BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-303M24
Chromosome3 (Build37)
Map Location 119,823,935 - 119,950,295
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpyd, LOC100043275, LOC100043278, Ptbp2
Downstream gene2510027J23Rik, LOC435752, Tmem56
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-303M24.bB6Ng01-303M24.g
ACCGA097522GA097523
length1,0531,114
definitionB6Ng01-303M24.b B6Ng01-303M24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,823,935 - 119,824,994)(119,949,190 - 119,950,295)
sequence
gaattctttgttcagttctgagccccattttttaagggggttatttgatt
ttctgaggtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtccc
ctatctgatttaggataggtaaagatcttaatagactcttaggaaactga
caggccttaagtacaaagaattccagacagcactgctccgaagctgctgt
aaagaacataggacacaccattagtcatacaggggttgagggtcccaata
tttaaggtccatttgggagctatagcactgacaaacacccctactgctat
ctgttgctggctactgccaccactctcttctcttggaggctgacagttac
aatacttgctaaggggtatggggctacaattggctgaagcagagggcaat
aagccttccacttgactatttagatccataattgtttgtgctttagagcc
tcaagatataagctcctagctatcaagacttagggctgtgatactttctg
tctgcaagtccaggacttatgccttgggaactcagtgctctaagactgtt
gaatcttcaagagcttctctttgcttactcatgattttaatcattagaga
aaaaggactccaggcagctcagtagtaacaagtggaaaatttgatgaatc
agacactaaatatctctagactacataacactagcggtcttatagtcaaa
gatttaggaaacaccagggtgcaaaagctagccaagagctcagtttcaga
cgctaaatactcaaggatgtatcaaggcataactttctccaaacttttgc
tatggttaactttagtgttgtctaagactccatataacatctctgtcttc
aatgggtactgctaatacccttagaatgcagtagggtaccaccaatcaaa
aaggatgtttgtgcactgaagtaactgggatgcctcataagtttccaaat
atccttaatggtgtgctcaaaaatcaagaactcacagtctgatctctctg
tgtgcataatagcagactctctctctctctctctctctctctctctctct
cta
gaattctggacaagtattttgaaccaaggttctgaactagatccagtagt
gtccattgagaagaatcttgtccttacagtacatttttgttttgttttgc
ttgttctgtgaaggagctaattggtaaagggaaaagaaatcttgcacttt
tggtgtaaatatatatgtgacaggaaaggaattgatggcagagtggatta
agtcttgattttctgattgtatactttagtcctagaagtcagaacctata
caagtaccaacagacatccaaaaaacccaagggataaaccaggcatccaa
aatgaacatgaggagctaaagccagatttactttaaagagattggtggtt
catcacgaaatacatatgtcttgataacactatcaggatatttttaaaaa
cgagtctctatgcaaatataatcttgaccaaaatcagaaggaaaataaaa
ttaattccatttaccccaaaggctgtttgtcccacactgcacacatgttt
gaagtgctgtcaggtatatttccccaattcttttttgaaatttgctgtgg
ccaataaacacctagccttgttttctcagtgaaggactagctgatttgca
ttcttacagctacctggcttgcagagtgtattaacatttatttgctattt
gtatcttaaaagacaaatagtaaattctgtaatgcaattctttaggcctg
ttttctcatgagaagtgtgaaacattttattttcaaagggtttttttttt
tctatgtctgtgcattcaatcattccttcatttgtccatttatttgacat
agaatctagctgcatagctcaggtactcactatgttctcaggctaggagg
tgtcaaaaaattgtaccccaatttactatgtccatgatgggcagacacct
acttttgtgattccatttttgttttgctttgcagtactggcgttgaactc
aaggtatgaagtaccactgggctataccaccagtgccattttttgtgatt
ccaggtagattcacatattaaaaaaaaaataacatcttgctaatccttac
tggtttaaggtacaatgcctcagaaccttaataaaacaccaggaattttc
gaataggtatttgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_119823935_119824994
seq2: B6Ng01-303M24.b_44_1095

seq1  GAATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAAGGGGGTTATTTGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAAGGGGGTTATTTGATT  50

seq1  TTCTGAGGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCC  100

seq1  CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCTTAATAGACTCTTAGGAAACTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCTTAATAGACTCTTAGGAAACTGA  150

seq1  CAGGCCTTAAGTACAAAGAATTCCAGACAGCACTGCTCCGAAGCTGCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTTAAGTACAAAGAATTCCAGACAGCACTGCTCCGAAGCTGCTGT  200

