| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-141F04.T7 (MSMg01no141_f04.b1) | MSMg01-141F04.TJ (MSMg01no141_f04.g1) |
|---|
| ACC | AG346224 | AG346225 |
|---|
| length | 1,212 | 1,221 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 644 (132 - 775) | 611 (78 - 688) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_f04.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_f04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_f04.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_f04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:59:35 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCCAATCCTNNNNNNNCCAGTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCAAGGCCCATACCTAAACCCGTTAAAAGCCCTCTACAG
CAAACCAGTAGCCAACATCAAACCTTAAGGAGAGAAGCTGGAAGCAATCC
CACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGCCCACTTTCTCCCTACCTTTTC
AACATAGTACTTGAAGTATTAGCCAGAGCAATTTGACAACAAAAGGAGAT
CAAGGGGATACAAATTGGAAAGGAGGGAGTCAAAATATCACTTTTTGCAG
ATGATATGATAGTATATATAAGTGACCCTAAAAATTCCACCAGAGAACTC
CTAAACCTGATAAACAGCTTCGGTGAAGTAGCTGGATATAAAATTAACTC
AAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACACAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAG
AAATTAGGGAAACAACACCCTTCTCAATAGTCACAAATAATATAAAATAC
CTCGGTGTGACTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTGTATGATAAAAACTT
CAAGTCTCTGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGATC
TCCCATGCTCATGGATTGGCAGGATCAACATTGTAAAAATGGCTATCTTG
CCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCCCCATCAAAATTCCAACTCA
ATTCTTCAACAAATTAGAAGGAGCAATTTGCAAATTCATCTGGAATAACA
AAAAACCTAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAGAACCTCTGGT
GGAATCACCATGCCTGACCTAAAGCTTTACTACAGAGCAATTGTGGTAAA
AACTGCATGGTACTGGTATAGAGACAGACNAGTAGACCAATGGAATAGAA
TTGAAGACCCAGAAATGAACCCCCCCACCTATGGTCCACTTGATCTTCGA
CAAGGGAGCTAAAAACATCCAGTGGAAAGAAAGAACGGCTTTTTCACAAT
GGGTGCTGGCCCAACTGGTTGGTATCATGGTAAAAAAAGGCGAATTGACC
ATACGTATCCCCCTTTACCAAGGTCAAACCTAAAGGGATCCAAGAACTTC
CCATAAAACCGAAAGGCCTGAAACTTTAAAAGGAAAAAGGGGGGAAAACC
CCTGAAAAAGGGTTACCGGGAAAAAATTTTTGAAAAAAAAACCAAGGGTT
GGGCTGGAAAAC
| CTCGTTTTTNTNNTAAAACGGAAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTAAGGATAATTGACAATAA
CTTCTGCATTGCAGGATGCTTTAGCTGACCACATCTGACCAATCCACTTT
GCCAAGCTGGTGTGCTTGGGTACAGGCTCCTCTGGGGCTAAGAAGGGAAT
CCACAACACCGGTACTCGATTTTTACTTAAATACTTGGATTCATGAAGAT
GCAGCATTTCTTCTTGTTGTTTCTGATTTTTGTTTGTTTGTTCTTTTAGG
ATAGAATTTCATGATTCAATAAGATTCTGAAATTAAAGCTTTGCCTCCCC
CATAGTGTCCATAAACAGAAAAGCATTTTTCTCTATCCTATCCCTCAAGT
CTGTCTTTAATTCCATCTAGCATTGACCCCTCAATCCAAGTTCACGCCTG
CCCTTTTGCGACTCATCTCTGTGAGCCCACTGAAATTGTTTGACATTCTA
AACAGACGGTAATCCTCCTTGAACTGCCAATAGGGCACAGACACATCAGA
CTCTTACTCTCTTCCCAAACTTGTTCTTGCTCTGAACATTCGCTTGCTCT
CTCACTTTAGGAGACCAAAGTTCAAAGACGACAATCCCGTACTTGCATCT
TTAAGGAGCACTGCCACCTCAGTGCTCCTGCACCTCACTGCCCTTCCTGG
GGACCTACTGCCTGAACTTCCTCATGTCCGGAGCTTTGCCTTGTGTCTTT
CTTTGTATGACTGCTCATTAAATCTCTCTCAGCTCTCTGCTTGATTGCCT
ATCCCCTTGTCTACTGACCTCTTTCCACCATTCGTCATACCTATTCCTTT
AAATCTTCCTCCGATCTCGGCCTAATCCTACCCTCCTTTCCTTTTTTGCT
GTGCCCTCTCGTTATCATTTTTTTCTTTTATTGCCGTCTTCCTCTCTTTA
CCTTCTCTCCTCTCCTTTTTCCTTCTATTCTTTCTCTCTTCTTCCTCTTT
TTAAATCATTTTTTTTCTCATTTCTTTACATCTTCTCTTTTTCCTTCTTT
CATCCCCCTTTCTCTTCTTTCTCCTTTCCTTACCTCCTCCTCTTCATCCC
TCAGCTTTTTCTCACTCTTNTTTTTCTCTCTCTCTCTCATTCCACTCTTT
TTGCTTTTCTCCTTCCCCTTCCCTCTTCTCTTCTCACTCATTCTCATTCT
CTCCTCTTCCTCTCATTACTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 7 7 8 9 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 13 15 15 8 8 8 8 8 12 19 20 25 27 21 24 24 28 32
36 47 50 47 42 42 43 43 50 47 42 57 57 57 42 42 57 38 36 36 33 33 33 33 33 33 33 19 17 11 11 9 10 11 12 12 11 22 20 24 24 16 14 14 13 23 27 31 33 50
50 50 53 59 59 50 36 36 36 36 35 53 50 50 39 37 37 37 23 23 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 21 24 34 34 28 37 37 37 32 24 23 20 20 23 32 43 53 53 53
53 50 50 50 53 53 57 59 57 57 57 57 57 57 47 47 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68
68 59 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 31 22 12 11 11 16 29 28 24 24 32 25 47 47 53 53 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 50 53 54 54 54 54 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 54 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59
59 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 68 68 57 57 48 50 47 48 48 54 57 54 54
