BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124H05.T7 (MSMg01no124_h05.b1) | MSMg01-124H05.TJ (MSMg01no124_h05.g1) |
ACC | AG333802 | AG333803 |
length | 1,259 | 1,294 |
length of high quality (start - end) | 608 (112 - 719) | 325 (124 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATGCGCGCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTACAAAG
GGTAAGCTCCCCTTACATGAAAAAGTGTAGTAGGCTAGGATATTTAAATC
CTTTAAAGACATTGGGTTTATGGAGATTATCGAGTGGAGATGAAGATGCC
GAACAGCCACATTGTAGTAAGCTGTGCAGTCTCTGGTTTAAAGAGAACTG
CCTCATCACCACTGTTTTCCTGTGAGACAAGGGAGAGGGGTAGAAAATAA
TTGCTTAATTATTTAAAGACATATACATATGCTTTCGAGCTTTATTTTTA
ACAAATTTCATCATTCAGTTCTCACATTTGGCACAAAATATTACTTATGC
GTTATTAGCAATTTGACACTAGATAATATTTACCAAAAAAGGTTATTATA
GTAACTGAACATGATGACAAAATCAGGTGTGGTCTCATCCCAATGTAAGA
TGAGGCACTTACTGCTCAGCTTAAGTGAGCTCTTTGCACAATGTGACTGT
GTCACATATCACACTTGAGCAAAATAAATCCATAATAGTTTTGAATTTCA
AAATGAAATACTAAAATTGAATGACTATACTACAAGTGCATAAATCTCTA
ACAATATAAGAAACAATAACTAGCTTTGTAAAAGAAACTTGCTTTATATA
TTAATAATTTCCTAAATAGAACTATAAATATGAAGGATTTCAATAGATTC
TATTATGAAATATCTAGGAATGAACCAAACAGAAAAAAATGAGTGATGTA
AAGCATCCAACTCTAACTAAAAATTCACATGGATTACATACTATCCGTGA
TATACAGAAGCAAAGGCTGTATGATCTTATTCATCAATATAGAAAAATAC
CTTTTATAACATTGAAAAACCATTTCAGGTTATAAAGAATATTTCTAAAC
TGTTAATAGGCAAAACCAATTCCTAACTTTACTCTTAGGGATTTACTAGA
GTAACTCTGTTCCTGTGAAACTGAGGGAAAGTTTCTAACTCTCCTGAAGC
TTAACTAGTTATAGGGATGCATGGCTGTAGGTAGGCTGTCAAAAAAACAA
AATGAAAGCCCCTTCAGCTTAAACTTATTAGAAAATATTCTGCCACCCCT
TTTGTGTGAAGAATCCCCTTGGTCTATATCCTAAAAGGGTCGTTCCCCTT
AAAGAGGTGTGGCACCCCTTTTGAACTTTTAAAAAAAGTTCCCCTGTGCT
CTGTGTACAACAAAAACAATTGGGCCTTCTTCTCTTTCTCACAACTTGAC
ATAAATATA
| NTTTCACCAATGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAACTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAA
GCACCAGACCCTTTAGATACCCATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATC
AAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCCCAATGGCTAAGATCAA
AAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACAC
TCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCA
GTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGC
AATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGG
ATTTTTGATCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGC
TGTTTTTATCCTACCCGCCCCTCAACAGACGAATGGATACAAAAAATGTG
GTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTA
TGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAG
GTAACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTACTCATTGATAAGTGG
ATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTAA
ACACATGAAACTCACGATAAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCC
TCCTTAAATTTGGGAACCAAACACCCCTGTAACGAGTTACTGAGACAAAG
TTTGGAGCTGACATGAAAGGAAGGACCATGTTTAAGACTGCCCTATCCCG
GGTATCCCCCCCTTATTCCCCATCCCAAACGCTGGACCCATTTGCTAACT
CTTACCAGGATTTTATTTGAAGGGACCCCCAATGGTACCCTGTCTCCTTG
GTGAAACTATGCCCGGGCTCCATTCATAATTCTGATATTGGTATTCTTTC
TGCTTCGCTTTATGGCAATGAATCCTATGCCCTCCCCAAAGTTTGCACTT
TAAATAAATTACCCCAATGTATTCAAGTGGTTCCTGCCAACCTTTATGGC
TGGTACAATCATTTTGATAACTACCCCGAACCCCCTGAAACTCTTTTAAT
TTTTATTTCCTATTATTTCAACAAGAAGGTCCAAATCTCGCCCTTTCTCT
GTAAATAAAATGGCCCCTTTGTGATCTAGTAAAATCTTAATTGGTCCCAC
TTCCACAAGAATACACATCTTCTCCTCATAAACGGCGTGTATGC
|
quality values | Open.Hide. 7 8 10 10 12 17 16 19 19 10 10 10 13 15 20 10 10 10 15 15 24 29 35 36 36 36 36 36 35 30 30 30 30 30 34 37 39 32 31 32 37 41 41 37 37 37 39 33 33 48
