BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-291L04
Chromosome3 (Build37)
Map Location 119,610,048 - 119,753,491
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-291L04.bB6Ng01-291L04.g
ACCGA088519GA088520
length1,0181,127
definitionB6Ng01-291L04.b B6Ng01-291L04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,752,474 - 119,753,491)(119,610,048 - 119,611,175)
sequence
gaattcctattgttctgagttacccattttacatgactggagggggagag
caaatttcatctgttggcacttacatttgcaccatgtccacttcctgaac
ccttgcctgtgtatggatgacaagaataacagttgtagcagactcatttg
gggatttgattggaatatcattatgaaatctctaggtcttatcaaagcca
accatgacaactgctcctacactttcctgttgggctcagttaccaatgaa
catatttttttaatagaaaacaagaacattttaattgcctctgcgagata
cttctattttgttttatgtgtgtgctcacagccagacccttgtgtataat
gttaaaagatggatatttttttccctgggcatttttccctttttgtgtaa
attatataacaattgctttgggaactgtgcatttggactagccataaaat
aatcaaaattgtaatgctgttcggtggcagtattggagtcttcaaattag
tggatatattaaccactcaccgttacaggcattttgctcctagctgggtt
taatagacttggtcattggggtaataaattcttttggttggtttgagggc
ttttcaaaataatatcttagatgtgactggctccatctctcacaaccata
tcttccttctgtctaatgctgcccaaataatggtgagaaagtgaattatt
tagcatcttctactctaaaagaacaattctgatgttaaatcctgtaattg
catttgccaaattatatttcagtgcttctcacccatatttacatagtctt
tggtgtgtttatgatatacttgatacatgggtcttagaaaccatcaactg
acaaaagatcccttcagaaatacccacaaacacaaactacatccacttaa
acaacaaccatacttgacttctgtcttggccaattctgtaagtttcaaat
gaaatttcacctatgataggtccttagattttagcgcagttttgttagta
gtgtctatgtctctgtgt

gaattctctatgcccagttcattagttctgctatattttaatctgtgcag
gaagtaaaccagttgctgcgaggtgagtatcaatgggtggttatataggt
aagattggcttgtggtctttcctgtaaagaattgtcttgattacatattg
aagtgggaagacccacctactgtgggtggtgctattccctagagagggac
cttgaactgcataaaaatggagaaggtaagctgaacaccagtaagcatgc
attaatttactgctctctgctcttgactatggatgtaccatgactggaga
ctagattcttcaagttcctgataccttaaattccttgtagtgaaggagtg
taaccttgtgagtcagatatgcctttccttcctaacatgctttaaggtat
tttatcacagcatcaggaaaataatctaagacaatgagatagtgatgtta
gattttatataatatctatctatctatctatctatctatctatctatcta
tctatctatctacctacctacctacctacctacctatcatctacttttga
gtcaggaccttactgctctggctgtttgatactatgtagatcaggctgtc
tggaattcagaaatcttcctgcctctgcttcccaagagttagggctaacg
atatacatcaccatacctggtaagattttttttttcagataacatgatga
ctgaagaaatagctcacctgcaaaggatacttattctggacttgcatact
ccaggttcagatcatgaatcttatataaggaggttgaatttgcacaagta
atttctatgaactttccctgagtctccctctcagagagggagagtcattc
tgtgtctttctcacacactgtagtgcagtgtacacatgtgttttgtgtgg
gaggatgcaatggacatttggatggaaggccagaggttgatggtttaatg
ttgaaattctatttcctctacatgatttgtggatagattcccctcactta
tcctgagctcaaaacttggcctaggttattatggtcaggtgagcctcagg
atcttgactgctgccacacccaagaatatattgcagagatgtgctgctgt
gccttgctttaatgtgggtgctggttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_119752474_119753491
seq2: B6Ng01-291L04.b_50_1067 (reverse)

seq1  ACACAGAGACATAGACACTACTAACAAAACTGCGCTAAAATCTAAGGACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAGACATAGACACTACTAACAAAACTGCGCTAAAATCTAAGGACC  50

seq1  TATCATAGGTGAAATTTCATTTGAAACTTACAGAATTGGCCAAGACAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATAGGTGAAATTTCATTTGAAACTTACAGAATTGGCCAAGACAGAA  100

seq1  GTCAAGTATGGTTGTTGTTTAAGTGGATGTAGTTTGTGTTTGTGGGTATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGTATGGTTGTTGTTTAAGTGGATGTAGTTTGTGTTTGTGGGTATT  150