seq1  AAAGAACATAGGACACACCATTAGTCATACAGGGGTTGAGGGTCCCAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACATAGGACACACCATTAGTCATACAGGGGTTGAGGGTCCCAATA  250

seq1  TTTAAGGTCCATTTGGGAGCTATAGCACTGACAAACACCCCTACTGCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGTCCATTTGGGAGCTATAGCACTGACAAACACCCCTACTGCTAT  300

seq1  CTGTTGCTGGCTACTGCCACCACTCTCTTCTCTTGGAGGCTGACAGTTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGCTGGCTACTGCCACCACTCTCTTCTCTTGGAGGCTGACAGTTAC  350

seq1  AATACTTGCTAAGGGGTATGGGGCTACAATTGGCTGAAGCAGAGGGCAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTGCTAAGGGGTATGGGGCTACAATTGGCTGAAGCAGAGGGCAAT  400

seq1  AAGCCTTCCACTTGACTATTTAGATCCATAATTGTTTGTGCTTTAGAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTCCACTTGACTATTTAGATCCATAATTGTTTGTGCTTTAGAGCC  450

seq1  TCAAGATATAAGCTCCTAGCTATCAAGACTTAGGGCTGTGATACTTTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATATAAGCTCCTAGCTATCAAGACTTAGGGCTGTGATACTTTCTG  500

seq1  TCTGCAAGTCCAGGACTTATGCCTTGGGAACTCAGTGCTCTAAGACTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAGTCCAGGACTTATGCCTTGGGAACTCAGTGCTCTAAGACTGTT  550

seq1  GAATCTTCAAGAGCTTCTCTTTGCTTACTCATGATTTTAATCATTAGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTTCAAGAGCTTCTCTTTGCTTACTCATGATTTTAATCATTAGAGA  600

seq1  AAAAGGACTCCAGGCAGCTCAGTAGTAACAAGTGGAAAATTTGATGAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGACTCCAGGCAGCTCAGTAGTAACAAGTGGAAAATTTGATGAATC  650

seq1  AGACACTAAATATCTCTAGACTACATAACACTAGCGGTCTTATAGTCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTAAATATCTCTAGACTACATAACACTAGCGGTCTTATAGTCAAA  700

seq1  GATTTAGGAAACACCAGGGTGCAAAAGCTAGCCAAGAGCTCAGTTTCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAGGAAACACCAGGGTGCAAAAGCTAGCCAAGAGCTCAGTTTCAGA  750

seq1  CGCTAAATACTCAAGGATGTATCAAGGCATAACTTTCTCCAAACTTTTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTAAATACTCAAGGATGTATCAAGGCATAACTTTCTCCAAACTTTTGC  800

seq1  TATGGTTAACTTTAGTGTTGTCTAAGACTCCATATAACATCTCTGTCTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTTAACTTTAGTGTTGTCTAAGACTCCATATAACATCTCTGTCTTC  850

seq1  AATGGGTACTGCTAATACCCTTAGAATGCAGTAGGGTACCACCAATCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGTACTGCTAATACCCTTAGAATGCAGTAGGGTACCACCAATCAAA  900

seq1  AAGGATGTTTGTGCACTGAAGTAACTGGGATGCCTCATAAGTTTCCAAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATGTTTGTGCACTGAAGTAACTGGGATGCCTCATAAGTTTCCAAAT  950

seq1  ATCCTTAATGGTGTTGCTCAAAAATCAAAGAAACTCAACAAGTCCTGAAT  1000
      ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||   ||| ||| ||
seq2  ATCCTTAATGGTG-TGCTCAAAAATCAA--GAACTCA--CAGT-CTG-AT  993

seq1  CTCTTCTGTGTGCATAATAGCAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  1050
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTC-TCTGTGTGCATAATAGCAGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  1042

seq1  CTCTCTCTCT  1060
      ||||||||||
seq2  CTCTCTCTCT  1052

seq1: chr3_119949190_119950295
seq2: B6Ng01-303M24.g_67_1180 (reverse)

seq1  GCAAATACCTATTTGAAAAT--CT-GTGTTTTATTAA-GTTCTGA-GCAT  45
      ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||
seq2  GCAAATACCTATTCGAAAATTCCTGGTGTTTTATTAAGGTTCTGAGGCAT  50

seq1  TGTACTTTAAA-CAGTAAGGA-TAGCAAGATGTTA-TTTTTTTTTAATAT  92
      ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGTACCTTAAACCAGTAAGGATTAGCAAGATGTTATTTTTTTTTTAATAT  100

seq1  GTGAATTCTTACTTGGAATCAC-AAAAATGGCACTGGTGGTATAGCCCAG  141
      ||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAT--CTACCTGGAATCACAAAAAATGGCACTGGTGGTATAGCCCAG  148

