BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106O05.T7 (MSMg01no106_o05.b1) | MSMg01-106O05.TJ (MSMg01no106_o05.g1) |
ACC | AG320851 | AG320852 |
length | 731 | 1,942 |
length of high quality (start - end) | 120 (129 - 248) | 527 (130 - 656) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o05.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_o05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_o05.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_o05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:57 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TAATGTTGGCTCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTCAAAGAGG
ATCCGCGGAATTAACCTTACTCTCAAAAAATAATTAATGCCAATACTTCT
TATGCTCTCCCACATAACAGAAACTGAAGGAACTTTCCCCAATTCTTTTT
ATGAGGCCACAGATAAACTCATCTCCAAACTCTGCCAATAACCAATGGAG
AAAAAGAAATACAGACCAATTTCTCTAATAAATATAGATTGAATATTCCC
ACGAAAACACTGGCAAACTGAATCTAATAACATACCAAAAAGATCACCCT
CAATACTAAAGTAGGTTTTCACCCTATATATGCATGGATGGCTCAAAATA
CGCAAATTCATATGTGTGATTTACCACATAAAGACCGATTCGGCAAGGCG
AATATCCTTTCGCCATGTCCTCACCCAATATCCCTTATCTTGATCTTCAT
CCATTACCTGACATACCTATCACACCTTTACCTTCTTCCATCTTCTACCA
CACGTTTTATTAAACATCCATTATCCCTTTTAGCTCTACTCTCCCACAGC
CCATTATCTATTCTACTCCTCTCTCTCTACTCTCTATCACCTATTTCTCT
CTATTATCTCCGTTTGCATCTATATTCTCCCCCCCTTCTTCTTTTCATCC
CTTCGCATTCTTTTCTCCCCTCTTTCTGTTATTAATTACGCTTTCTTCTC
TATGTCATTCCTCTTCATTTTTTTCTTCTTG
| NAATAGAACTATTTCTNNTNNGGGAGTATCGTNGGNCNCGTGNCNXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTTACTTAACAAAGC
CCTAGNTTTCACCAACCCAATTAGAATAAAATTACCATCAGACAGCACTT
AATGCCTATAGCTGAAATTTGCCCACCTATATAATGTTTCCTCCAATATT
TTGAAACATGCCTTGATTTATGACTTTCTTTGTTTCTAAAAAAAAAAATG
GGGAGGGGATAGGGTGTTTTCGGAGGGGAAACCAGGAAAGGGGATAACAT
TTGAAATGTAAATATAGAAAATATCTAATAAAAAATTCTTTACCAAACTG
TTATCACATGAAATTTGAAATAATCTAAACTTGTGTTCATAGACTTTGGC
TGTGTTTGCCTTCAGAATAAACTAATCTCTTCTCATCTTTAAGGTCTGAG
TTGTGATTCTTGGCAACACAGGGTTGTCTCTATAGGCATAGCATCAGAAT
ATGTTCTGTACCTTTAACATGTGAGACCCATTGAAAGCCCACGGAGGGTA
CCCTCAAAGGGAACTGGGGAGCCAAGGCTCTTTCACTGTCTCTCCCTGTG
TTGACATGTGATGTCAACTTACACTCCATCACTATTGTGCTGCTCCATCA
ACAGACTAACAACTGAGAGGAACACAAGCTTTCATTTCTATTAAGTCAGC
TGCAACAGGTGTACTGTAATCCGCCAAAGCAGACTTATAATGTTTCCAGC
AATGTATTTGCTCAATGATTTGATTTATGAATTTGCCTGTTGCTAGAAAA
TTTATCCAATTTTTAACATTTAATAATGCAGATTTTGTAGTACCTTAAAT
CTGTGTCCTCCAGCCAGGGTAATTTCAAATTTGCCTTCAAAATAAATTGC
TACCCCTCTGTATGTAATACTTAGAACTCCTTACTTTATCGAATGTTGGC
CCTGCATTTTGGAGCTCCTTCCTAATTCGGGTTTTCTGATTTCTTACTAA
ATTGGTTTTAAAATTTAAAATTTTTTTTTTAATATATTCCTTCTTTACAT
TTCAATGTCATTACTTTACTGTTTCCTTCCAAAATCCTCTAATACTCTAA
TTCCCCTTTTTTCATATTTATGCATTATTTTTTTCCTCTGTTTTCTATTC
TCCATACTAATTTCCTATATTACAAGCTTTCTTTTATTATTTTTTCCCTT
CTTTTTGGCATTAATTCTTTATCTATTACCTTTTCTTTTCTTTTCTACAT
TTTCATTTCCACTCGCTCTTTCCATTCTTAATTCTTATTCACCTTCTCTT
TTTCTATTTTTTTTTATTTCAATTCTCCTCTATTTTCTCATTTTTCACTA
ATTCTTTTCTTCCTTTATATTTTCATTCTTATCATTTTTTCTCATACTTC
ATCATCTCTTGTTTTATTTTCATTCTATTCTCTTCACTTCATCTCTATTT
TTGCTTTTGTTCACTCATATCTATTTCATACTCCTCTTCTTTCAATATAT
TATTCTTTCCATTACTTTATCCTATTTCTACTCTTCTATTCCCATTCTAC
TATCTCCTCTTCACACTCATATCTTTTTCTATTGCTTTCTATAGGTCACT
ATAGATTTCTCATCTTACCACTTTTATTCTTCACTCTCTATATTTCTACT
TCTCTCTTCTTCTCATCTCTATATTACCTATCTCTTCTCTCTATCTTCAT
TTCTACTCTATCTTATTCTATCTACAATGTCTTTTATCCCCCTTCTTCTT
CTCCTCATCTTTTGTACTTCTATTCACTCTCTCCTCACTTTAATTATCAT
TTCCTAATACTNCTTACTATCTTTCTATTCTTCTTTATATTCTACTCTCA
ACCTATTANATTTCCTTTTCTACTCTATCTTATTCTCTATCTTTCTATCA
TTCATCTTCTTATTAATCTGCTTACCTCTCATAATATTTTCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 12 19 17 28 22 19 25 15 15 18 21 21 29 29 28 33 33 43 43 35 35 24 19 10 10 10 9 9 10 12 10 10 10 18 18 22 21 19
