| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-146J22.T7 (MSMg01no146_j22.b1) | MSMg01-146J22.TJ (MSMg01no146_j22.g1) |
|---|
| ACC | AG350108 | AG350109 |
|---|
| length | 1,222 | 1,193 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 690 (127 - 816) | 527 (81 - 607) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_j22.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_j22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_j22.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_j22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:36 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CCCACCATTNNNNNAACACTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCAGAAGTTAGATTTCCCATATAAACCCATATTTAAAATTGGG
AAAGAGCTAAACAACTTATTCTCAACTGAGGAACATCATATGGTTGAAAA
GCATCTAAAGAATTGTTCAACATACTTATTCATCAGGGAAATGCCAATCA
AAATAACCCTGAGATTCTATCTCACACCAGTCAGAATAAGATTAAAAACT
CAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAAAACTCCTT
CATTGTTGATGAGATTGTTAGCTGGTACAATCACTCCATAATTCAGTCTG
GCAGTTTATCAGAAAATTGGACATAGTACTAACTGAGGATGTAGCATTAC
CACTCCTGGGCATATAACCCAAAGATTCTCCAATATGTAATAAGGATACA
TGCTGCATTGTGCTTGTAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTAGAA
AGAGCCTAGATGTCCTTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTAGTACA
TTTACACAATGGAGTACTAAACAGCTATTAAAAACCATGACTTCATCAAA
TTCTTAGACAAATAGATGGAACTAGAAAATATCATCCTGAGTGAGGTAAC
CCAGTCACAAAAGAAAACACAGGGTATGCACTCAGTGATAAGTGTATATT
AGCACAAAAGCTCAGACACCCATGATACAATTCACAGACTACATGGAGGT
CAAGAAGAAGGAAGACCAAAGTGTTGATATTTTGGTTCGCCTTTAAAGGG
GGATCAAAATACCCAATGGGAGGAAATACATAGACTAAGTGTGGAGCAGA
AACTGAAGGATAGCCAAGTGACTGTCCCACCTGGGGAGGAAATCACATAT
AGAGTTGCCAAATGCAGACCCAATTTTGGAAGCCAGCTAGTGCTTGCTGA
CCGGAACCCTGATATAGCTTTTCTCCTGAAGAGCTCTGCCCAGTGCCTGA
AAAATACATTGTCACTTGACAACAAGGCCCTCCGTGGCAGGAACCTAAAA
AAAGGATCCCAGGCACCTTAAAGGTTTTGTTTTCCCCCTTAGAGGAAAAA
AAATATTTACCCCTAAATTATCCTCTCTAAATCCCCCGGAAAATAAAACC
CCCTAAACTCCAAAATAACTCTTTGGCGGGGTCTATTGTCTCCCCCTTCT
TATTTTTATAAAAAAAACCCTG
| TTGNNNCCTCTATGGAGGCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGTTGCGACCAGGCTGGCCTCGAACTC
AGAAATCCCCCTGACTCTGCCTCCCACGTGCTGGCATTAAAGGCGTGTGC
CACCACTGCCAGGCTTGCTCCAATATTATTAAGAATATAGCAAGTTCATC
CTTTCTACCTCTTGTAATATTGGTGTCATTAAATTCATTGTTCATACTCT
ATAATTACCCAGTAGAGTGATGATATTTTGAATAATTATTAATTAAGAAT
TAGAAAAGAAACTATTGTTTATCATTACTTTTATTTCTTTGATCAACAGT
TTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTCTTGTTTGTTTTATTGTTTTGTTTTG
TTTTGTTTTTTAAACAGATATTATATCAGTGGGAACAAGTCTATCTTGGA
CTCTTTCTCCTTTTGGGTTGCCTTGTCCATACTTGATATGAGGGCTTTGG
CCTTGGCTTATTCAACTTTTTTTCATAATGCTTGGCTGTCTTCTTTGGAG
GCCTGATGTTTTTTTTGAAGAGAAATTCGATGGGGGAGTGAATCTGGAGG
AGAAGTATCTGGGAGGAACCAGAGAGAAGGGAGAGTGATGTCAGGAAGCA
TTGCATGAGAAAGATTCTATTTTCAATTAAATAAAAGAAAATAACAAAAT
AAATTAAAATTTAATCTTCCATGCTTTTTCATTGACAGAGTCCATGACAC
TTATTTTAAATTCTTTATTAAATTCTTATCAAACCTAAATTTTGTGGAAT
TTTCAATTATTGAAATACCTTCCATACTACTTTTTGCTTTTGTTTCTTTT
TTGTCCCTTAAAACTGAACTATTTCATTTTTCTTTAACTCCCCTTCCTCC
CTCAAGAACTTTCCAAAAATATATAATCATAATTCTCTCCCTTGCTTATA
TGTAATTCAAATCTCTTTTTTTCTTTATTATTTGTATAATTCTAACATTT
TTCATTAATATAACTTCCTAATATTCTTCTCTCCTTTTTTCTTCGTATCT
