BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-343O22
Chromosome3 (Build37)
Map Location 13,645,474 - 13,646,164
singlet/doubletsinglet
Overlap gene0710005M24Rik
Upstream geneEG668033, LOC668037, LOC100039823, LOC100039861, LOC100041679
Downstream geneLOC100041667, LOC100039882, EG622229, LOC668062, Slc7a12, LOC668068, Lrrcc1, E2f5, 1810022K09Rik, LOC100039929, Car13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-343O22.g
ACCGA126574
length691
definitionB6Ng01-343O22.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattccacagtgacaaccattgcaggtaagaaatttgggaggaggcaag
cacaatggctatgtgcaaggaaggccaggctgattttctgacagttgtgt
agggacatgaattataagacacttaatgaatagattgtggaattggtgtc
ctagttttaagtaacaataatataaatatttgcagcaattatggagagtg
gtacttaaagaactcacagggaagaaacttccagtatttggcaaagggaa
ggtttgcaagatctggatctgtatacatacatatatatatactgaatata
tgtatatacacactgaatatatatatatatatatatatatatatatatat
atacacacacagacatatatagtgtgtgtgtgtattttgaatagcttaag
tatcagaagacaaaagatcaggtaactacagtgatagaaatttactaatt
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tgagcattccatagtatgtatgactaagggggatatattattatagttat
gagagaacagccagaggctcttggcaaaagcagagagagaaactagtgga
ctgtccatggccagtagactggagaagcaggagcatagcagagaggaagg
gattgcagagcatactgggagagcagagagaggggaggaag
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_13645474_13646164
seq2: B6Ng01-343O22.g_66_756

seq1  GAATTCCACAGTGACAACCATTGCAGGTAAGAAATTTGGGAGGAGGCAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CACAATGGCTATGTGCAAGGAAGGCCAGGCTGATTTTCTGACAGTTGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGGGACATGAATTATAAGACACTTAATGAATAGATTGTGGAATTGGTGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACATGAATTATAAGACACTTAATGAATAGATTGTGGAATTGGTGTC  150

seq1  CTAGTTTTAAGTAACAATAATATAAATATTTGCAGCAATTATGGAGAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GTACTTAAAGAACTCACAGGGAAGAAACTTCCAGTATTTGGCAAAGGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GGTTTGCAAGATCTGGATCTGTATACATACATATATATATACTGAATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TGTATATACACACTGAATATATATATATATATATATATATATATATATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATACACACTGAATATATATATATATATATATATATATATATATAT  350

seq1  ATACACACACAGACATATATAGTGTGTGTGTGTATTTTGAATAGCTTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACACACAGACATATATAGTGTGTGTGTGTATTTTGAATAGCTTAAG  400

seq1  TATCAGAAGACAAAAGATCAGGTAACTACAGTGATAGAAATTTACTAATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATGATGTTATTATATTATTTCCTATATCATAATTGTTGAAACTGAAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGTTATTATATTATTTCCTATATCATAATTGTTGAAACTGAAGATA  500

seq1  TGAGCATTCCATAGTATGTATGACTAAGGGGGATATATTATTATAGTTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATTCCATAGTATGTATGACTAAGGGGGATATATTATTATAGTTAT  550

seq1  GAGAGAACAGCCAGAGGCTCTTGGCAAAAGCAGAGAGAGAAACTAGTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAACAGCCAGAGGCTCTTGGCAAAAGCAGAGAGAGAAACTAGTGGA  600

seq1  CTGTCCATGGCCAGTAGACTGGAGAAGCAGGAGCATAGCAGAGAGGAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCATGGCCAGTAGACTGGAGAAGCAGGAGCATAGCAGAGAGGAAGG  650

seq1  GATTGCAGAGCATACTGGGAGAGCAGAGAGAGGGGAGGAAG  691
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCAGAGCATACTGGGAGAGCAGAGAGAGGGGAGGAAG  691


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