BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050J22.T7 (MSMg01no050_j22.b1) | MSMg01-050J22.TJ (MSMg01no050_j22.g1) |
ACC | AG279644 | AG279645 |
length | 1,204 | 1,214 |
length of high quality (start - end) | 575 (82 - 656) | 582 (77 - 658) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_j22.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_j22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_j22.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_j22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCAACACTCGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATAATTCCTGGGGTTATTTGATTTTCTGG
GGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATCGGATATTAGTACCCTATCT
GATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAAACTGTTGGTGGTCTTTTTGT
CTTATTGATGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAACTTTATGAGGT
CCCATTTATCGATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTATTCTATTC
AGGAATTTTTCCCCTGTACCCATATCTTCGAGGCTTTTCCCTACTTTATC
CTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTTCTTAATCATCT
TAGATTTGACCTTAGCATAAGGAGATCTATGCAAAAATCCTCAATAAAGT
TCTTGCTAACCGAATCCAAGAACACATCAAAACAATCATCCATCCTGACC
AAGTAGGTTTCATCCCAGGGATGCAAGGATGGCCCAATATACGGAAATCC
ATCAAGATATTCCCGTATATAAACAAACTCAAAGACAAAAACCACATGAT
CATCTCGTTAGATGCTGAGAAAGCATTTGACAAAATCCAACACCCATTCA
TGATAATAGTCTTGGAAAGATCATGAATTTCAGGCCCACACCTAACCATG
ATAAAACCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCATCATCAAAGTAAATGGTGT
GAAGTTGGAAAAAATCCCACTACAATCATGTACTAGACCAGGTTGTCCAC
TCTCTCCCTACCTATTCAACATTGTAACTTGACGTCCTAGCCTGCGCAAT
TAGACCACTAAGCGAGATCTAGGGGTATTACAATTTGTAAAAACAAGAAA
TTCCAATATCCCCTCTTTGTCTTATGCTATGATTAGATTTTACGTGACCC
TTAAAAATTTCCTCTATAATATCTTCCTAATCCTGGATAAACATCCCCCC
ATGAAAAATATTGGGATTTAAAATTTAATTTCAGGCCAGTTCAATGGTTC
TCTTCTGGTTCCCCTAGCGATATATCTGGTTTGCATAAATAAAATTTTAG
GGCAATATTTTTCCCTCTTTTTCTAACTAGTCTCCATTATCAACTTTAAA
ATATCATCTTGTTCCAATGAACTCCCACACTCTTGTGGTATTGGAAATGA
ATTA
| NTTTTGAGTGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCTCTTTTAAGAATTATTTAATACCTATATCCATTT
TTATTTGCCTTTTTGTTTTGTTCAATTAATTATAATAGTTCCAGTTTTAT
CCATCATAAGGTTAACCTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATT
ATTATTATTATTATTATTATTATTATTGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGC
CCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTATAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAG
AAATTCTCCTGCCTCTGTCTCCCAAGTGTTGGGATCAAAGGCGTGCACCA
CTACTGTCCAGCTTTTTTAACCTTTAAATTTTATGTAGTAAAAAATTACT
CACCTTATTTATAATGTTTCTTCTTGACTTTACAAATAACTAATTTTATA
ATGGACATTCCATATAGATTAATATTTTCCTGCTTTGTTCGGTTGATGAC
AGTCCATCAATACCATTATTTATTTTGATGCTCTTATTAAAAACAATTTA
TATCTTTTGTACTTTCTTCTCAGATAAATTATTCTATGAAAATTATTCAC
TTTCATGTGGCCAATGGAGAAAAGTCCATTTTAATGTGGCATTTTTTCCC
TCTCACAGCGTATACCACCTATCCAAAGAATCCTTCCTAATTCTAGCCGG
AAAATAATATTTCCAATCTTGGACTTTTGCTTCAACAAAATCATTGATTT
TGGTCATCATTACTTACTTATCTTTTAGAGAAAGAACTTCTTTCCTATCG
TGAAAGTGATAAACTATTCTTGTATGTCAGTGCTTATCCATGTGCTTGGT
GCATTTTTCCTTCATATTGTTTACCTTCTTTTCTTATGGTAGAAATTCCT
TACCCATTTAAGAATCTTGAGGTCTTTTTTATCGTTTTCCTCCTTCCTTT
TTAAGGGTCATTCAATATGCTATCCTATCTCCTCCCGGGTTTGACCTGGC
ACCATTTTCTAAAATCTACGTTTTTATTTCTCTTTTTGATCGTTTCTTTT
CTTATTTCTCTAAAACCTTTTTTCCTTTTTGTGGCCTTTTAATTCCCATG
GTATTTGCACATATCACATTTTCTTCGTTCTCATATATTTTCCCTATTTG
GTCCCGGTCTCCATAACCCCATCTTTATTACCTCTATTACTATTATATCT
CCCTTTGTTCTTAT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 6 6 6 7 7 7 8 8 15 28 17 18 20 20 16 14 10 11 12 17 10 10 10 15 14 14 14 14 33 36 37 37 42 42 42 42 42 42 30 28 28 31 31 37 42 42 47
