaagaaatacagaaagaaggctgactagaaggct
ctgtgagaaatagtacctgccaacaagcttaacaacctaagtcaataccc
aggatccacatggcagagaactgacccctacaaattggcctctgacttct
atacatatagggtatgcataagtgcacataaatacacacatgcaaagact
aataaaaatataaaaacttttaaataaaaataaagaaatgatgaacagag
agaacctaatgtaatttcttgattctatgattgggttgtgttctctgagg
gtccgtggtgactgggggcttgcttgctgctcagagtgtcagtgataggg
acgttgagctgcccaggaggtctttagccattaggaatgtgtccctggga
gaggactgggaactccgttctctcacacacttccctgtaaaacttgattt
gactgcttttgaggtaactgggagcagaacggagctgtagcaggcactat
gctatgcagccccgcacaactcagctaatctgtcctctcttcaaatccaa
ctcttatagggactttgtactaagggagggaccatctggtaacatagcaa
gctttccagtaaaaacctgaagtaaatataaat
gaattccatctccttcgcccctaaaataaattaactgctaataatatcta
ttagacatagccaccacagatgcaccatttctgatcttgatggtttcaga
ttatagaaagcaaccccccaaaaatattgaagcacctctgattgcactgt
ttaagggcaactcactggaagggtgatggtggttctcaatgtggaaatca
ggcagaaagttctcagaaaagtgcagaagtcaaagcatgtctggaaaccc
aagtcaggtggacatcatcaacacccactccctaccagattctccttcct
gttagtgtgtgaaatggccttctccttcactgggtagactgcctccattc
actagtgacagggtggtttggactgtggtagtgcttccccatcattccat
gagtgcacacttatcataggagtgagtagcctagttatatttctcaggac
tcatttccttctactctcccaaatgcttcaccagccagccacagtatgct
tctggtctttcactgtgccttccaggcacactcctatgataggctcctgt
cccattgccccacctccgatgaaaacagtagcagccaagttttccatcac
acaacacttttgttgttgcctttacacataaacacactatttcaccttca
tctataaattcccaaagaagacagtgttttaacataatatcatagctaat
tgagggaaaggtatttcactcaatattatataattaatcaattttataga
cagatccaagttatagtttgaatatagggcgctgaacttttatatctgtt
tttaatttttatcaactcttttgactattctttccttcaatactcaacca
gcttatctaaatcacagtcttctctaatctctatcttctttctatacaat
ggcattttataagtatatcagcacttgatgctagagtgtgtattcattgg
gttgctgtctctaatcatcactaacacacaggtgccatggggacttaact
aatctacttgcttaataacctgggtacacagtgacacttctgggcttggg
gttcttcttaatgactgattattggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_151117621_151118651
seq2: B6Ng01-245G06.b_51_1083

seq1  GAATTCTTAGGAAATAGTTTGCTTTCAGTGAATATTTATTAAAATTAGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGGAAATAGTTTGCTTTCAGTGAATATTTATTAAAATTAGCT  50

seq1  ATAATATATATTAACACCCTTTCCTGTTTTATTGATAGAAGTGAATACGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATATATATTAACACCCTTTCCTGTTTTATTGATAGAAGTGAATACGT  100

seq1  TTACATGAAAATAATTGTGTTTAGTCCCAAAAAGTCTCTCATTGAAGTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGAAAATAATTGTGTTTAGTCCCAAAAAGTCTCTCATTGAAGTTA  150

seq1  GATGGTTAAAAATACATGAAGGAGAAAGGGGTGCAGTTGGAGAGATGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTAAAAATACATGAAGGAGAAAGGGGTGCAGTTGGAGAGATGGCT  200

seq1  CAGTGGTTATGGCATCTGTTGCTCTTACAGAAGACTAAAGATTGGTTCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTTATGGCATCTGTTGCTCTTACAGAAGACTAAAGATTGGTTCTC  250

seq1  AGAACCCAAACCTGACAGCTTGCAGCCACCCAAAAATTCAGCTTTAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCCAAACCTGACAGCTTGCAGCCACCCAAAAATTCAGCTTTAGAGA  300

