| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107C18.T7 (MSMg01no107_c18.b1) | MSMg01-107C18.TJ (MSMg01no107_c18.g1) |
|---|
| ACC | AG321058 | AG321059 |
|---|
| length | 1,258 | 1,487 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 531 (130 - 660) | 169 (203 - 371) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c18.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_c18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c18.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_c18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:40 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCATCTTTATNNNTAACATTGGGCGCTAACACTCCTAAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCCATTGGGATCCTGACACCTTTCATACCTTACCCTCAAGAAG
CAATTAGACCATAAGGCCCTTATGAGTGTAACCAACAGAGAAATATGATG
AAAATATTGCAATCATGAAATTATGATAACAAATCCATTGCACTCTTGAA
CTCACAGCAACTACTTTTACTTATACAAGATGCACACAAGGTTGGGTTGA
TGACGTGCTGTCTGCTATCATTGAGGAAACGGGAGATCCTGAGAGCTTAT
CACTATGAATATATATGTGCAGTGAATGATGCATGAGTAAGGAGACACTT
TCTTCAGTGGTATGGATATTGCTAAGTGCTTTTTTTTATCTTGCCTCTTT
CATCATCACTGTAATCACAAGAATGCTCTATATACTTCCTGTATTTGCAA
TATTTTACCTTCCTTCTAGCTCCTGCCATCTTTCAGCCATACTCACTATC
AGATTCACAATCTAGTATAATTATTATTGCATATATGTGCAGATATATAC
AACCTTCTGTAATTTTTACTTAAATATGTGTGATTGTCTGTGTGTATATG
CATGTGCATATGTGTGTGCAAGTATGTATGTTTGTGTATGTGCATGTATG
TGTGTACATATGTGTACCTGTCTGTATGCGTGTGTGTTTGTGTAGGGTAT
GTTTAAGACCGATTGCTGAAGAATGGATAGCCTATAGAGTCTTCTTCTCT
AAAAATGTCCAATTTTCTTTCTTTCACCATCAGTATTTTGGACAAAACCT
TTTTATAGCAAGTTGTACCCAATTATTTTTTTGAAATGAAGCATTTTTTT
GCATCTGATGCATATGTATATATTCCTCTTTATCCAGTTTTTTGCTATTG
TTTTGCTTGCTGATTCCTTGCTCTTTGTTAAAATAACCTTCACCCCACAT
TGTTTAATAAGGTTTTTTGGTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTAAATACT
CCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTACCCCCCCCCCCCCCCCTTTTTATACTAA
CTATACTTTTTTCACTTCAACGTCTTTAAATATTTTTCTTATTTTTTTCC
TTTATAATTTTCCATTCATATCTCTTCTAAATAATTGTTTTTTTTCCATA
TTTTTCTCTAAAATCTTCTCTCTACTTTTCTCTTTTTCTCTCTCTCCTTA
GCTCTCTTTACGGTTATTTACTGGTTAATCTCATTCTTTTCATCTTTTTC
GTTTATTT
| TTTCCATTAATATANNNCAAGCAGGAATGCGGTXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACTCTTAAGGGAGGACTAATG
AACGGCTGAGAAGCACCTGACCTTTGAAAAACACCCTAAGGCATCAGGGA
AATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGG
TTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGTAGATGCTGGAGAGGATGTGGAGAA
AGAGGGACACTCCTCCATTGTTCGTGGGATTGCAAGCTGATACACAACTC
TAGAAGTAAGTCTGGTGGTTCCTCAGAAAATTGGACAGAGCACTACCAGA
AGATCCAGCAGTTTCTCTTCTGGACATATACCTAGAACATGTTCCCACTT
GAAATAAGGACATTTTTTTTTATGATGTTCTTAACAGCTCTTATTTATTA
TAGTCAGAAAACGGGATTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCAAAGATGATTGTT
TCTCAAAAAAAAAAAGGGGGGGTTCTTCTTTGTTTTCCTTTCTCTTCCTT
TTCTNTTTTCTCTGTTTTTTATGCCTTTTCTTTATGCATAATCTAATTCA
CCTCGTAAGGCATATCTTTTTCTGAACTGTTAGTTAACTCTCTATTTTCT
ACTAGAAACATATAATGTTTTATGCATAATTTTTCTATTTATATTACACT
CACATTATTATTATTTATTCCCACGACTCTCCATCTTCGTAATATACTAC
CTAAATTTCTCTTATTATTATATCTAAAATATTCTTACTTTATTCGCTAC
ATCTTTTTTATCCAATTATTTCACAAACTTTATGTATCTAAATCATATTA
TAAATGTATATTGATTTATACATTAATTATTTTAATATTTCTTTTCTTTT
GAATTTTATATTATTTATAATACTAAATCTCATTACATACTGCTTTCACT
CCTATTAGTGATTATATTTATCTTTATATCTCTTATCCTCTCTATATCTT
CTATCACTTTATCTAACTTTCTTTCTCTTTTTACTACATAGTAGAGTACT
TCTTTTATTCTTTATACTTTATACNTTATTTCTCTTACTAATATCCTACT
TGTTTTCTTTGTCGTAATACATTACCTCTTTTTAATTTTTTATTTTTATT
CCTTCCTTCTTATATTGTCTTTCTATCTATAGTGGTGTTTTCTTATTATA
CTTTTCTTCTCTATATTCTTATCTCATTTCTTTTATTATCTATTGACATT
TATTTCTTCTAACTAAATCTATATATTCATCAGTACTTTTCATAATCCTT
CTTATTCTTATTTATATATCCTGATTATTCTTATCATTATTTCTACTCCA
CTCAGACTATTTCTAATGTCTATCTATCTCATATCTAGATCACATATTAC
AAATCTTCTCTCTACTCTAAATCTCCCATACTAAACGCCCTTCCTCAACT
TTATAATTATCTCTCTCTCTATTCTTTTATTTGTTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 7 8 8 9 3 0 0 0 3 7 7 7 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 8 8 12 19 8 8 8 10 8 8 8 21 21 28 34 34 31 31 37 37 37 43
