BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273I15
Chromosome3 (Build37)
Map Location 79,685,766 - 79,686,576
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC383883, LOC100041748, LOC100041716, LOC100041725, LOC100041766, Rapgef2, LOC100041741, LOC100041793, LOC667613, Ppid, Etfdh, 4930579G24Rik, Rxfp1, Tmem144
Downstream gene1110032E23Rik, EG626797, Gria2, Glrb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273I15.b
ACCGA075087
length813
definitionB6Ng01-273I15.b
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcccacgtggcaagcagtcagcacacacatgaggaattcccatgtg
gcaagcaggagaaaggctgcagttgaattgagcttccagtgaagtggtgc
atcctgtcaggagtaccactgtgtgccctgtggactcaaactccccaacc
ttctgaaagctattggcaaaataatttatagggactctcactgaaagttc
actcactaactcttcccttttctttgttgacccttgcttgttacatgtta
catatccaagaatgggcattctgagatgaagtgtgggtcaccacatgaag
ggaatttaccatgtagaccaagggtgctgatggagactgttgaatcacat
cccttatgagacagggctaaggaagccagtttgctggtcatctgacatgc
tgcttgagagaacaattaggagaggtgaagtgtaatgactagtgtgtaat
ggtggaatgatggatttcagagtctgaggagacatcaatagccagctgga
gagatgctgtgatattggcccctttgaagagattgtaagatgctccttgg
agggcacatataccccatgcccagggacctgctcagtagattcacaatag
tttcaaaggggagattttctgctctccccctagtctatcgaacactgggt
tacctggagccaggcttagcattcggtgaggaggtagaaaagcccagaat
ggatttattatacaggaaacacacaaacaagcaaacaaacaccatgggtc
accttgcttttctgtttttagtagttttttcgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_79685766_79686576
seq2: B6Ng01-273I15.b_42_854

seq1  GAATTCCCACGTGGCAAGCAGTCAGCACACACATGAGGAATTCCCATGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCACGTGGCAAGCAGTCAGCACACACATGAGGAATTCCCATGTG  50

seq1  GCAAGCAGGAGAAAGGCTGCAGTTGAATTGAGCTTCCAGTGAAGTGGTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCAGGAGAAAGGCTGCAGTTGAATTGAGCTTCCAGTGAAGTGGTGC  100

seq1  ATCCTGTCAGGAGTACCACTGTGTGCCCTGTGGACTCAAACTCCCCAACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGTCAGGAGTACCACTGTGTGCCCTGTGGACTCAAACTCCCCAACC  150

seq1  TTCTGAAAGCTATTGGCAAAATAATTTATAGGGACTCTCACTGAAAGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAAGCTATTGGCAAAATAATTTATAGGGACTCTCACTGAAAGTTC  200

seq1  ACTCACTAACTCTTCCCTTTTCTTTGTTGACCCTTGCTTGTTACATGTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTAACTCTTCCCTTTTCTTTGTTGACCCTTGCTTGTTACATGTTA  250

seq1  CATATCCAAGAATGGGCATTCTGAGATGAAGTGTGGGTCACCACATGAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCCAAGAATGGGCATTCTGAGATGAAGTGTGGGTCACCACATGAAG  300

seq1  GGAATTTACCATGTAGACCAAGGGTGCTGATGGAGACTGTTGAATCACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATTTACCATGTAGACCAAGGGTGCTGATGGAGACTGTTGAATCACAT  350

seq1  CCCTTATGAGACAGGGCTAAGGAAGCCAGTTTGCTGGTCATCTGACATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTATGAGACAGGGCTAAGGAAGCCAGTTTGCTGGTCATCTGACATGC  400

seq1  TGCTTGAGAGAACAATTAGGAGAGGTGAAGTGTAATGACTAGTGTGTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGAGAGAACAATTAGGAGAGGTGAAGTGTAATGACTAGTGTGTAAT  450

seq1  GGTGGAATGATGGATTTCAGAGTCTGAGGAGACATCAATAGCCAGCTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAATGATGGATTTCAGAGTCTGAGGAGACATCAATAGCCAGCTGGA  500

seq1  GAGATGCTGTGATATTGGCCCCTTTGAAGAGATTGTAAGATGCTCCTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGCTGTGATATTGGCCCCTTTGAAGAGATTGTAAGATGCTCCTTGG  550

seq1  AGGGCACATATACCCCATGCCCAGGGACCTGCTCAGTAGATTCACAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCACATATACCCCATGCCCAGGGACCTGCTCAGTAGATTCACAATAG  600

seq1  TTTCAAAGGGGAGATTTTCTGCTCTCCCCCTAGTCTATCGAACACTGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAGGGGAGATTTTCTGCTCTCCCCCTAGTCTATCGAACACTGGGT  650

seq1  TACCTGGAGCCAGGCTTAGCATTCGGTGAGGAGGTAGAAAAGCCCAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGGAGCCAGGCTTAGCATTCGGTGAGGAGGTAGAAAAGCCCAGAAT  700

seq1  GGATTTATTATACAGGAAACACACAAACAAGCAAACAAACACCATGGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTATTATACAGGAAACACACAAACAAGCAAACAAACACCATGGGTC  750

seq1  ACCTTGCTTTTCTG-TTTTAGTAG-TTTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  798
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGCTTTTCTGTTTTTAGTAGTTTTTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  800

seq1  TGTGTGTGTGTGT  811
      |||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGT  813