BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305G21
Chromosome3 (Build37)
Map Location 69,380,772 - 69,381,943
singlet/doubletsinglet
Overlap geneB3galnt1
Upstream geneSchip1, Il12a, LOC639530, 1110032F04Rik, Ift80, Smc4, Trim59, LOC667272, Kpna4, Arl14, Ppm1l, LOC667309
Downstream geneRpl32-ps, Nmd3, LOC100041334, 1110032A04Rik, Gm414, LOC100041384, LOC625868, LOC670542
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305G21.bB6Ng01-305G21.g
ACCGA098723GA098724
length791,179
definitionB6Ng01-305G21.b B6Ng01-305G21.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
ctactacattgtaagccaggttaaaagcccatggcataggccctaaggac
agggtgggtggtgggggtgggataggttc
gaattctctatgcacatatgcagagcaaggcatccacaaggatgtgctga
ctgagtcagcgcttatgtgtttggggccgccagaagagcttcctcttacc
ttctggatcactagattacaaatgtgatggtttggatttcctgtcttgtt
ttgtaataaaaacaaagcaaaaacgctggattttgtgcctgtgcagtgcc
aagtcccactaagtggaggtgaccttatgctagaggttgggagcccaaga
gttagcctgtcctggctttccaccagaggtgtgaccatctacaagtcaga
cattgctctcagttaatgttctcaattattttcatacatatcctttcaag
ccaggggatgcttggaaaagctcatttggatcggcagatatcacacagta
tcttacccacaagcaccagcacaccttgctcagagaggtgggttttactg
tacctattttataagtgaattttagagtattcacatgaaatataaagaat
attttcaaaaatactaggactcgggatccacctgtgcctgcctctcctct
gccttcagctccagagtgctgggatcaaaggcatgtgccactgtgcctgg
ctattgaggatctattttaatatgatggaaactaaggaggagtggaatgc
aagacgcaaaggtaaagtaggagactatgaaatcataccgaggactctaa
tcacagctacaagaaaagaaaaaggcaagaacaaaaatagttttcccatg
gagccagagtcgtggttctcaacctgtgggccatgaccccgggggagtca
catgggtcacctgagactattggaaaacattgatgcttacatcacaaatg
ctaatggcagcaagatttcagatatgaagtagcaaaactaatcatttcat
ggttggggaccagcccagcatgaggtgttgaaggctatggtagaggtggt
agtcagatgacggctcagctggtcaaacacaggagccgcacacatgcgag
caggtcctcaagctgcaacattcccaccatcctgttcctgaggaggcaga
aacaggaagatcctctgggcaatttgtgcctgttcaatcagtggagcact
agacctccagtgagagagaacagagttctcaaaaagtaatgtaacgcaat
gctgtaattcacggcgaatggctttgctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_69380772_69381943
seq2: B6Ng01-305G21.g_68_1246

seq1  GAATTCTCTATGCACATATGCAGAGCAAGGCATCCACAAGGATGTGCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTATGCACATATGCAGAGCAAGGCATCCACAAGGATGTGCTGA  50

seq1  CTGAGTCAGCGCTTATGTGTTTGGGGCCGCCAGAAGAGCTTCCTCTTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCAGCGCTTATGTGTTTGGGGCCGCCAGAAGAGCTTCCTCTTACC  100

seq1  TTCTGGATCACTAGATTACAAATGTGATGGTTTGGATTTCCTGTCTTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGATCACTAGATTACAAATGTGATGGTTTGGATTTCCTGTCTTGTT  150

seq1  TTGTAATAAAAACAAAGCAAAAACGCTGGATTTTGTGCCTGTGCAGTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATAAAAACAAAGCAAAAACGCTGGATTTTGTGCCTGTGCAGTGCC  200

seq1  AAGTCCCACTAAGTGGAGGTGACCTTATGCTAGAGGTTGGGAGCCCAAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCCACTAAGTGGAGGTGACCTTATGCTAGAGGTTGGGAGCCCAAGA  250

seq1  GTTAGCCTGTCCTGGCTTTCCACCAGAGGTGTGACCATCTACAAGTCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCCTGTCCTGGCTTTCCACCAGAGGTGTGACCATCTACAAGTCAGA  300

seq1  CATTGCTCTCAGTTAATGTTCTCAATTATTTTCATACATATCCTTTCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTCTCAGTTAATGTTCTCAATTATTTTCATACATATCCTTTCAAG  350

seq1  CCAGGGGATGCTTGGAAAAGCTCATTTGGATCGGCAGATATCACACAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGATGCTTGGAAAAGCTCATTTGGATCGGCAGATATCACACAGTA  400

seq1  TCTTACCCACAAGCACCAGCACACCTTGCTCAGAGAGGTGGGTTTTACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCCACAAGCACCAGCACACCTTGCTCAGAGAGGTGGGTTTTACTG  450

seq1  TACCTATTTTATAAGTGAATTTTAGAGTATTCACATGAAATATAAAGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATTTTATAAGTGAATTTTAGAGTATTCACATGAAATATAAAGAAT  500

seq1  ATTTTCAAAAATACTAGGACTCGGGATCCACCTGTGCCTGCCTCTCCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCAAAAATACTAGGACTCGGGATCCACCTGTGCCTGCCTCTCCTCT  550

seq1  GCCTTCAGCTCCAGAGTGCTGGGATCAAAGGCATGTGCCACTGTGCCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCAGCTCCAGAGTGCTGGGATCAAAGGCATGTGCCACTGTGCCTGG  600

seq1  CTATTGAGGATCTATTTTAATATGATGGAAACTAAGGAGGAGTGGAATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGAGGATCTATTTTAATATGATGGAAACTAAGGAGGAGTGGAATGC  650

seq1  AAGACGCAAAGGTAAAGTAGGAGACTATGAAATCATACCGAGGACTCTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACGCAAAGGTAAAGTAGGAGACTATGAAATCATACCGAGGACTCTAA  700

seq1  TCACAGCTACAAGAAAAGAAAAAGGCAAGAACAAAAATAGTTTTCCCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGCTACAAGAAAAGAAAAAGGCAAGAACAAAAATAGTTTTCCCATG  750

seq1  GAGCCAGAGTCGTGGTTCTCAACCTGTGGGCCATGACCCCGGGGGAGTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGAGTCGTGGTTCTCAACCTGTGGGCCATGACCCCGGGGGAGTCA  800

seq1  CATGGGTCACCTGAGACTATTGGAAAACATTGATGCTTACATCACAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGTCACCTGAGACTATTGGAAAACATTGATGCTTACATCACAAATG  850

seq1  CTAATGGCAGCAAGATTTCAGATATGAAGTAGCAAAACTAATCATTTCAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGGCAGCAAGATTTCAGATATGAAGTAGCAAAACTAATCATTTCAT  900

seq1  GGTTGGGGACCAGCCCAGCATGAGGTGTTGAAGGCTATGGTAGAGGTGGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGGGACCAGCCCAGCATGAGGTGTTGAAGGCTATGGTAGAGGTGGT  950

seq1  AGTCAGATGACGGCTCAGCTGGTCAAACACAGGAGCCGCACACATGCGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGATGACGGCTCAGCTGGTCAAACACAGGAGCCGCACACATGCGAG  1000

seq1  CAGGGTCCTCAAGCTGC-ACATTCCCACCATCCTGTCCCTGAGGAGGCAG  1049
      || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CA-GGTCCTCAAGCTGCAACATTCCCACCATCCTGTTCCTGAGGAGGCAG  1049

seq1  AGACAGGAGGAT-CTCT-GGCATTTGTTGGCTGGTC-ATCAGT-GAGCAC  1095
      | |||||| ||| |||| |||| ||  || ||| || |||||| ||||||
seq2  AAACAGGAAGATCCTCTGGGCAATTTGTGCCTGTTCAATCAGTGGAGCAC  1099

seq1  TAGAC--TCAGTGAGAG---ACAGAG-TCTCAAAAAAGTAATGTAGAAGG  1139
      |||||   |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||  || |
seq2  TAGACCTCCAGTGAGAGAGAACAGAGTTCTC-AAAAAGTAATGT--AACG  1146

seq1  CAATGCTGTAATTCAGCGGCAGATGGC-TTGCTG  1172
      ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||
seq2  CAATGCTGTAATTCA-CGGCGAATGGCTTTGCTG  1179