34 43 43 43 53 47 47 50 36 36 36 36 36 36 31 31 39 37 33 30 29 21 19 9 9 9 9 12 15 11 10 10 17 16 20 20 33 33 33 33 33 36 36 50 50 47 47 47 47 47
53 53 53 53 53 53 47 41 33 28 29 28 22 22 12 11 11 13 11 11 11 11 11 12 11 17 17 17 17 20 20 32 32 43 59 43 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 59 59 59
59 59 57 57 54 54 54 54 57 54 54 48 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 68 68
57 68 68 57 57 57 57 68 68 51 50 50 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 54 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 62 62 62 62 62 62
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 47 59 35 35 35 47 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 59 59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59 68 68 68 68 59 59 52 43 43 43 43 48 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 44 44 24 24 18 12 14 14 12 19 32 32 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 47 47 35 35 35 35 37 24 24 12 10 8 10 10 8 8 12 21 30 32 47 59 59 59 37 39 30 32 32 39 41 59 47 43 43 40 40 34 34 28 20 20
11 11 11 22 22 32 32 30 37 37 47 37 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 43 43 43 43 43 40 43 39 21 17 10 10 14 27 32 48 48
43 59 46 46 57 59 59 57 54 48 48 48 48 57 57 54 57 57 59 59 57 43 43 43 59 57 57 54 48 48 48 31 31 20 20 20 34 30 43 40 43 43 48 48 43 42 39 26 26 14
14 14 24 27 39 40 43 43 47 47 59 43 40 39 39 32 35 35 35 28 31 41 32 32 28 23 25 34 30 30 20 16 21 29 30 46 39 39 39 35 35 35 37 43 43 43 43 48 48 57
57 43 39 36 39 39 24 24 12 12 12 30 19 20 12 10 10 19 13 14 23 32 41 41 47 37 29 20 19 12 13 15 23 27 18 23 25 26 26 20 25 19 19 17 17 23 23 28 37 41
33 32 32 21 21 12 16 9 9 9 9 15 19 29 19 20 20 20 23 12 11 11 16 21 9 8 8 15 10 15 20 24 28 22 21 12 12 9 12 10 8 8 13 10 10 8 13 13 12 17
12 28 28 33 26 19 10 10 10 10 17 19 17 20 17 17 16 21 25 15 15 15 16 13 10 10 15 15 10 13 16 10 11 11 11 20 23 27 26 14 11 10 10 8 8 10 10 10 8 8
8 10 17 17 15 13 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 12 12 12 11 12 14 22 25 23 21 17 8 8 8 11 8 9 12 13 10 8 7 9 9 9 10 10 10 13 13 11
18 18 19 19 13 14 14 13 13 9 9 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 8 17 8 10 6 6 8 8 10 12 19 16 10 9 9 13 20 21 32 30 24 16 14 14 16 16 18 28 23
26 10 9 9 19 23 22 14 8 8 8 10 10 10 13 12 15 15 14 10 10 10 19 17 20 13 13 10 11 10 10 8 8 8 8 8 11 12 12 12 10 11 11 11 8 10 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 15 13 14 9 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 12 15 24 21 14 9 9 9 11 11 8 7 8 7
8 8 12 25 16 11 12 9 10 10 15 15 25 22 22 18 18 17 7 7 6 6 6 8 11 15 18 13 13 19 19 14 14 28 28 19 16 9 9 9 8 10 8 9 9 9 10 10 8 8
8 8 10 8 7 7 8 8 10 10 12 13 9 9 10 10 11 11 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 8 9 9 12 12 10 8
8 9 9 10 12 11 11 11 12 14 11 13 11 11 10 10 11 12 8 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 11 8 8 8 8 9 9 12 9 10 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6
6 7 7 13 15 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 10 10 12 11 9 8 10 6 7 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 8 10 6 6 8 8 9 9
9 9 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 15 11 8 8 7 7 10 10 10 10 8
8 8 12 8 10 10 11 11 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 6 6 9 9 10 9 9 3 0 0 0 3 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 7 10 8 12 9 13 8 8 8 7 8 12 10 15 3 0 3 23 17
12 12 9 9 12 12 10 15 10 10 10 22 21 26 26 14 13 23 18 19 17 14 12 12 10 12 13 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 9 10 17 18 21 23 28 16 19 10 9 9 9