42 48 43 44 44 35 35 28 28 24 28 37 37 28 27 15 15 12 17 9 9 9 11 9 11 11 12 12 12 15 11 15 18 29 35 37 41 44 53 59 59 59 59 57 48 48 48 43 43 44
43 50 50 50 53 23 34 12 15 15 23 23 23 23 30 28 28 29 21 24 25 28 36 42 51 48 43 23 18 11 11 11 22 23 48 57 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 51 57 57
57 57 57 57 57 57 43 43 46 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 48 48 48 57 57 68 57 57 57 57 43 43 35 43 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52
52 52 57 57 57 68 59 59 59 57 52 59 57 43 43 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43 43 52 59 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
52 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 59 43 43 29 42 42 50 50 57 57 57 57 57
54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 43 41 38 32 28 28 20 31 41 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68
59 59 54 54 48 47 47 57 57 57 57 59 59 48 48 46 46 46 47 57 57 59 48 46 43 39 42 42 40 43 25 25 17 30 30 48 48 48 59 57 48 48 47 37 24 20 11 11 11 12
22 11 11 16 25 34 41 41 41 37 37 33 33 24 33 34 41 28 25 17 17 17 26 28 36 43 47 57 57 42 39 32 25 26 17 20 22 37 40 42 32 28 23 23 23 28 28 35 36 37
39 43 43 59 44 39 39 37 39 43 46 44 43 39 32 36 18 19 11 12 12 32 32 43 43 39 32 32 24 28 27 36 36 42 44 35 34 33 33 36 29 33 29 41 36 44 44 48 52 52
57 57 57 52 52 52 52 38 38 42 35 35 35 32 27 15 12 12 15 18 20 38 38 32 33 32 26 36 42 42 19 21 11 12 9 20 20 43 44 52 52 52 52 52 52 43 43 23 23 16
14 19 32 31 28 24 32 19 28 28 44 44 20 20 20 28 28 35 44 43 43 32 28 18 18 14 19 19 30 24 35 26 29 24 24 15 12 12 12 32 18 27 23 25 28 32 32 42 41 30
17 17 17 32 32 46 40 40 46 42 42 17 19 8 8 8 15 16 15 17 25 30 30 30 30 33 42 43 40 37 25 23 20 20 23 23 28 23 28 28 20 23 21 26 18 20 15 28 21 28
32 34 34 21 14 9 9 9 14 10 13 18 27 25 11 11 12 22 26 32 29 19 19 19 25 19 19 15 16 16 11 13 19 21 12 12 12 12 11 11 11 11 11 18 20 28 28 24 24 23
23 19 30 24 13 8 8 8 8 8 11 28 28 34 23 21 14 14 14 18 15 18 18 24 22 19 12 12 12 8 8 8 8 8 8 15 15 16 22 24 10 10 10 10 10 11 10 10 10 10
16 15 12 9 9 9 10 10 8 8 8 8 9 10 17 12 8 8 8 10 12 12 12 11 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 10 14 12 12 15 11 13 15 20 19 13 10
24 28 25 26 22 24 31 19 19 10 10 8 17 11 11 11 11 11 12 10 10 12 22 15 10 8 8 8 8 19 11 8 8 8 10 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10
10 10 10 10 8 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 11 16 12 11 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 12 15 15 18 8 8 9 9 10 11 10 10 8 9 13
9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 15 24 19 13 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 8 10 12 8 8 8 8 8 10 13 8 9 9 9 9 10 10 10 9
9 9 10 11 14 14 12 15 12 13 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 12 17 11 8 10 10 8 8 9 8 8 12 10 9 9 10 10 10 11 15 11 11 11 13 10 13 13 11 12 10
9 9 9 10 11 12 12 12 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 11 12 12 12 10 11 11 11 10 10 11 13 11 11 10 11 11 11 11 10 9 13 9 9 9 10 13 13 11 10 9 9
9 9 9 12 13 8 8 8 12 10 12 14 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 11 10 10 10 9 9 10 10 10 10 11 13 10 13 12 10 11 11
9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 16 13 10 9 13 10 10 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 11 12 9 9 6 6 6 6 8 7 6 10 10 10 8 8 8 8 8
6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 7 7 8 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 11 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8
