BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-328E22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 146,211,353 - 146,370,651
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040473, Dnase2b, Uox, 4930503B20Rik, Gm1652, LOC670100
Upstream geneCol24a1, 2410019A14Rik, Cyr61, Ddah1, LOC100040331, Bcl10, 2410004B18Rik, Syde2, Wdr63, Mcoln3, Mcoln2, Edg7, Ssx2ip, Ctbs, Spata1, Gng5, Bxdc5
Downstream genePrkacb, LOC100040540, Ttll7, Ppia-ps3_1528.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-328E22.bB6Ng01-328E22.g
ACCGA115609GA115610
length1,1311,131
definitionB6Ng01-328E22.b B6Ng01-328E22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,211,353 - 146,212,484)(146,369,517 - 146,370,651)
sequence
gaattcagctcctactgctatcctcacaatggcggtagctcatgtcctgg
acttcctaggaccactttgtgttcttgtttatgtatatactttattttct
atggcctttaaaaaacctgtaccttactgctaatatttgctggttttctt
agctttccctcttctgttgtatatgaatgtagctgatagtcatgtaaatg
ctggtttgttaagcttgacagtgaagaaagcttagttcattcttctttat
tacagagttgcctcctactcaagtgtatcttacacgaaggcactgtgatt
cttgcaaatactgctattcttctgttatttcttttctgacatacccttcc
cttcctccttcctcccttcttccttctttccttcttcccttccttcttcc
cttcttccttcctcccttcctccttcccttcttccttctcctttttttcc
tccttccctccctttctccctccctccttcccttccttatatataagaaa
cccctctctcccctcatctagttagctcacaagggaaccacctaaggtag
ctttgtccagtgatggcctttcttttagagacatgcttttgtaattccct
agctttgatgtttgtgtttcctattttgctcccattccttgctgctggag
ctgatcttcctcagaggctctcaccctcgtaactttatttcccagaggca
agtacgtgctctctacctggctgtattatgaaacacccgggtttgcctga
cccacccctcctcagctgcaccacccaggacatttaaaagatgcagtggg
cctggctggaggttagtagagctgtgctggctccacgtgaacttcagcca
acatggaagtcccaaggccaggctctagagctttatctccgaacctcctt
gaggtaagttttcactggatttctttttttctgctggtttttgtgatgcc
acttttgtggcctttactttttttatgcttgccacataagtctggggtgt
tcagtgtagggttgcccaaatggagggtaagcagcagcagctcacttttg
ttgtaaaacctaactttatactgtacgccttgatgaaaattcttctagga
ctaccttttacttcctgggttggccaaaaaa
gaattcctgaataagagtaaaaaaagatcttgaaagtcgccttgtggaat
agaaagaatgtttgcagccatcctgggtatgactggtggacttctctaaa
ggtctttcttcccttaagtacaaagcttaaaaataggtgtgtctgttatg
gtttgtatatgcttggcccagggagtggcactattagaaggtgtgacgct
gttggagtaggtgtgtcactgtgggtgtgggttttaagacccttatccta
gtagcttggaagccagtcttccactagcagccttcagatgaagatgtaaa
actctcagctccccctgcaccacgcctgcctggatgctgccatgctccca
ccttgatgataatagactgaacctctgaacctgtaagccagccccaatta
aatgttgtcctttataagacttgcattggtcatggtgtctgttcatagca
gtaagaccctaactaaagcagtgcccaaatgcacatagtctggtgaggaa
atacaagtaagaataaaatgccaggatctaagcagtgaccttgatctgtg
gtcactggtgtctgatcttactgaggacataaccactctggccccagatc
aatgtgaaatcttggaaacgctacatattctgagctgctgagcatctttg
tctatagaaacaaatacttgattgagagtcattcagaactatattcaaca
aatatttactgcgcacctggcatattaaagataatgatgtaggcgttgag
attaaagttataaacagaacaccctgctcttatggatttttagagtcaaa
attaagcaacaaacaaagcaaactataaaagcatagagcaaacgtgatgg
tgaatgctacagacaaaagtgaaacacagaagttaggactgagagggttg
ctcagtgggtaagagcacttgctctcctgacatggggacatacatttgaa
tccctagaacccacattaaaagctcagcatgactatgtggtaccccagcc
actggggcagaaactggtgatactagaagtggaaaggctaaggagacatc
tgacagctgctctgtcttcttacatgacactcaacttgggccatgtgcac
cccacacattcccattgaatgcactgcatga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_146211353_146212484
seq2: B6Ng01-328E22.b_46_1176

seq1  GAATTCAGCTCCTACTGCTATCCTCACAATGGCGGTAGCTCATGTCCTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTCCTACTGCTATCCTCACAATGGCGGTAGCTCATGTCCTGG  50

seq1  ACTTCCTAGGACCACTTTGTGTTCTTGTTTATGTATATACTTTATTTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCTAGGACCACTTTGTGTTCTTGTTTATGTATATACTTTATTTTCT  100