seq1  TCTGAAGGGATCTTTTGTCAGTTGATGGTTTCTAAGACCCATGTATCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAGGGATCTTTTGTCAGTTGATGGTTTCTAAGACCCATGTATCAAG  200

seq1  TATATCATAAACACACCAAAGACTATGTAAATATGGGTGAGAAGCACTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCATAAACACACCAAAGACTATGTAAATATGGGTGAGAAGCACTGA  250

seq1  AATATAATTTGGCAAATGCAATTACAGGATTTAACATCAGAATTGTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAATTTGGCAAATGCAATTACAGGATTTAACATCAGAATTGTTCTT  300

seq1  TTAGAGTAGAAGATGCTAAATAATTCACTTTCTCACCATTATTTGGGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGTAGAAGATGCTAAATAATTCACTTTCTCACCATTATTTGGGCAG  350

seq1  CATTAGACAGAAGGAAGATATGGTTGTGAGAGATGGAGCCAGTCACATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGACAGAAGGAAGATATGGTTGTGAGAGATGGAGCCAGTCACATCT  400

seq1  AAGATATTATTTTGAAAAGCCCTCAAACCAACCAAAAGAATTTATTACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATATTATTTTGAAAAGCCCTCAAACCAACCAAAAGAATTTATTACCC  450

seq1  CAATGACCAAGTCTATTAAACCCAGCTAGGAGCAAAATGCCTGTAACGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACCAAGTCTATTAAACCCAGCTAGGAGCAAAATGCCTGTAACGGT  500

seq1  GAGTGGTTAATATATCCACTAATTTGAAGACTCCAATACTGCCACCGAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGTTAATATATCCACTAATTTGAAGACTCCAATACTGCCACCGAAC  550

seq1  AGCATTACAATTTTGATTATTTTATGGCTAGTCCAAATGCACAGTTCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTACAATTTTGATTATTTTATGGCTAGTCCAAATGCACAGTTCCCA  600

seq1  AAGCAATTGTTATATAATTTACACAAAAAGGGAAAAATGCCCAGGGAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAATTGTTATATAATTTACACAAAAAGGGAAAAATGCCCAGGGAAAA  650

seq1  AAATATCCATCTTTTAACATTATACACAAGGGTCTGGCTGTGAGCACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCCATCTTTTAACATTATACACAAGGGTCTGGCTGTGAGCACACA  700

seq1  CATAAAACAAAATAGAAGTATCTCGCAGAGGCAATTAAAATGTTCTTGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACAAAATAGAAGTATCTCGCAGAGGCAATTAAAATGTTCTTGTT  750

seq1  TTCTATTAAAAAAATATGTTCATTGGTAACTGAGCCCAACAGGAAAGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTAAAAAAATATGTTCATTGGTAACTGAGCCCAACAGGAAAGTGT  800

seq1  AGGAGCAGTTGTCATGGTTGGCTTTGATAAGACCTAGAGATTTCATAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCAGTTGTCATGGTTGGCTTTGATAAGACCTAGAGATTTCATAATG  850

seq1  ATATTCCAATCAAATCCCCAAATGAGTCTGCTACAACTGTTATTCTTGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCAATCAAATCCCCAAATGAGTCTGCTACAACTGTTATTCTTGTC  900

seq1  ATCCATACACAGGCAAGGGTTCAGGAAGTGGACATGGTGCAAATGTAAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATACACAGGCAAGGGTTCAGGAAGTGGACATGGTGCAAATGTAAGT  950

seq1  GCCAACAGATGAAATTTGCTCTCCCCCTCCAGTCATGTAAAATGGGTAAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACAGATGAAATTTGCTCTCCCCCTCCAGTCATGTAAAATGGGTAAC  1000

seq1  TCAGAACAATAGGAATTC  1018
      ||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACAATAGGAATTC  1018


seq1: chr3_119610048_119611175
seq2: B6Ng01-291L04.g_67_1193

seq1  GAATTCTCTATGCCCAGTTCATTAGTTCTGCTATATTTTAATCTGTGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATGCCCAGTTCATTAGTTCTGCTATATTTTAATCTGTGCAG  50

seq1  GAAGTAAACCAGTTGCTGCGAGGTGAGTATCAATGGGTGGTTATATAGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAAACCAGTTGCTGCGAGGTGAGTATCAATGGGTGGTTATATAGGT  100

seq1  AAGATTGGCTTGTGGTCTTTCCTGTAAAGAATTGTCTTGATTACATATTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGGCTTGTGGTCTTTCCTGTAAAGAATTGTCTTGATTACATATTG  150