8 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 9 11 8 8 8 8 8 12 19 19 18 11 10 12 9 16 21 19 22 10 12 12 23 22 29 16 16 22 26 22 10 10 12 25 22 39 36
36 44 44 53 57 57 44 43 43 36 36 31 21 16 11 11 12 15 15 26 17 19 21 16 20 20 19 16 31 31 42 42 48 48 47 47 50 50 50 50 50 50 53 48 47 39 39 39 44 33
37 37 37 34 21 15 15 12 12 12 15 28 26 28 20 28 28 28 28 23 23 26 31 37 31 31 31 22 30 33 33 37 43 47 47 47 40 40 40 48 48 42 42 42 46 41 41 48 50 50
50 47 47 47 47 47 47 48 48 54 50 57 57 57 48 48 48 57 47 57 57 68 57 57 68 68 57 43 32 21 21 24 24 24 32 38 47 47 47 47 47 44 44 43 43 43 50 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 57 57 57 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 44 44 35 43 43 43 44 52 52 52 62 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 45 62 62 62 52 52 43 39 23 17 17 17 29 39 14 13 13 23 39 44 43 52 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 62 43 43 39 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 41 23 23 12 39 39 62 62 62 62 62 62 52 39 39 29 23 13 12
12 12 23 39 43 62 44 44 29 27 23 23 39 43 62 62 62 45 43 43 43 43 39 62 44 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 43 43 35 35 29 35 18 11 8 8 8
10 15 43 43 43 39 43 39 39 18 19 19 39 39 62 52 43 43 39 39 11 12 12 23 39 44 52 52 52 62 62 62 62 62 33 33 11 11 11 33 33 39 43 43 62 39 20 15 12 9
9 9 33 33 52 52 43 43 35 35 35 44 44 52 52 52 62 62 62 38 38 17 19 19 44 38 57 57 43 43 43 43 35 35 35 35 28 38 35 35 31 39 43 42 42 45 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 43 43 34 38 15 28 19 27 29 39 39 57 44 32 23 17 20 20 43 43 52 52 43 52 52 54 54 54 44 44 21 24 12 32 32 28 28 13 18 16 27 12 14 32
38 57 50 19 19 9 9 9 27 27 32 20 20 17 27 16 11 11 11 18 24 32 28 28 28 14 14 14 28 28 30 38 24 25 13 15 18 19 19 20 20 20 34 44 57 44 44 23 25 25
41 26 19 14 8 8 8 8 8 10 18 12 11 9 9 9 9 10 10 15 15 12 12 9 13 13 15 23 22 23 18 15 15 15 15 15 13 15 24 16 22 24 24 16 12 12 9 9 9 12
18 24 30 33 37 39 34 37 32 22 22 12 11 10 10 15 17 13 12 12 9 16 11 10 10 19 19 24 15 20 18 21 12 11 11 12 10 14 16 16 21 14 10 10 19 19 15 10 10 10
12 10 10 8 12 8 8 8 10 16 23 12 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 8 9 9 10 10 13 12 12 9 9 12 13 14 34 34 22 15 9 9 9 10 10 9 9
9 10 10 10 10 10 10 10 7 7 6 8 8 11 11 11 11 13 16 16 16 21 17 17 14 25 13 10 9 9 9 10 13 17 16 10 8 8 8 8 8 11 9 9 10 9 9 9 9 9
7 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 10 10 10 12 12 10 10 8 8 8 8 12 10 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8
8 8 9 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 7 15 8 8 8 8 10 8 11 9 18 10 10 10 10 11 11 11 13 11 8 8 8 10 8 8 8 10 15 11 16 11 10 10
10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 12 15 14 10 9 9 8 8 8 8 8 11 10 15 8 8 8 8 13 11 12 11 11 11 13 13 11 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 10 10 19 9 9 9 9 9 9 10 11 13 11 11 11 11 11 12 10 8 8 8 8 8 13 13 11 11 11 11 11 8 10 8 6 8 8 8 8 12 12 8 10 10 18 15 11
8 8 8 8 10 15 19 14 10 10 10 12 12 12 10 10 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 8 8 8 6 8 11 11 12 12 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8
8 8 11 11 18 11 11 9 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 7 13 15 13 10 8 6 6 6 12 12 19 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 19 17 14 8 8 6 6 8 6 8
8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 7 9 9 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 6 9 12 10 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7
10 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 |