BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-294P22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 120,050,789 - 120,208,160
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream gene2510027J23Rik, LOC435752, Tmem56, LOC668778, LOC668780, Alg14, Ppia-ps3_1234.1, Cnn3, Slc44a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-294P22.bB6Ng01-294P22.g
ACCGA090979GA090980
length7441,116
definitionB6Ng01-294P22.b B6Ng01-294P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,207,418 - 120,208,160)(120,050,789 - 120,051,901)
sequence
gaattctttgtacaatgctgcaccccattttaatagggttatttgggtct
ctggagtctaatttcttgagttctttgtataaattggatattagtcctct
attggatgtagggttggtaaagatcttttcccaatctgttcgttgccatt
ttgtcctattgacagtgtcctttgccttacagaagctttgtacttttatg
aggtcctgttatgccctaagttcacaggaaaccctgacaagcccaagaat
tgtgaagtctgctgcaacttgcaagcaaaagggtctttattttcaagttt
gaacttggtttgtccacctagcactcactttgaatgctggcaagcaaacc
tgaatccagaaaagattgagtttatatacagtatagttagaaatagtgtg
actatttacagaaaaggggagtagagggtagactagtactgaagcgggag
gggttttaatgggttcaagcactaattttatgaccaggtgtaactgttag
tgacctcacctctgtttaacttttactttttccatggtctcccttgagct
tgttatttctctaaggtctcaagaagaagcacctggagatttatcaggag
gcatgttggtctttggagacacagaggaggtgcccttctaacactagggg
aaggggagggagccctgggatgctcaggaggatgctgcacagactccagc
tgtatgcatatcctgcttgccttggggggggatgtaggatggga

gaattccaagaaaacacactgcaggaaaaaaaaaatccaagatgatccga
ccagcaaacccacaccttcctgagcaagaacagctggaatataggctggg
atataaataggaactagacagaagtggaaacatgaagaaagatacccagc
agagccaaagatgcatcttagaatcctacaccaccccaaaatgaacaagt
cattaaacaggccatgctgaaagacatggcctttacccagtgggacagca
gctggcgaagcaggtgggtggcatacaactcacctgttatgtgctcctga
agtaaactaggctgcagaagagactgcacatttagaagaaagtaaccctt
gagggtaatgaatgtgatgtctttgacctttgctggcttaaaagatgcag
gcaccccactaagagctctatgagagccagggcattaccaagtacaggaa
actgaagctcactcaggacagctactcaatcaatatgcattcaatagaca
tcaaggaaagaatggggaaagaacgccccagacttgagtgaggaaatatg
gcagaacatgtgagcaagcttttctccgggcaaaggcaagtcaacagaaa
aacagaagttatctacaaagcagaggataatgctaggtgaatattgaagg
aaagccgagacatttctacgttgttgttttaaatgtagaatgagggaaat
taaagcattctgatgagaacagaaatgtaataaaacatggaagaaggaaa
gcagccactagcattccattgccaagcatcccccccccacaagtccacag
tgcctgtgggtctgtaaagggcaccgagatgaaccactctggagaaggtt
tcaagtagtgtctgctttactgtatgtgaacaactgcgttatacagtaga
gcctctctaccgtgattgggttagcacattatctcagattgggcagtgaa
cggtcataccaccaccatctctatgctaaagagggcataaaagacagcac
agactcatcagcttactagctaccagctattcacattagtcagattccat
gtttcttgactctggaatactgggagcactatattgcccatgcttcttta
atttagaaaaccacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_120207418_120208160
seq2: B6Ng01-294P22.b_48_791 (reverse)

seq1  TCCCATCCTACAT-CCCCCCCAAGGCAAGCAGGATATGCATACAGCTGGA  49
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATCCTACATCCCCCCCCAAGGCAAGCAGGATATGCATACAGCTGGA  50

seq1  GTCTGTGCAGCATCCTCCTGAGCATCCCAGGGCTCCCTCCCCTTCCCCTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGCAGCATCCTCCTGAGCATCCCAGGGCTCCCTCCCCTTCCCCTA  100