seq1  ATTCAAAGCAAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAAGCAAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  350

seq1  TAGTCACACACACACATATATATACACCCTACTCCTCACACACGCAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCACACACACACATATATATACACCCTACTCCTCACACACGCAAAAA  400

seq1  ATTAAGTATATCTTTAAAAGAAATACAGAAAGAAGGCTGACTAGAAGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGTATATCTTTAAAAGAAATACAGAAAGAAGGCTGACTAGAAGGCT  450

seq1  CTGTGAGAAATAGTACCTGCCAACAAGCTTAACAACCTAAGTCAATACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGAAATAGTACCTGCCAACAAGCTTAACAACCTAAGTCAATACCC  500

seq1  AGGATCCACATGGCAGAGAACTGACCCCTACAAATTGGCCTCTGACTTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCACATGGCAGAGAACTGACCCCTACAAATTGGCCTCTGACTTCT  550

seq1  ATACATATAGGGTATGCATAAGTGCACATAAATACACACATGCAAAGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATAGGGTATGCATAAGTGCACATAAATACACACATGCAAAGACT  600

seq1  AATAAAAATATAAAAACTTTTAAATAAAAATAAAGAAATGATGAACAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAAATATAAAAACTTTTAAATAAAAATAAAGAAATGATGAACAGAG  650

seq1  AGAACCTAATGTAATTTCTTGATTCTATGATTGGGTTGTGTTCTCTGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCTAATGTAATTTCTTGATTCTATGATTGGGTTGTGTTCTCTGAGG  700

seq1  GTCCGTGGTGACTGGGGGCTTGCTTGCTGCTCAGAGTGTCAGTGATAGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCGTGGTGACTGGGGGCTTGCTTGCTGCTCAGAGTGTCAGTGATAGGG  750

seq1  ACGTTGAGCTGCCCAGGAGGTCTTTAGCCATTAGGAATGTGTCCCTGGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTGAGCTGCCCAGGAGGTCTTTAGCCATTAGGAATGTGTCCCTGGGA  800

seq1  GAGGACTGGGAACTCCGTTCTCTCACACACTT-CCTGTAAAACTTGATTT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAGGACTGGGAACTCCGTTCTCTCACACACTTCCCTGTAAAACTTGATTT  850

seq1  GACTGC-TTTGAGGTAACT-GGAGCAGAACGGAGCTGTAGCAGGCACTAT  897
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTTTTGAGGTAACTGGGAGCAGAACGGAGCTGTAGCAGGCACTAT  900

seq1  GCTATGCAGCCCCGCACAACTCAGCTAATCTGTCCTCTCTTCAAATCCAA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGCAGCCCCGCACAACTCAGCTAATCTGTCCTCTCTTCAAATCCAA  950

seq1  CTCTTATAGGAACTTTGTACTAA-GGAAGGACCATCTGGTAACATAGCAA  996
      |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTATAGGGACTTTGTACTAAGGGAGGGACCATCTGGTAACATAGCAA  1000

seq1  GCTTTCCAGTAAAAAACCTGAAAGTAAATATAAAT  1031
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTTTCCAGT-AAAAACCTG-AAGTAAATATAAAT  1033

seq1: chr3_151221871_151222942
seq2: B6Ng01-245G06.g_65_1140 (reverse)

seq1  CCCAATAATTCAGTCATTAAG-AGAA-CCCAAG-CCAGAAGTGTCACTGT  47
      |||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  CCCAATAA-TCAGTCATTAAGAAGAACCCCAAGCCCAGAAGTGTCACTGT  49

seq1  GTA-CCAGGTTATTAAGCAAGTAGATTAAGTTAAGTCCCCATGGCACCTG  96
      ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCAGGTTATTAAGCAAGTAGATT-AGTTAAGTCCCCATGGCACCTG  98

seq1  TGTGTTAGTGATGATTAGAGACAGCAA-CCAATGAATACACACTCTAGCA  145
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTAGTGATGATTAGAGACAGCAACCCAATGAATACACACTCTAGCA  148

seq1  TCAAGTGCTGATATACTTAT-AAATGCCATTGTATAGAAAGAAGATAGAG  194
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTGCTGATATACTTATAAAATGCCATTGTATAGAAAGAAGATAGAG  198

