BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-342O04
Chromosome3 (Build37)
Map Location 155,718,527 - 155,847,903
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC624519
Upstream geneFpgt, Lrrc44, EG383956, Scp2-ps1, EG668902
Downstream geneLOC100040901, 4930570G19Rik, Negr1, LOC100041152, LOC668853
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-342O04.bB6Ng01-342O04.g
ACCGA125825GA125826
length1,056627
definitionB6Ng01-342O04.b B6Ng01-342O04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(155,846,850 - 155,847,903)(155,718,527 - 155,719,153)
sequence
gaattcttttaaaataagtattttaatatattaataatatctaattatat
aatatgcaatatattagtaatatcatggtgggggcaatatgcatacttga
cctcagacattaacgtgggtcatatacttagaatgaccttagatcttggg
ttctagtcaccagttgagtagagttttggaaatgaacctgggtcctctcc
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aagatccatgatagatgtatattatagataacagatgatggatagataga
caaatgatagatgatagatggatagatatatagatagaaggataacagat
gatagatagatgatagatcgatagatgatagatagatagatagatagata
gatagatagaagatagataggtatgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_155846850_155847903
seq2: B6Ng01-342O04.b_45_1100 (reverse)

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      |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCAAGTATGCATATTGCCCCCACCATGATATTACTAATATATTG  1000

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||
seq2  GAATTC  1056


seq1: chr3_155718527_155719153
seq2: B6Ng01-342O04.g_66_692

seq1  GAATTCATGAAAATTTTAGATCAATATTAAATTGCAATAGCACTCATTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTAACTGATATTATTGGAGCAATCCACTGTTAGCTGAAACTAATT  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATGTTTTAGACTGATTACTAGCATCATATTTAATTTTAACATTGTA  250

seq1  TCCATCCATACTATATAGGTAAACTTACAAAATTTAGTATGTCATTTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAAGCCAATATCACATTAACTGATATTAATGACAGAAGATGTTGAATCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAATATCACATTAACTGATATTAATGACAGAAGATGTTGAATCTG  350

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAAATGATAGATGATAGATGGATAGATATATAGATAGAAGGATAACAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GATAGATAGAAGATAGATAGGTATGTA  627
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGAAGATAGATAGGTATGTA  627


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