10 10 18 18 14 17 17 20 20 24 29 28 22 28 28 27 25 24 15 15 12 11 11 11 13 12 12 16 16 21 21 12 12 11 11 15 12 15 12 11 11 12 23 27 43 32 32 20 20 20
33 32 57 57 48 48 57 43 43 43 39 43 43 43 43 48 42 42 34 34 31 31 31 39 39 46 43 46 43 39 39 41 43 44 44 54 47 44 36 25 23 23 32 19 19 11 12 12 21 11
11 11 26 18 28 28 30 30 35 44 42 44 43 44 44 44 43 39 37 37 43 43 43 36 23 23 36 18 32 38 32 41 41 43 43 43 43 43 43 43 32 43 43 43 35 38 38 43 43 52
50 52 42 38 32 20 20 27 38 43 52 52 43 43 52 52 57 57 57 37 35 43 33 23 23 43 27 29 29 43 43 43 35 33 29 29 29 29 43 33 33 33 41 41 41 42 42 43 52 38
38 20 20 15 24 12 13 18 26 32 43 44 33 33 33 28 27 20 32 32 44 44 43 43 23 23 23 43 43 43 43 43 39 42 42 36 30 30 17 17 17 18 29 32 35 28 33 28 27 22
19 19 23 32 37 36 30 28 24 20 19 15 22 21 21 30 36 29 21 15 15 21 21 18 8 8 8 8 19 15 41 25 25 12 12 12 22 21 24 17 17 11 11 11 16 19 25 37 23 27
12 12 11 12 12 18 17 19 19 21 16 15 10 10 10 17 13 21 13 10 10 10 10 13 13 13 14 12 22 12 13 13 26 26 35 12 12 9 9 8 11 16 19 16 16 19 24 21 22 12
14 12 12 11 11 12 18 18 24 24 18 15 12 8 8 8 8 8 8 11 25 23 10 9 9 9 13 13 34 28 30 28 22 13 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8
10 10 12 12 9 10 11 12 13 13 34 26 15 15 15 13 10 11 13 10 9 8 8 8 8 8 10 11 14 18 15 12 10 8 8 8 8 9 10 10 13 8 10 8 8 8 8 8 8 12
12 8 10 3 0 3 12 10 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 13 10 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 10 13 10 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11
11 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 10 8 10 8 8 8 9 10 10 8 8 7 7 8 8 8 18 10 12 9 8 8 8 10 11 8 10 8 6 6 8
8 11 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 10 9 8 8 11 11 8 8 10 10 11 10 8 11 13 10 12 10 8 8 8 8 6 7 10 10 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 12 8 8 6 6 6 6 8 6 6
8 8 8 7 7 9 8 8 7 7 10 8 11 11 11 18 16 12 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 13 12 9 9 8 8 8 8 8
8 11 11 15 15 13 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 11 9 9 6 8 6 6 8 8 10 6 6 6 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8
8 8 8 6 6 7 6 6 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 14 11 10 8 8 8 8 11 8 7 10 10 13 10 10 10 8 8 8
8 8 8 11 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 13 19 12 9 8 8 8 8 8 9 8 8 10 11 10 9 9 9 9 8
6 6 6 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 15 16 10 10 10 10 6 6 8 8 8 10 9 9 9 8
8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 10 10 11 11 11 11 11 10 9 10 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 8 8 11 12 8 8 6 6 10 6 6 8 8 8 8 9 10 10 9 8 3 0 3 8 8 10 14 11 11 11 8 8 6 6 8 6 6 8 7 7 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 11
9 9 9 11 11 11 12 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 11 11 12 8 10 8 8 10 9 9 9 10 11 10 8 8 7 7 8 9 9 10 10 8 8 8 10 8 8 6
6 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 7 12 10 11 13 12 11 9 10 10 8 6 6 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 9 11 8 10 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 10 11 18 15 10 10 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 11 14 9 9 8 9 9 9 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 10 8
7 6 10 8 8 7 6 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 11 10 10 11 11 8 8 6 6 10 12 13 8 8 8 6 7 6 6
8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 10 8 8 7 6 8 6 9 9 16 13 18 18 16 16 11 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9
8 8 6 6 7 10 6 9 9 9 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 7 8 8 6 6 6 6 8 8 15 8 8 12 8 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 8 8 10 10 10 9 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 12 12 8 6 6 6 6 6 6 |
|---|