19 14 16 19 26 33 31 29 13 12 10 10 9 17 11 11 12 9 11 9 9 9 9 9 16 22 30 28 29 29 30 30 30 43 43 35 34 34 28 23 23 33 33 34 34 42 43 43 42 48
57 57 48 43 46 43 47 47 34 34 33 33 33 33 28 22 18 18 14 14 15 19 12 12 12 15 15 17 18 18 28 32 37 43 48 48 57 47 48 48 48 42 42 42 47 42 42 48 57 48
48 48 48 39 31 31 20 20 22 31 31 48 48 42 42 37 37 29 40 37 41 47 48 42 37 35 37 42 47 57 42 42 37 30 30 36 28 28 31 37 37 47 39 35 32 32 16 16 20 27
20 28 28 35 29 29 42 42 35 35 32 28 22 16 18 11 11 11 18 18 23 28 28 42 42 42 42 35 41 41 41 36 37 28 28 28 28 37 43 32 39 25 25 25 25 25 30 22 19 15
8 8 9 16 18 22 12 14 15 29 23 28 24 16 17 19 16 19 14 17 12 10 10 10 10 18 12 12 12 14 11 10 10 10 11 15 12 13 13 13 11 16 18 22 20 20 16 14 8 8
8 8 12 12 25 28 28 22 16 16 11 15 11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 10 13 18 15 10 10 8 9 9 11 15 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 15 12 12 12 11 12 10 8 8 12 13 14 13 14 10 8 8 6 6 8 8 8 9 12 10 10 8 11 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 9 9 9 10 11 11 15 19 22 22 19 15 12 13 10 13 8 10 10 10 13 14 14 12 12 10 12 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 9 10 8
8 9 8 8 8 10 10 10 15 10 12 10 19 12 12 12 10 10 10 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 10 14 13 14 11 11 11 13 9 8 8 7 6 10 8 9
8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 11 11 11 10 10 19 17 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 16 16 14 9 8 8 8 8 8 10
18 12 9 9 8 8 8 8 10 13 12 8 15 10 11 11 18 18 14 13 13 14 14 9 13 8 8 8 8 9 9 10 9 10 10 10 10 8 8 11 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8
10 11 12 12 11 11 12 12 10 13 8 8 9 10 8 8 8 8 8 16 8 8 6 6 8 8 11 11 12 12 18 18 22 18 19 13 13 9 9 9 9 10 10 8 12 12 17 18 13 12
8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 13 13 10 10 10 10 8 8 8 6 6 10 8 10 10 9 6 6 6 6 8 8 8 7 6 8 8 10 10 10 16 16 15 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 11 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 13 9 10 10 13 15 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 9 3 0 0 3 0 0 3 6 6 6 8 8 7 9 9 10 3 0 3 3 0 3 0 3 8 6 3 0 3 0 3 6 6 6 6
15 13 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 19 22 28 22 20 17 19 16 15 15 18 20 20 24 20 20 22 24 24 24 22 22 29 39 33 33 33 25
24 20 15 13 3 0 3 17 8 8 8 22 22 19 16 12 17 11 11 10 10 9 9 10 10 11 14 18 15 20 27 28 28 28 28 35 36 50 50 50 50 50 53 53 53 50 50 42 42 42
40 47 43 37 42 35 28 28 28 28 28 28 22 28 24 30 41 23 19 12 10 10 10 10 9 17 17 23 28 28 31 31 33 30 30 36 36 36 50 50 50 50 50 50 47 47 47 47 47 53
53 50 68 68 68 68 68 47 42 42 42 42 43 43 43 43 43 43 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 51 48 48 48 48 48 48 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68
50 50 50 47 48 47 47 47 50 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 57 57 38 50 50 57 52 52 54 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 50 50 43 43 43 44 37 37 37 48 44 48 48 57 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 48 48 57 46 36 36 25 36 36
57 57 59 57 57 54 54 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 50 50 50 48 48 48 42 42 42 43 43 48 48 43 43 48 40 43 39 35 35 39 39 39 39 33 33 33 33 33 37 39 39
43 43 47 59 36 31 28 28 32 34 28 28 34 37 37 34 32 36 36 34 32 16 15 13 12 15 11 11 11 21 16 33 28 23 22 22 26 28 39 48 48 42 59 59 47 41 39 35 29 27
25 25 16 13 11 9 9 14 9 9 13 23 24 39 35 39 37 37 36 37 37 37 33 32 27 22 18 20 19 28 24 28 28 31 31 31 34 34 34 28 28 32 37 24 21 15 15 14 26 26
37 36 36 15 17 8 8 8 8 8 9 9 10 10 17 10 10 14 9 6 6 6 6 10 15 18 28 13 13 13 28 28 28 28 22 21 18 18 28 28 30 18 11 8 8 10 13 11 13 14