48 41 41 42 41 21 21 10 10 11 11 16 12 11 11 12 11 13 17 12 12 15 24 32 43 41 53 36 36 36 38 38 36 36 36 36 36 36 53 53 50 50 50 50 47 39 25 19 8 8
7 7 7 8 11 12 11 11 11 12 15 15 30 23 30 34 33 33 36 53 53 53 59 59 59 57 57 57 53 53 47 57 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 54
54 54 54 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 43 48 35 35 35 42 25 24 19 12 12 12 12 24 32 44 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 52 57 50 57 41 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 59 68 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 26 26 12 15 15 39 16 21 21 39 39 43 43
44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 39 43 44 35 35 35 35 43 35 26 26 23 24
24 24 20 20 20 35 43 43 62 62 62 62 59 59 57 57 57 59 59 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57
44 44 33 33 33 43 43 57 43 43 43 59 59 43 52 43 43 33 37 36 43 43 52 57 52 43 43 41 43 50 52 52 52 52 52 52 52 43 43 50 59 59 59 48 48 48 57 50 43 43
43 43 47 42 43 37 43 43 48 57 57 57 42 37 32 35 42 44 44 48 48 44 44 32 41 41 47 42 44 44 39 39 32 37 28 28 28 42 42 48 48 57 43 43 43 46 46 48 48 43
43 43 33 33 30 32 24 28 32 32 25 28 28 24 24 24 33 33 39 43 43 36 36 36 37 37 48 47 47 46 59 47 43 39 25 25 27 30 33 33 40 40 40 43 37 37 40 43 43 48
47 57 43 39 37 35 29 23 24 37 34 34 39 39 39 37 37 28 21 14 21 21 34 34 32 30 28 32 30 34 26 23 14 14 11 14 19 22 20 24 22 25 23 32 28 37 37 39 37 39
29 21 11 11 12 23 23 33 30 30 30 29 29 37 32 28 24 24 16 16 14 23 14 20 22 25 17 17 22 19 24 23 28 14 14 9 9 9 9 10 10 10 19 13 19 13 14 10 12 15
10 10 13 19 31 13 21 10 14 13 8 10 12 17 30 30 31 28 24 27 19 13 17 16 22 16 19 20 24 17 26 19 18 18 22 26 30 30 30 37 37 39 36 19 18 9 9 9 13 14
21 21 15 15 11 12 10 10 13 13 13 16 21 22 11 11 14 11 10 10 8 8 10 15 20 28 25 22 28 18 23 12 12 12 15 8 8 8 8 13 8 14 14 22 22 20 17 12 8 8
8 8 9 9 16 23 24 12 15 10 10 10 16 14 11 15 19 15 13 13 11 16 16 9 9 9 10 10 13 8 8 6 6 6 10 8 9 10 10 10 10 10 22 12 12 12 9 9 12 12
10 6 6 6 6 6 8 10 11 9 9 10 13 10 10 10 10 8 8 8 7 11 6 6 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 10 13 11 10 8 8 12 13 15 10 8 8 6 6 8 8
10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 14 12 6 6 8 8 8 6 8 10 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 10 11 10 11 11 12 12 12 15 18 18 18 10 10
10 11 11 9 9 10 9 11 9 10 10 13 12 10 12 12 15 15 13 10 10 9 8 8 8 10 10 11 10 10 15 11 11 11 16 16 11 10 10 10 10 10 9 9 10 8 6 6 6 8
8 9 9 9 9 13 9 12 10 9 9 9 12 12 9 9 8 8 8 13 11 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 12 12 10 14 14 11 12 13 13
13 9 8 9 7 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 10 10 10 8 10 10 10 12 12 12 12 12 12 7 7 8 8 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 12 15 12 14
14 14 12 11 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 10 9 9 12 9 10 11 9 11 11 15 13 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8
8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 7 15 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 8
9 10 11 12 9 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 3 11 8 8 6 6 9 8 6 8 8 8 8 11 9 9 6 6 6 7 18 18 25 11 11 12 11 16 15 18 20 15 13 8 8 8 15 21 28 20 20 20 24 28 37 37 36 36 36
37 28 28 28 36 47 47 48 48 48 42 47 41 27 17 9 9 10 9 9 9 10 10 8 8 10 11 10 10 10 11 22 30 37 47 47 47 50 50 47 47 47 39 39 48 48 48 48 48 48
