BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-149I06.T7 (MSMg01no149_i06.b1) | MSMg01-149I06.TJ (MSMg01no149_i06.g1) |
ACC | AG352213 | AG352214 |
length | 697 | 699 |
length of high quality (start - end) | 555 (48 - 602) | 491 (74 - 564) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no149_i06.b1 PHD_FILE: MSMg01no149_i06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:12:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no149_i06.g1 PHD_FILE: MSMg01no149_i06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:12:49 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NATTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCACTGCTTTCCACAGTGGTCCCCAGTTCAAGGCACCAATTTTCC
CAAAAAAATATTGAAAAGAGTAGGGCTTTGAGATGTAAGCCATTAAGAGA
AGGCACAGTCTGGACTCAGTCCTGGCTTGATTTCTGGGCTACATTGTTGG
CTTGAAGGAACAAGAGGCTGAGGCAGCTGATGTGAGAATCAGCTTGGTAA
ATGGGAAACTCAGGGCTGGACAGCCTGAGCCCTCGGTGTGTAGGGTGGAC
AGACAGTGGGACAGCTCCAGGACCCTAGGCGGCAGCAATGTCAACTGACA
CCTTCCCTTCAGGTCCCTGCTCCGTGCCTCCTTCTCTTCCAGCTCATTGT
TATTCAGAAGCAACTTCTTCTCGGGCCTTCTCAGCATCTCCCTTGCTAGT
TTATAATGCTACATTTTATGTTGGGATTGGAGGCTAAGACTATGAAATGG
ACTATTTATTTTAAATCGTGCGTAGGAAGTAGAGATTGGGTAGAGAACAG
TGTGGGAAACGAGTCGAGAGATGTCACGCTCAGGGCCTCTCCTCATCACA
GATGTCCCTTCTACGTTCACCAATGCACACGGAAGTCGAGAGCAGCATAA
TGTGGCATGTCTGAGCTATCCAGACCCCCAATGGGCCCTGTTTTAAT
| NCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATATATTATGAATACACATGCATTTAA
ATATATTTATATATTTGCTTTGAGACAGAATCTCACTAATTAGCACTGGC
TGACCAGGAACCCACTATGTAGATCAGGCTAGCCTTGAGCTTATACAGAT
CAGCCTGCTTCAGCTTCCTGAGTGCTGGATTCAAGGTATGTGTCACCACA
TCCCATTTATATATATGACCTTAAAGTATTATTGTAATCAGAATAAATTG
AAGAAGAAATAACTTTGTAATGACTTTAATAGTCCCATCCAAGAACATGG
TATACCTTCTCATTTGTCTGTAGTCATTTATATTTTTTTAACAAAGTTTT
AAGCTTTTCTCTATGAATTCTTCTCTCCTCAGGTTAACTGTTAGATAACT
CATTTCTTTATTGCTATCGTAAATACTATCTTGATTTACATTTCTTTTTC
AGCCGCTTTTTGCTGACATAAAAAGGAGTTTTATAAAGTAGCCAGTATTT
TAAATGTTTCTGAAATAGCTTCGATATACTAGCTATTATTCATTCCCTGA
AAGTTTGGTAAAATGTACTTGTGGTGGTTTGAATATGCTTGGCCCAGGGA
GTGGCACTATTAAGAGGTATAGCTTTGTTGGAGTAGGTGAGGCCTTGTC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 6 8 6 6 10 9 18 34 37 23 22 19 17 13 17 8 8 8 19 19 33 43 41 26 19 14 12 11 8 11 9 11 9 11 11 10 11 11 14 14 18 18 24 24 34 37
44 36 36 36 36 36 33 33 33 33 47 30 21 10 8 8 8 8 11 21 18 33 33 37 37 39 36 36 36 36 38 35 35 37 37 37 40 47 50 50 50 50 50 50 50 59 57 68 47 47
47 50 50 50 68 57 68 68 57 50 50 50 50 54 54 50 50 50 50 50 50 48 36 37 42 42 48 48 46 57 57 57 47 48 47 47 47 57 57 57 57 57 44 42 42 42 42 43 50 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 48 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 32 32 21 21 11 11 11 24 26 38 43 43 52 43 43 52 52 52 52 43 43 43 43 52 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54
57 57 57 59 59 43 43 43 46 46 54 57 57 68 59 59 57 48 48 48 48 47 43 40 40 42 40 47 57 47 47 48 43 43 37 43 43 59 59 59 59 50 50 50 46 43 27 17 11 11
10 15 19 37 41 41 40 47 48 47 47 48 48 48 57 48 48 43 43 37 37 39 32 35 37 35 37 37 35 35 35 39 39 48 37 37 32 28 28 34 34 39 39 39 31 31 31 35 26 31
35 41 41 41 47 59 39 41 41 39 37 37 30 30 37 34 34 28 28 19 25 12 12 11 15 21 28 23 18 18 15 15 17 30 30 37 28 19 16 22 22 28 30 31 37 37 47 43 39 36
36 36 28 34 28 25 20 29 34 37 37 37 37 32 34 23 23 32 32 39 37 33 25 25 34 34 31 32 24 24 24 21 19 19 22 27 32 37 39 37 31 24 39 39 37 39 34 36 28 21
21 14 14 13 17 18 12 12 16 21 21 24 21 16 14 14 19 17 17 15 14 12 12 12 21 15 29 24 24 21 21 24 24 17 16 17 13 13 11 11 10 16 10 8 8 8 8 8 9 8
10 6 6 6 15 10 19 24 21 19 22 20 18 12 11 11 11 10 10 8 8 12 12 12 14 16 14 9 9 9 9 16 12 18 11 10 9 9 10 12 12 20 20 22 17 16 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 13 8 8 8 8 17 17 11 11 10 16 16 32 30 30 47 47 33 33 33 33 33 33 29 25 15 12 14 21 11 11 11 9 9 12 9 17 9 11 10 17 21 25 22 13 13
16 27 22 33 33 26 23 10 9 9 10 9 10 10 11 11 17 17 28 33 28 28 28 28 30 36 57 57 57 53 53 53 42 42 47 50 40 40 42 40 42 50 50 50 50 68 68 68 68 57
59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 50 50 50 50 50 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 51 50 50 50 50 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 62 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 44 62 52 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 57 43 39
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 57 59 52 43 43 42 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 50 48 48 59 59 57 44 44 42 42 47 57 57
57 57 43 47 47 48 57 57 54 54 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 50 59 59 57 57 47 43 37 34
33 36 47 47 41 59 39 43 43 43 43 48 40 40 37 37 37 32 30 28 28 30 32 39 39 39 33 23 21 20 31 31 37 22 28 21 24 19 23 21 24 18 20 23 17 17 20 29 29 37
32 29 25 28 28 25 31 34 37 37 37 19 17 17 18 18 14 20 20 21 19 15 15 11 15 13 19 19 24 24 16 16 9 12 13 11 17 27 25 31 32 37 36 27 24 25 25 27 27 27
29 34 35 28 28 27 16 11 9 9 16 16 19 19 17 15 13 16 11 15 14 21 18 25 30 20 14 14 14 21 25 28 21 22 22 22 22 22 21 17 13 10 11 11 10 12 12 16 15 17
9 9 12 13 18 22 16 24 16 16 16 12 12 14 15 16 18 16 14 20 10 12 16 18 18 25 24 19 18 12 14 9 9 9 9 10 10 12 12 14 14 14 10 9 10 8 8 8 8 |