14 13 10 10 10 10 10 15 15 10 11 10 12 13 18 19 12 10 10 11 8 8 8 8 8 9 14 23 21 21 13 10 13 10 8 8 10 10 9 9 13 15 18 30 30 28 21 22 22 22
31 26 23 21 10 10 10 18 19 9 11 11 8 9 9 10 10 12 10 10 10 17 20 21 17 12 12 11 13 10 12 14 17 18 11 11 12 15 15 20 24 14 12 12 9 9 10 9 8 8
10 11 13 13 14 9 8 10 8 10 8 8 8 10 8 6 10 10 14 15 12 12 9 9 12 15 15 13 9 9 9 10 9 9 13 10 9 10 9 9 9 16 16 33 36 39 32 24 16 12
12 10 9 8 8 10 10 11 14 13 11 11 8 8 8 8 8 8 11 10 9 9 9 10 12 11 11 11 12 16 10 10 9 9 8 8 8 10 19 13 12 13 13 11 10 11 10 19 10 10
10 10 10 10 10 9 9 10 7 6 8 8 10 9 9 9 9 8 8 9 10 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 11 11 8 11 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 19 18 15 13 12 13 11 8 8 8 8 7 7 9 11 10 9 9 8 8 8 11 13 13 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 17 11 11 10 10 10 11 12 12 9 10 10 10 10 11 25 25 28 19 19 18 11 9 9 6 6 6 6 6 6 8 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
15 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 10 8 8 6 7 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 11 11 21 19 15 10 8 8 12 10 10 6 6 8 10 10 8 8 8 8
8 10 15 16 16 12 10 12 11 11 9 12 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 7 6 8 8 9 9 13 15 10 10 8 10 6 6 6 6 8 8 13 11 10 8 8 9 12 10 16
10 10 8 8 8 8 8 8 9 11 11 12 11 11 11 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 10 10 8 8 8 8 10 13 13 12 8 8 8 8 9 9 9 11
10 8 8 8 11 11 11 10 10 10 13 12 12 12 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 10 10 8 6 6 8 6 6 8
10 8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 6 6 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 11 8 8 6 6 8 8 13 10 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13
10 10 9 8 8 10 8 8 13 17 15 15 11 8 8 8 15 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 9 9 12 10 8 9 10 10 13 13 10 10 8 8
8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 10 8 12 9 8 8 10 8 10 13 12 11 11 10 10 8 7 8 6 6 8 6 8 8 9 18 15 11 10 10 10 10 13 13 14 10 8 8
8 8 8 8 10 7 6 8 8 9 9 9 9 10 10 10 11 13 12 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 15 13 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8
8 8 6 6 8 8 10 9 6 8 8 6 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 7
13 10 12 10 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 7 6 8 8 10 10 10 8 6 6 7 7 10 12 10
10 10 10 15 11 8 8 8 8 8 10 15 16 15 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 9 9 12 8 8 8 6 6 9 9 10 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9
9 9 9 9 11 12 10 15 13 8 6 6 6 6 6 8 6 7 9 9 11 11 10 13 13 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 10 8 10 10 12 15 10 8 8 11 10 14
16 10 10 10 12 9 7 11 8 10 10 15 17 16 16 11 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 10 8 9 9 11 12 10 9 9 9 9 10 10 8 8 10 8 10 10 8 8
10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 10 9 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 13 8 10 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9
8 8 8 8 10 8 10 8 12 8 15 10 9 8 9 9 9 9 9 8 8 11 13 11 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 10 12 8 8 8 13 12 10 10 13 13 12
9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 3 0 3 10 8 8 9 12 12 17 15 10 10 10 10 8 8 9 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8
6 7 9 8 8 8 9 3 0 3 6 8 8 6 6 6 10 8 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 10 9 13 8 8 6
6 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 9 10 10 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 11 10 10 |