BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-052N12.T7 (MSMg01no052_n12.b1) | MSMg01-052N12.TJ (MSMg01no052_n12.g1) |
ACC | AG281223 | AG281224 |
length | 701 | 697 |
length of high quality (start - end) | 246 (66 - 311) | 512 (69 - 580) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no052_n12.b1 PHD_FILE: MSMg01no052_n12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:53:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no052_n12.g1 PHD_FILE: MSMg01no052_n12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:53:35 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATTTGCGGCGCTAAACGACTCCTATTTTCAGAGATGCGGCGGAATTCAA
AAGGTTGACTGTTACCATCTTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCGTGCATGCTTGTAATGA
ATTATACTCTGGTAAAATGAAGAGAAAATGAATTTATTTTGCTCACAGTT
TGAGGTGTAGTCCACTATGACAGGTTGTAACAGCTGTCATGGTCAAGAAA
CAGAACAAGGAATATTTGTGTTCCTCCAGTGCAGGATCTTACCCATGGGA
ATGATACCACCCTTTTTTGGCAACTCTTCCAACCCCGACTAATTTAATCA
AGATATTTTCCACAGGCACGCTTGGAGTCAATCCCCTAGATCTTATCAGA
TTGAGAATCAAGTTGCTACATATCAGTTGCTACATATATGAGAGTATTTG
GGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACCAAA
TCCCAAGTGTGAGAGAGTTAATTCTCAAGATCACCCACAGCATGGTTGTA
TTTACTGCTCAAGATAGTTGGCATTAACCCCTGTCTATATAGATTTTTCT
TTGTACCCATATAGGCTTTCACGCTTCCCAACACTGATGCAGAAGTTGTG
TCTCTTTGGTGCTTTCCCATGAATACATGCAATTTCTTCAGGCCCGCCTT
G
| GCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTAGAACAAGTTACAAAAATAGAGCCAGCTT
ATTCTGGTAGAAGCTCAATGAGATTTTTCTAGACCTCTGCTAATCAGAAC
ATGGAGAGGCACTGGACATCGTTAAGATATTTTGACCTTTTTTTGATGTA
GGATTTTTATCTCTTTATTCTCCCAACCTTTGCCTAGACAAATCCTAACA
GCCCCTCAGAGTTCAGCTTGGAATTAATCACATTTTAAATGTTATTTTAT
TTAGTGTGCTCGGGGAGTCCACACACACATGTGCACACCAGTGGAGCTAT
CAGAGAACAACTTGCCAGAGTTGGTTCTGTCCTTCCACAACATGAGTCCC
AGGACTCAGGTTACCAGACTTGACAGCAGGAACATTCACCAGCGGAGCCA
TCCTGTTGGCTCTTATGCTTCAGCTTCAAAACAGCGTTGCGTCGCGTCGC
ATTGCTTCGGAACACTCACCAAGGTTTATTGATGCTTGTTTCTGGTCTCT
CATCCCTGATAAACTGTATTCCCCACGGAAAATGAGACATCCACCCCTCC
TGTTTGTAGCTGCTTCCCAGTTCTAGCCGACAGCAGATCACTTAGTATGC
TTGTTGACTGATTCTCACTTTGAACTTTTCATTAGTCATCGATCTTA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 19 21 23 23 22 13 13 22 23 19 12 8 8 8 19 19 23 21 10 10 10 22 21 14 20 16 15 15 10 9 8 6 6 6 6 6 6 8 19 16 30 33 33 30 28 20 17 17
23 21 19 8 8 7 7 9 9 9 9 9 9 10 15 16 21 29 33 30 30 35 38 36 36 29 36 33 33 33 33 33 37 42 42 43 43 43 48 40 40 40 40 42 42 41 41 41 43 50
50 50 50 50 68 50 50 48 48 48 48 32 29 17 17 17 19 32 32 54 57 57 57 57 57 57 54 46 46 43 43 43 44 44 44 44 57 43 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50
50 57 54 54 54 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 50 50 50 50 50 52 52 43 43 35 35 26 35 46 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 39 39 39 57
57 43 39 39 43 43 35 35 35 39 39 43 43 52 52 57 57 57 57 57 35 33 35 29 31 43 44 42 45 43 44 23 23 23 27 33 35 42 38 43 38 39 43 43 43 43 33 29 42 42
43 32 32 38 43 43 52 52 52 52 57 50 50 57 50 50 50 54 57 57 57 52 50 50 57 50 42 37 35 35 42 42 32 32 28 33 37 46 32 25 11 11 11 24 25 36 36 33 32 24
32 27 44 43 44 44 44 30 28 24 21 11 14 14 16 21 19 21 12 13 19 18 23 28 36 37 43 42 40 28 28 28 30 41 42 42 37 30 30 32 42 39 40 36 28 25 25 32 37 34
37 22 22 26 26 35 41 39 32 32 30 30 22 18 15 15 12 12 12 12 16 19 19 13 12 24 24 35 37 37 43 47 47 47 43 37 37 28 23 23 28 24 32 33 30 21 28 21 25 28
32 34 28 18 12 12 19 19 30 31 37 37 39 39 35 35 35 59 47 47 47 37 28 28 23 24 28 37 32 39 32 32 26 33 38 57 57 57 57 57 43 39 41 46 46 47 47 48 46 44
37 37 28 28 28 39 44 48 54 48 48 48 48 46 46 46 48 48 57 43 43 30 30 30 30 30 37 42 39 35 35 30 33 32 59 39 32 30 30 28 28 28 28 21 26 15 20 20 24 21
14 11 10 11 9 13 14 18 21 16 14 10 10 10 14 10 8 8 8 6 6 11 19 19 22 11 11 11 8 8 8 8 8 10 10 10 10 16 11 11 8 8 11 8 8 8 8 6 6 8
8 10 10 10 15 13 11 10 16 19 21 20 18 8 8 6 6 8 8 12 12 11 11 11 15 13 10 14 12 11 9 9 13 18 16 14 14 16 13 13 10 11 10 10 9 13 10 12 18 24
15 13 9 7 10 8 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 11 11 10 10 9 9 9 9 9 9 9 19 12 9 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 7 7
7 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 12 12 19 16 19 10 10 8 8 8 8 10 16 10 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 13 11 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
6 | Open.Hide. 8 8 8 8 11 13 9 10 10 15 18 28 30 30 37 37 25 23 28 23 23 32 37 34 23 14 9 7 7 8 7 7 7 9 11 13 11 16 13 13 15 15 12 11 12 14 26 22 33 33
37 23 21 11 10 11 11 14 14 18 13 20 18 22 30 30 26 24 24 16 23 21 33 28 35 32 35 37 37 37 40 50 57 57 57 57 57 42 42 42 42 42 42 47 47 42 42 42 50 57
57 68 68 54 54 54 54 47 48 48 48 48 48 42 42 36 24 19 19 32 36 42 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 50 50 50 50 50 37 43 43
47 57 47 47 48 57 57 59 54 54 54 54 57 57 54 54 54 57 57 68 57 59 52 52 52 57 50 50 50 50 48 46 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 52 57 57
52 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52
52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 38 34 14 14 16 28 35 43 41 41 44 44 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 43 43 35 35 35 43 43 52 52 57 57 57 41
38 18 18 18 32 26 39 35 29 29 39 44 57 43 43 23 18 15 12 12 12 13 18 13 13 17 34 34 31 43 43 57 57 57 57 52 43 43 43 42 35 35 38 44 43 52 52 59 59 59
50 43 35 37 37 43 43 37 38 38 50 50 50 50 32 32 28 28 43 44 44 50 43 37 32 32 35 37 43 39 43 43 37 43 42 48 43 47 47 42 42 37 37 37 42 42 37 44 42 37
30 37 42 47 41 43 36 36 23 23 36 44 47 57 44 44 30 30 30 36 28 30 30 37 43 42 32 32 32 42 42 54 43 43 43 43 43 47 43 39 39 39 36 36 43 39 39 32 30 30
32 32 37 35 35 28 34 34 28 22 20 20 27 30 30 37 30 30 28 34 28 28 22 18 20 26 21 24 28 34 34 48 48 37 37 30 30 30 37 37 47 41 37 31 28 33 27 20 20 26
25 28 32 34 28 28 25 34 33 37 31 32 24 21 21 16 16 10 20 16 20 18 30 28 28 34 28 32 25 18 17 17 24 23 13 16 11 11 11 10 19 12 14 14 30 34 36 35 31 30
17 9 9 9 9 12 12 14 14 14 18 21 19 18 18 30 24 17 18 13 13 10 13 16 15 25 23 23 18 13 14 12 12 12 13 13 10 10 10 12 18 19 19 9 9 10 10 10 10 18
19 24 22 25 13 12 8 8 8 8 9 13 9 9 10 10 10 12 15 15 22 18 14 14 17 14 18 17 21 14 14 13 25 18 23 23 23 28 24 28 19 19 12 12 12 10 10 |