BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-349O12
Chromosome3 (Build37)
Map Location 111,850,991 - 112,024,564
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC625585
Upstream geneLOC100043190, LOC668712
Downstream geneEG229746, LOC668717, Utp14B-ps, EG433643, OTTMUSG00000022462, LOC668723
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-349O12.bB6Ng01-349O12.g
ACCGA130749GA130750
length7941,182
definitionB6Ng01-349O12.b B6Ng01-349O12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(112,023,772 - 112,024,564)(111,850,991 - 111,852,173)
sequence
gaattccatcttctggcagggtacttgctgttcagttgctctgttcattc
tgtttcatatctgtagttataatccagatgtagtcatttatagactcttc
atgtgaagttactaagcaaaagggggttgcttggaggcataccaaaaagt
ggtctgtaactgaaaaaatattgctcagctatcaggctctggattaagat
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tataatgctctgttattcttagttaattatggtattatatatcaaataaa
aattgggaaaatatattttggaataaatatatatatatatatatatatat
atcacatataaatatacatgtgtgtgtacgtgttacatgttatatgttat
atgctataagctctataagatatgttatacatgtaaatgttatattttat
gtattagatattatgttatttgatatatgttatatattatgtatgctatg
tgatatatgttaactttccaattttatgtcactcttcttattaatataaa
atccttgggcttttctgtcctcttcctacctggggtaatacttgtcccat
ctatccaactataatactactgacaaggtttcctgctggtgcctcattgt
ccttttttcctcaaaaccagccatgtgagattaaattgtacttatatcca
tacaaggtccacgagattaacccatgccatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr3_112023772_112024564
seq2: B6Ng01-349O12.b_48_841 (reverse)

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      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGAGCCTGATAGCTGAGCAATATTTTTTCAGTTACAGACCACTTTT  650

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ACAGAGCAACTGAACAGCAAGTACCCTGCCAGAAGATGGAATTC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCAACTGAACAGCAAGTACCCTGCCAGAAGATGGAATTC  794


seq1: chr3_111850991_111852173
seq2: B6Ng01-349O12.g_68_1249

seq1  GAATTCACTAATATAGACACAATTCTTTGCCATAAAGCACCTTACCAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAATATAGACACAATTCTTTGCCATAAAGCACCTTACCAAAT  50

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGACTCAAGACATGTAAACTTGATGTAGAGTCATAACAGAATAAAA  100

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTCTAAAAAATTCAGAATATCATTTTGCTTGAAAATATTTTTTAA  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TTCTTTCTGATTATTATGAATAAAGTCACAAGAAACATAGCTGAGTGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GGCCTTGTGGTAGCATTGAAGATCCTTTGTGCATATGCTAACAAAGTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTGTGGTAGCATTGAAGATCCTTTGTGCATATGCTAACAAAGTGCT  300

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAGATCTTTAGCTAGACTGGATATTTAATGGTTATATAGATTTGT  350

seq1  GTTACCTCACTGTTCTATACTATTAGAGCAATGATGAGATCATGCAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTCACTGTTCTATACTATTAGAGCAATGATGAGATCATGCAACCA  400

seq1  TAGAATGTTTTAATGTCAACATAGTAAAATAAAAATGACATTTATTCAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGTTTTAATGTCAACATAGTAAAATAAAAATGACATTTATTCAAA  450

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGTCCATTAAATGGCTTTAAATTTTGATAGCTAAAGATTATGTATA  500

seq1  AATTGAACTCTGTATTTTTCATAGCTTACAACTAGAAAATATGTCATATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAACTCTGTATTTTTCATAGCTTACAACTAGAAAATATGTCATATA  550

seq1  AGTATATATATCCCTATAAAAGATAGAAATTATTTAAAGCTACACTAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTGAAGAAATCAAATTTAAAAATGACTACCATTTCTTAAAAGTAA  650

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGCTCTGTTATTCTTAGTTAATTATGGTATTATATATCAAATAAA  750

seq1  AATTGGGAAAATATATTTTGGAATAAATATATATATATATATATATATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGGAAAATATATTTTGGAATAAATATATATATATATATATATATAT  800

seq1  ATCACATATAAATATACATGTGTGTGTACGTGTTACATGTTATATGTTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATATAAATATACATGTGTGTGTACGTGTTACATGTTATATGTTAT  850

seq1  ATGCTATAAGCTCTATAAGATATGTTATACATGTAAATGTTATATTTTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTATAAGCTCTATAAGATATGTTATACATGTAAATGTTATATTTTAT  900

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTATTAGATATTATGTTATTTGATATATGTTATATATTATG-TATGCTAT  949

seq1  GTGATATATGTTAACTTTCAAATTTTATGTCACTCTTCTTATTAATATAA  1000
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATATATGTTAACTTTCCAATTTTATGTCACTCTTCTTATTAATATAA  999

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      ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||
seq2  AATCCTTGGGCTTTTCTGTCCTCTTCCTACCTGGGGTAATACTTGTCCCA  1049

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      ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||
seq2  TCTATCCAACTATAATACTACTGACAAGGTTTCCTGCTGGTGCCTCATTG  1099

seq1  TCCTTTTTTCCTCAAAACCAGCCATGTGAGA-TAAATTGTACTTATATCA  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  TCCTTTTTTCCTCAAAACCAGCCATGTGAGATTAAATTGTACTTATATC-  1148

seq1  AACAACAAAAGTCAACAGGAGATATACCCCATGCCATAG  1183
        ||   || |||  || ||||| || ||||||||||||
seq2  --CATACAAGGTC--CACGAGAT-TAACCCATGCCATAG  1182


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