48 46 46 59 23 23 10 9 9 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 15 15 30 27 37 44 44 53 53 57 57 57 57 57 53 50 50 50 53 50 59 59 59 57 57 44 44 43
43 43 43 43 54 48 43 42 39 39 36 43 36 57 43 44 39 47 42 42 36 38 48 48 48 59 59 59 37 29 26 15 15 15 13 12 11 22 23 36 41 37 32 24 18 17 29 22 33 33
47 47 59 57 50 50 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 46 46 42 43 42 48 43 47 43 48 43 42 39 37 37 47 47 47 48 48 48 48 57 59 57 57 54 54 54 54 57 57 57 47
46 47 47 44 44 44 44 44 57 46 57 42 43 39 37 47 50 50 50 44 44 47 47 47 50 50 50 43 50 43 57 57 57 57 54 57 52 54 54 57 57 59 57 52 52 52 57 50 52 43
52 52 50 50 52 52 43 44 44 50 50 50 43 43 43 27 27 31 44 44 59 57 57 42 47 35 36 41 31 20 20 32 32 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 48 48 57 57 57
57 48 42 46 43 48 48 48 54 54 46 43 43 47 59 48 48 48 57 57 57 43 43 43 36 40 34 28 23 23 31 34 43 39 39 35 39 39 47 47 43 39 39 43 39 37 28 23 15 13
15 15 16 23 24 19 26 25 34 34 59 48 48 48 57 43 43 37 37 36 39 39 35 32 32 28 28 20 32 32 47 47 48 43 43 47 47 57 47 47 39 35 35 34 34 28 25 22 15 15
15 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 15 19 30 32 39 33 37 37 39 37 35 28 28 23 23 18 22 15 14 14 15 19 16 26 24 24 22 32 31 15 15 12 12 12
16 16 23 28 28 39 39 32 32 20 20 20 24 28 39 32 32 30 32 32 28 32 39 43 39 37 33 20 20 20 28 29 42 42 39 39 43 43 39 37 39 30 26 14 16 16 31 31 37 43
41 39 43 43 44 44 48 48 34 32 17 17 16 16 16 24 32 40 37 37 43 46 44 48 44 44 36 36 23 25 28 36 32 30 30 32 30 32 23 23 28 36 32 39 35 28 28 36 28 28
30 37 32 35 42 24 22 12 12 15 12 12 18 26 32 32 24 15 18 13 13 13 15 15 25 30 19 16 16 13 13 16 21 30 33 32 37 28 27 22 25 27 31 34 34 28 34 33 32 21
22 18 18 19 24 18 18 16 19 22 19 23 23 24 24 23 23 15 15 15 19 19 14 14 15 15 19 19 14 14 14 24 23 26 16 15 15 15 15 12 22 11 11 10 15 13 9 9 9 10
13 11 12 12 12 12 24 17 16 13 13 16 16 11 11 11 8 8 8 8 11 13 16 13 11 9 9 8 10 17 13 12 12 18 18 15 13 12 13 13 10 10 16 16 23 17 9 8 8 8
10 10 18 15 17 12 11 15 10 10 11 13 11 10 10 15 10 14 14 15 17 21 21 11 10 10 13 10 10 9 8 8 8 8 8 9 14 14 10 8 8 8 8 8 15 15 12 12 12 12
13 24 25 10 10 10 8 8 10 10 8 8 11 15 17 19 19 19 10 10 8 8 8 10 13 15 14 14 10 10 8 9 6 8 6 6 8 10 15 23 10 8 8 8 8 11 12 10 10 8
10 7 6 8 8 9 9 9 9 10 17 16 12 10 9 10 9 9 11 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 8 13 12 10 8 6 6 8 8 13
10 10 10 10 14 13 12 10 10 10 10 19 19 10 10 10 13 14 13 9 9 10 10 15 15 20 18 24 11 13 8 8 10 6 6 6 6 6 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 10 12 12 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 7 8 8 9 11 11 11 10 10 9 9 9 9 16 8 8 10 8 8 8 12 12 13 10 9
9 9 9 9 12 9 12 9 10 10 10 11 11 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 9 9 9 11 9 10 10 10 10 10 9 10
10 10 8 10 8 13 13 6 6 8 8 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 12 12 15 11 9 9 10 10 10 10 11 11 11 9 9
9 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 10 17 11 11 11 9 11 12 15 13 10 10 10 10 12 13 19 19 14 9 10 11 10 8 8 8
8 8 8 6 6 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 7 7 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 15 13 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 6 7 7 10 8 10 10 10 10 10 13 15 15 15 12 11 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 14 10 15 10 10 10 11 10 7 6 7 6
10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |