BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-306G08
Chromosome3 (Build37)
Map Location 121,189,243 - 121,345,306
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc44a3, A730020M07Rik
Upstream gene2510027J23Rik, LOC435752, Tmem56, LOC668778, LOC668780, Alg14, Ppia-ps3_1234.1, Cnn3
Downstream gene4930432M17Rik, F3, Abcd3, LOC100043298, Arhgap29, Abca4, EG668788, LOC626807, LOC100043724, Gclm, Ppia-ps3_1245.1, Dnttip2, LOC675117, LOC100043726, Bcar3, Fnbp1l, Ppia-ps3_2252.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-306G08.bB6Ng01-306G08.g
ACCGA099446GA099447
length3501,099
definitionB6Ng01-306G08.b B6Ng01-306G08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(121,189,243 - 121,189,592)(121,344,212 - 121,345,306)
sequence
acctcttgaccaagcactgcgctgctgagctcagtcaggtccaggcacat
agagagaagacagagagggtaagcagaggtaagaaagaggaggactgctt
ccatttgtgggtctatgtatgggtaaatgtgtgtggggatacgggtgact
gggtgcagggtgggtgcagtatgggcggcagggtgccggataagatgggg
tagagtaggggattcctagagcacttctcactctctcactcttttttttt
ttttaagatttattttattttatgtatgtgagtacactgtagctgtacag
atggttgtgagccttcatgtggttgttgggaattgaatttttaagacctc

gaattcaatgggaacttgggatagaggcaagcagaggagagagtgggagc
gggcagggagatcagagagaaaagaaaggtggcaagcctcaaggtagagc
ggctgacaagcacagaacaggggagcactttagagtgtgaaggaactcgt
cctgactgacccactggggttggagcagcttctgagtggaaactgagggg
caaaggtacgcttcacaccagtcatggtgaggcaaaacaaaaggcatctg
tgggatgaagaggaaggcagagagagacactgaaggaatttagtggcagc
aggaagagccaccgctaagcacaaacgggctccttagcaatggaggatgc
cttgcgtggtgtgtttcacaggacgtagagtaagtgagcccatctgttat
tgaggcagggttctttgagcactgtgtgggacatacactgagctggacca
attttctaatagccctggcaaagctgaagacattccaaagtgacacttgt
atctttcgattggctaccagactactaaaatatgattctctggaaattgg
aatttcccaagaatctcatggtgtcagccagaagagcttgtctaccagaa
agagattttacacacggctctgccaacctgtcaggcctcttcacagaagg
gactccagtcctccattgtagacagacagctatgatgaaagagacctacc
acaccttgaccaggactatttagttacgcatgtctcagaccttctattta
aactaaaccatgtcaggacatggaggatggacttgggaatgtaggggaca
tcttggtacctctgccggacagggccacagtgactgttttctcttcctca
tcattactttttacaactttaatttaaattgtcccactgagacctggtgg
ccaggcctagcttattagggttagcagggttcaaggctctgctctaaaca
actccggtaacatttgacctacctacttaaggggtggtctctgctgcata
tggcccttcagtgatgagtctgctccactcctccctgcagctcggctccc
aggttttggagtttctatactggaaaggagaggtctgttgaacctctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_121189243_121189592
seq2: B6Ng01-306G08.b_54_403

seq1  ACCTCTTGACCAAGCACTGCGCTGCTGAGCTCAGTCAGGTCCAGGCACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTGACCAAGCACTGCGCTGCTGAGCTCAGTCAGGTCCAGGCACAT  50

seq1  AGAGAGAAGACAGAGAGGGTAAGCAGAGGTAAGAAAGAGGAGGACTGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAAGACAGAGAGGGTAAGCAGAGGTAAGAAAGAGGAGGACTGCTT  100

seq1  CCATTTGTGGGTCTATGTATGGGTAAATGTGTGTGGGGATACGGGTGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGTGGGTCTATGTATGGGTAAATGTGTGTGGGGATACGGGTGACT  150

seq1  GGGTGCAGGGTGGGTGCAGTATGGGCGGCAGGGTGCCGGATAAGATGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCAGGGTGGGTGCAGTATGGGCGGCAGGGTGCCGGATAAGATGGGG  200

seq1  TAGAGTAGGGGATTCCTAGAGCACTTCTCACTCTCTCACTCTTTTTTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTAGGGGATTCCTAGAGCACTTCTCACTCTCTCACTCTTTTTTTTT  250

seq1  TTTTAAGATTTATTTTATTTTATGTATGTGAGTACACTGTAGCTGTACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGATTTATTTTATTTTATGTATGTGAGTACACTGTAGCTGTACAG  300

seq1  ATGGTTGTGAGCCTTCATGTGGTTGTTGGGAATTGAATTTTTAGGACCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATGGTTGTGAGCCTTCATGTGGTTGTTGGGAATTGAATTTTTAAGACCTC  350

seq1: chr3_121344212_121345306
seq2: B6Ng01-306G08.g_68_1166 (reverse)

seq1  AGAGAGGT--CACAGACCTCTTCCTTCCAGTATAGAAACT-CAAAACTGG  47
      ||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |
seq2  AGAGAGGTTCAACAGACCTCTCCTTTCCAGTATAGAAACTCCAAAACCTG  50