CTTATATTTCCCCCTTCCCTCCCCTTCCCTTATAATTTTTTATATTCTTC
TTTTTTTTTTCTTTCTTTTCATACTCTTCCTCTCTTTTTTCTCCTACTAT
ATGTTCTTTTCATCTCTTCTCTCTTATCTTCCACACCACTTTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide.10 10 12 10 11 9 9 10 3 0 0 0 0 0 3 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 12 13 8 8 8 8 8 8 19 21 36 33 33 33 36 33 33 33 33 33
27 28 25 25 26 26 23 22 10 10 10 22 22 33 41 37 37 37 37 33 25 12 9 10 9 9 8 8 6 7 10 8 10 10 10 11 11 12 23 26 37 37 39 44 59 53 53 57 57 57
57 57 53 59 48 33 33 33 33 21 27 11 11 11 9 9 11 11 13 19 21 26 24 19 19 15 21 24 24 28 30 21 19 14 17 17 21 32 43 53 50 50 57 57 57 57 59 59 59 59
59 68 68 50 48 48 47 41 43 48 59 57 57 57 48 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 43 59 43 48 47 47 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 57 43 57 57 59 59 59 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 68 59 59 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 68 68 68 68 62 62 45 45 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 39 62 43
62 62 62 52 62 62 62 62 44 43 31 31 35 43 43 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 45 62 62 68 62 62 62 39 39 39 62 62 44 47 43
39 29 29 29 29 27 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 39 43 43 62 62 52
52 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 43 35 35 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 62 43 43 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 43 43 39 43 43 62 43 39 39 35 43 43 62 62 62 62 62 52 52 52 59 57 57
57 59 59 59 35 35 35 35 35 43 44 44 52 43 43 45 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68
59 59 59 59 59 59 38 38 24 24 35 44 44 47 47 35 43 43 52 52 57 50 57 57 44 44 44 44 48 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 43 43 44 44 59 43 43 47 57
57 57 46 42 37 35 35 42 44 42 43 35 35 35 48 48 48 48 48 48 47 47 43 57 57 44 44 39 43 43 47 43 37 30 30 30 31 37 42 42 43 43 43 43 43 43 43 43 32 32
23 24 37 39 39 46 43 43 46 47 48 47 47 31 31 28 28 27 23 24 27 37 37 37 37 37 42 48 48 48 39 39 35 35 30 32 35 39 39 32 32 34 34 37 31 31 39 32 32 28
28 28 34 28 29 24 34 29 31 31 28 32 28 39 31 31 31 35 37 32 32 28 28 28 32 28 28 22 30 30 33 32 37 28 18 18 13 11 10 10 10 17 19 27 25 25 29 27 26 26
39 37 37 39 35 32 34 34 34 28 28 28 34 28 21 11 9 10 9 10 12 15 19 14 14 19 23 33 29 25 15 12 8 8 8 8 8 8 13 12 11 12 11 15 18 18 18 13 15 19
22 19 27 32 28 28 22 12 12 9 7 6 8 8 8 8 9 13 13 18 16 14 14 10 10 10 19 10 10 8 8 6 7 6 9 13 12 15 15 20 18 14 22 12 11 11 24 25 18 18
12 22 10 13 11 14 12 12 8 8 9 9 16 18 15 10 12 12 10 10 14 13 16 16 19 14 13 8 8 8 8 10 10 10 9 16 10 11 14 19 19 11 10 10 15 10 10 9 12 8
9 9 9 10 9 11 9 9 9 6 8 6 8 7 10 8 8 8 8 9 13 14 10 10 10 11 13 11 10 8 8 8 13 12 9 11 11 10 15 17 11 13 8 9 9 8 8 8 8 8
8 10 9 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 9 9 10 9 8 8 9 8 8 8 8 8 6 10 10 11 10 11 11 14 9 10 10 10 8 11 8 8 8 12
11 8 8 8 6 8 6 6 7 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 11 17 17 19 13 13 10 10 12 17 14 16 10 13 8 8 8 8 9 9 10 12 12 11 11
