| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107D13.T7 (MSMg01no107_d13.b1) | MSMg01-107D13.TJ (MSMg01no107_d13.g1) |
|---|
| ACC | AG321092 | AG321093 |
|---|
| length | 1,265 | 1,261 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 469 (128 - 596) | 539 (131 - 669) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d13.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_d13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d13.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_d13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:47 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCCTATATTATTNNAAGCATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTGATCTCTTGAAAGCCCCATTAAACACATGTTTCAACA
TGTTACATAAAATGGAAGCCCCTAAACCAATGCTTCTATTACAACTTATT
GCATTACAAAAATCACTGTGGAGAACTCTCACTCTCCATTGCTTAGGCAA
GAATAAATATGTGAAGGTTATATGTTCCACTTTCCATAATAAATGTGATT
TACTTTGTTTGGAAATACTAAATTAACTTAAATAAATGTTTTTTATTAAA
AAAATTAGTATGCTGTGAAATAAGTAATTTAGTTTGTGACTTGTTTTCTG
ACAAATCTGCTTTTCAGCACAAGGTCGACACTAAGATGAGCTTTTGTAAA
AGAGCCATATTTATGAGTGTTGGGGAATTCGTGTTGTTATTAAATCTATT
TTATCAGCCAGAAGTATGACTTCTGTACCAGAAGTGGTACTACTGTAGCT
GGGTGTTAAGTTTAACAAGTCATCCTATGGGATACAGCTGTGTTTATTCT
GGACTCTGTGAATGTACATTGTTAGCAAAGCTTTAATCATCCTGGACCCA
CAAAACAATACTTACCATCTTTAGTTTATAAGAACTAGAATGAAAATAGA
CTCATTCATAGACACATGTTTTTCCAGACACTACAAATCATTTGCCTTGG
TATGATATTATAGGGTCTTTGGAAACATATCCCATCCTACTCACCATATG
AACTCTGTGACTTTATTATATAAAGTCCATCTCAATTGTCTACTGATAAA
ATTTGTCCCCATATTCCTTACTTCCTTAAATCCATTTGTTCATTAACCTC
TTATGAACCCTTTAATCCCTCCCCCTAACCCCCAAACTCCTCAATATCCT
GTACCTAAAAAATATGCTTACTCACGCTTCACTGTCTCTTCTTGAATGAA
ACTGGTCTTCCTGCCCGGCCTTTTTCTCATGGAAGGCTAATATCATAAAC
CACTATCCTGATCCTTTCATTTTAAGGGTCTAATTCTTATTATAAAAACT
CCCTTTTTATGTTAAACAAATTGTATATGTCTTTTTTAAAATTTTAGTTC
TCATATTGGTTTTTCTCGTGTTATTTTTACATCTTCCTGTTCCTACCTTT
AATTGAATATATACTTTTTTCTCCTGCGTATTTCGACATATACAAAAATT
CATATGTCCTTTTACAAGTTACTAAAAATACTTCCTTATTTATGTCCCAC
ATCTTATTTGGTTCT
| CCGTTTTTTTNNCACGCATGGAGGCGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTTATTCTGGTCTGGACCTTT
GAAGAAGGAAAACATACACCTTTGATCTGGATCAAAGACTATGATAAGAA
AGCTAGGATCAGCAGAACAGATGATCCCCCTACCCATCCACCCCTCCCCC
CCCCCAAATAACACAACAAAGGATGCCGTCCCTGGAACTGAAAATCTAGC
AAACTTCTCAGTGCCAGTGACATCATGGATACTGGAGAACTCACAACCAC
CATTTTGCTAAACCAGCATAATGTCTAACTACAACGTAGAAACATTTGTC
CTTATACACACAGATCAGTGTAGTCTTTACCCCTTGTCTTTGTTGGAGTT
ATGATTTCTGAGATGATATACCATGGACAAAGCAACTTGAGGAGGAAAAG
ATTTGTTTAACTTACACTCTCACAGCACCATTGATCATTGAAGAAAATCA
GAGTAGGAATTCAAACAGGAATGTGGATGCAGGAGCTGATGCTTACTTAT
AGTTGCTGCTTACTGACTTGCTCTCCATGGCTTGTTCACCCTGCATTCTT
ATAGAACCCAGGACCACCAACCCAGGAATAGCATCATCTACAATGGGATG
CCCCACCCCCCATCAATAAAGAGTTTAAAAAACACCCTATAGGCAGTAAG
CCCCATCACATGGAAACATTTTCTTAATTCATATTCCTTCCTCTCCGTTG
ATTTTAGCTTGTGCCAGGTAGACCTTAACTATTAAGTCACCCTTCTTCCT
AAAACATTTCTAGGCAACATACTGAGACCCACTACAGAAAAGCCACCCTA
AATATTTCAAAGTGGTGTAGTGCAGTTCCAAGGAATCTTTCCCAAAACAC
TCTTGCATCCCAGGCTCAGGAAACTTTCTTAAAAGAAGCTGGAAAGATTA
AAAGTCAAAAAATTTAAAGTGTGTGCTTTAGGTCCTCTTATTAACATCCA
AAGCTATTCTTGTTAATTATTCTTCACTGGACCCGCCCAGTGGGAGTTTG
AACTAAGTAAATCCCAATCCACTTTTCCAATTGGGATGAGAGATATAACC
CTTGTATGTTTTATCCTGTCTCCTATAATTTTTATACTCTCCTTAGGAGA
GACTTTGTTTCTGGAAAGGGTGTCTCTTTTCTCCGATATAAAACCAGTAT
TTGTTGTGTTCTCTAACATCAAAATAGTGTCTCTTGTAACTTATCCCCTC
ATTATTACATT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 9 9 11 11 9 11 3 0 0 3 9 9 9 8 8 8 8 8 8 13 15 8 8 8 8 8 10 21 21 9 8 8 8 11 12 17 17 35 30 24 28 28 29 34 37
43 47 50 48 57 57 57 57 43 43 50 50 50 53 53 53 53 53 50 50 42 42 47 47 28 25 12 12 14 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 15 15 23 30 37 48 53 47 47 36
36 35 42 35 38 53 53 57 53 53 50 48 46 46 46 41 43 27 21 9 8 8 8 8 9 19 19 23 24 23 28 33 33 33 35 36 42 36 26 26 10 12 12 34 27 47 43 43 43 43
54 57 48 48 48 48 42 47 48 59 59 59 59 54 54 54 54 48 48 48 47 47 47 47 57 48 50 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 30 32 19 19 32 32 42 48
57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 68
68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52
57 57 57 57 57 44 43 27 27 33 44 59 59 57 54 50 57 50 50 50 57 50 47 47 47 50 57 57 59 57 47 47 47 47 59 46 44 37 57 57 57 57 47 47 57 59 59 59 57 57
57 54 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 47 43 43 37 43 43 48 47 43 39 32 30 30 32 37 37 43 28 26 14 15 15 32 32 43 43 43 47 59 59 47 43 43 43 43 43
40 40 43 40 41 32 28 22 19 16 14 12 12 11 16 11 12 21 28 37 59 33 37 36 43 39 39 39 39 39 35 32 33 37 37 30 39 39 47 47 48 48 48 48 48 54 57 54 54 54
54 54 54 47 47 35 32 32 41 24 19 13 13 13 19 28 28 36 37 37 30 30 14 12 10 10 10 19 26 25 33 28 33 33 37 42 42 37 42 44 57 57 48 50 32 32 20 18 32 32
32 20 20 19 32 32 43 43 52 52 52 43 44 35 35 35 43 43 43 43 50 50 57 50 50 54 50 43 43 35 37 30 32 30 32 32 37 42 48 57 48 48 48 47 57 47 57 57 42 42
35 35 35 42 44 44 37 28 28 28 37 39 39 39 30 30 30 32 28 36 36 36 43 30 30 20 23 23 31 30 35 36 42 42 36 36 36 43 43 48 46 37 37 19 18 15 22 19 19 19
15 25 29 17 18 20 24 26 24 30 24 19 14 16 16 14 25 32 34 39 37 19 14 12 12 14 22 24 22 22 11 9 9 10 11 14 9 8 10 13 13 15 13 14 14 12 22 12 12 13
28 28 35 37 37 37 28 23 28 23 18 18 12 10 9 9 9 9 10 15 15 10 10 10 14 13 15 15 13 13 13 22 15 15 15 15 12 16 13 10 8 22 22 26 14 28 19 21 12 12
15 20 18 12 15 15 32 20 31 18 21 19 21 16 11 10 11 13 17 21 18 21 12 15 14 11 11 11 13 13 17 16 19 12 10 9 9 13 16 13 13 10 10 15 19 14 17 17 12 11
8 8 9 14 13 13 9 9 10 10 10 9 10 15 10 12 12 19 15 18 15 16 14 11 12 12 19 10 9 9 11 11 13 11 11 10 10 10 10 18 15 24 30 24 17 16 11 10 10 9
9 9 10 11 13 12 12 10 10 18 13 16 12 10 10 8 10 9 9 8 8 8 8 12 14 22 12 12 11 11 11 12 12 15 15 19 22 19 21 11 11 11 12 19 15 22 14 12 11 8
8 8 11 10 11 10 9 10 8 8 8 8 10 11 19 11 10 10 10 10 10 10 10 10 15 17 15 26 20 23 19 12 11 11 11 10 10 8 10 10 8 8 8 8 9 10 12 10 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 11 13 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 13 13 10 10 11 15 13 13 11 9 10 10
12 11 11 11 11 11 10 13 9 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 12 16 20 13 15 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 10 9 9 9 9 9 12 10 10 8 7 6 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 11 10 15 22 21 28 24 32 21 15 11 12 11 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 11 11 11 8 8 6 6 8
8 10 15 19 21 17 14 11 10 8 8 8 8 10 9 11 11 9 9 9 9 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 11 11 12 9 9 9 14 12 12 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 18 12 12 11 11 10 10 8 8 6 6 8 10 13 10 8 8 6 6 6 6 8 6 7 8 10 10 18 13 11 11 11 9 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 11 10 10 9 8 8 8 10 8 10 10 13 13 24 8 9 10 9 9 9 10 10 9 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 14 14 15 13 12 13 13 9 9 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6