seq1  ATTAGAGAAGACTGTGATTTAGATAAGCTGGTTGAGTATTGAAGGAAAGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAGAAGACTGTGATTTAGATAAGCTGGTTGAGTATTGAAGGAAAGA  248

seq1  ATAGTCAAAAGAGTTGATAAAAATTAAAAACAGATATAAAAGTTCAGCGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCAAAAGAGTTGATAAAAATTAAAAACAGATATAAAAGTTCAGCGC  298

seq1  CCTATATTCAAACTATAACTTGGATCTGTCTATAAAATTGATTAATTATA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATTCAAACTATAACTTGGATCTGTCTATAAAATTGATTAATTATA  348

seq1  TAATATTGAGTGAAATACCTTTCCCTCAATTAGCTATGATATTATGTTAA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTGAGTGAAATACCTTTCCCTCAATTAGCTATGATATTATGTTAA  398

seq1  AACACTGTCTTCTTTGGGAATTTATAGATGAAGGTGAAATAGTGTGTTTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGTCTTCTTTGGGAATTTATAGATGAAGGTGAAATAGTGTGTTTA  448

seq1  TGTGTAAAGGCAACAACAAAAGTGTTGTGTGATGGAAAACTTGGCTGCTA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAAAGGCAACAACAAAAGTGTTGTGTGATGGAAAACTTGGCTGCTA  498

seq1  CTGTTTTCATCGGAGGTGGGGCAATGGGACAGGAGCCTATCATAGGAGTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTTCATCGGAGGTGGGGCAATGGGACAGGAGCCTATCATAGGAGTG  548

seq1  TGCCTGGAAGGCACAGTGAAAGACCAGAAGCATACTGTGGCTGGCTGGTG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGAAGGCACAGTGAAAGACCAGAAGCATACTGTGGCTGGCTGGTG  598

seq1  AAGCATTTGGGAGAGTAGAAGGAAATGAGTCCTGAGAAATATAACTAGGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTTGGGAGAGTAGAAGGAAATGAGTCCTGAGAAATATAACTAGGC  648

seq1  TACTCACTCCTATGATAAGTGTGCACTCATGGAATGATGGGGAAGCACTA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACTCCTATGATAAGTGTGCACTCATGGAATGATGGGGAAGCACTA  698

seq1  CCACAGTCCAAACCACCCTGTCACTAGTGAATGGAGGCAGTCTACCCAGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGTCCAAACCACCCTGTCACTAGTGAATGGAGGCAGTCTACCCAGT  748

seq1  GAAGGAGAAGGCCATTTCACACACTAACAGGAAGGAGAATCTGGTAGGGA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGAAGGCCATTTCACACACTAACAGGAAGGAGAATCTGGTAGGGA  798

seq1  GTGGGTGTTGATGATGTCCACCTGACTTGGGTTTCCAGACATGCTTTGAC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTGTTGATGATGTCCACCTGACTTGGGTTTCCAGACATGCTTTGAC  848

seq1  TTCTGCACTTTTCTGAGAACTTTCTGCCTGATTTCCACATTGAGAACCAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCACTTTTCTGAGAACTTTCTGCCTGATTTCCACATTGAGAACCAC  898

seq1  CATCACCCTTCCAGTGAGTTGCCCTTAAACAGTGCAATCAGAGGTGCTTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCCTTCCAGTGAGTTGCCCTTAAACAGTGCAATCAGAGGTGCTTC  948

seq1  AATATTTTTGGGGGGTTGCTTTCTATAATCTGAAACCATCAAGATCAGAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTTTGGGGGGTTGCTTTCTATAATCTGAAACCATCAAGATCAGAA  998

seq1  ATGGTGCATCTGTGGTGGCTATGTCTAATAGATATTATTAGCAGTTAATT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGCATCTGTGGTGGCTATGTCTAATAGATATTATTAGCAGTTAATT  1048

seq1  TATTTTAGGGGCGAAGGAGATGGAATTC  1072
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAGGGGCGAAGGAGATGGAATTC  1076