11 8 11 9 9 10 10 10 12 11 14 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11 13 10 10 10 10 14 15 10 9 11 11 11 11 11 17
11 11 11 13 13 11 11 9 9 9 11 11 11 8 6 6 6 10 7 11 12 11 12 9 8 8 8 8 11 12 11 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 6
8 8 8 8 12 16 10 10 10 9 8 10 10 10 9 9 9 7 10 6 6 6 | Open.Hide. 6 8 3 0 0 0 3 7 6 3 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 8 13 10 9 9 13 8 8 9 8 12 12 19 12 12 9 9 10 21 21 31 24 28 21 21 10 10 9 23 23
36 36 36 38 53 53 50 50 50 50 42 41 27 27 9 9 9 12 8 9 7 7 7 6 7 8 10 9 9 9 15 21 36 42 50 33 33 33 36 36 38 50 50 50 50 50 36 36 44 44
37 42 47 37 27 23 18 14 10 10 9 8 8 8 8 17 19 30 31 31 33 44 44 22 19 8 8 8 8 19 30 43 47 47 48 42 47 48 53 53 53 59 59 57 57 50 53 53 50 53
57 68 68 68 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 32 32 20 27 32 44 57 68 68 68 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 68 62 39 39 39 39 39 62 41 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 45 45
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 57 59
45 52 57 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 54 54 59 59 59 59 59 50 38 38 43 42
42 52 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 43 43 44 43 43 46 57 44 44 37 35 35 44 36 28 27 23 27 27 44 44 47 42 46 41 36 36 44 25 25 19 29
22 28 28 29 27 19 15 15 14 14 12 12 11 11 15 16 14 21 19 19 12 11 11 11 12 15 16 12 11 11 11 11 12 12 21 18 23 22 24 15 15 26 18 23 18 19 13 11 11 11
11 11 14 16 19 16 16 11 11 12 23 19 28 19 26 14 14 21 23 28 37 30 32 23 23 23 23 28 18 14 14 18 18 15 20 20 22 18 27 27 30 32 28 18 18 14 11 11 11 13
11 15 24 28 37 28 25 25 31 24 24 24 24 21 14 14 21 19 19 19 19 19 17 13 13 10 10 10 10 17 18 31 37 28 28 14 14 9 12 10 12 8 12 10 10 10 15 12 11 14
19 25 28 30 37 36 37 25 22 16 19 16 14 18 18 30 30 19 15 8 8 8 8 8 15 19 34 19 19 19 23 23 25 37 37 37 30 28 28 28 27 22 18 13 9 9 8 10 8 8
8 13 13 10 8 8 8 8 7 7 11 8 8 8 11 12 12 8 8 8 8 10 13 10 8 10 10 12 12 10 10 12 21 16 17 17 15 14 8 8 8 15 12 17 17 18 27 30 30 25
15 10 8 8 8 13 15 12 16 14 14 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 13 9 9 10 9 9 12 13 10 9 13 8 9 9 9 13 15 10 13 13 12 12 10 13 10 10 13 10 10
10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 9 11 11 10 10 8 10 6 6 8 8 8 10 10 10 11 11 11 11 12 11 11 11 12 12 10 10 10 16 12 13 10 10 8 8 8 8 8
10 8 9 10 10 8 8 9 9 10 8 10 10 10 10 10 15 19 24 19 11 11 9 9 10 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 8 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10
13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 10 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 12 11 11 11 11 11 8 10 8 8 8 8 10 11 12 11 8 8 6 6 8 8 8 8 11 12 15 10 10 8 8 8 8 9 10 10 11 15
15 11 10 10 15 10 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 11 11 11 10 10 8 6 6 8 12 16 23 10 11 8 8 8 8 8 8 9 16 8 8 12 15 10 8 9 9 8 8 6
7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 9 7 13 11 8 8 8 10 10 12 10 10 8 7 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 10 16 15 12 |
|---|