seq1  ATGGCCTTTAAAAAACCTGTACCTTACTGCTAATATTTGCTGGTTTTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCTTTAAAAAACCTGTACCTTACTGCTAATATTTGCTGGTTTTCTT  150

seq1  AGCTTTCCCTCTTCTGTTGTATATGAATGTAGCTGATAGTCATGTAAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTCCCTCTTCTGTTGTATATGAATGTAGCTGATAGTCATGTAAATG  200

seq1  CTGGTTTGTTAAGCTTGACAGTGAAGAAAGCTTAGTTCATTCTTCTTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTGTTAAGCTTGACAGTGAAGAAAGCTTAGTTCATTCTTCTTTAT  250

seq1  TACAGAGTTGCCTCCTACTCAAGTGTATCTTACACGAAGGCACTGTGATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGTTGCCTCCTACTCAAGTGTATCTTACACGAAGGCACTGTGATT  300

seq1  CTTGCAAATACTGCTATTCTTCTGTTATTTCTTTTCTGACATACCCTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAAATACTGCTATTCTTCTGTTATTTCTTTTCTGACATACCCTTCC  350

seq1  CTTCCTCCTTCCTCCCTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCCTTCCTTCTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCCTTCCTCCCTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTCCCTTCCTTCTTCC  400

seq1  CTTCTTCCTTCCTCCCTTCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCTCCTTTTTTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCCTTCCTCCCTTCCTCCTTCCCTTCTTCCTTCTCCTTTTTTTCC  450

seq1  TCCTTCCCTCCCTTTCTCCCTCCCTCCTTCCCTTCCTTATATATAAGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCCTCCCTTTCTCCCTCCCTCCTTCCCTTCCTTATATATAAGAAA  500

seq1  CCCCTCTCTCCCCTCATCTAGTTAGCTCACAAGGGAACCACCTAAGGTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTCTCTCCCCTCATCTAGTTAGCTCACAAGGGAACCACCTAAGGTAG  550

seq1  CTTTGTCCAGTGATGGCCTTTCTTTTAGAGACATGCTTTTGTAATTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTCCAGTGATGGCCTTTCTTTTAGAGACATGCTTTTGTAATTCCCT  600

seq1  AGCTTTGATGTTTGTGTTTCCTATTTTGCTCCCATTCCTTGCTGCTGGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTGATGTTTGTGTTTCCTATTTTGCTCCCATTCCTTGCTGCTGGAG  650

seq1  CTGATCTTCCTCAGAGGCTCTCACCCTCGTAACTTTATTTCCCAGAGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTTCCTCAGAGGCTCTCACCCTCGTAACTTTATTTCCCAGAGGCA  700

seq1  AGTACGTGCTCTCTACCTGGCTGTATTATGAAACACCCGGGTTTGCCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACGTGCTCTCTACCTGGCTGTATTATGAAACACCCGGGTTTGCCTGA  750

seq1  CCCACCCCTCCTCAGCTGCACCACCCAGGACATTTAAAAGATGCAGTGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCCCTCCTCAGCTGCACCACCCAGGACATTTAAAAGATGCAGTGGG  800

seq1  CCTGGCTGGAGGTTAGTAGAGCTGTGCTGGCTCCACGTGAACTTCAGCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTGGAGGTTAGTAGAGCTGTGCTGGCTCCACGTGAACTTCAGCCA  850

seq1  ACATGGAAGTCCCAAGGCCAGGCTCTAGAGCTTTATCTCCGAACCTCCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGAAGTCCCAAGGCCAGGCTCTAGAGCTTTATCTCCGAACCTCCTT  900

seq1  GAGGTAAGTTTTCACTGGATTTCTTTTTTTCTGCTGGTTTTTGTGATGCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAAGTTTTCACTGGATTTCTTTTTTTCTGCTGGTTTTTGTGATGCC  950

seq1  ACTTTTGTGGCCTTTACTTTTTTTATGCTTGCCACATAAGTCTGGGGTGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACTTTTGTGGCCTTTACTTTTTTTATGCTTGCCACATAAGTCTGGGGTG-  999

seq1  TTCAGTGTAGGGTTGCCCAAAT-GAGGGTAAGCAGCAGCAGGCTCACTTT  1049
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTCAGTGTAGGGTTGCCCAAATGGAGGGTAAGCAGCAGCA-GCTCACTTT  1048

seq1  TGTTTGTAAAACCT-ACTTTATACTGTACGCCTTGATGAAAATACTTCCT  1098
      || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  TG-TTGTAAAACCTAACTTTATACTGTACGCCTTGATGAAAATTCTT-CT  1096

seq1  AGGAATTACCTTTACTT-CTTGGTTGGCCAAAAAA  1132
      |||| |  | ||||||| || ||||||||||||||
seq2  AGGACTACCTTTTACTTCCTGGGTTGGCCAAAAAA  1131

seq1: chr3_146369517_146370651
seq2: B6Ng01-328E22.g_68_1198 (reverse)

seq1  TCATGCAGTGCATTC-ATGGGAATGTGT-GGGTGCACAT-GCCCAAGTGT  47
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
seq2  TCATGCAGTGCATTCAATGGGAATGTGTGGGGTGCACATGGCCCAAGT-T  49

