BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107J17.T7 (MSMg01no107_j17.b1) | MSMg01-107J17.TJ (MSMg01no107_j17.g1) |
ACC | AG321322 | AG321323 |
length | 1,275 | 1,296 |
length of high quality (start - end) | 549 (93 - 641) | 616 (89 - 704) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_j17.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_j17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_j17.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_j17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:09:43 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTGCGGATTTTATNNNNAAGCATTGCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAG
AGGATCCGCGGAATTCCTTTGTGATTATGTTACCCATTTTCAGGATGATG
CCCTGCAGGTCCATCCATTTGCCCCCTAAATTTCATAAATTCATTCTTTT
TCCTAGCTGAGTGTTACTCCATTGTGTAAATGTACCACATTTTCTGTTCC
TCTGTTGAGGGACACCTGGATTCTTTCCAGCTTCTGGCTATTATAAATAA
GGCTGCTGTGAACATAGTGGAGCATCTGTCTTTCTTACAAGTTGGAACAT
CTTCTGAATAGATGCCCAGGAGAGGTATCATGGGATTCTCTGGTAGTACT
ATGTCTAATTTTCTGAGGACCCACCAGAATGATTTCCAGAGTGGTTGTAC
AAGCTTGCAATTCCTCCTAAATGGAGGAGTGTTCCTCTTTCTCCACATCC
TCACCATCATATTCTGTCACCTGAATTTTTTATCTTAGCCATTCTGACTG
GTGTGAGGTGGAATCTCAGGGTTCTTTTGATTTGCATTTCCCTGATGATT
ATCTTGGCATGACTCTAAGTAAGAAAGTGAAATATCTGTATGATAAGAAC
TTCAAGTCTCTGAATAAAGAAATTAAAGAAGGTCTCAGAAGATTGAACGA
TCTCCAATGCTCATGGATTGGCAGGATCAATATAGTATAAATGGCTATCT
TGCCAAAAGCAAATCTACAGATTCAATATAATCCTCATCAAAATTCCAAA
TTAATTCTTCACCAAATTATATATAGCAATCTGTAATTTCATCTGTGAAC
AACTAAAACCTTAGAAAATAAAAATTCTTCTTTAGTGATATATAAACTCT
CGGGTGTAATCCACCTGTCTGACCTAAATCTTTTACTAAATGTCAATTTG
TAATAAATTTGCTTGGTATTGTTTTTATAACCTTATTTTTATAACTATGT
TATATAATTTGAATATCCTAATTTAACCCTTCTCCCTTTTGTTTATTGTA
TCTTTGACTATGCTAATTTAAACCCTTTATTTGAAAAAAAATAATTGAAT
TTTCTTACTAATTCCTTTTTTCACATTTGGTTGTTTTTTCTATTTTTATA
ATGTATTTTTTANCCTTTCTTTTTCTCCTTTTATTAATTGCTAATCCTAT
TTGTCTCTATCTTTTCTCCCTTTTAATACTCAATCTTTCGTGCTAATTTT
CCTTTCATCTAATCCTGATAAAACTCTACTTTTTATATTGTCCCATCATC
TTAATATTTTCTTATATTATCTTCC
| NCCGATTTTTTNNNNNTAACATGTGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTATTTCAAACCACTTTCT
CTAAATAGAGTGATAGCAGTCCCTGAAAGTTCTCTTTCACTCATTCCTCA
AATTCCAATTTGAATATCCATGCTCTTGAGAACTAACAAAGCATCCTCAC
ACAGGACTGCTGGGATGAGAAGGTCATGCAGGCCAATAGTCAGCATATTG
TGAGGCATATCCTACAACATACTTTCTAGGGTCGTTCATATTCTCATATG
GGCTGAACTGCTAAGATTTGTTTGACAGGATATTATTTCCAGATACTTTA
AATCATAGTTTCATTTATTTGTCTAGTCATACTGGTAAGCTAGGATATCT
AATAAGACAGGTGAAAAACACTAAACAAACAAATAAACATTGACCTGTTA
GTACTTTATATTTTCAGGGAATTTGAGACTAGAAAAAAATCATAGTATCA
ATCATTTTTTAGTTATTTGCGTTGTCTTCATCATTACCAAACTTCAGCCC
CAGGCACCTAGATGTTTTAGAAGAGCAAGTATGCAGCTGGTTCATTTCAA
CTGTGAAATAGCAGTGTGCTTTGCAGCCTGTTGAGCATAGCATCTAGGCT
GTCTATTAGTAAAGCATACCCTTATATGCCCTGCTGATACCCTAGTATAA
AATGAATAAATCTGAGGTGTAGTTAGCTTAACTCTGATATTTACTTACTA
AAAATACTTTCTTCTAGCCTAATGATAGATTACACATAAATATATAACAC
AATGCTTACAAAATATTTTTTCTCCCATTGAAAATTTTTATATCTTATTT
CTTCACATAAGATACTTTTTGCTATGTATCCATGGTCCTTGTTTCCTCCT
ATAAATGTTATATTTTCACACAAATTTATCAGGAGTATATAATTGTCTAA
TATTAAAAAAATGTCCAAATTTTAATATTGGGAATGCTGATTTAAATTTA
CTCCAACACCCCCCCAAAGAAGCAAATTGCCAGCTGAACCGATATAATTG
AATTTATGGAAATCTTTGTCTCTGAAAGGTTGGAAAAAAAAAACACTGGG