seq1  GTGTTAGAAGGGCACCTCCTCTGTGTCTCCAAAGACCAACATGCCTCCTG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAGAAGGGCACCTCCTCTGTGTCTCCAAAGACCAACATGCCTCCTG  150

seq1  ATAAATCTCCAGGTGCTTCTTCTTGAGACCTTAGAGAAATAACAAGCTCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATCTCCAGGTGCTTCTTCTTGAGACCTTAGAGAAATAACAAGCTCA  200

seq1  AGGGAGACCATGGAAAAAGTAAAAGTTAAACAGAGGTGAGGTCACTAACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGACCATGGAAAAAGTAAAAGTTAAACAGAGGTGAGGTCACTAACA  250

seq1  GTTACACCTGGTCATAAAATTAGTGCTTGAACCCATTAAAACCCCTCCCG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACACCTGGTCATAAAATTAGTGCTTGAACCCATTAAAACCCCTCCCG  300

seq1  CTTCAGTACTAGTCTACCCTCTACTCCCCTTTTCTGTAAATAGTCACACT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTACTAGTCTACCCTCTACTCCCCTTTTCTGTAAATAGTCACACT  350

seq1  ATTTCTAACTATACTGTATATAAACTCAATCTTTTCTGGATTCAGGTTTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTAACTATACTGTATATAAACTCAATCTTTTCTGGATTCAGGTTTG  400

seq1  CTTGCCAGCATTCAAAGTGAGTGCTAGGTGGACAAACCAAGTTCAAACTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCAGCATTCAAAGTGAGTGCTAGGTGGACAAACCAAGTTCAAACTT  450

seq1  GAAAATAAAGACCCTTTTGCTTGCAAGTTGCAGCAGACTTCACAATTCTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATAAAGACCCTTTTGCTTGCAAGTTGCAGCAGACTTCACAATTCTT  500

seq1  GGGCTTGTCAGGGTTTCCTGTGAACTTAGGGCATAACAGGACCTCATAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTGTCAGGGTTTCCTGTGAACTTAGGGCATAACAGGACCTCATAAA  550

seq1  AGTACAAAGCTTCTGTAAGGCAAAGGACACTGTCAATAGGACAAAATGGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACAAAGCTTCTGTAAGGCAAAGGACACTGTCAATAGGACAAAATGGC  600

seq1  AACGAACAGATTGGGAAAAGATCTTTACCAACCCTACATCCAATAGAGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGAACAGATTGGGAAAAGATCTTTACCAACCCTACATCCAATAGAGGA  650

seq1  CTAATATCCAATTTATACAAAGAACTCAAGAAATTAGACTCCAGAGACCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATATCCAATTTATACAAAGAACTCAAGAAATTAGACTCCAGAGACCC  700

seq1  AAATAACCCTATTAAAATGGGGTGCAGCATTGTACAAAGAATTC  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACCCTATTAAAATGGGGTGCAGCATTGTACAAAGAATTC  744


seq1: chr3_120050789_120051901
seq2: B6Ng01-294P22.g_66_1181

seq1  GAATTCCAAGAAAACACACTGCAGGAAAAAAAAAATCCAAGATGATCCGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGAAAACACACTGCAGGAAAAAAAAAATCCAAGATGATCCGA  50

seq1  CCAGCAAACCCACACCTTCCTGAGCAAGAACAGCTGGAATATAGGCTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAAACCCACACCTTCCTGAGCAAGAACAGCTGGAATATAGGCTGGG  100

seq1  ATATAAATAGGAACTAGACAGAAGTGGAAACATGAAGAAAGATACCCAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAATAGGAACTAGACAGAAGTGGAAACATGAAGAAAGATACCCAGC  150

seq1  AGAGCCAAAGATGCATCTTAGAATCCTACACCACCCCAAAATGAACAAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAAAGATGCATCTTAGAATCCTACACCACCCCAAAATGAACAAGT  200

seq1  CATTAAACAGGCCATGCTGAAAGACATGGCCTTTACCCAGTGGGACAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAACAGGCCATGCTGAAAGACATGGCCTTTACCCAGTGGGACAGCA  250

