BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-305J08
Chromosome3 (Build37)
Map Location 140,922,078 - 141,055,676
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC621343, 4930590L14Rik, Pdha2
Downstream geneUnc5c, LOC100039923, Bmpr1b, Gabarapl2-ps3, Pdlim5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305J08.bB6Ng01-305J08.g
ACCGA098839GA098840
length430486
definitionB6Ng01-305J08.b B6Ng01-305J08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,055,241 - 141,055,676)(140,922,078 - 140,922,570)
sequence
tccttataattgcaatgataccacctgaatgtgcctgtgcacacagtgat
ggcaaagctcattatttctgacagtatctctcacttctagcaaagtatcg
gccacatggagcttggaagatgagatgtctctttccataatatcctgccc
cttcttaacgcgctctacatagggcttctttctgatccttacattcctga
gttctctactgctgtatcatttcccattacccttctctttgttgggatgc
taactcaacaccttccaagattcctctgtctcttgggtgcatcttaataa
tgcacctcaccctcagatacagataacttacttcaagatggagttctgtt
tcacatgcagattctgtgtgtaattttcaggacaaagcaaaggctttgtt
tggtaagttctttgtgtgtgtgtgtgtgtg

tatacaaatatatatgtatgcttttatattatttatataatatataacta
tatatatagttacacatatacatgatatattatgtatacatgtttatgtg
cataaatatatagtataatatatagagtatatataatatagagttataga
gttatatattttatgttattacatacttatatagagttatatatatcata
ttcatagtatatattgttttatatcatgtatatgatatagctatatagtt
ctatatatatagttatattagctatataagtagttatatattagctatat
tgttatatatgtaattatgtttatatgattatatagttgtagattatcta
ctttagctgcatgtgactttttttttttttttttagaatcctttcccttc
ccctaacatgtttattttctccaacacaatcacttccttccttgttcttc
tactcgtttaacctagggaatggatcatgcgaactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_141055241_141055676
seq2: B6Ng01-305J08.b_43_478 (reverse)

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGGGAAATGATACAGCAGTAGAGAACTCAGGAATGTAAGGATCAGA  250

seq1  AAGAAGCCCTATGTAGAGCGCGTTAAGAAGGGGCAGGATATTATGGAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGACATCTCATCTTCCAAGCTCCATGTGGCCGATACTTTGCTAGAAGTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATCTCATCTTCCAAGCTCCATGTGGCCGATACTTTGCTAGAAGTGA  350

seq1  GAGATACTGTCAGAAATAATGAGCTTTGCCATCACTGTGTGCACAGGCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATACTGTCAGAAATAATGAGCTTTGCCATCACTGTGTGCACAGGCAC  400

seq1  ATTCAGGTGGTATCATTGCAATTATAAGGAGAATTC  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGGTGGTATCATTGCAATTATAAGGAGAATTC  436


seq1: chr3_140922078_140922570
seq2: B6Ng01-305J08.g_67_558

seq1  GAATTCTATACAAATATATATGTATGCTTTTATATTATTTATATAATATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAACTATATATATAGTTACACATATACATGATATATTATGTATACATGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGCATAAATATATAGTATAATATATAGAGTATATATAATATAGAGT  150

seq1  TATAGAGTTATATATTTTATGTTATTACATACTTATATAGAGTTATATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAGTTATATATTTTATGTTATTACATACTTATATAGAGTTATATAT  200

seq1  ATCATATTCATAGTATATATTGTTTTATATCATGTATATGATATAGCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CTATATTGTTATATATGTAATTATGTTTATATGATTATATAGTTGTAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATTGTTATATATGTAATTATGTTTATATGATTATATAGTTGTAGAT  350

seq1  TATCTACTTTAGCTGCATGTGACTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAATCCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTACTTTAGCTGCATGTGACTTTTTTTTTTTTTTTTTAGAATCCTTT  400

seq1  CCCTTCCCCTAACATGCTTATTCTCTCCAACACAATCACTTCCTTCTTTG  450
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCCTTCCCCTAACATGTTTATTTTCTCCAACACAATCACTTCCTTCCTTG  450

seq1  TTCTTCTTACTCGTTTAACCTAGGGCATGGATCATGCGAACAT  493
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
seq2  TTCTTC-TACTCGTTTAACCTAGGGAATGGATCATGCGAACTT  492


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