TGTGGTGGTGGTTTCCCTGTTTCTTATTTGAATAATGAACCCATATAAAA
AAAAATATTTCTTACCACCCTTCATCTGGGGTCTGGATTTTATAGAGTAA
TTGTTAATCCGTATACTTCGTTAAGATAAAAAAACAAAAACCCTTTGTGG
GTCCTCTCTCTTCTCTTCATGGTTATAAAAACCTCTCCGGTAAAAT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 10 15 9 8 8 10 13 12 15 15 36 35 32 32
32 37 37 36 47 47 47 40 43 43 53 53 42 42 53 53 53 38 35 35 35 28 26 28 28 28 28 25 22 17 9 9 10 13 14 15 12 11 11 12 12 17 18 25 30 30 31 33 36 47
50 36 36 36 36 37 42 50 50 50 50 36 36 36 31 31 31 31 31 30 25 23 11 11 10 10 13 13 15 26 28 28 34 30 37 37 33 33 38 47 50 50 50 50 57 57 57 57 47 53
47 47 47 47 43 43 43 57 57 54 57 57 54 54 50 68 68 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 54 54 57 57
57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 43 43 31 43 39 44 44 62 62 62 62 62 52 52 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 52 52 52 62 62 62 62 62 44 39 39 23 15 12 12 11 11 13 18 39 39 39 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 43 35 35 43 43 52 62 57 52 45 45 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 59 43 43 43 35 35 28 39 43 57 57 57 57 57 57 57 38 57 57 57 57 59 59 68 59 59 54 54 54 59 59 57 54 54 59 54 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68
59 59 54 50 50 44 44 28 42 43 57 57 59 59 59 44 44 32 32 32 34 13 13 13 32 32 43 43 57 57 54 57 54 59 57 57 57 54 54 43 44 43 43 31 34 24 28 23 36 36
44 40 30 30 30 37 27 24 20 20 24 28 25 28 28 28 41 34 32 32 20 18 18 24 15 15 18 18 23 28 28 30 39 34 25 23 11 11 16 22 12 15 26 28 28 20 14 24 13 13
15 28 28 39 35 35 35 39 43 48 48 41 37 37 37 37 37 34 25 12 11 10 11 11 11 13 20 26 30 34 23 21 16 17 17 10 9 9 9 11 11 12 18 13 13 10 13 10 19 23
21 11 11 11 11 11 18 19 16 15 16 13 11 11 15 20 21 21 13 13 13 21 28 10 10 9 8 8 8 8 10 20 24 26 24 14 14 10 10 8 9 9 12 13 19 10 10 10 10 10
11 15 14 14 14 19 23 22 18 10 8 8 10 15 19 24 20 23 10 10 8 8 8 10 8 11 11 11 11 11 18 12 10 8 8 8 8 10 13 10 10 10 13 13 13 12 10 11 11 16
9 8 8 10 10 16 16 24 21 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 9 17 15 10 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 7 6 6 6 8
8 8 8 10 8 9 8 8 10 8 10 6 6 8 10 10 13 8 8 8 12 10 12 17 10 10 10 10 8 10 9 8 8 7 7 8 6 8 8 8 11 11 11 11 10 13 15 12 8 8
8 8 9 9 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 9 10 10 8 8 8 8 11 10 10 10 9 10 10 10 10 10 10 11 11 8 10 10 8 8 8 8 12
8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 8 8 8 8 7 6 8 8 10 10 11 11 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 9 9 9 6 10 6 6 8 8
8 8 13 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 9 9 8 10 8 8 8 8 8 16 12 11 11 11 10 10 9 9 9 9 10 12 23
25 14 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 11 17 17 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 10 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 11 11
13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 11 17 21 21 12 12 11 9 9 9 10 10 11 11 18 18 9 9 9 9 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 10 14 9 8 8 8 8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 15 12 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 7 6 6 6 6 8 6 10 9 9