seq1  GGAGCCGAGCTGCAGGGAGGAGTGGAGCAGACTCATCACTGAAGGGCCAA  97
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGAGCCGAGCTGCAGGGAGGAGTGGAGCAGACTCATCACTGAAGGGCC-A  99

seq1  TATGCAGCAGAGACCA-CCCTTAAGTAGGTAGGTCAAATGTTACCGGAGT  146
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGCAGAGACCACCCCTTAAGTAGGTAGGTCAAATGTTACCGGAGT  149

seq1  TGTTTAGAGCAGAGCC-TGGACCCTGCTAACCCTAATAAGCTAGGCCTGG  195
      |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGAGCAGAGCCTTGAACCCTGCTAACCCTAATAAGCTAGGCCTGG  199

seq1  CCACCAGGTCTCAGTGGGACAATTTAAATTAAAGTTGTAAAAAGTAATGA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCAGGTCTCAGTGGGACAATTTAAATTAAAGTTGTAAAAAGTAATGA  249

seq1  TGAGGAAGAGAAAACAGTCACTGTGGCCCTGTCCGGCAGAGGTACCAAGA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAAGAGAAAACAGTCACTGTGGCCCTGTCCGGCAGAGGTACCAAGA  299

seq1  TGTCCCCTACATTCCCAAGTCCATCCTCCATGTCCTGACATGGTTTAGTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCTACATTCCCAAGTCCATCCTCCATGTCCTGACATGGTTTAGTT  349

seq1  TAAATAGAAGGTCTGAGACATGCGTAACTAAATAGTCCTGGTCAAGGTGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGAAGGTCTGAGACATGCGTAACTAAATAGTCCTGGTCAAGGTGT  399

seq1  GGTAGGTCTCTTTCATCATAGCTGTCTGTCTACAATGGAGGACTGGAGTC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGTCTCTTTCATCATAGCTGTCTGTCTACAATGGAGGACTGGAGTC  449

seq1  CCTTCTGTGAAGAGGCCTGACAGGTTGGCAGAGCCGTGTGTAAAATCTCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTGTGAAGAGGCCTGACAGGTTGGCAGAGCCGTGTGTAAAATCTCT  499

seq1  TTCTGGTAGACAAGCTCTTCTGGCTGACACCATGAGATTCTTGGGAAATT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTAGACAAGCTCTTCTGGCTGACACCATGAGATTCTTGGGAAATT  549

seq1  CCAATTTCCAGAGAATCATATTTTAGTAGTCTGGTAGCCAATCGAAAGAT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTCCAGAGAATCATATTTTAGTAGTCTGGTAGCCAATCGAAAGAT  599

seq1  ACAAGTGTCACTTTGGAATGTCTTCAGCTTTGCCAGGGCTATTAGAAAAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGTCACTTTGGAATGTCTTCAGCTTTGCCAGGGCTATTAGAAAAT  649

seq1  TGGTCCAGCTCAGTGTATGTCCCACACAGTGCTCAAAGAACCCTGCCTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCAGCTCAGTGTATGTCCCACACAGTGCTCAAAGAACCCTGCCTCA  699

seq1  ATAACAGATGGGCTCACTTACTCTACGTCCTGTGAAACACACCACGCAAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAGATGGGCTCACTTACTCTACGTCCTGTGAAACACACCACGCAAG  749

seq1  GCATCCTCCATTGCTAAGGAGCCCGTTTGTGCTTAGCGGTGGCTCTTCCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCTCCATTGCTAAGGAGCCCGTTTGTGCTTAGCGGTGGCTCTTCCT  799

seq1  GCTGCCACTAAATTCCTTCAGTGTCTCTCTCTGCCTTCCTCTTCATCCCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCACTAAATTCCTTCAGTGTCTCTCTCTGCCTTCCTCTTCATCCCA  849

seq1  CAGATGCCTTTTGTTTTGCCTCACCATGACTGGTGTGAAGCGTACCTTTG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCCTTTTGTTTTGCCTCACCATGACTGGTGTGAAGCGTACCTTTG  899

seq1  CCCCTCAGTTTCCACTCAGAAGCTGCTCCAACCCCAGTGGGTCAGTCAGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCAGTTTCCACTCAGAAGCTGCTCCAACCCCAGTGGGTCAGTCAGG  949

seq1  ACGAGTTCCTTCACACTCTAAAGTGCTCCCCTGTTCTGTGCTTGTCAGCC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGTTCCTTCACACTCTAAAGTGCTCCCCTGTTCTGTGCTTGTCAGCC  999

seq1  GCTCTACCTTGAGGCTTGCCACCTTTCTTTTCTCTCTGATCTCCCTGCCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTACCTTGAGGCTTGCCACCTTTCTTTTCTCTCTGATCTCCCTGCCC  1049

seq1  GCTCCCACTCTCTCCTCTGCTTGCCTCTATCCCAAGTTCCCATTGAATTC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCACTCTCTCCTCTGCTTGCCTCTATCCCAAGTTCCCATTGAATTC  1099