54 54 54 57 59 59 54 54 54 59 59 68 68 59 59 59 57 48 48 48 50 50 50 47 43 42 42 42 38 50 50 50 50 48 46 46 46 43 47 43 41 37 39 39 39 44 37 36 35 32
32 39 30 23 21 18 18 21 30 29 29 32 37 39 33 29 28 23 23 28 37 37 27 22 16 16 18 15 11 11 11 13 16 17 31 31 33 33 37 24 31 31 31 31 37 41 30 21 15 15
15 11 9 11 15 16 14 28 31 34 30 24 22 22 23 23 18 18 15 21 18 23 21 18 28 30 28 32 22 22 17 22 17 19 20 15 13 17 16 17 15 21 13 11 9 9 9 11 15 15
11 29 32 26 26 21 14 12 12 12 9 9 11 10 9 10 13 9 12 11 25 25 21 23 11 10 9 23 3 0 3 12 12 11 12 12 20 13 20 10 9 9 11 11 9 15 12 12 12 18
15 15 13 9 9 12 10 10 15 15 12 12 9 9 8 11 12 9 9 8 8 8 9 10 11 11 11 11 16 19 28 15 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 12 8 8 8 9 9
12 11 16 9 9 9 10 16 12 16 16 16 13 12 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 10 12 8 9 9 9 8 8 8 8 8 17 12 9 9 10 10 10 12 9 8
8 8 6 6 8 8 12 9 10 9 9 9 10 14 21 14 17 9 8 6 6 6 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 13 10 11 11 13 12 10 13 11 11 9 12 10 10 10 9 9 9
9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 14 16 16 22 19 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 9 9 13 14 10 10 8 8 8 6 6 6 6 7 6 11 12 12 15 11 12 16 11 10 9 9 9 9 9 14 16 19 23 22 20 20 20 25 19 21 12 15 11 15 14 10 10 8
8 9 9 8 10 10 8 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 9 9 9 12 19 19 13 9 11 10 15 14 17 18 13 13 12 12 11 11 12 9 9 9 9 8 8 8 10 8 12 7
7 7 8 9 9 10 10 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 0 3 3 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 9 10 11 7 7 9 9 16 12 19 19 19 9 9 10 22 19 28 17
20 24 35 35 35 35 37 37 37 40 40 42 43 43 53 53 53 53 57 53 59 50 50 41 27 12 10 10 15 15 16 13 21 13 19 19 30 30 33 37 37 46 48 57 57 53 53 53 53 53
53 57 53 47 47 48 50 50 50 53 68 68 51 68 47 43 26 27 19 19 17 21 21 29 41 48 50 50 57 54 54 54 57 57 40 32 19 15 14 14 14 21 32 44 57 68 68 51 51 51
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59
59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 48 47 59 41 36 22 16 10 10 10 13 12 13 24 31 41 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
57 57 59 59 59 59 57 48 48 48 48 54 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 57 59 57
59 59 57 47 54 47 38 38 23 44 24 32 32 52 52 52 57 57 57 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 54 57 57 50 43 35 35 43 50 57 57 44 44 35 35 37 44 44 44 33 33
42 44 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 47 44 39 57 43 57 57 59 57 57 54 54 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 43 43 43 43 43 43 47 59 59 59 59 59 57
57 48 48 48 57 59 59 59 48 48 48 48 48 32 28 21 13 13 21 28 29 22 31 23 28 28 39 37 39 32 32 23 20 17 30 26 37 39 39 39 40 39 39 37 33 30 37 37 43 43
43 37 34 34 34 34 34 43 30 30 23 23 10 12 14 24 24 39 34 33 29 32 28 22 30 24 32 31 34 31 28 23 20 31 31 12 10 9 9 9 19 15 20 20 31 25 18 21 22 20
21 19 12 21 21 25 25 23 21 24 15 15 15 26 12 11 10 11 11 16 13 16 12 15 10 10 10 15 17 22 25 22 18 15 9 9 9 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 12 15 29
29 32 32 24 24 18 20 23 28 23 23 12 11 11 10 12 10 10 11 12 9 10 12 15 15 13 15 10 10 9 9 10 10 10 12 10 10 10 10 12 12 13 11 16 15 15 13 10 10 10
10 11 11 11 12 10 10 12 12 8 12 10 8 8 10 10 10 8 8 7 7 8 8 21 11 11 11 10 10 10 12 10 9 9 10 8 8 8 8 8 6 8 7 6 6 6 8 8 10 13
14 10 8 8 6 6 10 15 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11
11 11 11 9 15 17 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 11 11 15 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 12 11 11 11 11 11 10 8 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 8 8 6 9 9 12 11 11 9 9 9 8 10 10 8 8 8 11 11 14 8 8 8 8 8 8 12 13 12 10 8 8 8 8 8 12 11
12 11 8 8 6 6 8 6 6 10 8 20 18 18 10 8 8 8 8 10 11 11 16 12 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 8 11 11
8 10 12 12 12 10 10 9 9 12 12 7 6 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 15 14 24 10 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 7 8 8 8 9 9 9 9
8 8 7 7 7 8 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 16 16 16 13 10 10 10 10 10 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 9 11 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 11 12 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 11 10 13 10 8
8 8 10 13 16 16 12 8 8 10 15 15 8 8 9 9 9 11 11 16 11 |
|---|