9 9 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 11 10
8 6 6 6 6 8 6 14 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 7 9 10 10 10 9 15 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 17 11 12 13 8 8 9 8 8 8 15 15 17 8 9 10 19
19 24 12 14 18 24 28 32 35 37 37 37 37 35 35 35 36 50 36 47 44 44 39 50 47 27 27 11 9 9 9 8 6 6 6 8 8 12 12 22 27 47 37 41 53 53 53 36 53 42
42 43 43 43 53 53 50 40 42 50 48 40 47 53 53 68 47 47 51 21 21 9 10 10 12 12 14 24 24 35 42 42 47 47 50 50 50 50 46 46 48 50 51 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 51 51 51 51 68 68 68 50 51 51 50 50 50 50 50 50 50 68 68 50 50 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57
57 57 57 59 59 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 44 44 29 29 29 29 29 39 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 45 45 39 39 13 17 15 39 23 29 29 39 39 43 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 57 57 57 57 52 57 52 50 47 37 35 35 44 44 50 57 57 59 59 52 52 52 52 52 57 59 57 59 57 52 52 43 50 47 59 57 57 57 44 43 50 43 35 35 25 32 18
17 17 30 30 50 44 44 26 26 26 40 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 54 54 54 57 48 42 28 29 29 29 40 29 59 59 59 46 43 43 27 32
17 17 17 21 21 10 10 10 19 19 15 15 12 23 23 39 36 35 30 36 30 35 39 25 21 11 10 10 15 15 29 32 37 30 37 37 37 37 37 37 37 39 44 44 41 41 40 40 43 43
34 32 16 14 15 26 26 32 43 43 40 25 25 11 11 10 17 16 28 30 28 25 30 30 26 23 17 11 11 18 22 21 13 15 13 13 12 19 12 13 13 26 21 34 34 23 23 23 26 24
30 30 36 39 35 32 39 39 37 37 28 28 28 24 30 30 41 21 11 9 9 10 10 12 22 25 24 23 23 28 31 28 30 27 27 30 31 37 37 37 37 37 37 37 19 15 9 9 9 22
25 28 28 10 10 11 11 11 11 11 11 11 12 12 19 19 29 29 30 28 35 28 24 20 19 17 11 10 12 9 10 10 12 19 12 12 9 20 16 25 10 10 10 14 13 11 10 8 8 8
8 8 8 8 9 10 12 20 12 11 8 8 9 9 10 9 10 10 8 7 7 7 10 8 10 8 9 9 9 11 9 9 9 10 14 12 16 13 13 13 9 9 9 18 17 14 15 15 10 8
8 8 8 13 10 13 19 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 8 10 10 13 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 8 10 10 10 10 9 10 10 10 13
13 12 10 6 6 8 8 10 10 10 8 13 11 10 10 10 15 10 10 10 10 10 10 19 11 15 10 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 11 10 12 8 10 6 6 8 12 10 9 9
11 11 15 9 16 10 10 10 18 20 25 14 14 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 12 9 9 9 9 11 8 8 9 13 13 12 11 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 9
9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 12 13 10 11 10 10 10 10 10 8 8 10 10 8 8 10 10 16 9 8 8 10 8 8 8 12 18 11 11 12 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8
8 12 11 11 10 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 11 13 10 10 10 10 10 10 11 10 8 8 8 7 8 7 8 8 8 11 15 13 12 8 6 6 6 6 8 8
10 8 8 7 7 6 6 6 6 8 8 12 8 8 6 6 7 6 6 9 11 10 8 8 6 6 6 7 14 13 9 8 9 7 7 7 8 8 11 11 8 8 6 6 7 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 11 8 8 10 8 6 6 8 10 8 10 15 12 12 7 6 8 8 8 8 8 9 8 12 7 7 8 7 7 7 |