seq1  GCTGGCGAAGCAGGTGGGTGGCATACAACTCACCTGTTATGTGCTCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCGAAGCAGGTGGGTGGCATACAACTCACCTGTTATGTGCTCCTGA  300

seq1  AGTAAACTAGGCTGCAGAAGAGACTGCACATTTAGAAGAAAGTAACCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAACTAGGCTGCAGAAGAGACTGCACATTTAGAAGAAAGTAACCCTT  350

seq1  GAGGGTAATGAATGTGATGTCTTTGACCTTTGCTGGCTTAAAAGATGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGTAATGAATGTGATGTCTTTGACCTTTGCTGGCTTAAAAGATGCAG  400

seq1  GCACCCCACTAAGAGCTCTATGAGAGCCAGGGCATTACCAAGTACAGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCCACTAAGAGCTCTATGAGAGCCAGGGCATTACCAAGTACAGGAA  450

seq1  ACTGAAGCTCACTCAGGACAGCTACTCAATCAATATGCATTCAATAGACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAGCTCACTCAGGACAGCTACTCAATCAATATGCATTCAATAGACA  500

seq1  TCAAGGAAAGAATGGGGAAAGAACGCCCCAGACTTGAGTGAGGAAATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGAAAGAATGGGGAAAGAACGCCCCAGACTTGAGTGAGGAAATATG  550

seq1  GCAGAACATGTGAGCAAGCTTTTCTCCGGGCAAAGGCAAGTCAACAGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACATGTGAGCAAGCTTTTCTCCGGGCAAAGGCAAGTCAACAGAAA  600

seq1  AACAGAAGTTATCTACAAAGCAGAGGATAATGCTAGGTGAATATTGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAGTTATCTACAAAGCAGAGGATAATGCTAGGTGAATATTGAAGG  650

seq1  AAAGCCGAGACATTTCTACGTTGTTGTTTTAAATGTAGAATGAGGGAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCGAGACATTTCTACGTTGTTGTTTTAAATGTAGAATGAGGGAAAT  700

seq1  TAAAGCATTCTGATGAGAACAGAAATGTAATAAAACATGGAAGAAGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCATTCTGATGAGAACAGAAATGTAATAAAACATGGAAGAAGGAAA  750

seq1  GCAGCCACTAGCATTCCATTGCCAAGCATCCCCCCCCCACAAGTCCACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCACTAGCATTCCATTGCCAAGCATCCCCCCCCCACAAGTCCACAG  800

seq1  TGCCTGTGGGTCTGTAAAGGGCACCGAGATGAACCACTCTGGAGAAGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTGGGTCTGTAAAGGGCACCGAGATGAACCACTCTGGAGAAGGTT  850

seq1  TCAAGTAGTGTCTGCTTTACTGTATGTGAACAACTGCG-TATACAGTAGA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TCAAGTAGTGTCTGCTTTACTGTATGTGAACAACTGCGTTATACAGTAG-  899

seq1  AGCCTCTCTACCGTGATT-GGTTAGCACATTATCTCAGATTGGGCAGTGA  948
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTCTACCGTGATTGGGTTAGCACATTATCTCAGATTGGGCAGTGA  949

seq1  ACGGTCATACCACCACCATCTCTATGCTAAAGAGGGCATAAAAGACAAGC  998
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ACGGTCATACCACCACCATCTCTATGCTAAAGAGGGCATAAAAGAC-AGC  998

seq1  ACAGACTCATCAGCCTACTAGCTACCAGCTATTCACATTAGTCCAGAATT  1048
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
seq2  ACAGACTCATCAGCTTACTAGCTACCAGCTATTCACATTAGT-CAG-ATT  1046

seq1  CCATGTT--CTGACTTCTGGGAATACTTGGGAGCACTATAT--GCCATGC  1094
      |||||||   |||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||
seq2  CCATGTTTCTTGAC-TCT-GGAATAC-TGGGAGCACTATATTGCCCATGC  1093

seq1  TTCTT--ATTTAGAAA--CACAG  1113
      |||||  |||||||||  |||||
seq2  TTCTTTAATTTAGAAAACCACAG  1116


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |