| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-053M24.T7 (MSMg01no053_m24.b1) | MSMg01-053M24.TJ (MSMg01no053_m24.g1) |
|---|
| ACC | AG281924 | AG281925 |
|---|
| length | 696 | 1,222 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 473 (44 - 516) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_m24.b1 PHD_FILE: MSMg01no053_m24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_m24.g1 PHD_FILE: MSMg01no053_m24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:54:50 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGAGATCCGCGG
AATTCCTCTTATACTGTCATATGAACCATCAATATAAGTATCTGCCAGTG
GACTGGTAGAAGGTGGAACGTTTTTTCGCAATCACAAACTCAGTTTGTAT
GAGAAAATCCAATAGCTTGCCAGCTAGATAATGATTTCCTATCCTTCCCA
TAGTAATCAGCAAATAAAACTTGAAAATACATAGAGTTCTGTAATGCTCT
TAAAAATTGATTGCTAATTAAGGATAATATAATACCATAAATATTCAATC
CATATAATTACTGACATCAGGTCCTCCCTAATTTACTAATTAAGTAAGAT
GAGTAAGGTAAGCAGTTATTATTTTATGCCCTTCATTGTGTAAATAAATT
CATTCTGAAAGTTTATCTTCTTGTGCTATAATAACTGTAGGAGACAATTT
AGTGGGTAATAAAGTAAAATTAAAGGAACTGAAGGATCCATATGATACAC
AAATGCTTCTTTTAGTTGGGATTCAAATAGCTATAGTTCTTTTCTTGTCT
CTTAAAATAATTTGAGGACCATCCAATGCACTCTTTCTTTCTAAAATTTT
AAATAAATTGGTTAGTGCTTTACCAATACCCAAGTGCGCTCATGAATTTT
AGAGAGGAACTGGAAAAACAATTTTCTTTTCCCTGTTACGCTTTAA
| AGCGAATGAAAATAGAGAAGGATTAGGAANGAAAAGCAATGAACTCTACA
NNCAGCGGGGGGGAGAGGTGTGNTGCGAGAGGGATTATCCCAAAAAAAAA
GAGGGAGTGGTGTGGAAGAGGAAGAGGAGGTTGTTTAANATGCGACCTAC
ATCTACTACTCTCTAATACACCCCCAATAAACCCTCGATCTAGATCTCAT
TCATATACCCCAATACAGAAAAATGGATTTTATATATATAAACTATATAC
TTGGTATAATTATCGATGGTGTATATATCATGATATTTCATAAATCGATT
CATACGGATATGAATGCATATATCCGGTATAGAGATGTTCATATTATATG
ACTGCTCATGAGGATAAGAATGGCCTGGTATACCATCATGACAGATGTGT
GGTAGGCGGCTGAGGGCGATACGCCATACTTCCTATGTTCTATTAAACCA
CGCGCACAATAACACTGAACCAATGAAAAATAAGATAAGAACATAATTAT
TCTCTCATTAGATAGAAAGGAGAGACAAGTAAGCGAGGGGGAGAAGAACA
GGCGGAGGCAGTTATAGTTGGGGGGTAAGGACTACCGCCGACGAAGAGGA
GGGAAGTGGGTGGCGGTATGTGGCTGATGAGTCGATGGTGTGAGGGTGGT
AATACGATGAAGGATGAGTGATCGGATAGAGAGAGATGAGATAGGAATAT
ATACGTATAGCGAGCATCGATGTTTTGATGATGGTGTGTGCGCGTGTATG
TATGCGATAGAGCGTGGTGAGACGGATATCACGGGGAGCGGGAGTGATGT
GAATGAGAATGCATACGGTAACGATAGTAATGAACGAGAGGTATTGTCAG
ATTGTNAGAGTAAAGGTGCGGTGAGCGGCGCGTATAGTGGCGATAGGAAC
GAGTGAGNGAAGGATATAGAGATAGTAGAGGCGAAGTAGGAGCGAACTGA
GGCAGAATGGTAGAGCATGTGAGACAGAGCAAGGTGAGAGAAATGAGTGG
TGAGTCAGAGACGGTGATATGAGGGACGTGTGACATAGTAAGACGGTAAC
AGCGATAANAGAACTGTAGACATTAGATGTGAGNAGTACGAGAAGATGCA
TGTGTGGTACAGGGGATGGGACCTATTAGCAGATGAAGGAGCGCTCGTGA
CGTGCGACATTTTATCACCGCCATTGCGCAGGTAATANGTGCAGCGGAAG
GNGACGTTATCGGATATGTAAN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 8 8 12 17 12 23 30 23 17 10 10 14 23 23 33 36 36 33 43 43 43 47 30 29 30 30 30 30 28 22 10 8 8 8 8 8 15 8 10 10 22 23 48 48 48 36
36 36 50 50 50 59 59 50 50 50 42 42 33 25 22 11 11 11 13 18 29 34 37 37 31 33 31 36 36 36 36 36 50 57 53 50 50 50 50 50 47 47 47 42 42 40 40 36 42 54
54 54 57 57 57 68 68 57 57 57 50 50 50 50 48 48 57 57 57 54 48 44 32 26 14 10 9 11 11 27 38 57 50 50 50 47 47 41 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 50 50
68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 48 48 48 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 59
59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57
57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 54 54 57 59 57 57 54 54 54 57 57
57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 44 48 48 39 42 35 35 35 44 44 54 59 59 54 54 54 46 46 47 47 59 41 30 22 28 31
37 37 48 48 57 43 42 39 35 35 40 47 48 48 32 32 20 25 29 33 37 37 43 37 32 28 28 28 33 36 18 11 8 8 8 11 13 15 18 21 24 30 37 37 43 43 43 43 46 57
57 59 59 59 59 59 57 48 43 43 43 43 43 43 48 54 57 57 48 43 41 41 28 28 31 40 37 43 43 43 43 43 46 43 41 28 21 21 28 24 35 37 36 40 39 37 28 32 29 33
24 24 23 28 23 25 25 25 33 29 29 33 25 24 24 28 28 33 39 43 32 28 23 23 23 25 24 22 30 30 30 19 19 20 20 28 32 34 39 39 33 34 32 24 19 13 23 11 11 11
11 11 13 16 30 34 43 46 41 40 40 32 19 10 10 9 9 10 12 12 10 10 10 15 13 23 25 26 20 20 23 23 28 28 28 28 37 37 43 36 34 33 33 28 24 24 16 18 13 16
14 11 8 8 8 8 11 11 10 10 15 15 24 24 22 15 19 12 13 13 21 13 12 8 9 10 15 13 11 12 15 22 12 12 9 17 15 19 12 11 8 15 8 8 8 8 14 12 11 12
12 9 8 10 12 10 10 11 21 15 12 12 9 11 9 8 8 10 10 10 15 8 8 12 8 10 8 8 10 13 12 12 10 10 7 7 8 8 9 9 13 13 17 25 15 14 14 16 13 8
8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 14 12 12 9 11 13 11 16 19 19 11 9 12 10 12 8 9 8 8 8 8 8 10 16 17 10 10 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 10 8 6 7 12 7 6 8 6 6 8 8 10 10 10 12 10 11 8 8 8 7 6 6 3 0 3 6 8 7 8 9 6 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 3
0 0 3 6 6 6 6 6 6 11 19 17 9 6 6 6 6 8 10 10 16 3 0 3 10 8 8 10 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 7 7 6 6 6 13 18 13 8 8 8
6 6 7 7 6 6 8 8 11 17 10 8 9 9 6 8 6 6 6 6 6 6 10 8 10 10 10 9 11 11 8 9 9 10 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 6 7
10 15 15 17 10 8 8 8 8 8 8 13 12 8 8 8 8 10 8 8 11 14 15 15 8 8 8 8 8 12 11 11 9 6 6 6 6 8 6 7 8 9 13 8 8 8 8 8 8 10
9 9 6 8 6 6 12 10 9 9 9 11 11 13 10 8 8 6 7 10 10 7 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 11 12 10 11 17 14 10 10 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 13 14 10 8 8 8 9 10 10 15 10 10 10 10 9 8 8 8 8 13 19 10 10 10 10 8 8 8 8 8 13 10 8 7 7 10 10 9 9 9 7 8 10 8 8
8 11 9 9 9 8 8 8 10 10 8 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10
8 8 9 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 10 8 11 10 7 7 7 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 9 9 11 11 10 10 10 8 8 6 7 10 8 10 9 9 9 9 9 10 10 9
9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 7 7 10 6 6 8 6 9 9
6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 7 8 8 10 10 10 10 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 7 9 10 8 15
9 9 9 8 8 9 9 9 10 11 11 11 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 7 6 6 8 6 11 9 9 7 12 10
9 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 7 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 13 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 7 6 6 8 8 8 8 10 10 12 12 10 11 10 10 10 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 10 8 7 7 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 7 8 8 7 8 7 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 8 6 6 6 6 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8
8 8 6 6 3 0 3 12 13 11 10 6 6 6 7 10 6 8 8 8 8 8 8 11 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 7 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 6 6 6 7 6 6 6 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 13 11 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 12 13 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 8 13 8 8 6 10 6 6 6 6 6 6
8 6 7 8 9 8 6 6 6 8 6 8 12 8 10 8 8 9 8 8 6 6 6 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 8 6 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 7 9 9 9 9 11 9 9 8 8 8 6 8 6 6 6 6 7 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 11 8 8 3 0 3 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6
3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 3 0 |
|---|