seq1  T-GTACTTCATACCCTGAGTTCAACGCCCAGTACTGCAAAGCAAAACAAA  190
      | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACTTCATACCTTGAGTTCAACG-CCAGTACTGCAAAGCAAAACAAA  197

seq1  AATGGAATCACAAAAGTAGGTGTCTGCCCATCATGGACATAGTAAATTGG  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAATCACAAAAGTAGGTGTCTGCCCATCATGGACATAGTAAATTGG  247

seq1  GGTACAATTTTTTGACACCTCCTAGCCTGAGAACATAGTGAGTACCTGAG  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACAATTTTTTGACACCTCCTAGCCTGAGAACATAGTGAGTACCTGAG  297

seq1  CTATGCAGCTAGATTCTATGTCAAATAAATGGACAAATGAAGGAATGATT  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCAGCTAGATTCTATGTCAAATAAATGGACAAATGAAGGAATGATT  347

seq1  GAATGCACAGACATAG-AAAAAAAAAACCCTTTGAAAATAAAATGTTTCA  389
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCACAGACATAGAAAAAAAAAAACCCTTTGAAAATAAAATGTTTCA  397

seq1  CACTTCTCATGAGAAAACAGGCCTAAAGAATTGCATTACAGAATTTACTA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTCATGAGAAAACAGGCCTAAAGAATTGCATTACAGAATTTACTA  447

seq1  TTTGTCTTTTAAGATACAAATAGCAAATAAATGTTAATACACTCTGCAAG  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTTTTAAGATACAAATAGCAAATAAATGTTAATACACTCTGCAAG  497

seq1  CCAGGTAGCTGTAAGAATGCAAATCAGCTAGTCCTTCACTGAGAAAACAA  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTAGCTGTAAGAATGCAAATCAGCTAGTCCTTCACTGAGAAAACAA  547

seq1  GGCTAGGTGTTTATTGGCCACAGCAAATTTCAAAAAAGAATTGGGGAAAT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGGTGTTTATTGGCCACAGCAAATTTCAAAAAAGAATTGGGGAAAT  597

seq1  ATACCTGACAGCACTTCAAACATGTGTGCAGTGTGGGACAAACAGCCTTT  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTGACAGCACTTCAAACATGTGTGCAGTGTGGGACAAACAGCCTTT  647

seq1  GGGGTAAATGGAATTAATTTTATTTTCCTTCTGATTTTGGTCAAGATTAT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTAAATGGAATTAATTTTATTTTCCTTCTGATTTTGGTCAAGATTAT  697

seq1  ATTTGCATAGAGACTCGTTTTTAAAAATATCCTGATAGTGTTATCAAGAC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCATAGAGACTCGTTTTTAAAAATATCCTGATAGTGTTATCAAGAC  747

seq1  ATATGTATTTCGTGATGAACCACCAATCTCTTTAAAGTAAATCTGGCTTT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATTTCGTGATGAACCACCAATCTCTTTAAAGTAAATCTGGCTTT  797

seq1  AGCTCCTCATGTTCATTTTGGATGCCTGGTTTATCCCTTGGGTTTTTTGG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCTCATGTTCATTTTGGATGCCTGGTTTATCCCTTGGGTTTTTTGG  847

seq1  ATGTCTGTTGGTACTTGTATAGGTTCTGACTTCTAGGACTAAAGTATACA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGTTGGTACTTGTATAGGTTCTGACTTCTAGGACTAAAGTATACA  897

seq1  ATCAGAAAATCAAGACTTAATCCACTCTGCCATCAATTCCTTTCCTGTCA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAAAATCAAGACTTAATCCACTCTGCCATCAATTCCTTTCCTGTCA  947

seq1  CATATATATTTACACCAAAAGTGCAAGATTTCTTTTCCCTTTACCAATTA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATATTTACACCAAAAGTGCAAGATTTCTTTTCCCTTTACCAATTA  997

seq1  GCTCCTTCACAGAACAAGCAAAACAAAACAAAAATGTACTGTAAGGACAA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTTCACAGAACAAGCAAAACAAAACAAAAATGTACTGTAAGGACAA  1047

seq1  GATTCTTCTCAATGGACACTACTGGATCTAGTTCAGAACCTTGGTTCAAA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTCTCAATGGACACTACTGGATCTAGTTCAGAACCTTGGTTCAAA  1097

seq1  ATACTTGTCCAGAATTC  1106
      |||||||||||||||||
seq2  ATACTTGTCCAGAATTC  1114