7 10 10 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 11 9 9 23 3 0 0 3 9 9 7 8 8 8 6 7 6 6 6 8 6 6 6 7 11 10 12 13 7 7 9 15 19 19 19 19 28 28 28 30 24 24 24 24 20
20 20 24 24 33 37 33 33 33 28 24 29 36 50 36 36 33 33 33 33 42 41 21 19 9 9 10 10 14 9 8 8 9 8 8 8 10 12 10 10 13 23 27 36 36 50 50 36 36 38
42 36 36 50 57 57 50 50 50 50 50 37 31 30 23 23 10 10 11 11 10 10 17 22 22 25 24 24 22 22 23 24 24 30 36 57 47 37 40 40 40 47 47 53 48 48 48 54 54 59
57 42 42 42 43 43 48 54 54 54 54 48 57 48 48 47 47 47 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 54 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 54 54
57 57 57 57 59 59 54 52 52 52 52 52 52 57 57 57 54 50 50 48 48 48 57 47 43 50 47 48 48 43 59 47 57 54 57 42 44 28 28 23 36 36 46 47 59 59 59 54 54 54
59 59 59 57 57 57 54 57 57 57 47 48 48 48 48 48 43 43 37 42 44 48 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48
59 59 59 48 47 47 59 36 24 20 11 11 11 12 16 15 18 30 34 47 59 59 47 43 39 39 39 39 35 35 37 39 33 35 35 35 42 37 28 28 28 36 42 48 48 48 48 48 57 57
57 57 59 59 59 46 46 43 43 43 46 59 47 41 32 20 20 41 30 32 15 15 13 13 13 15 15 20 34 34 48 57 57 57 57 44 44 43 46 43 43 43 43 43 39 39 39 43 32 23
23 23 43 32 35 42 43 43 52 44 44 43 35 35 35 43 32 20 32 32 36 43 43 50 35 35 35 44 43 35 35 35 43 43 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 44 43
24 24 24 38 38 50 59 52 52 52 59 59 59 52 52 52 50 50 50 47 50 57 50 50 50 57 57 50 47 47 47 50 57 50 48 43 42 37 37 42 44 48 54 54 42 42 42 43 47 44
44 37 30 28 33 32 32 37 42 42 30 27 17 22 15 26 26 37 31 28 28 36 32 30 27 18 17 17 19 28 32 46 43 43 33 33 25 33 33 24 24 15 15 19 30 24 30 30 37 37
39 30 30 17 17 17 22 30 31 34 25 28 23 28 23 28 28 20 20 23 15 13 8 8 8 11 12 16 14 13 13 13 15 18 19 22 23 28 29 29 28 26 19 19 16 29 17 17 17 18
28 18 14 14 14 24 28 26 15 13 13 17 17 24 19 18 13 13 13 25 26 37 41 39 39 30 28 21 25 15 15 15 30 30 32 36 39 32 28 15 14 14 21 26 30 32 16 14 12 12
12 12 13 16 24 25 18 18 28 19 17 10 13 15 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 11 12 10 11 11 10 10 10 8 10 12 32 34 39 31 26 19 10 10
10 10 10 10 8 8 8 9 9 10 10 20 18 12 8 8 8 10 10 9 8 8 10 10 14 13 17 21 17 13 10 10 10 10 10 11 15 16 19 19 19 13 21 11 8 8 8 8 9 9
10 10 10 11 10 10 9 8 8 8 10 9 9 11 14 12 12 12 10 9 12 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 22 10 9 11 12 14 14 11 12 10 12 12
16 19 23 22 17 16 15 15 15 12 10 9 9 11 11 9 11 9 9 9 10 10 10 10 10 14 12 11 11 12 12 12 10 10 10 10 10 10 10 10 11 11 11 12 15 12 11 11 11 11
12 11 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8
10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 12 8 10 8 8 8 10 7 7 8 8 9 9 9 9 8 8 10 11 9 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 8
6 6 10 10 14 11 11 10 10 10 10 11 12 12 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 12 12 9 9 8 8 10 10 12 11 13 10 8 10 7 7 6 8 10 9 9 15 11 11 11 15
18 18 10 8 8 8 8 8 13 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 11 15 14 9 12 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8 7 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 12 8 9 7 8 10 10 10 10 10 14 18 18 13 8 10 11 8 8 8 8 8 8
10 10 7 6 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 9 12
10 10 9 9 10 8 6 6 8 8 6 |
|---|