seq1  GAGTGTCCATGT-AGAGACCAGAGCAGGCTGTCAGATGTCTCCTTTAGCC  96
      |||||| ||||| |||   ||||||| |||||||||||||||| |||| |
seq2  GAGTGT-CATGTAAGAAGACAGAGCA-GCTGTCAGATGTCTCC-TTAG-C  95

seq1  CTTTCCACTTCTTAGTATCCACCAGTTTCTGCCCCCAGT-GCTGGGGTAC  145
      ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| 
seq2  CTTTCCACTTC-TAGTAT-CACCAGTTTCTG-CCCCAGTGGCTGGGGTA-  141

seq1  CCACATAGTCATGCTGAGCTTTTAATGTGGGTTCTAGGGATTCAAATGTA  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATAGTCATGCTGAGCTTTTAATGTGGGTTCTAGGGATTCAAATGTA  191

seq1  TGTCCCCATGTCAGGAGAGCAAGTGCTCTTACCCACTGAGCAACCCTCTC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCATGTCAGGAGAGCAAGTGCTCTTACCCACTGAGCAACCCTCTC  241

seq1  AGTCCTAACTTCTGTGTTTCACTTTTGTCTGTAGCATTCACCATCACGTT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTAACTTCTGTGTTTCACTTTTGTCTGTAGCATTCACCATCACGTT  291

seq1  TGCTCTATGCTTTTATAGTTTGCTTTGTTTGTTGCTTAATTTTGACTCTA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTATGCTTTTATAGTTTGCTTTGTTTGTTGCTTAATTTTGACTCTA  341

seq1  AAAATCCATAAGAGCAGGGTGTTCTGTTTATAACTTTAATCTCAACGCCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCATAAGAGCAGGGTGTTCTGTTTATAACTTTAATCTCAACGCCT  391

seq1  ACATCATTATCTTTAATATGCCAGGTGCGCAGTAAATATTTGTTGAATAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATTATCTTTAATATGCCAGGTGCGCAGTAAATATTTGTTGAATAT  441

seq1  AGTTCTGAATGACTCTCAATCAAGTATTTGTTTCTATAGACAAAGATGCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTGAATGACTCTCAATCAAGTATTTGTTTCTATAGACAAAGATGCT  491

seq1  CAGCAGCTCAGAATATGTAGCGTTTCCAAGATTTCACATTGATCTGGGGC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCTCAGAATATGTAGCGTTTCCAAGATTTCACATTGATCTGGGGC  541

seq1  CAGAGTGGTTATGTCCTCAGTAAGATCAGACACCAGTGACCACAGATCAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGGTTATGTCCTCAGTAAGATCAGACACCAGTGACCACAGATCAA  591

seq1  GGTCACTGCTTAGATCCTGGCATTTTATTCTTACTTGTATTTCCTCACCA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACTGCTTAGATCCTGGCATTTTATTCTTACTTGTATTTCCTCACCA  641

seq1  GACTATGTGCATTTGGGCACTGCTTTAGTTAGGGTCTTACTGCTATGAAC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATGTGCATTTGGGCACTGCTTTAGTTAGGGTCTTACTGCTATGAAC  691

seq1  AGACACCATGACCAATGCAAGTCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGGGC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACCATGACCAATGCAAGTCTTATAAAGGACAACATTTAATTGGGGC  741

seq1  TGGCTTACAGGTTCAGAGGTTCAGTCTATTATCATCAAGGTGGGAGCATG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTACAGGTTCAGAGGTTCAGTCTATTATCATCAAGGTGGGAGCATG  791

seq1  GCAGCATCCAGGCAGGCGTGGTGCAGGGGGAGCTGAGAGTTTTACATCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCATCCAGGCAGGCGTGGTGCAGGGGGAGCTGAGAGTTTTACATCTT  841

seq1  CATCTGAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGGCTTCCAAGCTACTAGGATAAGG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGGCTTCCAAGCTACTAGGATAAGG  891

seq1  GTCTTAAAACCCACACCCACAGTGACACACCTACTCCAACAGCGTCACAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAAAACCCACACCCACAGTGACACACCTACTCCAACAGCGTCACAC  941

seq1  CTTCTAATAGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCATATACAAACCATAACAGAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAATAGTGCCACTCCCTGGGCCAAGCATATACAAACCATAACAGAC  991

seq1  ACACCTATTTTTAAGCTTTGTACTTAAGGGAAGAAAGACCTTTAGAGAAG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTATTTTTAAGCTTTGTACTTAAGGGAAGAAAGACCTTTAGAGAAG  1041

seq1  TCCACCAGTCATACCCAGGATGGCTGCAAACATTCTTTCTATTCCACAAG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCAGTCATACCCAGGATGGCTGCAAACATTCTTTCTATTCCACAAG  1091

seq1  GCGACTTTCAAGATCTTTTTTTACTCTTATTCAGGAATTC  1135
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGACTTTCAAGATCTTTTTTTACTCTTATTCAGGAATTC  1131