seq1  AAGTGGGAAGACCCACCTACTGTGGGTGGTGCTATTCCCTAGAGAGGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGGAAGACCCACCTACTGTGGGTGGTGCTATTCCCTAGAGAGGGAC  200

seq1  CTTGAACTGCATAAAAATGGAGAAGGTAAGCTGAACACCAGTAAGCATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACTGCATAAAAATGGAGAAGGTAAGCTGAACACCAGTAAGCATGC  250

seq1  ATTAATTTACTGCTCTCTGCTCTTGACTATGGATGTACCATGACTGGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTTACTGCTCTCTGCTCTTGACTATGGATGTACCATGACTGGAGA  300

seq1  CTAGATTCTTCAAGTTCCTGATACCTTAAATTCCTTGTAGTGAAGGAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTCTTCAAGTTCCTGATACCTTAAATTCCTTGTAGTGAAGGAGTG  350

seq1  TAACCTTGTGAGTCAGATATGCCTTTCCTTCCTAACATGCTTTAAGGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTTGTGAGTCAGATATGCCTTTCCTTCCTAACATGCTTTAAGGTAT  400

seq1  TTTATCACAGCATCAGGAAAATAATCTAAGACAATGAGATAGTGATGTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCACAGCATCAGGAAAATAATCTAAGACAATGAGATAGTGATGTTA  450

seq1  GATTTTATATAATATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  500
      ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTATATAA----TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  496

seq1  TCTATCTATCTATCTACCTACCTACCTACCTACCTACCTATCATCTACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATCTACCTACCTACCTACCTACCTACCTATCATCTACTT  546

seq1  TTGAGTCAGGACCTTACTGCTCTGGCTGTTTGATACTATGTAGATCAGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTCAGGACCTTACTGCTCTGGCTGTTTGATACTATGTAGATCAGGC  596

seq1  TGTCTGGAATTCAGAAATCTTCCTGCCTCTGCTTCCCAAGAGTTAGGGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGAATTCAGAAATCTTCCTGCCTCTGCTTCCCAAGAGTTAGGGCT  646

seq1  AACGATATACATCACCATACCTGGTAAGATTTTTTTTTTCAGATAACATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGATATACATCACCATACCTGGTAAGATTTTTTTTTTCAGATAACATG  696

seq1  ATGACTGAAGAAATAGCTCACCTGCAAAGGATACTTATTCTGGACTTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTGAAGAAATAGCTCACCTGCAAAGGATACTTATTCTGGACTTGCA  746

seq1  TACTCCAGGTTCAGATCATGAATCTTATATAAGGAGGTTGAATTTGCACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCAGGTTCAGATCATGAATCTTATATAAGGAGGTTGAATTTGCACA  796

seq1  AGTAATTTCTATGAACTTTCCCTGAGTCTCCCTCTCAGAGAGGGAGAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTTCTATGAACTTTCCCTGAGTCTCCCTCTCAGAGAGGGAGAGTC  846

seq1  ATTCTGTGTCTTTCTCACACACTGTAGTGCAGTGTACACATGTGTTTTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTGTCTTTCTCACACACTGTAGTGCAGTGTACACATGTGTTTTGT  896

seq1  GTGGGAGGATGCAATGGACATTTGGATGG-AGGCCAGAGGTTGATGGTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGGATGCAATGGACATTTGGATGGAAGGCCAGAGGTTGATGGTTT  946

seq1  AATGTTG-AATTCTATTTCCTCTACATGATTTGTGGGATAGATT-CCCTC  997
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2  AATGTTGAAATTCTATTTCCTCTACATGATTTGT-GGATAGATTCCCCTC  995

seq1  ACTTATCCTGGAGCTCAAAAACTTGG-CTAGGTTA-TATGGTCA-GTGAG  1044
      ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||
seq2  ACTTATCCT-GAGCTC-AAAACTTGGCCTAGGTTATTATGGTCAGGTGAG  1043

seq1  CTCCAGGGATC-TGACTGCTGCCACACCC-AGATAATATTGCAGAGATGT  1092
      |  || ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||
seq2  CCTCA-GGATCTTGACTGCTGCCACACCCAAGAATATATTGCAGAGATGT  1092

seq1  GCTGCTGTGCCTTGGCTTTTATGTGTGTGCTGGTTT  1128
      ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
seq2  GCTGCTGTGCCTT-GCTTTAATGTGGGTGCTGGTTT  1127


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |